Protein

View in Explore
Genbank accession
AGH56301.1 [GenBank]
Protein name
fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESVTNTANTLVQRDADGNFSASTVTATLIGNASTAARLASTRQIQLSGDVQATGVFDGSTNLNLNTTVSLVSTLPHYDGTGDSSGTYRSVTVDAKGRVTNATNPTTLAGYGLDGNVEGSSAQPYDLDLQALANLTSTGIIARTSGGAMATRTVLGSATRIAITNGNGVAGNPVIDLITTAVTAAEYNTESLTSAAGSETVNATKFTVDAYGRLTDSNTVPIATATEGSKYASYNAGTTYARYDIIANASKVYQAYQAITAGSGAPTHTSGDNGGWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPNIDLDGAVDQVINKDGSGHFTISHTQNVATPRNLNILATNTGSGTSNIVIRAEDTVTINATEATGKVHVEDLRIQDNFLASTGQLNLDPGDDRAATGLVRIYGDLQIDGTTTTVNSTELTVDDVTILLGGDTAPTSDDNLDRGVQFRYYDSQARLGFYGWDTNYTDLGGHEGGYRFLHAATNNSEVFTGTDSGIIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNMVLQGASKTLQLNNGSGTTKVEFQSTTGNGSLAGILDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTTVAGTLGVTGDTTLTGALDANSTLNVAGDVYLESTNDITVAKNSGTGVWEIQSNDYGALRLDGGFYTAGDALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRNSGDTVKFSVLGASGNTDIQGTLDVAGNSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKFTVASSSGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEIFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSDVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDNVTITADNKTFAIQNASAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDVGGDVTAESNLTVTGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPSTNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSANQFAFVTDATNSSEVLAGTDGALRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIVSQVTSGAALVIPTTTKINNLNADLLDSMTTASAATPTTVVARDSSGDFSANQITAASGVGAAAGFLGNASSADILKTARVITIDGVVNGNVSFDGSQAVTITTTYDDADITALAAQSGTGYMVRTAANTYAHRTFAVTASSGITLTNPDGISGNTTINVASASTNAANNLVLRDASGGFSAEDVNVATLDATGNSTIGGTLGVTGVVTLSGQLNANSGILVDTNKFTVDGQNGSVSTQGTLNADGATTLGSTLTVTGATEFNSTVDVDGNFAVRTNLGVDKFTVLGASGNTSISGTLGVTGATTLSDTLAVTGTSAFTGAITASGGVIGNVTGTVSSIANHDTDALSEGSTNLYFTNERVDDRIDALFVASTGITKVYDDTAGTYTLSVTQADIDTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIELSGAGELSVTQVDIDTDNVTEGSTNIFYTEARFNSSLAAKTTDDVTEGSANLYYTDARADARIAAADTDALSEGSANLYYTDARAEASFDTKIAAASTDDLSEGSTNVYYTDARAEASFDTKIAAASTTNLSEGNNLYYTEARVQTKLDDAFAQLQAMLNNLATTTTLTLALSGDPTPGAVVTTAVDNGGGGGFTAGTAVATSGGTGSGLTVDTTVVGGVITAAAVNAGGSDYLISDTVTITNPNAGKVLSFNLATLTGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITAVAGAITNVTINDGGTGYAADETITIVQPTGADGSNPATGGTVDIATVATNATLSMTDITTMEVGAIVTGATSGTVGTITALGTNQITVDNVDGFFKVGEVVSANDVTTLTISSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2162 AA
molecular weight: 220618,45260 Da
isoelectric point:4,16837
aromaticity:0,05920
hydropathy:-0,11994

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607 DC_1607 DC_0029 DC_0029
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352 DC_1607 DC_0029
AGH56301.1
1 2162
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 4-43 | STR 44-242 | STR 320-1515 | RBD 1762-2162
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage Syn2
[NCBI] 		536473 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Pontusvirus > Pontusvirus syn19
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH56301.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634190 [NCBI]
CDS location
range 23063 -> 29551
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCCTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGCTTTAAGATCGGTGATGGTGTTTCCGCATGGAACACGTTGAGGTATGAAAGACCTGTTGAATCCGTCACCAATACGGCGAATACGCTCGTACAGAGAGATGCTGATGGTAATTTTAGTGCTAGCACAGTCACTGCAACATTAATCGGTAATGCTTCAACCGCCGCTCGTCTTGCTTCGACTCGTCAGATTCAACTTTCAGGTGACGTTCAGGCAACAGGTGTCTTTGATGGTTCTACCAACCTGAACCTGAATACAACAGTTAGTCTTGTTTCAACCTTACCTCATTATGACGGCACAGGAGATTCATCAGGAACTTATCGTTCAGTAACTGTTGATGCAAAAGGTCGTGTTACTAATGCGACTAATCCTACAACTCTTGCTGGATACGGATTGGATGGTAATGTTGAGGGTTCTTCAGCACAACCATATGACCTTGACCTTCAAGCATTAGCAAACCTTACTTCTACTGGTATTATTGCCAGAACTTCTGGTGGTGCAATGGCAACCAGAACTGTTCTGGGTTCTGCTACCAGAATTGCTATTACTAATGGTAACGGTGTTGCAGGCAACCCTGTTATCGACTTAATTACAACTGCTGTAACTGCAGCAGAATATAACACCGAATCACTCACGTCTGCTGCTGGTAGTGAGACTGTAAACGCTACAAAATTTACAGTTGATGCATATGGTAGATTAACAGACTCTAATACTGTGCCTATCGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTACGCTAGCTATAATGCAGGCACGACATATGCTCGCTATGACATCATTGCTAATGCATCGAAGGTTTACCAGGCATATCAAGCAATTACTGCTGGTTCTGGTGCTCCTACTCATACCAGCGGCGATAATGGAGGTTGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCAACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGTTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATCGCCGCACTAGGCGTAGATAATACACAATTACAAAATAATAGAGTCTCCTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGACTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTTAAAGTTAACGATACGAGCGGTAATCTTTTGTTTGGGGCTAACAATACAGGGGATTCTGGCGCTGGCGAGATTGATGTCAACGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCCAATATCGATCTGGATGGCGCTGTCGATCAGGTCATTAATAAGGATGGATCTGGTCATTTCACCATAAGTCATACTCAGAATGTTGCAACACCTAGAAATCTCAACATTCTTGCAACAAACACTGGATCAGGAACTTCTAATATCGTAATTCGTGCAGAAGATACTGTTACAATTAACGCAACTGAAGCAACTGGTAAGGTTCATGTAGAAGATCTTAGAATTCAAGACAACTTCCTTGCTTCTACTGGTCAATTAAATCTTGACCCTGGTGATGACCGTGCTGCTACTGGTCTGGTTCGTATCTACGGTGACCTTCAGATTGATGGCACAACTACCACAGTTAATTCAACTGAACTGACAGTTGATGATGTTACTATCCTTCTCGGTGGTGACACTGCTCCTACATCTGATGACAACCTTGACCGTGGTGTTCAGTTCCGCTATTACGATAGTCAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCACGCTGCTACAAATAATTCCGAAGTCTTTACTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTTACAACTAATACAAACTCTACTTCTAATACAACTGGTGACCTTGTAGTTGCTGGTGGTGCTGGTATCGGTCAAGACGTTAATATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGATGGCACATTCCGTGCTAACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTTCTGCAGGGTGCATCTAAGACTCTGCAACTGAATAATGGTTCTGGAACTACGAAGGTTGAGTTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATCCTCGATGTAACTGGTAATTTCAACGTTAATACGAATAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAATACAACCGTTGCTGGTACTCTTGGAGTTACTGGTGATACAACACTGACTGGTGCTCTGGATGCAAACAGCACTTTAAATGTTGCTGGTGATGTTTATCTTGAAAGCACTAATGACATCACAGTTGCTAAGAACTCTGGCACTGGTGTTTGGGAAATTCAGTCTAACGACTATGGTGCTCTTAGACTTGACGGTGGTTTCTACACCGCTGGCGATGCTCTGATTGATGGAACACTACACGTCAACGGTGCTATTGAAGTTAAAGATAGTGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGACTCTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACTACAACCATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACTCTGCACGTTGGTGGCACGGGTTCTGGCGAAGGTCTGTTCGTTGGTAAGAGAAACTCTGGCGATACTGTTAAGTTCTCTGTCTTGGGTGCATCTGGTAACACAGATATTCAAGGCACACTCGATGTTGCTGGCAACTCTGAGTTCAACGGCACTGTCGATGTTGATGCAGATTTCGCTGTTAGAAACGGTACAACCGACAAGTTCTTCGTTGATAACGTAACTGGTAACACCGATATCCAAGGCACTTTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAACACTCTGGATGTTAGCAACGCTGTTACATTCGATCAGACACTTCTGGTCCAAGGCAACTCCGAGTTTAACGGCACAGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCCGTTAGAAGTGGTAGCACAGATAAGTTTACTGTTGCTTCTTCCTCTGGTAACGTTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAATCTTCTCTATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAACGGTAATACAAACATCATCGGCACACTAACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCTTGGGTGTCTCTGATGTTGTAACCTTCACAAGAAACACTCAGCAAACCCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAACCTTGCTGTTGGCGAAGGTTTGAGAGTTTATGGTGGCACAGAACTAACTGGTGCTCTTGATCTCAATAACTCTGCAGATATCTCTGGTGCTTTAGTAACTCATGATAATGTTACTATCACTGCAGATAACAAAACATTTGCTATTCAAAATGCATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGCAATACAGATATTCGTGGAACCCTGGATGTTGGTGGTGATGTAACTGCCGAATCTAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTGTTAATGGCACAACCACTACTGTCAATAGCACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCCTCGACTAACGATGGTAAGGATCGCGGTGTTGAATTCCGTTATTATGACGGCTCTGCTAAAATTGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCGCCAACCAATTCGCGTTCGTAACTGATGCAACTAACTCCTCTGAAGTTCTTGCTGGTACAGATGGCGCTCTTCGTGCTGGTTCTCTTAATCTTACTGGGTCTGGAACATCTCTTGATGTTGATGCCAATGCTAACATTGATGGCACCCTGACTGTTGATGGACAGATTGTTTCTCAAGTTACATCTGGTGCAGCACTGGTCATTCCTACCACCACCAAAATTAATAATTTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCTGCGACACCGACTACTGTCGTTGCTCGTGATTCTAGCGGTGACTTCTCTGCTAATCAAATCACTGCTGCTAGTGGTGTAGGTGCTGCTGCAGGTTTCTTAGGTAATGCTTCGAGTGCAGATATCCTTAAGACTGCAAGAGTTATCACCATTGATGGTGTTGTCAACGGCAATGTTTCCTTTGATGGATCTCAAGCAGTAACCATTACTACCACATATGATGATGCTGACATTACTGCTTTGGCAGCACAGTCTGGCACTGGTTATATGGTCAGAACTGCTGCTAACACCTATGCACACCGCACGTTTGCTGTTACAGCATCTTCTGGTATTACTCTGACCAATCCTGATGGCATCTCTGGTAATACTACAATTAACGTTGCTTCTGCATCCACTAACGCAGCAAACAACCTGGTTCTGCGTGATGCCAGCGGCGGTTTCTCCGCAGAAGACGTAAATGTTGCAACACTGGATGCTACAGGAAACTCCACCATCGGTGGAACACTTGGTGTAACGGGTGTAGTTACCCTTTCGGGTCAGTTGAACGCTAACAGTGGTATTTTAGTTGATACTAATAAATTCACTGTTGATGGACAGAACGGTTCTGTTTCTACTCAAGGCACACTGAATGCCGATGGTGCTACAACTCTTGGTAGCACACTGACAGTTACTGGTGCAACCGAATTTAATAGTACGGTTGATGTAGATGGTAACTTTGCAGTTAGAACTAATCTTGGTGTAGATAAATTTACCGTTCTGGGTGCATCGGGTAACACTAGTATTTCTGGTACTCTTGGAGTCACAGGTGCTACAACCTTGTCTGACACCCTGGCAGTAACTGGAACATCTGCATTCACTGGTGCAATCACCGCAAGTGGCGGCGTTATCGGTAACGTAACGGGAACAGTTTCTAGTATCGCAAACCATGATACTGATGCTCTGAGTGAAGGTTCTACCAATCTCTACTTCACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAATCGACGCACTGTTTGTTGCAAGCACTGGTATTACTAAGGTATATGATGACACAGCAGGCACCTATACGCTCTCTGTAACGCAAGCAGACATCGATACCGATAATGTCACTGAAGGATCTACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGCACACACTTCACTTATGGTACGGGTATCGAACTGAGTGGTGCAGGTGAATTGTCTGTCACTCAGGTCGATATTGATACTGATAATGTTACTGAAGGTAGCACTAATATCTTCTACACTGAAGCACGCTTTAATTCAAGTCTTGCTGCTAAGACCACTGATGATGTAACTGAAGGTTCTGCTAACCTTTACTACACAGACGCTCGTGCTGATGCTCGTATCGCTGCTGCTGATACCGATGCATTGTCTGAAGGTTCTGCAAATCTATATTACACAGATGCTCGTGCTGAGGCATCTTTCGATACCAAGATTGCTGCTGCATCTACCGATGATCTGAGTGAAGGTTCTACTAACGTTTATTATACTGATGCTCGCGCTGAGGCATCTTTTGATACCAAGATTGCTGCTGCATCTACAACAAATCTGTCTGAAGGCAACAACCTTTATTATACGGAGGCAAGAGTTCAGACAAAACTTGACGATGCATTTGCTCAACTTCAGGCAATGCTCAACAATCTTGCAACTACTACCACTTTAACCCTGGCACTGTCTGGTGATCCTACACCTGGTGCGGTTGTTACAACTGCTGTTGATAATGGTGGTGGTGGCGGATTCACTGCTGGAACTGCCGTTGCTACCTCTGGTGGCACTGGTTCTGGATTGACAGTTGATACCACTGTTGTTGGTGGAGTAATCACTGCTGCTGCAGTTAATGCAGGTGGTTCTGATTATCTTATTTCCGATACTGTAACAATTACTAACCCCAATGCTGGTAAGGTCCTCTCCTTTAACTTGGCGACCCTTACAGGCGGTTCTAACTATGTTACAGGGACTGCTCTGGCAACGACTGGTGGATCTGGATCTGCATCTCTGACTGTTGATATCACAGCAGTTGCTGGTGCAATCACTAACGTTACTATTAATGATGGTGGCACTGGATATGCTGCCGATGAAACAATTACTATCGTTCAACCAACTGGTGCTGATGGTAGTAATCCTGCAACAGGTGGTACAGTTGATATCGCGACTGTCGCTACTAATGCAACCTTGTCCATGACTGACATCACTACGATGGAAGTCGGTGCAATTGTCACTGGTGCTACTAGTGGCACAGTTGGCACCATCACTGCTCTGGGAACTAACCAGATCACTGTTGATAACGTTGATGGATTCTTCAAAGTTGGAGAAGTCGTCAGTGCAAATGATGTTACAACTCTCACTATCTCCTCATTCGCTTGA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
1dbd9b9c884db6a3030f31eb02c37881c7068c6737008e589a622dae13ccd029
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4945
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Cyanophage Syn2 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank