Protein

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Genbank accession
XYM57506.1 [GenBank]
Protein name
short tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADLIYDLRPGSAGFDFTQTNEFLDGCAIYDSCYGVSGSCGTGELGGFQNNIGTKHLSIGTFNSTLFVQNRTAQFLLNTTSMEYMIIDLITGDDFNGGERPNNSNEGLKIKCVTGGDTSTTQLVAGGNGYGPYPGVEGGPGWITRQVNIPAANRGQFLWQIFMTSGSPEFQGAGGVFANNQNAGDRYAVSRLRIYGTVPTTITYFRANDDSPDTLIDPGAPVTLSWNTKLGQFDGATSGSINQGIGNISPIGQGSVTLNPGPTTETTYTLTVQGPTGQLTSQVTVEMDVPDSDPDLFTFDSIIEAETATVYTSNTVTITGLETSVTLQASNGASTSKNGGGFSTSNKTINNGDTVRVRMTSSSNFNTLKTSTVQVGSASATFNITTKSEPAQIPNNFDFNDVTDAGLNTTITSNQVTITGITQAVPVTAPTNGFESSVNGGTFSAAAKTITNGQTLRLRYQTSGNTGETAVTQITVGGGASVDWSVTNQGTADTDPNYFFFDDEDNVAANTLITSQPVAITGINVPTQVTASNGAQIRVANGSWVNGNTGTTITNGQNLRVRITSSADPGGVVETDVTVGALTDTFTVTTTTANDTTPDPFYFANRDNQAPNTYIESNVIVLQGITSPSNVSVTGGQFSKNDGSGWSAFAATGQVNNGDQFKVRVLTGGLATTSNLSVTIS
Physico‐chemical
properties
protein length:681 AA
molecular weight: 71010,67130 Da
isoelectric point:4,24624
aromaticity:0,07783
hydropathy:-0,24479

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH1b
[NCBI] 		3413213 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57506.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340850.1 [NCBI]
CDS location
range 36690 -> 38735
strand +
CDS
ATGGCAGATTTAATTTACGACTTACGCCCAGGAAGTGCTGGATTTGATTTTACTCAAACAAATGAATTTTTGGATGGGTGTGCCATCTATGATAGTTGCTATGGTGTTTCTGGTTCTTGTGGAACTGGTGAACTTGGTGGATTCCAAAATAACATTGGCACAAAACATTTAAGTATTGGTACTTTCAATTCTACTTTGTTTGTACAAAATAGGACAGCACAGTTTCTTTTGAATACTACAAGCATGGAATATATGATCATCGACCTCATTACAGGCGATGATTTTAATGGCGGAGAAAGACCAAACAACTCGAATGAAGGACTTAAGATTAAATGTGTGACTGGTGGTGACACTAGTACAACACAATTGGTTGCTGGTGGTAATGGTTATGGTCCATACCCAGGAGTAGAAGGTGGTCCTGGATGGATTACAAGACAAGTTAATATTCCTGCTGCTAACAGAGGGCAATTTCTCTGGCAAATTTTTATGACTTCTGGATCACCAGAATTTCAAGGTGCTGGTGGTGTTTTTGCTAACAACCAAAATGCTGGTGATAGATATGCTGTTTCTAGACTTAGAATTTATGGGACTGTTCCTACAACTATCACATATTTTAGGGCAAATGATGATTCACCAGACACGCTGATTGATCCTGGTGCTCCAGTTACTTTATCTTGGAACACCAAATTAGGACAATTTGATGGTGCTACTAGTGGATCAATCAACCAAGGTATTGGTAATATTTCTCCAATTGGACAAGGATCTGTTACACTAAATCCTGGTCCTACAACAGAGACTACCTATACTTTAACTGTACAGGGTCCAACAGGGCAGTTAACATCTCAGGTAACTGTCGAGATGGATGTTCCTGACAGTGATCCAGACTTGTTTACATTTGACAGTATAATAGAGGCAGAAACTGCCACCGTATATACTAGTAATACAGTAACAATTACTGGATTGGAAACTAGTGTTACACTCCAAGCATCAAATGGTGCATCAACTTCTAAAAATGGTGGAGGTTTTAGTACCTCAAATAAAACCATTAACAATGGTGATACGGTGAGAGTCAGGATGACCTCATCTTCAAATTTTAATACACTAAAAACATCTACTGTTCAAGTTGGCAGTGCATCAGCAACATTTAATATTACTACTAAGTCTGAACCAGCACAGATTCCAAACAACTTCGATTTTAATGATGTAACAGATGCTGGACTGAATACTACTATTACTAGTAATCAAGTAACGATCACTGGTATCACTCAAGCAGTCCCTGTTACTGCTCCTACAAACGGATTTGAAAGTTCCGTTAATGGCGGTACATTCTCTGCTGCAGCAAAAACTATTACCAACGGACAAACCTTACGATTAAGATATCAAACTAGTGGTAATACTGGTGAAACAGCAGTTACTCAAATTACAGTAGGTGGTGGTGCTTCTGTTGACTGGAGTGTTACTAACCAAGGAACCGCAGATACTGATCCGAATTATTTCTTCTTTGATGATGAAGATAATGTTGCTGCTAATACATTGATCACAAGTCAACCAGTTGCTATTACTGGTATTAATGTACCAACACAAGTCACTGCATCAAATGGTGCTCAGATTAGAGTTGCAAATGGTAGTTGGGTTAATGGAAATACAGGAACTACTATTACAAATGGACAGAATCTAAGAGTTAGAATTACATCTAGTGCAGACCCTGGTGGTGTTGTAGAAACTGATGTTACTGTTGGTGCTTTAACAGATACATTTACAGTGACAACAACTACTGCAAATGATACTACACCTGATCCATTCTATTTTGCAAATAGAGATAACCAAGCACCAAATACATATATTGAGAGTAATGTGATTGTCTTGCAAGGCATTACATCACCTTCTAATGTATCTGTCACTGGTGGACAATTCTCTAAAAATGATGGTAGTGGTTGGAGTGCATTTGCAGCAACAGGACAGGTAAATAATGGTGATCAGTTTAAGGTTAGAGTCTTAACTGGTGGATTAGCAACAACTAGTAACTTAAGCGTAACGATTAGTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
a813731ad718883be20639a1c88e32eaaaf7dfbbc7e36f733caec413e75684d3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8946
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50