Protein

Genbank accession
YAF80007.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MADYKLSELNSIDTIRSDDLLHVRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITMGDVLKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARLAVTNNFNIRQAIVTDGEQLTLKKATNAGASYIQGRDANNQQTWYVGQGNANNTNVYLYNHATGSMLTLDATASFNKTLRIMGQVQPSDFSNLDARYFTQTAANQRFAQLAGDNTFSGSNIFTNFVVKKNANAITLQNVDTTAALYIQAKKSDGTRKWYIGNDTDENTVNIYNYLANTQISLGNTIAMSRTVQITGQVQPSDWTNIDSRYIPAGTLSNLPKLNVSNTFTNTQTIVANNEGLIVKNLTQNQPLYIRGVDTANTSRWWIGVGGNNSNVVTWNNSYSGTQIALEPSVIVANKSLAITGQVQPSDFSNLDARYYTQSVANSRYMLASLTGSASEKDGGNGVAWNARTGLYNVTNPTGGASFLVSHMFLGAGSTPSAQLKFEYRNGGMWYRTSRDGYGFEANWSKIYTEAQKPTPSDIGAYTKAETDQKIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVDPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLAVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTTNTTGAHTHSVSGSTNNTGAHTHTVGGRYGGDSIGGKPRVQVSGTEQVSSSAGAHAHTVSGTAASNGNHAHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:781 AA
molecular weight: 83875,60160 Da
isoelectric point:8,94333
aromaticity:0,08579
hydropathy:-0,40730

Domains

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage SenM-L8
[NCBI] 		3459913 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YAF80007.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PX104381.1 [NCBI]
CDS location
range 20507 -> 22852
strand +
CDS
ATGGCAGATTACAAGTTGAGTGAATTAAACTCAATCGATACAATCCGTTCAGATGACCTTCTTCATGTCAGGGTTAAAAAGAGACCTGAAATGCTGGGTGATGAAGACCGTCGAATGACCTATCAAGATTTCTTAGCATCTTTTAAGCTTGAAAGATTTGTTCAGATTGCTGGTAGTACTATGACTGGTGACTTAGGGATTGTTAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCAGTCTTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATGGGGGATGTTTTAAAGACTTTTAAAATTAATGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCTGCAACTGTTTATCATACTCTTAATAAGCCAAGTCCTAATGAACTTGGGATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATATGCAAGGCTGGCTGTAACAAATAACTTCAACATTAGGCAAGCAATTGTAACTGATGGTGAGCAGTTAACCCTTAAGAAAGCAACTAATGCAGGAGCTTCATATATTCAGGGTAGAGATGCTAATAACCAGCAAACTTGGTATGTTGGGCAAGGGAATGCAAACAATACTAATGTTTATTTGTACAATCACGCCACTGGCTCAATGTTGACACTTGATGCAACAGCGTCATTTAACAAGACACTAAGAATTATGGGTCAAGTTCAACCTTCTGACTTCTCTAACTTAGATGCTAGGTACTTCACCCAGACAGCAGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGTGATAATACTTTTAGTGGCTCTAATATTTTCACTAACTTTGTTGTTAAGAAGAATGCTAATGCTATCACTCTGCAAAATGTAGATACAACTGCTGCTTTGTATATCCAAGCAAAAAAATCAGATGGAACTCGTAAGTGGTATATTGGCAATGATACCGATGAAAACACTGTAAACATCTATAACTACTTAGCAAATACACAAATCTCACTAGGTAACACCATTGCCATGAGCAGAACAGTCCAAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCTGATTGGACTAACATCGACTCTAGATATATTCCAGCAGGAACTTTGAGTAATCTCCCTAAACTTAATGTGTCTAATACTTTCACGAATACACAAACTATTGTTGCTAACAATGAAGGGTTGATTGTAAAGAATTTAACACAAAATCAACCTTTGTATATCCGTGGTGTTGACACCGCAAACACCTCTAGATGGTGGATTGGTGTAGGAGGAAACAATTCCAACGTGGTTACTTGGAACAACAGCTACTCTGGCACTCAAATTGCCCTTGAACCATCAGTAATTGTGGCTAACAAGAGTCTTGCTATCACTGGTCAAGTTCAGCCTTCTGACTTCTCTAACTTGGATGCCAGATATTATACGCAATCTGTTGCTAACTCTAGGTACATGCTTGCAAGCCTCACTGGTTCAGCTTCTGAAAAGGATGGTGGGAATGGAGTTGCATGGAATGCTAGAACAGGGCTATACAATGTTACCAACCCTACTGGTGGAGCATCTTTTCTTGTATCTCATATGTTTTTAGGTGCTGGTTCTACACCATCTGCGCAATTAAAATTTGAATACAGGAATGGTGGGATGTGGTATAGAACATCCAGAGATGGTTATGGTTTTGAAGCTAACTGGTCTAAGATTTATACCGAGGCACAAAAACCAACCCCTTCAGATATTGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAAGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTTAACAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAATAGTAATGTTGACCCTAATACAGCACTTCCTGGGTTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATCAGAATCGCAGCAGCAAATGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGATTCTGTAACGTTAGCTGTTGGCAACTTACCATCACACACTCACAGTTTCTCTGCGACAACCTCTAGCTTTGACTACGGTACTAAAACCACTAACACTACTGGTGCTCACACCCACTCAGTGAGCGGTTCTACTAACAACACTGGTGCTCATACACATACTGTAGGTGGTCGTTACGGAGGTGACTCTATCGGTGGTAAACCGCGTGTTCAGGTATCTGGTACAGAACAGGTATCTAGCTCTGCTGGTGCTCACGCTCACACTGTGTCTGGTACTGCTGCCTCTAACGGAAACCATGCTCACACTGTTGGTATTGGTGCTCACAGTCATACAGTTAGTGGTAACACTGGTGGTACAGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTAACTAACCAGTTCTATAAGCTGATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
A machine learning approach to predict strain-specific phage-host interactions Camejo,P.Y., Leon,L.E., Rojas,F., Ossa,A., Hurtado,R., Tichy,D., Pieringer,C., Pino,M., Mora-Uribe,P., Ulloa,S., Norambuena,R., Tobar-Calfucoy,E., Aguilera,M., Rojas-Martinez,V., Cifuentes,O., Sabag,A., Cifuentes,N., San Martin,D., Infante,C., Cifuentes,P. and Pieringer,H. — — GenBank