Genbank accession
XFC52623.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,61
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,85
Protein sequence
MATIKQIQFKRSNVAGKRPLPADIAEGELAINIKDSTLFTKNADGQIIDLGFAKGGRIDGDVVQVGNYTQTGNYTTSGDVSAKTILASAGVSSNGDIVAERGVIRTRAASSGNAHLWFEGEEITGENRNKERGVLYATQQTDTDGRVNLRVYNGKAHAANTNNALFVFNGAGDFAAPKDLYAQRSRLSNESIAPTMNTSRLYTRNRAFNEFGTNQSYGWDDTVNYTAGQNGAIALNYVYKGRAHASGTIWHQLIDERDGADWAIYTGSGPERKMFNIRSAGSLGHAQFTGSLFLGSGGGGLGVISGMGEGSLALGDNDTGFRNDGDGAFSVMANSRELINYNSSTVKFQIEHKKATRITHTDNANTAILPANNTSILEVDTSLDGNNVGGNGLTLLGYVSSGRYYHYFRGRGSANFDMDGGVYISKGGLSVTGNISTTGQVQPSNFSNFDSRYQNLLQLGGNVNLDTLAGDNHAGEYAQHANANTSLALNYPEAQAGHLTVTSGAGVQQRYHVYNSTRVYLRAKYSSEAWRPWDRVVTDDYLASGIGGSIVSKAADGFRIAYGSYGFFIRNDGGNTYFMLTNSGDQMGTWNGLRPLTINNGTGQVSIGTPLVVTHSSGLTVTSTAGDAISWGSLGACLANDGNLKGSRWKSFGGSDWAGDALSWVNNNNVAKAGDTMSGTLTMGNGQITLSGGAGNINFLKAGTNPRNMRIFIAGDTSRGNRIELADDSSYLVYFERHPTSGVQLMMNGNGNFSNVYIRSDIRLKRNLKKIENAVDKVDKLNGYIYEKTDKIGGTEFKVEAGIIAQELKEVLPEAVETVSMDDGEETLTVSSAATIALLVNAIKELKARVEYLESK
Physico‐chemical
properties
protein length:856 AA
molecular weight: 91625,19720 Da
isoelectric point:6,31091
aromaticity:0,08645
hydropathy:-0,38341

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–646
cd19958
STR
458–536
IPR030392
CHP
760–816
XFC52623.1
1 856
Architecture
STR
ATT
STR
RBD
STR 1-545 | ATT 546-598 | STR 599-646 | RBD 647-856
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterobacter phage vB_EluM_RZH
[NCBI]
3447540 Viruses >
Host Enterobacter ludwigii
[NCBI]
299767 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XFC52623.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ140450 [NCBI]
CDS location
range 11691 -> 14261
strand -
CDS
ATGGCAACTATCAAACAAATTCAATTTAAGCGTTCTAATGTTGCTGGTAAAAGACCGCTTCCAGCTGATATCGCAGAAGGCGAATTAGCAATTAATATCAAGGATTCGACTTTATTCACTAAGAACGCTGATGGGCAAATCATTGACCTCGGTTTTGCAAAAGGCGGCAGAATCGACGGTGACGTTGTACAAGTAGGTAATTATACTCAGACCGGTAATTACACTACTTCTGGTGATGTCAGTGCTAAAACTATTTTAGCCTCAGCAGGTGTTTCATCAAATGGTGATATTGTTGCTGAAAGAGGCGTAATTCGAACTCGTGCTGCTTCTTCAGGCAACGCTCATTTGTGGTTTGAAGGCGAAGAAATTACAGGTGAAAACCGTAATAAAGAACGTGGTGTTTTATATGCTACCCAACAAACAGATACAGATGGGCGAGTAAACCTTCGAGTTTACAATGGTAAAGCCCACGCGGCTAATACAAACAACGCGCTGTTCGTGTTTAACGGTGCTGGGGATTTCGCGGCTCCTAAAGATTTATACGCTCAACGCTCTCGTTTAAGTAATGAGTCTATTGCTCCTACGATGAATACTTCACGACTTTATACAAGAAATAGAGCGTTTAACGAGTTTGGCACCAACCAAAGCTACGGCTGGGACGATACTGTAAATTATACCGCTGGTCAGAATGGAGCCATTGCTCTGAACTATGTTTATAAGGGCAGGGCTCACGCATCAGGAACAATTTGGCATCAGCTAATTGATGAGCGCGATGGCGCCGATTGGGCTATTTATACTGGTTCAGGGCCTGAACGCAAAATGTTTAATATACGTTCAGCTGGTTCACTCGGCCACGCGCAATTTACAGGAAGTTTGTTCTTAGGGTCTGGTGGCGGTGGATTGGGTGTTATTTCTGGAATGGGTGAAGGTTCTTTGGCATTAGGTGATAACGATACCGGATTCAGAAATGATGGCGATGGCGCGTTTAGCGTAATGGCTAATTCTCGTGAGTTAATTAATTACAATTCATCAACTGTTAAATTCCAAATTGAGCACAAAAAAGCTACTAGAATTACTCATACCGATAATGCTAACACCGCAATTTTACCGGCTAATAACACTTCAATTCTTGAGGTCGATACTTCATTAGATGGTAATAATGTAGGTGGTAATGGATTAACTCTCTTAGGCTATGTGTCTAGTGGAAGATATTACCATTATTTTCGTGGTCGTGGAAGCGCAAATTTTGATATGGATGGCGGTGTCTATATTAGTAAAGGCGGGTTATCGGTTACTGGAAATATTTCAACTACTGGTCAAGTTCAGCCTTCTAACTTTAGCAACTTTGATTCACGCTATCAGAATTTGTTACAACTCGGCGGCAATGTGAACTTAGATACGCTAGCCGGTGATAATCATGCTGGCGAATATGCTCAACATGCTAATGCTAATACTTCTTTGGCTTTGAATTATCCCGAAGCTCAAGCAGGTCATTTAACAGTTACTTCTGGTGCTGGTGTTCAACAGCGATACCACGTTTATAACAGTACTCGTGTATATTTACGTGCTAAATATAGTTCTGAAGCATGGCGCCCTTGGGACCGAGTTGTAACAGATGATTATTTAGCCTCTGGTATCGGCGGTTCTATAGTTTCTAAAGCAGCAGATGGTTTCCGTATTGCATATGGTAGCTACGGGTTCTTTATCCGTAACGATGGTGGCAATACTTATTTCATGCTGACCAACTCTGGCGACCAAATGGGGACTTGGAACGGCCTTCGTCCATTAACAATAAATAACGGAACAGGCCAAGTTTCTATAGGCACTCCTTTAGTTGTAACTCATTCTTCAGGTCTCACAGTTACTAGTACAGCAGGTGATGCTATTTCATGGGGTAGCTTAGGTGCTTGTTTAGCAAACGATGGTAACTTAAAAGGCTCGCGTTGGAAATCCTTTGGCGGTTCTGACTGGGCTGGTGATGCTTTAAGTTGGGTTAACAACAATAATGTTGCCAAAGCCGGTGATACTATGTCAGGCACTTTGACCATGGGCAACGGCCAAATAACTTTATCCGGCGGTGCTGGTAATATTAATTTTCTTAAAGCAGGTACTAACCCTCGCAATATGCGTATTTTCATTGCGGGCGATACTAGTCGCGGAAACCGTATTGAATTAGCTGACGACTCATCTTATTTGGTCTATTTTGAACGTCATCCTACTTCAGGCGTTCAATTAATGATGAACGGAAACGGTAACTTTTCTAACGTTTACATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAACGTAATCTGAAGAAAATTGAAAATGCCGTTGATAAAGTAGATAAACTTAACGGTTATATTTATGAAAAAACCGATAAGATAGGCGGAACTGAATTTAAAGTTGAAGCTGGTATTATAGCTCAAGAATTAAAAGAAGTTTTACCTGAAGCGGTCGAAACTGTATCTATGGACGATGGTGAAGAAACCTTAACGGTATCTTCTGCTGCTACTATTGCATTGTTAGTTAATGCAATTAAAGAACTTAAAGCTCGTGTTGAATATCTTGAATCAAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
496b31c942dd87d565e88113305400f1f39e51ddb7591c39b77adb36589745f8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3224
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50