Protein

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Genbank accession
QRD99548.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
Protein sequence
MIPRLYETYISDFNTEGLGSLKDLLTISITKNRNQIPTLAMTYPINASLSKDITEGMIIVADMGLEDDERNQQFRIVDVSKSMTSMSITANHIWADLSNIPLKKDISEAHASPNRAFSLISDALAWSIGDLGFASDIPTVANLGWNFKELGNANAAIFGADQAGDQTTNTMEALYNGEFRFNNYYLTMLKHAGKDKGVVIKYGRNMQSITRDETTSDTYNAIMPYVTYSPEEQPQPDGEPFDGKATVQYLANGTINLFSTPYKGHTPVNSIRNGEYLKFVAKTDKQTLNNDTWYKTDTGGWVEASLITFDKSGNYVVNKVNAQGTLEVSDDITGIIVKNDGVGTISYAGPGQVPLYTSPFGGHKSGKYLNNGTSYRIYWKAKDINGTIWYNLGNRDTQWVSSQYFVLSKTGDYATVKAYGRLSINGNVTVRSGPGGTGNVISWNNKGQYPIYDISTDYEGTKWYHIGQQNGHQLWVKSGDNVSFKEPGTVEYKEDDAAKANIKQTAQVPVYSDPSGISPTGKYYSLGSLLRITAQSTSQGKTFYEVGTNQWINSDFFSFAHATDVAPGEDDSNAKPEVSEQTLELDETVLVSEYARITNAPLRVQAVDLSSYGIGNDKNKLLAVAKAYMQEYRIGYPNISLTVSYDQMQGEYQKLTQVDLYDYVSVLFDEVGIFEKAQCTSITWDPVREIATSITIGQLPISYDHALNNFVTNMVTKNTTTANKRATHLFGELKQVMEEKDQDQKAGLLKLTRQLGIDDQAWRDSYDRLQSMITSINTTVQDVHNWIAGGGGGEITAYPNWQKPTELRALSNGGGYLRFNAEGLEYVGRDGVARSAIDSQGRLIAERITGGTITGVKLEGITVDGDSYIRSIGGDGKVAVMSGDHGFSCTAPGKEKVALDWDQNWGVLRIGNQYLYASDIAWIRQQRGGRIH
Physico‐chemical
properties
protein length:932 AA
molecular weight: 102908,38660 Da
isoelectric point:5,22932
aromaticity:0,10086
hydropathy:-0,45032

Domains

Domains [InterPro]
DC_1274
ATT
4–605
DC_1274 DC_0661
IPR007119
Unmapped
30–227
IPR007119
IPR010572
ENZ
167–697
IPR010572
QRD99548.1
1 932
Architecture
ATT
ENZ
STR
ATT 4-605 | ENZ 606-672 | STR 673-911 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage vB_Lga_AB1
[NCBI] 		2803737 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Lactobacillus gasseri
[NCBI] 		1596 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QRD99548.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW476489 [NCBI]
CDS location
range 32072 -> 34870
strand +
CDS
ATGATTCCTCGACTTTATGAAACATATATTTCTGACTTTAATACTGAAGGTCTGGGATCACTTAAGGATTTACTTACTATTTCAATTACTAAAAATAGAAATCAGATACCTACTTTAGCAATGACTTATCCGATTAATGCATCTTTAAGCAAAGACATAACTGAGGGCATGATAATTGTGGCTGATATGGGACTAGAAGACGATGAAAGAAATCAACAATTTAGAATTGTAGACGTATCTAAGAGCATGACTTCAATGTCAATTACTGCTAATCATATATGGGCTGATTTATCCAATATCCCTTTAAAGAAGGATATTAGTGAAGCCCATGCTAGTCCTAATAGAGCCTTTAGTCTCATCAGTGATGCCTTAGCTTGGTCAATTGGTGACTTAGGATTTGCAAGTGATATTCCTACCGTTGCAAACTTAGGCTGGAACTTTAAAGAGTTAGGTAATGCTAATGCTGCTATTTTTGGAGCTGACCAAGCTGGGGATCAAACCACTAACACAATGGAAGCCCTATATAATGGAGAATTTAGGTTTAACAACTATTATCTAACAATGCTGAAACATGCAGGTAAAGATAAGGGAGTAGTAATTAAGTATGGTCGCAATATGCAGTCAATCACTAGGGATGAAACAACTAGCGACACTTACAATGCAATCATGCCCTATGTTACCTATTCTCCTGAAGAACAACCACAGCCAGACGGAGAACCGTTTGATGGAAAAGCCACAGTTCAATATTTGGCTAACGGTACAATTAACCTTTTTAGTACCCCATATAAAGGACACACTCCTGTAAACAGTATCAGGAACGGCGAATACTTAAAGTTTGTTGCGAAGACTGATAAGCAAACGCTAAATAATGATACCTGGTATAAGACTGATACAGGTGGTTGGGTTGAAGCCAGTTTGATTACATTTGACAAGTCAGGTAACTATGTCGTTAACAAAGTAAATGCACAGGGAACTTTGGAAGTTTCAGATGATATTACTGGAATAATTGTAAAAAATGACGGTGTAGGTACTATTTCATATGCTGGACCGGGACAGGTACCACTTTATACCTCGCCTTTTGGCGGTCATAAGAGTGGTAAGTATTTAAACAATGGTACAAGCTATAGAATTTACTGGAAGGCTAAAGATATTAATGGGACCATTTGGTACAACTTAGGAAATAGGGATACACAATGGGTTTCATCTCAATATTTTGTTTTGTCAAAAACTGGCGATTATGCAACTGTAAAAGCATATGGTCGTTTAAGTATTAACGGAAATGTAACTGTAAGGTCTGGTCCTGGTGGAACAGGAAACGTAATTAGCTGGAATAATAAAGGTCAATATCCGATTTATGATATTTCAACTGACTATGAAGGCACTAAGTGGTATCACATTGGTCAGCAGAATGGCCATCAGCTTTGGGTTAAATCTGGCGATAATGTTAGCTTTAAAGAACCTGGAACAGTTGAATATAAAGAAGATGATGCAGCAAAAGCTAATATTAAGCAAACTGCACAAGTTCCTGTATATAGTGATCCAAGTGGTATAAGTCCAACCGGCAAATACTATAGCTTAGGTAGTTTACTAAGAATTACAGCGCAGTCAACTAGTCAAGGTAAAACCTTTTATGAAGTTGGAACTAATCAATGGATTAATTCAGATTTCTTCAGTTTCGCTCATGCCACAGATGTAGCACCAGGTGAAGATGATTCGAATGCTAAGCCTGAGGTATCAGAACAAACTTTAGAATTAGACGAAACAGTGCTAGTTTCTGAATATGCACGGATTACTAACGCACCTTTGAGAGTGCAAGCAGTAGATTTATCTTCTTATGGAATTGGTAATGATAAGAACAAGTTGCTAGCAGTTGCTAAAGCTTATATGCAAGAATACAGGATCGGTTACCCAAATATTTCGCTTACTGTTTCATATGATCAAATGCAAGGCGAGTATCAAAAATTAACTCAAGTTGACTTATATGATTATGTGAGTGTGTTATTCGATGAAGTAGGAATTTTTGAAAAAGCACAATGCACTTCCATAACTTGGGATCCTGTTAGAGAGATTGCTACCAGTATTACAATAGGCCAGTTGCCTATTAGTTATGACCATGCTTTAAACAATTTTGTCACTAATATGGTTACCAAAAATACAACGACTGCTAATAAAAGAGCAACTCACTTGTTTGGCGAATTAAAGCAAGTAATGGAAGAAAAGGACCAAGATCAAAAGGCTGGGCTACTTAAACTAACTAGGCAACTTGGTATTGATGACCAAGCTTGGCGAGATAGCTATGATCGATTGCAAAGCATGATTACTTCCATAAACACGACGGTTCAAGACGTCCACAACTGGATTGCCGGTGGTGGCGGTGGTGAAATCACTGCGTATCCTAACTGGCAGAAGCCAACTGAACTAAGAGCTTTGAGTAATGGAGGAGGTTATCTCCGATTTAATGCTGAAGGCTTGGAATACGTTGGACGCGATGGAGTTGCTAGAAGTGCTATAGACAGTCAAGGTCGGCTAATTGCTGAACGTATTACTGGTGGTACGATCACAGGTGTTAAGCTTGAAGGTATCACAGTAGATGGGGATTCTTACATTCGTTCAATTGGTGGCGATGGAAAAGTTGCAGTTATGTCGGGCGACCATGGCTTTTCTTGCACAGCACCTGGCAAAGAAAAAGTTGCTCTTGATTGGGATCAAAATTGGGGAGTATTGAGAATTGGAAATCAATATTTATATGCTTCCGACATTGCTTGGATTCGTCAACAACGAGGTGGCAGAATTCATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7022c7adc8f6664efe6d639749bd631cb07d454863340150ed1af13c7e1c1840
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2993
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50