Protein

Genbank accession
ABA47077.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNSLRYERPIESTSNTANTLVQRDADGNFAAGTITATLIGNASTAARLSSTRQIQLSTDVTASGVFDGSANLNLNAELSLVQTLPHYDGTTAPSATYTKLTVDAKGRIINAANPTTIQDYGLDTSIEGTGAQPYDADLASLAGLTTTGIIARNAPNNIVTRTITGTPSRIAINDGGGINGNPTIDLIVTAVQAGDYNTESLTSVSAVGGNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTNAVNVPIATATEGSKYPNYDAGTAYVRYDIIQNASKVYQALTSINAGAGAPTHSSGDTGSWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAALGVDNTQLQNNRIIYTDGNTIQEFELDNELTTSTAHTGFDYLNYIKINDTSGNLLFGANNTGDSGAGEIDVNVRSYFSDPDITLDGAVAQTLDKTGDGNLTFQLTQNSADARNLSILSTNAGSGTSTVTITAEDVVDIDASDANGKVHVENARFQANYIATTDATMNLDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIITLGGDTAPTTDDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTGYTDLGGHEGGYRFLHAATNTAEVFTGTDSGIIAGNVKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGAGIGQDVNIGGLLDVDGTLRVTSTSRFDDSIVLQGASKTLQLNNGSGTTRIELQSTTGNASFYGVVDITNDLNINTNKFNVASATGNTLIAGTLGITGDTTVTGATDLNSTLNVSGFTYLENTAEPQIALNSGNGEWEIQSSDYGAFRFDGGGYVEGETLFNSDIYVNGQVVQQENVSEVYNRQNYLQVRYKLRTGTSAAYNPSFATDNNSNLRVFGGAGIYQDLHIGDDLYIGKLNSGDTTEFSVLGESGNTTIGRSGAGTSSVGTLTVYGDTLLDRNLTVNGSAITLGNASSDVLTVNADATFNDDVTINGDNLMFTIEAQNGTDAFTVDSDNGNTVIAGTLNVDDATTITNTLNVTNGVDFDQTLNVDGAVDFNSTLVVDGQTTIYDSLILQSDNEVFNINTSSGATRFSVDFDNGNTNIVGTLTVGNATQLNNTLGVTGISSFTNAADQTLTGLYGADGAVRLTGGMGVAKNLAVGGNMRVYGDFEITGSTTQSGNTGFSGRVSITNTSDITSYTDNTVSLSTEGGFRAEKNAYIGGDFYIWDAANSRAAFSVDNSTGNAELHNNLIIGGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPVSNDGKDRGVEFRYYDGSAKTGFFGFDRGSQQYAFLTDTSNSSEVISGTDAALRAGSLNLTGTGTTLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTNKINNLNADLLDSMTTASAATPTTVVNRDSNGDFAANQITVNNGIGALAGIQGNATTADALRTARTITIDGVVDGSVSFDGSANVTISTVYNDADITALAAMAGTGFVSRTAANTYAQRTLQVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASASTNAANNLVIRDASGNFAANVITADLVGDVTGQVSSIANHSTTNLTEGTNLYYTTARANADFDTKLAAATTTDLTEGTNLYYTNARADARIVAAGLSAGTLTGNVTGNVTGNADTATAVSVSQSGSVGDFFVGIVANAAASGTSALRADSGMKFNTGTNILTVLGGVAANVTGNVTGNLTGNVTGDVTGNLTGNVTGDVTGNVDGNVSGEVTLEGTAPTTATDPGTAGDIRYDADYVYVCVATDTWKRSALATW
Physico‐chemical
properties
protein length:1779 AA
molecular weight: 183743,90310 Da
isoelectric point:4,10408
aromaticity:0,06464
hydropathy:-0,18072

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–242
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
ABA47077.1
1 1779
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage syn9
[NCBI] 		382359 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales >
Host Synechococcus sp. WH 8012
[NCBI] 		166313 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ABA47077.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
DQ149023 [NCBI]
CDS location
range 93673 -> 99012
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGGAGAGGTGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAACCCTACCCTCGCTCAAGGCGAATTAGGAATTGAGCTAGACACGGGTCGTATTAAGATCGGTGATGGTGTTACAGCATGGAACTCTCTTAGATATGAGAGACCTATCGAATCTACATCAAACACTGCAAATACTCTGGTCCAGAGAGACGCAGATGGTAATTTTGCAGCGGGCACAATTACTGCGACCCTGATCGGTAATGCTTCTACCGCTGCTAGATTGTCTTCGACTCGTCAAATTCAGTTATCTACTGACGTTACTGCTTCTGGTGTTTTTGACGGATCTGCAAACCTCAACCTGAATGCAGAGTTATCTTTGGTGCAAACTTTGCCTCACTACGATGGCACAACGGCACCTTCCGCAACCTACACAAAACTTACAGTTGATGCTAAAGGTAGGATTATTAATGCTGCTAATCCTACAACTATTCAAGATTATGGATTAGACACTAGCATTGAAGGCACTGGTGCTCAACCATATGATGCTGACTTGGCATCTCTTGCTGGTTTGACAACAACGGGCATCATTGCTAGAAATGCTCCTAATAATATTGTAACCCGCACGATTACTGGCACACCTAGCAGAATCGCTATTAACGATGGTGGTGGTATCAATGGCAACCCCACTATTGATCTTATTGTTACTGCAGTGCAAGCAGGTGACTACAATACAGAGTCTCTGACATCTGTATCTGCTGTTGGTGGTAATAGCGAACCTTTTGGCACAGAAACTGTAAACGCTACGAAATTTACGGTTGATGCTTATGGTAGGTTAACAAATGCTGTCAATGTGCCTATTGCTACTGCTACTGAAGGTAGTAAGTATCCTAACTATGATGCAGGGACTGCTTATGTCAGGTATGACATTATCCAAAACGCATCAAAAGTTTACCAAGCACTTACATCAATCAATGCTGGTGCTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGTGATACTGGATCATGGCGTTACCTCGCGGCTGAAGCAACAGAGCAGAAGGGACTGGCTTCATTTGCACAGGAAGATTTCGATGTTGACAGCAACGGGCACGTTACCATCGCTGCACTAGGTGTAGATAATACACAACTTCAAAACAATAGAATCATTTATACGGATGGTAACACCATTCAAGAATTTGAATTAGATAATGAGCTTACAACATCTACAGCGCATACTGGTTTTGATTATCTCAACTATATCAAAATCAATGATACGAGTGGTAATCTTCTGTTTGGCGCTAATAATACAGGGGACAGTGGCGCTGGTGAGATTGATGTCAATGTCCGTTCCTATTTTTCTGATCCTGATATTACTCTTGATGGAGCAGTTGCTCAGACATTGGATAAAACTGGGGATGGTAACCTTACCTTCCAGTTAACACAAAACTCTGCAGATGCTAGAAACCTCAGCATCCTCTCTACAAATGCTGGGTCTGGCACAAGCACAGTTACAATCACTGCAGAAGATGTTGTTGATATTGATGCATCTGATGCAAATGGTAAAGTCCATGTAGAGAATGCAAGATTCCAAGCAAATTACATCGCCACAACTGATGCGACGATGAATCTTGACCCTGGCGATGACCGTGCTGTAACTGGCACTGTCCGTGTCTGGGGTGATCTCCAAGTTGATGGCACTACCACCACTGTAAACAGTACAACCCTGCAGGTCGATGACCCCATCATTACTCTTGGTGGTGACACTGCACCTACAACTGATGACAACCTTGATAGAGGTATTGAGTTTAGATATTATGACACTGAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTGGGTATACTGATTTGGGTGGTCATGAAGGTGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTGCCGAAGTCTTTACTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAATGTAAAACTTACTACTAATACCAACTCCACTTCTAATACAACTGGTGATTTGGTTGTTGCTGGCGGTGCTGGTATTGGTCAGGACGTTAACATCGGTGGTCTTCTCGATGTCGATGGCACACTGCGTGTCACTAGCACTTCTCGTTTCGATGATAGCATCGTCCTTCAGGGTGCATCTAAGACTTTGCAACTGAATAATGGTAGTGGCACCACTCGTATTGAATTGCAATCTACCACTGGTAATGCTTCTTTCTATGGCGTTGTAGATATTACAAATGATCTCAATATTAATACTAATAAGTTTAATGTTGCTTCTGCGACTGGTAACACCCTCATAGCAGGCACACTTGGTATTACTGGAGACACAACTGTAACTGGTGCTACTGATCTTAACAGCACTTTGAATGTTTCTGGATTTACTTACCTCGAAAATACGGCAGAACCTCAGATTGCACTGAATAGTGGCAATGGTGAATGGGAGATTCAGTCTAGTGATTATGGTGCATTTAGATTTGACGGTGGTGGATATGTTGAAGGTGAGACACTTTTCAATTCTGACATTTATGTAAACGGTCAGGTTGTCCAACAGGAAAACGTCAGTGAGGTCTATAACAGACAAAACTACTTGCAGGTCCGTTATAAACTGCGGACAGGTACTTCTGCTGCTTACAATCCTAGTTTTGCAACTGACAACAACTCCAACCTGAGAGTATTTGGTGGTGCTGGTATTTACCAGGATCTTCACATTGGTGATGATCTTTATATCGGTAAACTGAATAGTGGAGACACTACAGAATTTAGTGTCCTTGGTGAGAGTGGAAATACTACAATCGGTCGCTCTGGTGCAGGCACATCATCTGTTGGCACACTGACTGTTTATGGTGATACTCTGCTTGATAGAAATCTGACAGTCAATGGATCTGCAATCACTCTGGGTAATGCAAGCAGTGATGTTTTAACGGTCAATGCTGATGCCACATTCAACGATGATGTAACTATCAACGGTGACAACCTCATGTTTACCATTGAGGCACAGAATGGCACCGATGCATTTACCGTTGACTCTGACAATGGTAATACTGTTATTGCTGGCACACTTAATGTAGATGATGCGACAACAATCACAAACACGCTCAACGTCACTAACGGCGTTGACTTTGATCAAACTCTCAATGTTGATGGTGCCGTTGATTTCAATAGCACTCTGGTTGTTGACGGTCAAACGACTATCTACGATTCTCTAATTCTTCAGAGCGACAACGAAGTATTCAATATTAATACTTCTTCTGGTGCAACTAGATTTAGTGTTGACTTTGATAACGGCAACACTAACATTGTTGGCACTCTGACGGTTGGCAATGCCACTCAACTGAATAACACTCTAGGAGTTACTGGTATATCCAGTTTCACTAATGCTGCTGACCAAACTCTCACAGGTCTCTACGGTGCTGACGGTGCTGTAAGACTCACTGGTGGTATGGGTGTTGCTAAAAACCTCGCTGTTGGCGGCAACATGCGTGTCTATGGTGACTTTGAGATTACTGGTAGCACCACACAGTCTGGTAACACTGGTTTCAGTGGTCGTGTTTCGATTACTAATACTTCTGATATCACTTCTTATACTGATAATACAGTTTCTCTATCGACAGAAGGTGGTTTCAGAGCAGAGAAGAATGCTTACATCGGTGGTGATTTCTACATCTGGGATGCTGCAAATTCTCGTGCTGCATTCTCTGTTGACAACAGCACTGGTAATGCAGAATTACACAATAACCTGATTATCGGAGGAAACCTTACTGTTAATGGCACAACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTCTGGGTGGTGACACAGCACCAGTCTCTAATGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAATTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAACTGGCTTCTTCGGATTCGACAGAGGATCCCAACAATATGCATTCCTGACCGATACATCCAATAGCTCTGAAGTTATTTCAGGCACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGTTTGAATCTGACTGGCACTGGCACTACTCTTGACGTTGATGCTAATGCCAACATCGATGGCACTCTGACCGTTGATGGTCAGATTATCTCTCAGGTTTCTTCTGGTCCTGCTCTGGTTATTCCTACAACTAATAAGATCAATAACTTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTGCAGCAACACCTACAACCGTTGTTAATAGAGATTCCAATGGAGACTTCGCCGCTAATCAAATTACAGTTAATAATGGCATTGGTGCTCTTGCTGGTATTCAAGGCAATGCTACTACTGCTGATGCACTCAGAACCGCAAGGACAATCACAATCGACGGCGTTGTTGATGGTAGTGTCTCCTTCGATGGATCTGCAAACGTAACCATCAGCACTGTCTACAACGATGCAGACATCACTGCACTCGCTGCAATGGCAGGCACTGGTTTTGTTTCTAGGACTGCTGCTAATACCTATGCACAGCGCACTCTGCAGGTTACAGCATCCTCTGGTATCACTCTAACCAATGCTGATGGTGTTTCTGGTAACCCAACCATTAACGTTGCTTCTGCAAGCACCAACGCTGCAAACAACCTTGTCATTCGTGATGCTTCTGGTAACTTTGCTGCCAATGTCATCACTGCTGATTTGGTTGGCGATGTAACTGGTCAAGTTTCCAGTATTGCAAATCACAGCACAACCAATCTGACCGAAGGCACAAACCTTTACTATACAACTGCAAGAGCAAATGCAGACTTCGATACTAAACTTGCTGCTGCAACTACAACCGATCTTACTGAAGGCACTAACCTCTACTACACAAACGCTCGTGCTGATGCAAGAATTGTTGCTGCTGGACTTAGTGCTGGCACACTAACAGGCAATGTAACTGGTAACGTAACTGGTAATGCTGATACTGCTACTGCAGTTTCTGTAAGTCAGTCTGGTAGCGTTGGTGATTTCTTTGTTGGTATTGTTGCTAATGCTGCTGCTTCAGG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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
57d5fc6b6660c098373cd2951a6237da366f2c5ba8c4e514fe5aca0c7763ef91
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5581
Evidence 0,5581
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Bacteriophage Syn9 Hendrix,R.W., Pedulla,M.L., Peebles,C.L., Pope,W., Houtz,J.M., Smith,A.L., Hatfull,G.F. and King,J.A. 1979-01 — GenBank