Protein

Genbank accession
QJQ82606.1 [GenBank]
Protein name
tail fibers protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,84
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MATTEVFYNGDNSDVTFTIPFEYLEESDVKVSVGGTLKTQDTDYTFSTLTEITFTTAPPTGVNNVRIFRDTDIDSGVRNEFFAGSAIRAQDLNDDFLQVLYSAQELEDQFVTKTDGEFDTNIDMNSNRITELGDPVNAQDAVTKQYLEDNYFDDGTETILSSETWPDNDTTIATTASIDNRVDSKIDLAITGDVLIDNSGLTKSTNAGQTTLGIGAGSVDLDRIKAADIITSSESNPDNDTTIATTAKIDDMIDAAITGDIAADSTGLSVTNDGDGTITLGITQGGVDLDRINPADVITLAEQNAGPTTDDDSIFTSSAASKRFDTLVQTGTPANSPYPVGKTWLQNDDDQTLKIWNGSAWLDVASGGSFRTQDKVIYVDKTGGDDNKTGHRISGPKLTIKEAINDINADVDTSIKTAGSGYTDATYNNVPLTGGTTGSGLTATITVSGGAVTSVTNVANSTLQEYQIGDILSAADSNLGGGGGSGFELEVTGGGDGMTVIVAAGTYQEIAPIQIKRRNVSIIGMALRSCLVHPTPATEKPASAGNSALFELNSGSFIQNLTLTGMQASNSGNNSIDSDLPDKQGWNFAFYNNAFITKSPYVQNCTNFSDSQIDNSNLNAHNPAGGQAGDLTNAPTGGGMLIDGSVPKTTSPLRSMVADSYTHVGLNGPGILVTNNGYAQCTSSYAFFNKYHIKALNGGQANLAASTTDFGEKGLVADGKSTAPIFSGQVAGAAADGDITFDVDNISAGTGWFGDDTKPASNMLVTVNSVTYPILSSTVITGGHRVTISRPNASNRSQNDGLNGAIADNAAVQFFLRSQIASSGHTMEYVGSGMDYDALPENGGVPDETKQITELNNGKVWTAITDHNGKFKIGGNQTDDPIFEVDQQLGFITIPTGSIAFDLLSDTTPQLGGDLDTNDFKITSAGNNNVHIGPHGTGKIRVDAAIITHADNDLILDPHGTGDIDASTHTIKNVVDPTNAQDAATKAYVDSTVAGIDEVVEDLTPQLGGNLDVQARTITTSTTNGPINLDPGGTGGVVVLGNEDASADNPGKVVFNCEQNSHGVTVKAPLHADIAGDNGSYSLTLPTGVPDTGGKALISTTGGVLSWGFAGGAKGGSNDQVFFENDITVTTSYSITANKNAMTAGPITINSGATVTVPSGSTWTII
Physico‐chemical
properties
protein length:1166 AA
molecular weight: 121352,07670 Da
isoelectric point:4,18843
aromaticity:0,06175
hydropathy:-0,26329

Domains

Domains [InterPro]
IPR005604
4–110
IPR005604
QJQ82606.1
1 1166
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SBP1
[NCBI] 		2735125 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QJQ82606.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MT424636.1 [NCBI]
CDS location
range 32210 -> 35710
strand +
CDS
ATGGCTACAACTGAAGTATTTTACAATGGTGACAACTCTGACGTCACCTTTACAATTCCATTTGAATATCTAGAGGAATCCGACGTTAAAGTTTCTGTCGGAGGTACCTTAAAAACTCAAGACACTGATTACACGTTTTCGACTCTTACTGAGATTACGTTTACTACTGCACCTCCAACTGGTGTAAACAACGTAAGGATCTTTAGAGATACGGACATTGATAGTGGAGTTCGCAATGAATTTTTTGCGGGCTCTGCCATCCGTGCTCAAGACCTTAATGATGACTTTTTACAGGTACTGTATTCAGCGCAAGAGCTTGAAGACCAGTTTGTAACTAAAACTGACGGTGAGTTCGATACTAACATTGATATGAACAGCAACAGGATTACCGAACTGGGTGATCCTGTTAACGCACAAGACGCTGTTACCAAGCAGTACCTGGAGGACAACTACTTTGATGATGGTACTGAAACCATCCTTAGCAGTGAAACTTGGCCTGACAACGACACTACGATTGCTACCACTGCATCTATTGATAACCGTGTTGATTCTAAAATCGACTTGGCTATCACTGGTGATGTGTTGATTGACAACTCTGGTCTTACTAAGTCTACTAATGCTGGTCAAACAACCCTTGGTATTGGTGCAGGAAGTGTTGATCTTGATAGGATTAAAGCTGCTGACATCATCACATCTAGTGAGTCTAACCCTGACAACGATACGACTATCGCTACTACGGCAAAGATCGACGACATGATCGATGCTGCTATCACTGGCGATATTGCTGCTGATAGCACAGGGTTAAGTGTTACCAACGATGGTGACGGAACCATTACTTTAGGTATTACTCAAGGTGGTGTTGATCTAGACCGTATTAACCCAGCTGACGTTATCACACTGGCAGAACAAAATGCCGGTCCTACTACAGATGACGACAGCATCTTTACTTCTAGTGCTGCTTCTAAACGGTTTGACACTTTGGTTCAAACTGGCACTCCCGCTAATTCTCCTTATCCAGTCGGTAAAACCTGGCTGCAAAACGACGACGATCAGACCCTAAAAATCTGGAACGGTTCAGCTTGGCTAGACGTTGCGTCTGGCGGTTCTTTCCGAACCCAAGACAAAGTCATCTATGTTGATAAAACTGGTGGTGATGATAACAAAACCGGTCACCGCATTAGTGGTCCTAAACTAACCATTAAAGAAGCTATCAACGACATTAACGCAGATGTTGATACGTCTATTAAAACTGCAGGTTCTGGCTACACTGACGCTACTTATAACAACGTTCCTCTTACTGGAGGTACGACTGGATCAGGACTGACCGCAACGATTACTGTTTCTGGTGGCGCAGTTACTTCAGTCACTAACGTTGCTAACTCTACGTTGCAAGAGTATCAAATTGGTGACATTTTGTCTGCTGCTGACTCTAACCTTGGCGGTGGCGGTGGTTCTGGCTTTGAGTTGGAAGTGACCGGTGGTGGCGATGGTATGACCGTTATTGTGGCTGCTGGCACCTACCAAGAGATTGCACCTATCCAAATTAAACGTCGTAACGTTTCTATTATCGGCATGGCGTTGCGTAGCTGTCTTGTGCATCCTACGCCTGCAACTGAAAAACCTGCATCTGCTGGTAACTCTGCGCTGTTTGAGTTGAACAGTGGTTCGTTTATTCAGAACCTGACGTTGACTGGTATGCAAGCCAGTAACTCCGGTAACAACAGTATTGACTCTGATCTGCCTGATAAGCAAGGCTGGAACTTTGCGTTCTATAACAACGCATTTATTACTAAGTCGCCTTACGTTCAGAACTGTACTAATTTCTCTGACAGCCAGATTGACAACAGCAACCTTAATGCACACAACCCTGCTGGTGGACAAGCTGGTGACCTTACCAACGCTCCTACCGGTGGCGGTATGTTAATTGACGGCTCTGTGCCTAAGACCACAAGTCCTTTGCGGTCGATGGTTGCAGACAGCTATACCCACGTTGGTCTTAACGGACCTGGCATCCTTGTTACTAACAATGGTTACGCACAGTGTACATCTAGCTACGCCTTCTTTAACAAGTATCATATCAAAGCACTGAATGGTGGTCAAGCCAACCTGGCTGCGTCTACCACTGACTTTGGTGAGAAAGGATTGGTTGCTGATGGTAAGTCTACTGCGCCTATCTTTAGCGGACAGGTTGCAGGTGCTGCTGCCGATGGAGATATTACGTTTGACGTAGATAACATTTCTGCAGGCACTGGTTGGTTCGGTGATGACACCAAACCGGCAAGTAATATGCTTGTTACTGTTAACAGCGTAACCTATCCTATTCTGTCGTCTACTGTTATTACTGGCGGACATAGGGTTACAATTAGTCGTCCTAACGCTAGCAATCGTAGTCAAAACGATGGCCTTAATGGTGCTATCGCTGACAACGCTGCTGTACAGTTCTTCCTTCGTTCTCAGATTGCTTCTAGCGGTCACACGATGGAGTACGTCGGTAGCGGTATGGATTATGATGCACTGCCTGAAAATGGTGGTGTGCCGGATGAAACCAAACAGATTACTGAACTAAACAACGGTAAGGTTTGGACTGCTATCACTGATCACAACGGTAAGTTTAAGATTGGTGGTAACCAAACTGATGACCCAATCTTTGAGGTAGACCAACAGCTTGGTTTCATTACCATTCCTACTGGCTCTATTGCCTTTGACTTGTTGTCGGATACGACTCCACAGCTTGGTGGTGACTTAGACACCAACGACTTTAAGATTACCAGTGCAGGTAACAACAACGTCCACATCGGACCACACGGCACAGGTAAGATTAGGGTTGATGCAGCAATCATCACTCACGCTGACAACGACCTTATCCTTGATCCGCACGGTACTGGTGATATTGATGCTAGTACTCACACGATTAAAAACGTTGTTGACCCAACCAATGCACAAGACGCTGCAACTAAAGCATACGTTGATAGCACAGTCGCTGGTATTGACGAGGTTGTAGAAGACCTTACACCTCAACTTGGTGGTAATCTTGATGTTCAAGCTAGAACCATCACTACCAGCACTACTAACGGTCCTATTAACCTTGATCCAGGCGGTACTGGTGGTGTTGTAGTTCTTGGTAACGAAGACGCAAGTGCTGATAACCCAGGTAAAGTTGTATTTAATTGTGAACAGAATAGCCACGGTGTAACCGTTAAAGCACCGCTTCATGCAGATATTGCAGGTGATAATGGTTCTTACAGTTTAACTCTTCCTACAGGCGTACCAGACACAGGTGGTAAAGCCCTTATTTCTACCACTGGTGGTGTTTTAAGCTGGGGCTTTGCAGGTGGTGCAAAAGGTGGTTCTAATGATCAAGTTTTCTTTGAAAACGATATAACTGTAACCACTAGCTACAGCATTACTGCAAACAAAAACGCAATGACTGCTGGTCCTATTACTATTAATAGCGGTGCAACTGTTACCGTACCTTCTGGCTCTACCTGGACTATTATTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
ae602a8544f46e880b8cd13b4391158252930dc6f4ed6ac889cc03c45ee22b29
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5823
Evidence 0,5823
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Programmed transcriptomes of a marine cyanopodovirus and its Synechococcus host during infection Huang,S. 2020-12-30 — GenBank