Protein

Genbank accession
AMO43115.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MPAINVAKSDTFEIQRQKINQIGSQIFSISQGGSDLSTGNLKLGDGSVGDPSLSFINDTKLGIYKSGIGSIGFVSSDKKILDFEPSSVISYQDFIVRRSSLISSGLNVLDPGSGYDEGIFTNVRVTGGTGQSALATVSVVGFSGTVTSVGENYTEGSWSASLTGGTGTGAVMSFVVPGIVGDINNAGSGYNSGTYINVPFTTVSGSGANGRATVTVTGSPTLSANITNAGTGLSDGDYISTALLNVPTTTFTVATTANPNTPPPDNIFTIDGSNNPTLNLVEGNTYHFLIGDPTVEGHPFEFADVNGGALNTNAFVITKYGSEGVPNSLVELVVKPNATYYGTEIQYYCTNHDNMGNTITIGTGSSGNYGSGATANITVAGGVVTVFTFDATGNDYFVNDNLTAFGPTLFATSPTTGVFQVSTATYNGVVSSVLPISAGSNYDNGDVLSVSQANLGGFGSGFEYTLNVDPGSVSDITFSSYGSGYSSSDVLSLPPEQTGAATIINDEGTFIVNVPTLSTLNVANGYLISGNLIPAGTVIGGFDPVTGDISISTTPTGTGSTTLTFTPPWGYQTGVDAWSYTVNSNGVVNTVTITEGGVGYSLDDTISLSSVELTTPITLVVTAGDIQELTFSPAVSSASISVGDSIKIPDGNIEGYDITTVTVTGSSGEFVEVSPSSTSGSGTGATFTVTRGDGGDAGPLGEVVGVDIVSTGVGYNVDDTVTLPGSQVGGSTPADNIVLTITAVTTNPESVVHSVSSNGGFITSILVDGIGFVATNNVVISGTTSPEFTIGTASTATKRFFVDGVLQDSLTLYSGNTYNFDYSSPTVISNDILFKLSKTEDGSFYTVENLTTTLTLGSTVFSVSDTSQLSIGMGISVAFGEGAFPSGTTITAINGNDITASSPVSVAGSATLLFAGTEYTEGVSIVSNILSISINETTPNLFYYSSAASNAGGSLTIDLNNPKTFGSGFSAQVTSLDLEDVFTAGVTDGSLNVSTLEVATTATINDGTFTTSVSSPAASITTLTATNIQNTTGPITVTTSSTNFVSDVTIGTLISVEQSTGNIQTAGELKTTSSLNINDLLFIENNQIKSTPGTSIEIKPGSTSDVTVVKSETALAIPAGTEAQKPSIAKNGYIRFNTDINQYEGFSETNSSWSSLGGIRDLDGNTTILAEETVGANDNTLWFINDDINTLKVSPQYLEFVNLKKVRSTNISAPTYINWAANSPVTAGQYLKYRNNIYEVVSGGSTGTSGAEPVDVTGDNFTNGSATLRYFTTAVAPLTFEEISEVRIDPLGFTDLVVNGELRFSNNEISSTVNDIIIKPTGTQKVVVQGTSSLVVPVGDNNSKGNPAQGSIRYSTTDAQFEGFNGTQWGGLGGVKDVDQDTKIDAETGPGNDEDILYFFNAGSNTLRLTTTGLLFDTIDTIESAGSGNLNLNASLVTFNNLETSIDNSSSTVTKISTTKDNLDFAIATGINNDHLLRLNDTGEVIYNLGFGTGTPDNLIVLNNTLTTLELKHAKINTSRLLLEKGTLNSANATVYSTSTEASAKVFVTAYNTTTGDKEVVEFSVINNGSDIFFTDTNNLKTGADIFSSSFDFDPLNNVRITIVLSDELTTGDEVEVTVIKNITKR
Physico‐chemical
properties
protein length:1626 AA
molecular weight: 168359,75160 Da
isoelectric point:4,05872
aromaticity:0,07811
hydropathy:0,00935

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM32
[NCBI] 		1278479 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMO43115.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU594606 [NCBI]
CDS location
range 89714 -> 94594
strand +
CDS
ATGCCAGCAATTAACGTCGCTAAATCAGACACCTTTGAAATTCAAAGGCAAAAAATTAACCAGATTGGATCGCAAATTTTTAGCATCTCTCAGGGTGGAAGTGATCTATCTACTGGCAACTTAAAATTAGGAGATGGTTCTGTTGGCGACCCATCTCTATCTTTTATCAATGACACAAAACTTGGAATATACAAATCTGGGATAGGAAGTATTGGATTTGTTAGTTCTGACAAAAAAATTCTTGATTTTGAACCATCTTCTGTAATTTCATATCAAGACTTTATTGTAAGAAGAAGTAGTCTTATTAGTTCTGGTTTAAATGTCTTAGATCCTGGATCTGGATATGATGAGGGCATTTTTACAAATGTACGTGTTACTGGTGGTACAGGACAAAGTGCTTTAGCTACAGTAAGTGTCGTTGGATTTAGTGGAACTGTTACCTCAGTTGGAGAAAACTATACTGAAGGATCTTGGTCCGCTTCTTTGACTGGAGGAACGGGAACTGGTGCTGTAATGTCTTTCGTAGTTCCAGGTATTGTGGGCGATATTAATAATGCTGGTTCTGGTTATAACTCTGGTACTTACATTAATGTTCCGTTTACTACGGTAAGTGGTTCTGGAGCAAATGGTAGAGCTACTGTTACAGTTACAGGATCTCCAACATTATCGGCAAATATTACTAATGCTGGAACTGGTCTTTCAGATGGTGATTATATTTCTACCGCTTTACTTAATGTACCAACAACTACATTTACTGTAGCGACAACTGCTAATCCAAATACGCCTCCCCCTGATAATATTTTTACTATCGATGGATCTAACAATCCTACATTAAATTTAGTTGAGGGTAATACATATCATTTTCTAATTGGAGATCCTACGGTTGAGGGTCACCCTTTTGAATTTGCTGATGTAAATGGAGGTGCTTTAAATACCAACGCTTTTGTAATTACAAAATATGGATCCGAAGGAGTACCAAATTCTCTCGTTGAATTAGTTGTAAAACCAAATGCCACTTATTATGGCACTGAAATTCAATATTATTGTACCAATCACGATAATATGGGCAATACCATTACTATTGGTACTGGATCATCTGGAAATTATGGATCTGGAGCAACTGCTAATATTACCGTTGCTGGTGGAGTAGTAACAGTATTTACATTCGACGCTACTGGAAATGATTATTTTGTTAATGATAACCTTACTGCTTTTGGTCCTACTCTTTTTGCCACCAGTCCAACAACAGGTGTTTTCCAAGTAAGTACCGCTACTTATAATGGTGTGGTATCATCTGTCCTTCCAATTAGTGCTGGATCTAATTATGACAATGGAGATGTTCTCTCTGTATCTCAAGCAAATTTGGGTGGATTTGGTAGTGGATTTGAATATACTCTAAATGTTGATCCTGGATCTGTCTCGGATATTACATTTTCCAGTTATGGTTCTGGATATAGTAGTTCGGATGTGTTGTCTCTACCTCCAGAACAAACGGGAGCAGCAACTATTATAAATGATGAAGGAACTTTTATAGTTAACGTTCCTACATTGTCTACATTAAATGTAGCAAATGGTTATCTCATAAGCGGTAATCTTATTCCTGCTGGAACTGTTATTGGTGGATTCGATCCAGTAACAGGAGATATTAGTATATCAACAACTCCTACTGGAACAGGAAGCACCACTTTAACATTCACTCCACCATGGGGATATCAAACTGGTGTTGATGCTTGGTCATACACAGTAAATAGCAATGGTGTAGTAAATACAGTAACTATTACTGAAGGTGGAGTTGGATATTCTTTAGATGATACCATTTCCTTATCATCTGTAGAACTTACTACGCCGATTACTCTGGTAGTAACAGCAGGAGATATTCAAGAATTAACATTTAGTCCTGCCGTTTCTTCTGCATCAATTTCTGTTGGAGATTCTATTAAAATTCCAGACGGAAATATTGAAGGATATGATATTACAACTGTAACTGTTACTGGAAGCAGTGGAGAATTTGTTGAGGTTTCTCCAAGTTCAACATCTGGTTCTGGAACAGGAGCAACATTTACTGTAACAAGAGGAGATGGTGGTGACGCTGGACCTTTAGGAGAAGTAGTCGGCGTTGATATTGTCTCTACTGGAGTTGGTTATAACGTCGATGATACGGTAACTCTTCCTGGAAGTCAAGTTGGTGGATCCACACCTGCCGATAATATTGTCCTCACTATTACTGCAGTTACTACAAATCCAGAATCAGTTGTTCATAGTGTATCTTCTAATGGAGGATTTATTACATCAATTTTAGTAGATGGAATTGGATTTGTCGCGACAAATAACGTAGTCATTAGTGGTACAACTTCCCCAGAATTTACTATCGGTACTGCCAGTACAGCTACTAAAAGATTTTTTGTTGATGGTGTATTACAAGATTCATTAACGCTATATTCTGGAAATACTTACAATTTTGATTATTCATCCCCAACAGTTATTAGTAATGACATTTTATTCAAATTAAGTAAAACAGAAGACGGTTCTTTTTATACTGTAGAAAACCTCACAACTACTTTAACTTTAGGAAGCACAGTATTTTCTGTATCTGATACTTCACAACTGTCCATTGGAATGGGAATTTCAGTAGCTTTTGGTGAGGGAGCATTCCCATCTGGAACTACAATTACTGCTATAAATGGAAATGATATTACCGCAAGCTCACCAGTTTCTGTTGCTGGAAGTGCTACCTTATTGTTTGCTGGTACAGAGTATACGGAAGGAGTTTCTATTGTAAGTAATATTTTGTCAATTTCTATCAATGAAACTACCCCAAATCTATTTTATTATTCATCTGCTGCGAGCAATGCTGGCGGATCATTAACTATAGATTTAAACAACCCAAAGACTTTTGGTAGTGGATTTTCTGCTCAAGTAACATCTTTGGATTTAGAAGATGTATTTACGGCGGGCGTTACTGATGGTAGTTTAAATGTATCAACTCTGGAAGTTGCTACAACCGCAACAATTAATGATGGAACGTTTACTACATCGGTATCTTCACCAGCTGCATCAATTACTACTTTAACAGCAACAAATATCCAGAATACAACTGGACCGATTACTGTTACCACTTCCTCCACAAATTTTGTTTCTGATGTTACTATCGGAACTTTAATTTCAGTAGAGCAATCTACTGGAAATATTCAAACTGCTGGTGAGTTAAAAACTACATCATCTTTAAACATTAACGACCTACTCTTTATTGAAAATAATCAGATTAAGTCAACTCCTGGTACAAGCATCGAAATCAAACCAGGATCTACCAGTGATGTCACAGTTGTAAAATCAGAAACTGCTCTTGCTATTCCAGCAGGAACAGAAGCACAAAAACCATCAATTGCTAAGAATGGATACATTCGTTTTAATACTGATATCAATCAATACGAAGGATTTAGTGAAACTAATTCTTCCTGGTCGTCATTGGGAGGAATTCGAGATCTTGATGGCAACACTACTATTCTTGCCGAAGAAACGGTAGGAGCAAATGATAACACTCTTTGGTTTATCAACGACGATATTAACACTTTAAAAGTAAGTCCACAATACTTAGAGTTTGTCAATTTAAAGAAAGTTAGATCTACTAATATATCTGCTCCTACCTATATTAATTGGGCAGCAAATTCTCCTGTAACTGCTGGACAGTATTTAAAGTACAGAAATAATATTTACGAAGTTGTTAGTGGAGGATCAACAGGAACTTCTGGTGCCGAGCCAGTAGATGTTACTGGAGATAATTTTACTAACGGATCTGCTACACTTAGATATTTTACAACAGCAGTAGCACCACTAACTTTCGAAGAAATTTCAGAAGTAAGAATTGATCCTCTTGGATTCACGGATTTGGTGGTAAATGGAGAACTTCGTTTCTCGAATAACGAAATTTCTTCTACAGTAAATGATATCATTATTAAACCAACTGGAACCCAAAAAGTAGTAGTTCAAGGAACATCTTCTTTAGTTGTCCCAGTAGGTGACAATAACTCAAAAGGAAATCCTGCTCAAGGTTCCATTAGATATAGCACAACTGATGCTCAGTTTGAAGGATTTAATGGTACTCAATGGGGTGGACTTGGCGGCGTAAAAGACGTTGATCAAGATACAAAAATCGATGCTGAAACTGGTCCTGGTAATGATGAGGATATTCTATACTTCTTCAATGCTGGAAGTAATACTTTAAGATTGACAACCACTGGATTACTGTTTGATACTATCGACACTATAGAATCTGCTGGTAGTGGCAATTTGAATTTAAATGCTTCTTTAGTCACATTTAATAATTTAGAAACTTCTATTGATAATAGTAGTTCTACGGTTACAAAGATTTCAACCACTAAAGATAATTTAGACTTTGCTATTGCCACAGGTATCAATAATGATCACCTCTTAAGGTTGAATGATACTGGAGAAGTAATTTATAACTTAGGATTTGGCACTGGTACGCCAGATAATCTGATTGTATTAAATAACACGTTAACTACTTTAGAATTAAAACACGCTAAGATAAACACTTCCCGACTTTTATTAGAAAAAGGAACTCTAAATAGTGCCAACGCTACAGTATATTCCACATCAACAGAAGCTTCTGCTAAGGTATTTGTAACTGCTTACAATACTACAACAGGAGACAAAGAAGTTGTAGAATTTTCTGTTATTAATAACGGAAGTGATATTTTCTTCACTGATACCAATAACTTAAAAACAGGAGCAGATATATTTTCCTCAAGTTTTGACTTTGATCCATTAAATAATGTACGTATTACTATTGTTTTAAGTGATGAATTAACAACAGGCGATGAGGTAGAGGTTACTGTTATTAAAAACATCACCAAGAGGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
7b1005d9c02a6c4c25b68e6817003da7639ffe24e2efef11e8f1182cae111754
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7864
Evidence 0,7864
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
The genomic content and context of auxiliary metabolic genes in marine cyanophages Marston,M.F., Martiny,J.B.H. and Crummett,L.T. 2016-12 — GenBank