Protein

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Genbank accession
AMO43115.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,84
Protein sequence
MPAINVAKSDTFEIQRQKINQIGSQIFSISQGGSDLSTGNLKLGDGSVGDPSLSFINDTKLGIYKSGIGSIGFVSSDKKILDFEPSSVISYQDFIVRRSSLISSGLNVLDPGSGYDEGIFTNVRVTGGTGQSALATVSVVGFSGTVTSVGENYTEGSWSASLTGGTGTGAVMSFVVPGIVGDINNAGSGYNSGTYINVPFTTVSGSGANGRATVTVTGSPTLSANITNAGTGLSDGDYISTALLNVPTTTFTVATTANPNTPPPDNIFTIDGSNNPTLNLVEGNTYHFLIGDPTVEGHPFEFADVNGGALNTNAFVITKYGSEGVPNSLVELVVKPNATYYGTEIQYYCTNHDNMGNTITIGTGSSGNYGSGATANITVAGGVVTVFTFDATGNDYFVNDNLTAFGPTLFATSPTTGVFQVSTATYNGVVSSVLPISAGSNYDNGDVLSVSQANLGGFGSGFEYTLNVDPGSVSDITFSSYGSGYSSSDVLSLPPEQTGAATIINDEGTFIVNVPTLSTLNVANGYLISGNLIPAGTVIGGFDPVTGDISISTTPTGTGSTTLTFTPPWGYQTGVDAWSYTVNSNGVVNTVTITEGGVGYSLDDTISLSSVELTTPITLVVTAGDIQELTFSPAVSSASISVGDSIKIPDGNIEGYDITTVTVTGSSGEFVEVSPSSTSGSGTGATFTVTRGDGGDAGPLGEVVGVDIVSTGVGYNVDDTVTLPGSQVGGSTPADNIVLTITAVTTNPESVVHSVSSNGGFITSILVDGIGFVATNNVVISGTTSPEFTIGTASTATKRFFVDGVLQDSLTLYSGNTYNFDYSSPTVISNDILFKLSKTEDGSFYTVENLTTTLTLGSTVFSVSDTSQLSIGMGISVAFGEGAFPSGTTITAINGNDITASSPVSVAGSATLLFAGTEYTEGVSIVSNILSISINETTPNLFYYSSAASNAGGSLTIDLNNPKTFGSGFSAQVTSLDLEDVFTAGVTDGSLNVSTLEVATTATINDGTFTTSVSSPAASITTLTATNIQNTTGPITVTTSSTNFVSDVTIGTLISVEQSTGNIQTAGELKTTSSLNINDLLFIENNQIKSTPGTSIEIKPGSTSDVTVVKSETALAIPAGTEAQKPSIAKNGYIRFNTDINQYEGFSETNSSWSSLGGIRDLDGNTTILAEETVGANDNTLWFINDDINTLKVSPQYLEFVNLKKVRSTNISAPTYINWAANSPVTAGQYLKYRNNIYEVVSGGSTGTSGAEPVDVTGDNFTNGSATLRYFTTAVAPLTFEEISEVRIDPLGFTDLVVNGELRFSNNEISSTVNDIIIKPTGTQKVVVQGTSSLVVPVGDNNSKGNPAQGSIRYSTTDAQFEGFNGTQWGGLGGVKDVDQDTKIDAETGPGNDEDILYFFNAGSNTLRLTTTGLLFDTIDTIESAGSGNLNLNASLVTFNNLETSIDNSSSTVTKISTTKDNLDFAIATGINNDHLLRLNDTGEVIYNLGFGTGTPDNLIVLNNTLTTLELKHAKINTSRLLLEKGTLNSANATVYSTSTEASAKVFVTAYNTTTGDKEVVEFSVINNGSDIFFTDTNNLKTGADIFSSSFDFDPLNNVRITIVLSDELTTGDEVEVTVIKNITKR
Physico‐chemical
properties
protein length:1626 AA
molecular weight: 168359,75160 Da
isoelectric point:4,05872
aromaticity:0,07811
hydropathy:0,00935

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Cyanophage S-RIM32
[NCBI] 		1278479 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Bristolvirus > Bristolvirus rhodeisland
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AMO43115.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU594606 [NCBI]
CDS location
range 89714 -> 94594
strand +
CDS
ATGCCAGCAATTAACGTCGCTAAATCAGACACCTTTGAAATTCAAAGGCAAAAAATTAACCAGATTGGATCGCAAATTTTTAGCATCTCTCAGGGTGGAAGTGATCTATCTACTGGCAACTTAAAATTAGGAGATGGTTCTGTTGGCGACCCATCTCTATCTTTTATCAATGACACAAAACTTGGAATATACAAATCTGGGATAGGAAGTATTGGATTTGTTAGTTCTGACAAAAAAATTCTTGATTTTGAACCATCTTCTGTAATTTCATATCAAGACTTTATTGTAAGAAGAAGTAGTCTTATTAGTTCTGGTTTAAATGTCTTAGATCCTGGATCTGGATATGATGAGGGCATTTTTACAAATGTACGTGTTACTGGTGGTACAGGACAAAGTGCTTTAGCTACAGTAAGTGTCGTTGGATTTAGTGGAACTGTTACCTCAGTTGGAGAAAACTATACTGAAGGATCTTGGTCCGCTTCTTTGACTGGAGGAACGGGAACTGGTGCTGTAATGTCTTTCGTAGTTCCAGGTATTGTGGGCGATATTAATAATGCTGGTTCTGGTTATAACTCTGGTACTTACATTAATGTTCCGTTTACTACGGTAAGTGGTTCTGGAGCAAATGGTAGAGCTACTGTTACAGTTACAGGATCTCCAACATTATCGGCAAATATTACTAATGCTGGAACTGGTCTTTCAGATGGTGATTATATTTCTACCGCTTTACTTAATGTACCAACAACTACATTTACTGTAGCGACAACTGCTAATCCAAATACGCCTCCCCCTGATAATATTTTTACTATCGATGGATCTAACAATCCTACATTAAATTTAGTTGAGGGTAATACATATCATTTTCTAATTGGAGATCCTACGGTTGAGGGTCACCCTTTTGAATTTGCTGATGTAAATGGAGGTGCTTTAAATACCAACGCTTTTGTAATTACAAAATATGGATCCGAAGGAGTACCAAATTCTCTCGTTGAATTAGTTGTAAAACCAAATGCCACTTATTATGGCACTGAAATTCAATATTATTGTACCAATCACGATAATATGGGCAATACCATTACTATTGGTACTGGATCATCTGGAAATTATGGATCTGGAGCAACTGCTAATATTACCGTTGCTGGTGGAGTAGTAACAGTATTTACATTCGACGCTACTGGAAATGATTATTTTGTTAATGATAACCTTACTGCTTTTGGTCCTACTCTTTTTGCCACCAGTCCAACAACAGGTGTTTTCCAAGTAAGTACCGCTACTTATAATGGTGTGGTATCATCTGTCCTTCCAATTAGTGCTGGATCTAATTATGACAATGGAGATGTTCTCTCTGTATCTCAAGCAAATTTGGGTGGATTTGGTAGTGGATTTGAATATACTCTAAATGTTGATCCTGGATCTGTCTCGGATATTACATTTTCCAGTTATGGTTCTGGATATAGTAGTTCGGATGTGTTGTCTCTACCTCCAGAACAAACGGGAGCAGCAACTATTATAAATGATGAAGGAACTTTTATAGTTAACGTTCCTACATTGTCTACATTAAATGTAGCAAATGGTTATCTCATAAGCGGTAATCTTATTCCTGCTGGAACTGTTATTGGTGGATTCGATCCAGTAACAGGAGATATTAGTATATCAACAACTCCTACTGGAACAGGAAGCACCACTTTAACATTCACTCCACCATGGGGATATCAAACTGGTGTTGATGCTTGGTCATACACAGTAAATAGCAATGGTGTAGTAAATACAGTAACTATTACTGAAGGTGGAGTTGGATATTCTTTAGATGATACCATTTCCTTATCATCTGTAGAACTTACTACGCCGATTACTCTGGTAGTAACAGCAGGAGATATTCAAGAATTAACATTTAGTCCTGCCGTTTCTTCTGCATCAATTTCTGTTGGAGATTCTATTAAAATTCCAGACGGAAATATTGAAGGATATGATATTACAACTGTAACTGTTACTGGAAGCAGTGGAGAATTTGTTGAGGTTTCTCCAAGTTCAACATCTGGTTCTGGAACAGGAGCAACATTTACTGTAACAAGAGGAGATGGTGGTGACGCTGGACCTTTAGGAGAAGTAGTCGGCGTTGATATTGTCTCTACTGGAGTTGGTTATAACGTCGATGATACGGTAACTCTTCCTGGAAGTCAAGTTGGTGGATCCACACCTGCCGATAATATTGTCCTCACTATTACTGCAGTTACTACAAATCCAGAATCAGTTGTTCATAGTGTATCTTCTAATGGAGGATTTATTACATCAATTTTAGTAGATGGAATTGGATTTGTCGCGACAAATAACGTAGTCATTAGTGGTACAACTTCCCCAGAATTTACTATCGGTACTGCCAGTACAGCTACTAAAAGATTTTTTGTTGATGGTGTATTACAAGATTCATTAACGCTATATTCTGGAAATACTTACAATTTTGATTATTCATCCCCAACAGTTATTAGTAATGACATTTTATTCAAATTAAGTAAAACAGAAGACGGTTCTTTTTATACTGTAGAAAACCTCACAACTACTTTAACTTTAGGAAGCACAGTATTTTCTGTATCTGATACTTCACAACTGTCCATTGGAATGGGAATTTCAGTAGCTTTTGGTGAGGGAGCATTCCCATCTGGAACTACAATTACTGCTATAAATGGAAATGATATTACCGCAAGCTCACCAGTTTCTGTTGCTGGAAGTGCTACCTTATTGTTTGCTGGTACAGAGTATACGGAAGGAGTTTCTATTGTAAGTAATATTTTGTCAATTTCTATCAATGAAACTACCCCAAATCTATTTTATTATTCATCTGCTGCGAGCAATGCTGGCGGATCATTAACTATAGATTTAAACAACCCAAAGACTTTTGGTAGTGGATTTTCTGCTCAAGTAACATCTTTGGATTTAGAAGATGTATTTACGGCGGGCGTTACTGATGGTAGTTTAAATGTATCAACTCTGGAAGTTGCTACAACCGCAACAATTAATGATGGAACGTTTACTACATCGGTATCTTCACCAGCTGCATCAATTACTACTTTAACAGCAACAAATATCCAGAATACAACTGGACCGATTACTGTTACCACTTCCTCCACAAATTTTGTTTCTGATGTTACTATCGGAACTTTAATTTCAGTAGAGCAATCTACTGGAAATATTCAAACTGCTGGTGAGTTAAAAACTACATCATCTTTAAACATTAACGACCTACTCTTTATTGAAAATAATCAGATTAAGTCAACTCCTGGTACAAGCATCGAAATCAAACCAGGATCTACCAGTGATGTCACAGTTGTAAAATCAGAAACTGCTCTTGCTATTCCAGCAGGAACAGAAGCACAAAAACCATCAATTGCTAAGAATGGATACATTCGTTTTAATACTGATATCAATCAATACGAAGGATTTAGTGAAACTAATTCTTCCTGGTCGTCATTGGGAGGAATTCGAGATCTTGATGGCAACACTACTATTCTTGCCGAAGAAACGGTAGGAGCAAATGATAACACTCTTTGGTTTATCAACGACGATATTAACACTTTAAAAGTAAGTCCACAATACTTAGAGTTTGTCAATTTAAAGAAAGTTAGATCTACTAATATATCTGCTCCTACCTATATTAATTGGGCAGCAAATTCTCCTGTAACTGCTGGACAGTATTTAAAGTACAGAAATAATATTTACGAAGTTGTTAGTGGAGGATCAACAGGAACTTCTGGTGCCGAGCCAGTAGATGTTACTGGAGATAATTTTACTAACGGATCTGCTACACTTAGATATTTTACAACAGCAGTAGCACCACTAACTTTCGAAGAAATTTCAGAAGTAAGAATTGATCCTCTTGGATTCACGGATTTGGTGGTAAATGGAGAACTTCGTTTCTCGAATAACGAAATTTCTTCTACAGTAAATGATATCATTATTAAACCAACTGGAACCCAAAAAGTAGTAGTTCAAGGAACATCTTCTTTAGTTGTCCCAGTAGGTGACAATAACTCAAAAGGAAATCCTGCTCAAGGTTCCATTAGATATAGCACAACTGATGCTCAGTTTGAAGGATTTAATGGTACTCAATGGGGTGGACTTGGCGGCGTAAAAGACGTTGATCAAGATACAAAAATCGATGCTGAAACTGGTCCTGGTAATGATGAGGATATTCTATACTTCTTCAATGCTGGAAGTAATACTTTAAGATTGACAACCACTGGATTACTGTTTGATACTATCGACACTATAGAATCTGCTGGTAGTGGCAATTTGAATTTAAATGCTTCTTTAGTCACATTTAATAATTTAGAAACTTCTATTGATAATAGTAGTTCTACGGTTACAAAGATTTCAACCACTAAAGATAATTTAGACTTTGCTATTGCCACAGGTATCAATAATGATCACCTCTTAAGGTTGAATGATACTGGAGAAGTAATTTATAACTTAGGATTTGGCACTGGTACGCCAGATAATCTGATTGTATTAAATAACACGTTAACTACTTTAGAATTAAAACACGCTAAGATAAACACTTCCCGACTTTTATTAGAAAAAGGAACTCTAAATAGTGCCAACGCTACAGTATATTCCACATCAACAGAAGCTTCTGCTAAGGTATTTGTAACTGCTTACAATACTACAACAGGAGACAAAGAAGTTGTAGAATTTTCTGTTATTAATAACGGAAGTGATATTTTCTTCACTGATACCAATAACTTAAAAACAGGAGCAGATATATTTTCCTCAAGTTTTGACTTTGATCCATTAAATAATGTACGTATTACTATTGTTTTAAGTGATGAATTAACAACAGGCGATGAGGTAGAGGTTACTGTTATTAAAAACATCACCAAGAGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7b1005d9c02a6c4c25b68e6817003da7639ffe24e2efef11e8f1182cae111754
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7899
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The genomic content and context of auxiliary metabolic genes in marine cyanophages Marston,M.F., Martiny,J.B.H. and Crummett,L.T. 2016-12 — GenBank