Protein

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Genbank accession
XYM57949.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANFKKVFNFREGVQVDDQTFVVNGSLVGIGTSVPEKFLDVRRDATFTGLTTFTEVVISAGATFETGITSVQIGRFAFNDGIVSAATGVVTFLGDGSQLSDLPTSQWVDVDTGIGVSSVYNGGNVGIATLVPRFQLQIGGDPEPPTSADGVGIRQGNIYMSGVITATRYYGDAANLTNLNADELTAGIVTQARIPRLELDKIPLIPDYKLEQNLQISGILTAGGGFIGSLVGDVEGNVIANSGFSTFNDGEFKGTLTAVASTARTLTGTPDIRVGFVSANIIDAGIALTVNRANMTGDVSVGILTVTGESLRVGTGGSIFNVTEGAIGIGTTLPQSTLVLYQQEGTNLEILTETGAATLNLGGDLGIGQSTAELRQEDLRFELSNYSNGDYIYHLGRELSVGSVNGAFRWLKGDPVNEMMTLTKDGNLGLGITAPGKKLVVTGDTDLDGTLLVTGKTEIDDDVIIYGNLTYNALSGVTTAFDLDVSGSLNVTSDIIASGIATFPNVGFLVQNAGVSTFPTLDVTGGLGVAGIATFGTLIIPDNTNLFTNSGISTFSDLRVTGDLSLDGNTFNYETTTGITTVNNFNITGFVTFAEAPNFNLNISSGISTLQALNVQGSLSVGGTATFGSVVIDDLVFTNTLGVTTIRSIDVDTDVNVGGALTVTGDAEFQGAVILPSDLEINFISGISTFFDLDVTNNLYAGGISSIREINTDITFSGTTQQIGTGLTIGTAGAEIDLASVIRFSDVSGKIGFNTAQPSSAIDVGMRTDTSIIFPRMTTTQRDSLEDAALEGSVIYNTSTSAHEGYDGSSWTELNYQPPASPGWTALETYTTAGRNALTGMPTGAIIYNTTLSQVEVYNGSNWVAV
Physico‐chemical
properties
protein length:866 AA
molecular weight: 90194,29720 Da
isoelectric point:4,08754
aromaticity:0,07621
hydropathy:0,15670

Domains

Domains [InterPro]
DC_2204
STR
110–189
DC_2204 DC_0034 DC_1884 DC_1884
IPR059888
RBD
751–816
IPR059888
XYM57949.1
1 866
Architecture
STR
STR
STR
STR 110-189 | STR 381-557 | STR 684-866
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH5
[NCBI] 		3413215 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57949.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340852 [NCBI]
CDS location
range 21734 -> 24334
strand +
CDS
ATGGCAAATTTCAAGAAGGTATTTAACTTTAGGGAAGGTGTTCAGGTTGATGACCAAACCTTCGTGGTCAATGGTTCCCTAGTTGGTATTGGAACCTCAGTTCCTGAGAAGTTCCTAGATGTTAGGCGAGATGCAACTTTCACGGGTTTAACAACCTTTACGGAAGTTGTTATCTCTGCTGGTGCAACCTTTGAGACTGGTATCACTAGTGTCCAGATTGGACGATTTGCCTTTAACGATGGCATTGTATCTGCTGCAACTGGTGTTGTAACATTCCTGGGAGATGGTTCTCAACTATCAGATCTACCAACTTCACAATGGGTTGATGTAGACACTGGTATTGGTGTTTCCAGTGTCTATAACGGTGGTAATGTTGGTATTGCAACTTTAGTTCCTAGATTCCAATTACAGATCGGTGGTGATCCTGAACCACCAACAAGTGCTGATGGTGTTGGTATTAGGCAGGGCAATATTTACATGTCCGGTGTCATCACCGCGACAAGATATTATGGTGATGCTGCAAACTTAACCAATCTAAATGCAGACGAACTAACAGCTGGTATTGTAACACAAGCAAGGATTCCTAGACTAGAATTAGACAAGATTCCTCTCATTCCAGACTATAAACTAGAGCAGAATCTACAGATCAGTGGCATCTTAACTGCTGGTGGTGGATTTATTGGCAGTCTAGTTGGTGATGTTGAAGGTAACGTAATTGCTAACAGTGGATTCTCTACATTCAACGATGGTGAGTTTAAAGGAACTCTAACTGCTGTCGCATCTACTGCTAGAACTTTAACAGGAACTCCTGATATTAGAGTTGGTTTTGTATCTGCAAACATTATTGATGCCGGTATTGCTCTAACTGTAAATAGAGCAAATATGACTGGTGATGTTTCAGTTGGTATTCTAACTGTAACTGGTGAAAGTCTTAGGGTTGGTACGGGTGGTTCAATCTTTAATGTAACTGAAGGTGCGATTGGTATTGGTACAACACTACCACAATCCACACTTGTTTTATATCAGCAAGAGGGTACAAACCTAGAGATTCTAACTGAAACTGGTGCTGCAACTCTAAACCTTGGTGGTGACTTAGGTATTGGTCAAAGTACAGCAGAACTTAGACAAGAAGACTTAAGGTTTGAACTATCAAACTATTCAAATGGTGACTACATTTATCATCTAGGTAGAGAACTTTCTGTTGGCAGTGTCAACGGAGCATTTAGATGGTTAAAGGGTGATCCAGTTAATGAGATGATGACTCTAACCAAGGATGGAAACCTTGGATTAGGAATTACAGCTCCTGGTAAGAAATTAGTCGTAACTGGTGATACTGATCTAGACGGAACACTTCTTGTTACTGGAAAGACTGAAATTGATGATGATGTTATCATCTATGGCAACTTAACATATAACGCTCTAAGTGGTGTTACAACTGCCTTTGACTTAGATGTAAGTGGTAGTCTAAACGTAACTAGTGACATCATTGCATCTGGTATTGCTACATTCCCTAATGTTGGATTCCTTGTTCAAAACGCAGGTGTATCTACATTCCCAACTCTAGATGTTACTGGTGGTTTAGGTGTTGCTGGTATTGCAACGTTTGGAACTTTGATTATTCCAGACAATACTAACTTGTTCACTAATAGTGGTATTAGTACATTTTCAGACCTGAGAGTTACTGGAGATCTATCACTTGATGGTAACACATTTAACTATGAAACCACCACTGGTATTACAACAGTAAACAACTTTAATATCACTGGATTTGTTACATTCGCTGAAGCACCAAACTTCAACTTAAATATTAGTAGCGGTATCTCTACACTCCAAGCATTAAATGTTCAAGGATCACTAAGTGTTGGTGGTACTGCTACCTTCGGTAGTGTAGTAATTGATGACCTAGTGTTTACTAACACTTTAGGTGTTACAACAATTAGATCGATTGATGTTGATACTGACGTAAATGTTGGTGGTGCTCTAACTGTTACTGGAGATGCAGAGTTCCAAGGAGCAGTAATTCTTCCCTCTGATCTTGAGATTAATTTTATTTCTGGTATCTCAACATTCTTTGATCTAGATGTAACCAACAATTTATATGCTGGTGGTATCAGTTCAATTCGTGAGATCAATACTGATATTACATTCTCTGGAACAACACAACAGATTGGAACTGGATTAACGATTGGAACTGCTGGTGCTGAAATTGATCTAGCATCAGTAATTAGATTCTCTGATGTTAGTGGAAAGATTGGATTTAATACTGCTCAACCGTCTTCTGCTATTGATGTCGGTATGAGAACCGACACCAGTATCATCTTCCCAAGGATGACTACAACTCAGCGAGATTCTTTAGAAGACGCAGCTCTTGAAGGTTCTGTTATCTACAACACCAGCACTAGCGCACATGAAGGGTACGATGGATCGTCTTGGACTGAACTAAACTATCAACCACCTGCATCTCCTGGTTGGACTGCATTAGAAACATACACTACTGCTGGAAGAAATGCCTTAACAGGTATGCCAACGGGTGCAATTATCTACAACACAACATTAAGTCAAGTAGAAGTTTACAACGGATCTAATTGGGTTGCTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8fdb73818245216197859310172ef935efa1a1b7aad0939c0bf8a371b1f56382
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6259
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50