Protein

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Genbank accession
AGF91582.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MAVTTKKTFSAADGSTKSFGPIGIELNNQDDLDVYVTLSGGTRRLSLRQSSDTTATSSHPQVNDTTGLYFPAVSVGDQLYNYSISTDNNNIVFNNNLPSGAVVSCERRTRDSSGNYTNFSGGSTIRSTDLNTAFDESNFTAQEARNKAFEIEGKIFGTEATSTSFITSDEIVDGTIVDADLSSTAEIQVSKLKDGTARQVLQTAANGSDVEWTSNVDIPGTLDVTSSAAFDSNVTVSGTTTAAAINASGAVGVDGNFDVNTNKFTVDSSTGNTVIGGNLSVSGTASITGTSTYTGQQNVPGGALVKNIRVGLDADNEVSTTSGNLILDSANGTVQVTDTLDVVGNVTVSGTVDGRDIASDGSKLDGIEAGATADQTASEIRTLVESASNSNVFTDADHSKLNAIEASATADQTASEIKTLLQSDKLTASEIATGALDGRYYTETESDARYFNISTGDTIKDGDAFPDNDTTIATTAAINDRIIDLVDDVGGFVPIANELAFPNANPDVNNGAGTLVSIKTLSTNYTSSGSGVISISNGTVGNSTVTINGAENSTTYSSGYGMIVETTTTLNTYTFHRLVPKATEVTTVAGKATEIGRLGTAAAVEDLGILGTTAVVEDLNLLGTAAVVADMALLGDSAVIADMATIADTSNLISNIGTVAGIQANVTTVAGNSANVTSVADNMGTVNDFAARYRVGANNPTSSLDTGDLFFNTSANELKVYNGSSWQGGVTASGSFATVTGNTFTGDNLYNDNVKLKLGTGSDLEVYHDATDNQIKSVNGKVVITTTAGNSDIEITPHGSGVVKLDGLSWPTADGSANQYLKTDGSGALSWATVDLSAATDYADNVKVRFGTGNDLEIYHDSSNSYVTDQGTGALLLAGNEVKIINAAHNENGLVFDENGAISLYYDNSLKLATTAAGINLDNSGGTTGYGKITFGNSGQQYIEAKDSGNFGSGAYVTIGSGTDVAIKAKHDNAVELYYDNSKNFETTSTGVKVTSSGSSHGLDIIHSNGNTVAQLIHGGTGDEGVLNLRDSNTSTVIIRGEVGQDTDITTGANFDLEHDSAKLRLGAGNDLEIYHDGSNTYIDNNTGTLNILAATDVSMWAANSEQTIKGIANGAVELYYDATKKFETTSEGVETQGELHFKAPSSSTGEQVGRLEWWNENDAGVMAKIAVDRTAGSLAPGDLVFSTSANVDTTANGGDGDITERLRITSDGKVKVPDNGSAVFGNGSDLSIYHNGVNSVIYENGTGNLSIMSSGGAIVLEKSTGEPMGTFAVDGAVSLYYDNSKKFETTDAGGTLTGALTVTNEINLFNGATDASRYIDAGLGDGNTLFIRGCSGGDANHETLAQFTRNGGVSLFYDAAKKFETDTNGVTITGQCNVTSNIALPDHSSGYVGKMVFGGGDDLQIYHNGSDSYIRDTGAGSLKIDTSQLLLRDSSGSDSMITATADGAVELYYDNSKKLATTSGGVHIYNALSTSGAISIGNGANLTLEDNGEAVFGFGSDLKIYANGSASYIAHNGDGDLFISTGASGENLYVSSAEHLILRTAASENAVYCSKNAHVSLYYDSSQKFYTQSYGAVIDGTLKPAANNTHDLGDNSYKFSTVWAKNTAKAWINVDGDASTASIRASHNVSSLTDDAYERHTVNFSTNMGSASNYCFVSGARAGDSGGGGRVVVGYDTPTASAFKYQMRNLGNSNEHVDAACLAFFST
Physico‐chemical
properties
protein length:1708 AA
molecular weight: 177043,01940 Da
isoelectric point:4,37015
aromaticity:0,06909
hydropathy:-0,23308

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSP6
[NCBI] 		382275 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGF91582.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634152.1 [NCBI]
CDS location
range 12998 -> 18124
strand -
CDS
ATGGCAGTTACAACTAAAAAAACATTCTCAGCGGCTGATGGATCAACAAAATCCTTTGGCCCGATTGGGATCGAACTGAATAACCAAGATGATCTTGATGTATATGTAACCTTATCGGGTGGTACTAGGAGGCTTAGTCTAAGACAAAGTTCAGATACTACTGCTACTAGCTCTCACCCACAGGTTAATGATACAACTGGATTATATTTTCCAGCCGTTTCGGTTGGAGATCAACTTTATAATTACTCAATATCCACTGATAACAACAATATTGTTTTTAATAACAATTTACCGTCAGGTGCTGTAGTATCTTGTGAGCGTCGAACTAGGGATAGCTCGGGTAATTACACAAATTTCTCAGGTGGTAGTACAATCAGATCAACAGATTTGAATACTGCATTTGATGAATCTAATTTCACAGCACAGGAAGCAAGAAATAAAGCATTTGAAATAGAAGGAAAGATATTTGGGACAGAAGCTACAAGTACATCATTTATCACAAGTGATGAAATTGTAGATGGTACTATTGTAGATGCAGATCTATCATCTACTGCAGAGATACAAGTTAGTAAATTAAAAGATGGTACTGCAAGACAAGTTTTACAGACAGCAGCTAATGGTTCTGATGTAGAATGGACAAGTAATGTAGACATTCCTGGTACATTAGATGTTACAAGTTCAGCAGCATTTGATAGTAATGTTACTGTATCTGGGACTACTACAGCAGCTGCTATTAATGCAAGTGGGGCTGTAGGAGTAGATGGTAATTTTGATGTAAATACTAATAAATTTACAGTTGATTCATCGACAGGTAATACAGTTATTGGAGGTAATTTAAGTGTCTCTGGTACAGCTAGTATAACTGGTACATCTACATATACAGGTCAACAGAATGTTCCTGGTGGAGCTTTAGTTAAGAATATAAGAGTTGGTCTTGATGCTGATAATGAAGTTAGTACAACAAGCGGTAATTTAATACTAGACTCAGCTAACGGTACTGTTCAAGTTACTGATACACTAGATGTTGTTGGAAACGTTACTGTTTCAGGGACTGTAGATGGTAGAGATATAGCAAGCGATGGTTCAAAACTAGATGGAATAGAAGCAGGTGCTACAGCTGATCAAACAGCTAGTGAAATTAGAACCCTTGTAGAAAGTGCTAGTAATTCAAACGTTTTTACAGATGCTGATCACAGTAAACTAAATGCTATCGAAGCTTCAGCTACTGCAGACCAAACAGCTAGTGAAATTAAAACACTATTACAGTCTGACAAGTTAACCGCTAGTGAGATAGCAACTGGTGCATTAGACGGAAGGTATTACACAGAAACAGAATCAGATGCTAGATACTTTAACATCAGCACAGGTGACACTATTAAAGATGGTGATGCCTTCCCAGATAATGACACAACCATAGCTACAACTGCTGCTATCAACGACAGGATTATTGATCTTGTTGATGATGTAGGTGGTTTTGTACCAATAGCAAATGAATTAGCTTTCCCAAATGCTAATCCCGATGTTAATAATGGTGCAGGTACTCTTGTCAGTATTAAGACTTTATCTACAAACTACACTTCAAGTGGTAGTGGTGTTATATCTATTTCTAATGGTACTGTAGGTAATTCTACTGTCACTATTAATGGTGCTGAAAATAGTACTACTTATAGTTCTGGGTATGGTATGATCGTAGAAACAACTACGACATTAAATACTTATACTTTCCATAGATTAGTTCCTAAAGCTACTGAAGTAACTACGGTTGCTGGTAAAGCTACAGAAATAGGTCGTCTTGGTACAGCAGCAGCTGTTGAAGATTTAGGAATATTAGGTACAACAGCAGTTGTTGAAGATCTAAACTTGTTAGGTACAGCAGCAGTTGTTGCTGATATGGCATTGCTAGGTGATTCAGCTGTTATAGCTGATATGGCTACTATTGCTGATACAAGTAATTTAATATCTAATATTGGTACGGTTGCAGGTATACAAGCTAATGTAACTACAGTTGCAGGTAACAGTGCTAATGTAACTTCAGTAGCCGATAATATGGGTACTGTTAACGACTTTGCAGCTAGATACCGTGTAGGAGCTAATAACCCAACATCAAGTTTAGATACTGGAGATTTATTCTTTAATACATCTGCTAATGAACTAAAGGTTTATAACGGAAGTTCTTGGCAAGGTGGTGTAACAGCTAGTGGTAGTTTTGCAACCGTTACTGGTAATACATTTACTGGAGATAACTTATATAATGATAATGTTAAATTAAAACTTGGAACTGGATCGGATTTAGAAGTCTACCATGATGCAACTGATAATCAAATTAAATCAGTTAATGGTAAAGTAGTTATTACAACTACAGCTGGTAATAGTGATATTGAAATCACACCACATGGATCTGGTGTTGTAAAATTGGATGGACTTAGCTGGCCTACAGCTGATGGTTCAGCCAATCAATACTTAAAGACAGATGGATCAGGAGCTTTATCTTGGGCAACTGTTGATTTAAGTGCTGCTACTGATTACGCTGATAACGTTAAAGTTAGGTTTGGAACAGGTAATGATTTAGAAATCTACCATGATTCATCGAACTCTTATGTAACAGATCAAGGTACGGGTGCATTATTATTAGCTGGTAATGAAGTCAAAATTATTAATGCAGCACATAATGAAAATGGTCTTGTCTTTGATGAAAACGGAGCTATATCATTATATTATGACAACTCACTGAAGCTTGCTACAACTGCTGCTGGAATCAATTTAGATAATTCTGGAGGTACAACAGGTTACGGTAAGATTACCTTTGGTAATAGTGGTCAACAATATATTGAAGCAAAAGACTCAGGTAATTTTGGAAGCGGTGCTTATGTAACTATTGGGTCAGGAACCGATGTAGCTATAAAAGCAAAACATGATAATGCCGTAGAACTCTATTACGACAATAGTAAGAATTTTGAGACAACGAGTACTGGTGTAAAAGTAACTTCTAGTGGTTCAAGTCATGGTTTAGATATTATTCATAGTAATGGTAATACAGTTGCACAATTAATTCATGGTGGTACTGGTGATGAAGGGGTTTTAAATTTAAGAGATTCAAATACATCTACAGTCATTATAAGAGGAGAAGTTGGTCAAGATACTGATATAACTACTGGTGCTAACTTTGACCTTGAGCACGACTCAGCTAAGTTAAGACTTGGAGCTGGAAATGATCTAGAAATCTACCATGATGGATCGAATACATATATTGACAATAATACTGGCACGTTAAATATATTAGCTGCAACTGATGTCAGTATGTGGGCTGCTAATAGTGAGCAAACTATTAAAGGTATAGCTAACGGAGCTGTAGAACTATATTATGATGCTACTAAGAAGTTTGAGACAACTAGCGAAGGAGTAGAAACTCAAGGAGAGCTTCATTTTAAAGCACCTTCTTCATCTACTGGAGAACAGGTAGGAAGACTTGAGTGGTGGAATGAGAATGATGCTGGTGTTATGGCAAAGATTGCAGTAGATAGAACTGCTGGATCATTAGCTCCTGGTGATTTAGTCTTTTCAACTTCTGCAAATGTTGATACTACAGCTAATGGTGGCGATGGAGATATTACAGAAAGGCTCAGAATTACATCTGATGGAAAAGTAAAAGTTCCAGATAATGGTTCAGCTGTATTTGGTAATGGATCAGATTTAAGTATCTACCATAACGGGGTTAATTCCGTAATTTACGAGAATGGTACAGGTAATTTATCTATAATGTCTAGTGGTGGAGCCATTGTTCTTGAAAAGAGTACTGGTGAACCAATGGGTACATTTGCAGTAGATGGAGCTGTATCACTCTATTACGACAACAGTAAAAAGTTTGAGACAACTGACGCTGGTGGTACATTAACAGGTGCTCTTACTGTTACTAACGAGATAAATTTATTTAATGGAGCTACTGATGCCTCTAGATATATAGATGCTGGACTTGGAGATGGTAATACATTATTTATTAGAGGATGTTCTGGTGGTGATGCTAACCATGAAACTTTAGCTCAATTTACTAGAAATGGTGGTGTAAGTCTCTTTTATGATGCTGCTAAGAAGTTTGAGACAGATACAAACGGCGTGACTATAACAGGTCAATGTAATGTAACGTCAAATATAGCTTTACCTGATCATAGTAGTGGTTATGTAGGAAAGATGGTATTTGGAGGTGGAGATGATCTACAGATCTACCATAATGGATCGGACTCTTATATTAGAGACACAGGAGCAGGTTCCTTAAAAATAGATACTAGCCAACTTCTTTTAAGAGATAGTTCTGGATCAGACAGTATGATTACAGCTACAGCAGATGGAGCTGTAGAACTCTATTATGATAACTCGAAGAAGCTTGCTACGACTTCAGGAGGAGTACACATATATAATGCACTTAGTACAAGTGGAGCAATATCCATTGGTAATGGAGCTAATTTAACATTAGAAGATAATGGAGAAGCTGTATTTGGTTTTGGGTCAGATCTAAAAATCTATGCAAACGGAAGTGCTTCTTATATAGCTCATAACGGTGATGGGGATTTATTTATATCAACTGGTGCGTCTGGAGAGAATTTATATGTATCCTCTGCAGAACATCTAATATTAAGAACCGCAGCAAGTGAAAATGCTGTTTATTGTTCTAAAAACGCACACGTTTCTCTTTACTACGACAGCTCACAAAAGTTCTATACTCAAAGTTATGGAGCTGTTATTGATGGTACTCTAAAACCTGCTGCTAATAATACTCATGATTTAGGTGATAATAGCTATAAATTCAGTACAGTTTGGGCTAAAAACACAGCAAAAGCTTGGATTAACGTAGATGGTGATGCAAGTACAGCATCAATCAGAGCTAGTCATAATGTAAGCTCTTTAACTGATGATGCCTATGAACGTCATACAGTTAACTTTAGTACAAATATGGGTAGTGCCTCTAATTACTGCTTTGTTTCTGGTGCAAGAGCTGGTGATAGCGGTGGTGGAGGTCGTGTCGTAGTCGGTTATGACACACCAACAGCAAGTGCCTTTAAATATCAAATGAGAAACTTAGGTAACAGTAACGAACACGTTGATGCTGCCTGTTTAGCTTTCTTCTCTACTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
b78a4c2a598900d17eafa224c03c488177b52372b63792e76351c6f1e84e141f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6475
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Prochlorococcus phage P-SSP6 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank