Protein

Genbank accession
QGT55338.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,74
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGAFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGESISVNTGAGNDMVFTLPNTPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRTVLMTRPRSQLLFVFSNRLWQMYITDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDRLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATTGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASTVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTVAGTRYWVVQQNVPTVERVDAGTDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTAAFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQVETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAVDSEVIAGQSQAGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDIYKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQAETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAISPYELNRVLANYLPLKAKAADANLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGASTRLIFEKGPQTGNNPAQAMNIRVWGNQFAGGSDTSRATIFEVGDETSNHFYSQRDNLGNITFSINGTVRPINVNASGTLNANGAATFGRSVTAQGEFITYSANAFRAISGNYGFFIRNDAANTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGEGLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKASDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATIGNLTIRDFLRIGNVRVIPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139462,53320 Da
isoelectric point:5,38722
aromaticity:0,07514
hydropathy:-0,30170

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
981–1094
IPR048390 IPR048391
QGT55338.1
1 1291
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage FP43
[NCBI] 		2666261 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGT55338.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN648445.1 [NCBI]
CDS location
range 103620 -> 107495
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATACAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGGCATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACTGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGAATCGATTTCGGTTAACACTGGGGCCGGCAATGATATGGTTTTTACATTGCCAAATACTCCAGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGACGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTACAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGTGAACAAGTTCGTACGGTTTTAATGACGCGCCCACGTTCACAACTATTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATTACCGATTATGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATCGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAGATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTCGGGACTCATATTGCTGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCGGATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTCTTATCTTTGGCACAAATAACGCTACAACCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTACCGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCCACTGTTGCATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACCGTTGCTGGTACACGTTATTGGGTTGTTCAACAAAACGTCCCAACCGTAGAACGTGTCGATGCTGGAACTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCAGCTAAAGAAGTGGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAATTCCACAGCAGCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAATTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGTGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGGTTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACACCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGTTCTGAAACACTGTCTGGTATAGTTAAATATGTATCAACTACTTCTGCTACTCCTGCTGAAACTCGTGGGGCTGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACTTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTGTTGATAGTGAAGTAATTGCTGGTCAATCACAAGCAGGTTATTCTCACGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTATAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGCGTAATTAAGGTTGCTACTCAGGCTGAAACTGTAACAGGAACTTCTGCTAATACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAATGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGCGGATTCGTTAAAACTTCATCTGGTTCTATTACATTTGTTGGTAATGATACAGTTGGTTCAACACAACCTTTAGAATCGTATGAAAAAAATAGCTATGCTATATCTCCATATGAATTAAACCGTGTACTTGCTAACTATTTGCCATTGAAAGCTAAAGCTGCTGATGCAAATTTATTAGATGGCCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCGGTATCTGCTAATAGTACATTAACTATTTCTAATACAGGTGCTTCAACTCGCTTAATATTTGAAAAAGGTCCACAAACTGGAAACAACCCTGCTCAGGCGATGAATATCCGTGTATGGGGTAACCAATTCGCCGGCGGTTCTGATACATCTCGTGCTACGATATTTGAAGTTGGTGATGAAACATCTAACCACTTTTATTCACAACGGGATAACCTTGGTAATATTACTTTCAGCATCAACGGTACAGTTCGGCCGATTAATGTTAATGCATCCGGAACATTGAATGCTAATGGTGCGGCAACATTTGGACGTTCGGTGACAGCACAGGGTGAATTTATAACCTATAGTGCAAACGCATTCAGAGCAATTAGTGGTAATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGCTAATACCTATTTTATGCTTACTGCATCCGGTGATCAGACCGGTGGATTTAATGGATTACGTCCTTTGGCTATTAATAATGCATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAGGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAGCATCTGATTTATATACCCGCGCGCCAACATCTGATACCGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAGGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGTGCTTTACCTTCTGATAATGCAACAATCGGAAACTTGACAATAAGGGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCGTTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTTGAGTGGATTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
3a88691e34d9a7b85301149aeadaae69084f887630c45e34a09cd4d6ffe09955
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5567
Evidence 0,5567
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Characterization of STEC phage and application of the phage to control STEC on lettuce Zhang,Y., Minh,D.H., Shen,C., Shigemura,K., Masuda,Y., Honjoh,K.-I. and Miyamoto,T. 2023-11 — GenBank