Protein

Genbank accession
AIX20495.1 [GenBank]
Protein name
virion structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,59
Protein sequence
MTTTQTFTSSTTYAIPSDAANVTYIIHGGKGGQGGPASTRVNTSGAAGARGQKISGTLTGVVGSTLTLTMGGNGSRCFGDSGANGGGGYWNGGRGGNNGSYDSESGWNAGGGGGGGGASAIRIGNTVLAGAGGGGGGACICYSGDTDAPGLTSSNINTSGGSNGAAGQNSGAAWNGGGGGAGGGFPGGTTGVFQAGYAYNAGNDGSGFGGAGGAGLYNPSYHRSASTLQTSSSGISFITISYDDQIVTEDFNWTTRSPQLDNIVGSQGSDPNNLWTTFLTNTNVGGNEPEGSTVIRSIEWKINFNNTGKQIFNTAVDDAADVYIDNVLQFSLNTYNTNTSLTTPNTITAGEHTIRIEHVSNGGPYGVAMDWTGYVPPAPPTVSLTATDYSTPPNNITSIYKGQSLRLTYSASIPTNGDAITANTFTANANGNVSNPIPSVGNSGVYFPAPTTTTTYTYTATNANGTSTANVTITVEDDFPVVTLTSDDADNTIISGGVPESVTLTWSATANTTISNTTMTGVTNPGTSGSVTVSPTSTTTYTFLATTATGTRTASVTITVNTRPVITLTSSTSTISAGQTVNLNWTTTGSANNIVWVSGTPAPTTGSGVINGSASVAPTNSQQYCVYASGPGGVSDAKCVSINVIQIDTSITDYDQSFSNDTTVNIPSYAINVSVDISAASGTNGGTDAGGASGPGGGGRRATFYFADYVARTFTLRLGNQGSSGFGCVAGSGAGTGGSSNVARGGNGGTSGPSGCSGGGGGGGGASGIYDSVKNGWVAIVGGGGGGGGASWNVSATGGTTGTGMNTGNVNSISNGNNGSACPTDGGGGGGGGGGATGGAGGNFGLDNNRGGAGGRGGQSAYDNSYCSFNYNSGSQNFGNGSARVRWNIGAPTIDSFTISPAPIIAGQSTRLTWTSTNSLTGSINNGVNAVTVPDSFVDVFPSDDTTYTLTVVGYGGLTDTDTVSIVVYIPPELILVLNSPSIIVNGSTNLSWSVTGDGDALYWVAGGITNTNLNSNVSLSPSVTTTYTGYVTGLGGVSPQTSIELIVYYPPTLIVDYPAVIDYGQQATIEYEGDYANTSVTLSATYNYDFVANTTDPITNLNVASSAEFGSNSSYGGVYNTNIVYNDRGPLSVTYVITATGNGGSTSEEFTVLINIDKTPDNMDIDETSDLFKDQDPVYTPETEVLSDMYYVDDIEIQVEVKSNLPILVDLNANQQWTKLRQIGTAPAVQGNSVGGNSMPTKPGVYYIKPRSLQTEAPLIAKSNLSAVEAAKLITCLSVIDETNNSYYNNQGNLNNVWQQNPPVIGGAVNDRRGFRTAFPYRTFYLLDPQGSGQSGIDVPTNFPGDPNAFGPIRVNRDEGNVGSRSDWFSICNFGSLPYGTIVSIWIDVSGSMRLSTVQASYDYFLTRCAAAGIEIVLSLSAAGERYIEGHIVYLPPSANFTAVDADGNTSNIEVISGSSVTLSWIVFGDVNTLSITPGVLNITPSFNDFVDSAVVNPTSDTTYILNANGPAGTTTRQITISVLIPPTISITSSQGASIINGNCTTLSWSISGDGNSVSWTQGGISNTNANSSAVVCPNDTTTYCAVASGPGGVSPETCIEITVYQNPTAGITAPGVIDYSVNFTIEYESQYANTSIQITPTYTYLNGTVVTGTTINRTAATSAEINGGASGTVSDTRANGTGVPITVPWNNFGPYQIDFVIVAAGTGGTAEDTARTIVNIDQTPDNFIVDETDDKLKDQDPVYTPETEILSEMYQINDIDIPVEIKADYPIKVDINKNDDWEDVRQI
Physico‐chemical
properties
protein length:1789 AA
molecular weight: 182995,82070 Da
isoelectric point:4,12284
aromaticity:0,08161
hydropathy:-0,17267

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.60.120.260
291–376
G3DSA:2.60.120.260
AIX20495.1
1 1789
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014e
[NCBI] 		1493510 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX20495.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019054 [NCBI]
CDS location
range 35331 -> 40700
strand +
CDS
ATGACAACTACTCAAACGTTTACTTCTAGCACTACATATGCTATTCCTTCGGATGCTGCTAATGTTACATATATTATTCATGGTGGTAAAGGTGGTCAGGGTGGTCCTGCCAGCACTCGTGTCAATACTAGTGGCGCTGCTGGTGCTAGAGGACAAAAAATATCTGGAACTTTAACTGGAGTTGTAGGTTCAACACTCACCTTAACGATGGGTGGCAATGGATCTAGATGTTTTGGAGATTCTGGCGCTAATGGTGGTGGTGGATATTGGAATGGTGGACGTGGTGGTAATAATGGTTCCTACGATAGTGAGAGTGGATGGAATGCTGGTGGAGGTGGCGGCGGTGGCGGTGCTTCTGCTATTCGTATTGGTAATACTGTATTAGCTGGTGCTGGCGGTGGTGGAGGAGGAGCGTGTATTTGTTATAGTGGTGATACTGATGCTCCTGGACTAACATCTTCTAATATTAACACTAGTGGCGGATCTAATGGTGCTGCTGGACAGAATTCTGGTGCTGCATGGAATGGCGGCGGTGGTGGCGCTGGCGGGGGATTTCCTGGTGGCACGACGGGGGTTTTTCAAGCTGGATATGCCTACAACGCTGGTAATGATGGTAGCGGATTTGGTGGTGCTGGCGGTGCTGGATTGTACAATCCTTCATATCATCGTAGTGCTTCTACTCTACAAACTTCTAGTTCTGGTATTTCTTTTATTACAATTTCTTATGATGATCAAATTGTTACAGAAGATTTTAATTGGACCACTAGATCTCCCCAACTTGATAATATTGTAGGAAGTCAGGGGTCTGATCCAAATAACTTATGGACTACTTTTTTAACTAATACTAACGTGGGTGGTAATGAACCTGAAGGTAGTACTGTTATTAGATCAATTGAATGGAAAATTAATTTTAATAATACTGGAAAACAAATATTTAATACAGCTGTAGATGATGCTGCTGATGTATACATTGATAACGTACTTCAATTTTCACTCAACACTTATAATACTAACACTTCTTTAACTACACCAAACACAATTACTGCTGGTGAACATACTATACGGATTGAACATGTTAGTAATGGTGGACCATATGGTGTTGCAATGGATTGGACTGGATATGTACCTCCTGCACCACCAACAGTAAGTCTAACTGCAACTGATTATAGCACTCCACCAAATAATATTACTAGCATTTATAAAGGTCAAAGTCTGAGGCTTACATACTCTGCTTCTATCCCTACTAATGGCGATGCTATCACTGCTAATACCTTTACTGCTAATGCCAATGGAAATGTAAGTAATCCTATTCCTAGTGTGGGAAATAGTGGCGTATATTTTCCTGCCCCTACAACCACAACAACTTATACGTATACAGCAACTAATGCCAATGGGACATCTACCGCAAATGTAACAATTACAGTCGAAGATGATTTCCCAGTAGTAACTCTTACTTCGGATGATGCTGATAATACAATTATTTCTGGTGGAGTTCCTGAATCTGTAACACTTACGTGGTCTGCTACTGCAAATACTACTATTAGTAATACTACAATGACTGGTGTTACTAATCCTGGCACATCTGGCAGCGTAACAGTAAGTCCCACATCCACAACAACTTATACATTTTTAGCAACAACTGCTACTGGAACACGTACAGCAAGTGTAACTATTACCGTTAATACTAGACCAGTAATTACATTAACCTCAAGTACATCAACAATATCAGCAGGACAAACTGTTAATTTAAACTGGACTACAACTGGAAGTGCAAATAATATAGTTTGGGTTTCTGGCACACCTGCTCCTACAACTGGAAGTGGAGTTATTAACGGATCTGCATCGGTTGCTCCTACAAACTCACAGCAATATTGTGTTTATGCTTCTGGACCTGGTGGAGTTAGTGATGCTAAATGTGTTTCAATAAATGTTATACAGATAGACACTAGCATAACTGATTATGATCAATCATTTTCTAACGATACTACTGTTAATATTCCTTCTTATGCCATTAATGTTAGTGTAGATATCTCAGCTGCAAGTGGTACAAATGGAGGTACTGATGCTGGTGGTGCTTCTGGTCCTGGTGGCGGTGGAAGAAGGGCGACATTCTATTTTGCTGATTATGTTGCGAGGACATTTACTTTAAGATTGGGCAATCAAGGATCATCTGGATTTGGATGTGTTGCTGGTAGTGGAGCCGGAACAGGAGGAAGTTCTAATGTAGCTCGTGGAGGAAACGGTGGCACTTCTGGTCCTTCTGGATGCTCCGGTGGTGGTGGAGGTGGTGGAGGTGCCAGCGGCATTTACGACTCCGTTAAAAATGGTTGGGTTGCTATTGTAGGTGGCGGCGGTGGCGGTGGCGGTGCTTCATGGAATGTTAGTGCTACCGGTGGCACTACGGGAACAGGAATGAACACTGGAAATGTAAACAGTATTAGTAATGGTAATAACGGTTCTGCGTGCCCTACTGACGGCGGAGGCGGCGGTGGCGGCGGAGGTGGAGCTACTGGTGGCGCTGGAGGAAATTTTGGACTTGACAATAATAGAGGAGGTGCTGGTGGTCGTGGTGGACAATCTGCTTATGATAATAGTTATTGTAGTTTTAATTACAACTCTGGATCACAAAATTTTGGTAATGGATCTGCTAGAGTAAGATGGAATATAGGTGCGCCAACTATTGATAGTTTTACTATTAGTCCCGCACCTATTATTGCAGGGCAAAGCACAAGATTAACATGGACATCTACAAATTCTCTTACTGGTAGTATTAATAATGGTGTTAATGCAGTTACTGTTCCCGATAGTTTTGTCGATGTTTTCCCTAGTGATGACACAACATATACATTAACTGTTGTTGGTTATGGTGGTTTGACCGATACTGATACGGTATCTATTGTAGTCTACATCCCACCCGAACTTATTCTCGTTTTAAATAGTCCATCTATTATTGTTAATGGAAGTACAAATCTTTCTTGGAGTGTCACTGGAGATGGTGATGCTTTATATTGGGTTGCTGGTGGTATCACGAATACAAATTTAAACAGTAATGTATCTCTTAGTCCATCTGTTACTACAACTTATACTGGATATGTTACTGGTCTTGGTGGTGTTTCTCCACAAACATCTATAGAATTAATTGTATACTACCCTCCAACTTTAATTGTAGATTATCCTGCAGTAATTGATTACGGTCAGCAAGCAACAATTGAATATGAAGGAGATTATGCAAATACATCAGTAACATTGTCTGCTACTTACAATTATGATTTTGTTGCTAATACCACTGATCCTATTACAAATTTAAATGTAGCATCTTCTGCTGAATTTGGATCAAATTCTTCTTATGGTGGAGTTTATAATACAAATATTGTTTATAATGATAGAGGACCACTTAGTGTAACTTATGTTATTACTGCTACTGGTAATGGTGGATCAACGAGCGAAGAGTTTACAGTTTTAATTAATATTGACAAAACACCAGATAATATGGACATTGATGAGACTAGTGATCTATTTAAAGATCAAGATCCTGTCTATACACCAGAAACAGAAGTATTATCTGATATGTATTATGTTGATGATATTGAAATTCAGGTAGAAGTTAAATCAAATCTTCCTATACTAGTTGATTTAAATGCAAATCAACAATGGACTAAACTAAGACAAATTGGTACAGCACCAGCAGTTCAGGGAAATTCTGTAGGTGGCAATTCAATGCCAACAAAACCAGGAGTGTATTATATCAAACCAAGGTCTTTACAAACTGAAGCACCTCTAATTGCAAAATCTAACCTATCAGCGGTTGAAGCAGCAAAACTTATTACATGTCTTTCTGTTATTGATGAAACAAATAATAGTTATTATAATAATCAAGGCAATTTAAATAATGTGTGGCAGCAGAACCCGCCAGTTATTGGTGGCGCTGTAAATGATCGTAGAGGATTCAGAACAGCATTTCCATATAGAACATTTTATCTTTTGGATCCACAAGGTTCGGGACAGAGTGGTATTGACGTACCTACTAACTTCCCAGGTGATCCAAATGCATTTGGACCAATTCGTGTCAATCGTGATGAAGGAAATGTTGGTAGTAGATCTGATTGGTTTAGTATCTGTAATTTTGGTTCTCTGCCATATGGAACGATTGTTTCTATCTGGATTGATGTTTCTGGTTCAATGAGACTCTCCACAGTTCAAGCATCATATGATTATTTCTTGACACGTTGTGCTGCTGCTGGTATTGAGATTGTATTGAGTCTTAGTGCTGCTGGCGAAAGATATATTGAGGGTCATATTGTATATCTTCCCCCTAGTGCTAACTTTACAGCAGTAGATGCTGATGGAAATACCTCAAATATTGAAGTTATTTCAGGATCTTCTGTCACATTGAGTTGGATTGTATTTGGTGATGTCAACACTTTATCTATTACACCGGGAGTATTGAATATTACACCTTCTTTTAATGATTTTGTAGATTCTGCAGTAGTTAATCCTACATCAGATACAACATATATTTTAAATGCAAACGGTCCCGCTGGAACAACCACGAGACAAATTACTATCTCTGTATTAATTCCTCCTACTATTTCTATTACATCTAGTCAAGGAGCATCAATTATTAATGGCAATTGTACAACTCTTTCTTGGAGCATAAGTGGTGATGGAAATAGTGTTTCATGGACACAAGGGGGCATTTCAAATACAAATGCTAATAGTTCTGCTGTTGTGTGTCCTAATGACACCACAACATATTGCGCTGTTGCTAGTGGACCTGGTGGCGTCTCTCCAGAAACTTGTATTGAGATCACTGTATACCAAAACCCAACTGCTGGCATTACTGCTCCGGGAGTCATAGATTATAGTGTTAACTTCACTATTGAATATGAATCACAATATGCAAATACTAGTATTCAGATAACTCCAACATATACATATCTGAATGGAACTGTTGTAACAGGAACAACAATCAATAGAACTGCTGCAACTAGTGCAGAAAT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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
1eeeae0e60cd5e577fb172a05a5c7b084f9cd423aa8ca6085570a31762ed73a4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7472
Evidence 0,7472
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank