Protein

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UniProt accession
M4R1W3 [UniProt]
Protein name
Uncharacterized protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,59
Protein sequence
MPLNKLDSIIKNTEGRILYVSPSDLDSTDSISNQGNSLARPFKTIQRALIESARFSYVKGNNNDETEKTTILLMPGNHVVDNRPGYSINSSGTTSTPDGTAIRDYQLTLDSVFDLTQKDNDLYKFNSVNGGVIVPRGTSIVGLDLRKTKIRPLYVPNPTDDDVLNSAIFRITGACYLWQFSIFDGDEFGTVYTQPDNFELKSTPTFSHHKLTVFEYADGVNDVGTQGVTDLAMYYAKLSKAYSAGSGREVDPLDRFPGNKEGFTSVRPEFEIVGAFASDPIVITSIISGDGATPTRTITVTTQVPHGLDVGTPIRIKDVSDSQYNISTRVTEVSTISDNIFFYTISSDPALISPTATPNEGTVTIETDTVSGASPYIFNISMRSVWGMNGMHTDGSKATGFRSMVVAQFTGISLQKDDRAFVKYIPSSREYRNDFYSSGTTQTGSVLSSKSSSSGIVYHLDSDAIYRKGWEQTHIKMSNDAIVQIVSVFAIGYNKHFEAQSGGDASVTNSNSNFGQLSLISEGFKKEAFEKDNKAFITHIIPPRALHSIEEDIDWLTLDQDATNTSTKLYLFGFDNEDVKPPILTQGYRVGAKVNDKLFLTVGGTEYSADILMSDGSSSFKEYPVTSGPSSNIFTTGTHGIVTGEKVIIISDDGDLPENLRTNTVYYAIAPNNTTVKLAASEAEALADEPITVYGGTNLKILTRVSDKQSGDAGHPVQWDGSQWYINVTNAGTMASAINSLSGATEPTIIKRTPDNRSLDEKIYKVRVVVPSQLSNAKTPEAGFVLQESSTTGYVGTADTNRTTIDSTNYDYNRNPRFISTCSFSNPTDTVTVITELPHSLKVGDSVTIKNVTDSTNTTGLIDKGYNGTYNVDSVSATNDLEFTYTTTSTPGTFTNNVNERTTSLPRFERTDLQSNLYVYRNEIISEYSDGDSNGVYHLYTLNSNNAIQNEFTNLEYSQNVTDLYPQLDRDNPNDDPNSATTYALRSPIGEVQTDDLKKSITRESANLLLTSLGIGLDIASVTNPTSTTPTITFDRNHNFNSIVTGTLGATSGFTPGTYFNVKIYNNIGLTQWNGATAKVSVAGTTINSVEIMNGGSNYSDGTYFLDTGVIGAGTPNTFTVTSADISSHIGDVVQFTGVGIGTDTYHRIDSVTGRNSISIARTTGDPVITSDNYAFITAPSVAFTASGDVVTAPGHGLVVGNKFRVIGINTSNFGDYIVESSTLNEFEVTGGIGTASGFILKHGLSSNSGVSDRSNENLQSRAITVFDGETLTLSESGGIDATSTAFSVSSPGIAGTMTRFPLGSYIQIDNEIMRIASDSLSGTPTDEITVIRGALATSPVTHVENSTIRKIKVPSIEFHRPSIIRASGHTFEYLGYGPGNYSTGLPQVQDRTITEREEFLSQAQERSSGLVVYTGMNNKGDFYIGNQKKSSATGEETNFDIPVPTVTGEDPSRLSAVFDEVTIKERLVVEGGDSGQVLSQFGGPVTFDKDVRIKEELKVTGDTKLKNLSSTTNILPINDNVDVDGSITADQFIATTPSFTNINGNDIYHMLRSNGTQGLITSGEVTNALGFTPASIGSITGDFPLGNSIVVDDISSQFNGTLTDFALLRASAAFIPAGSSANLIVSLGGVIQKPGSDYFIVQSGGENTNTIRFTTAPLSGTSAFIIGLGGQGSLISNLDWDTKGEIIVATGNNSAAKVQVGQNGYALTADSNQTTGVSWQPSVPRGSVFYVATATTPAGYLYCDGTRIPTSGTFQGIAASLLQDLRTLLGTSYGATGTLPNLVNRFAGYSATPGNTGGSANATLVSHSHTVTGSTNQRGGIARWRPATPSPSVTHGGGDVILFDEGNVGDGEETDFNNGVQLRLDTRHTHTVSGTAGNQGSSATNKNLPPYLGMRPIIKY
Physico‐chemical
properties
protein length:1901 AA
molecular weight: 203482,20260 Da
isoelectric point:4,85385
aromaticity:0,08206
hydropathy:-0,27685

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1085
DC_0066 SSF88874
IPR023366
STR
819–899
IPR023366 DC_0066
M4R1W3
1 1901
Architecture
STR
STR 1-1901
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SKS1
[NCBI] 		754042 Uroviricota > Caudoviricetes > Llyrvirus >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGH31752.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ633071 [NCBI]
CDS location
range 172009 -> 177714
strand -
CDS
ATGCCATTGAATAAACTAGATTCTATTATTAAGAACACTGAAGGTCGTATATTATATGTAAGTCCATCAGATTTAGACTCGACTGATAGTATTAGTAATCAAGGAAACTCACTTGCTCGTCCGTTTAAGACAATTCAGAGAGCATTAATTGAGTCTGCGAGATTTTCATATGTAAAGGGAAATAATAACGACGAAACAGAGAAAACTACAATTCTCTTGATGCCTGGTAATCATGTAGTTGATAATCGTCCAGGTTATTCTATTAATAGTAGTGGAACAACAAGCACTCCTGATGGAACTGCGATAAGGGATTATCAGTTAACATTGGATTCCGTTTTTGACTTAACACAAAAAGATAATGACCTTTATAAGTTTAATAGTGTAAATGGTGGTGTAATTGTTCCTCGTGGAACTTCAATTGTCGGTCTTGATTTAAGAAAGACCAAGATACGCCCTCTTTATGTTCCGAATCCAACTGATGATGATGTACTAAATTCTGCAATATTTAGAATTACTGGAGCATGTTATCTCTGGCAGTTCTCTATTTTTGATGGAGATGAATTTGGAACAGTTTATACACAACCAGATAATTTTGAACTTAAATCAACTCCAACATTTTCACACCATAAACTTACGGTATTTGAATATGCCGATGGTGTAAATGATGTCGGCACTCAAGGTGTAACAGACCTTGCGATGTATTATGCAAAACTATCAAAAGCATATAGTGCCGGATCAGGTCGAGAAGTTGATCCTTTAGATAGATTCCCTGGAAATAAAGAAGGGTTTACTTCAGTAAGACCAGAGTTTGAGATTGTTGGTGCATTTGCATCAGATCCTATTGTAATCACATCAATTATATCAGGTGATGGTGCAACACCAACAAGAACAATTACTGTCACAACACAAGTTCCTCATGGATTAGATGTAGGAACACCAATTCGTATTAAGGATGTATCAGATTCTCAGTATAATATTTCAACTAGAGTTACAGAAGTTAGTACTATTAGTGATAATATCTTTTTCTATACTATATCATCTGATCCAGCACTAATTTCACCTACAGCAACACCAAACGAAGGAACCGTAACAATTGAAACTGATACTGTTTCTGGTGCTTCTCCTTACATCTTTAATATCTCTATGCGTTCTGTATGGGGTATGAATGGAATGCATACTGATGGATCCAAAGCAACTGGATTCCGTAGTATGGTCGTGGCTCAATTTACTGGGATTAGTCTTCAAAAAGATGATAGAGCCTTTGTAAAGTATATTCCATCATCTAGAGAATATAGAAATGATTTTTATTCATCAGGAACAACACAAACTGGTTCAGTATTATCTTCAAAATCTTCATCTAGTGGAATTGTATACCATTTAGATTCTGATGCAATCTATAGAAAAGGATGGGAACAAACTCATATTAAGATGAGCAATGATGCAATTGTTCAAATTGTTTCAGTTTTTGCGATTGGATATAACAAGCACTTTGAGGCACAGAGTGGTGGAGATGCCTCTGTAACCAACTCAAACTCCAACTTTGGTCAATTATCACTAATCTCTGAAGGATTTAAGAAAGAAGCATTTGAGAAGGATAATAAGGCATTTATTACTCATATTATTCCTCCAAGAGCATTACATTCAATTGAAGAGGATATTGATTGGTTGACTCTTGATCAGGATGCAACAAATACTTCAACTAAATTATATCTCTTTGGATTTGATAATGAGGATGTAAAACCACCAATTCTTACACAAGGTTATCGTGTTGGTGCAAAAGTAAATGATAAACTTTTCCTTACTGTTGGAGGAACAGAATATTCGGCAGATATTTTAATGTCGGATGGTTCTTCATCATTCAAAGAGTATCCGGTAACTTCTGGACCTTCATCAAATATATTCACGACAGGAACACATGGAATAGTAACAGGTGAAAAAGTTATCATTATTAGTGATGATGGAGATCTACCAGAAAATTTAAGAACTAACACAGTTTATTATGCAATTGCTCCAAATAATACGACTGTTAAACTTGCCGCATCAGAAGCAGAAGCACTTGCAGATGAACCAATTACAGTATATGGTGGAACAAATCTAAAAATTCTTACGAGAGTTTCTGATAAACAATCTGGTGATGCCGGACACCCAGTTCAGTGGGATGGAAGTCAATGGTATATTAATGTAACTAATGCCGGTACTATGGCATCAGCCATAAATTCCCTATCTGGTGCGACAGAACCAACTATTATTAAGAGAACACCAGATAATAGAAGTTTAGATGAGAAAATTTATAAAGTTAGAGTTGTAGTTCCAAGTCAACTTTCAAATGCAAAGACACCAGAAGCAGGATTTGTTCTTCAAGAATCTAGCACAACTGGATATGTAGGAACTGCTGATACGAATAGAACTACTATCGATTCTACTAATTATGATTACAATCGTAACCCAAGATTCATTAGCACTTGTTCATTCTCAAACCCAACAGATACAGTCACTGTTATTACAGAATTACCTCACAGTTTAAAAGTTGGAGATTCAGTCACTATTAAAAATGTAACTGATTCCACAAACACGACTGGATTAATTGATAAGGGATATAATGGAACATATAATGTCGATAGTGTTTCTGCAACAAATGATTTAGAATTTACATATACAACAACATCAACTCCAGGAACATTTACAAATAATGTAAATGAAAGAACAACATCACTTCCAAGATTTGAGAGAACTGACCTACAGTCAAATCTTTATGTTTATAGGAACGAGATAATCTCTGAATATAGTGATGGAGATTCAAATGGTGTGTATCACCTTTATACGCTGAATTCTAATAATGCAATTCAGAATGAATTTACAAATCTCGAATATAGTCAAAATGTAACTGATTTGTATCCACAACTTGATAGAGATAATCCTAATGATGACCCCAATTCAGCAACCACATATGCCTTAAGGTCTCCAATTGGAGAAGTTCAGACAGATGACCTTAAAAAGAGTATTACAAGAGAAAGTGCCAACTTATTACTAACATCACTCGGCATTGGTCTTGATATTGCATCAGTCACAAATCCAACATCAACAACACCAACTATTACTTTTGATAGAAATCACAACTTTAATAGTATTGTAACTGGAACTCTTGGTGCAACATCAGGGTTTACTCCAGGAACTTATTTTAATGTAAAAATTTACAATAATATAGGATTGACCCAATGGAATGGAGCAACGGCAAAAGTTTCTGTTGCCGGAACTACTATAAATTCTGTAGAAATAATGAACGGAGGTTCTAATTATTCTGACGGAACATATTTCTTAGATACTGGTGTAATCGGAGCAGGAACTCCTAATACATTTACGGTCACTTCTGCTGATATTTCATCTCATATTGGAGATGTAGTTCAGTTTACTGGTGTTGGAATAGGAACTGATACTTATCATCGTATTGATAGTGTCACTGGTAGAAATAGTATTTCAATTGCAAGAACAACTGGTGATCCGGTAATTACTTCAGATAATTATGCATTTATAACGGCACCTTCTGTTGCATTTACTGCTTCTGGGGATGTTGTTACTGCCCCTGGTCATGGATTAGTAGTCGGTAATAAGTTTAGAGTAATCGGTATTAACACTAGTAATTTTGGAGATTATATTGTTGAATCCTCCACACTTAATGAATTTGAAGTTACTGGTGGAATTGGAACAGCATCAGGATTTATTCTGAAGCACGGATTATCATCAAATAGTGGTGTTTCTGATAGGTCAAATGAAAATCTTCAGTCAAGAGCAATTACTGTTTTTGATGGAGAAACATTAACTCTTTCTGAATCTGGTGGTATTGATGCTACTTCAACAGCATTCTCTGTAAGTAGTCCTGGTATTGCCGGAACTATGACAAGGTTCCCATTAGGTTCTTATATTCAGATTGATAATGAAATTATGAGAATTGCGAGTGATTCTCTGAGTGGAACTCCTACAGATGAAATTACCGTTATTCGTGGAGCACTTGCTACTTCACCCGTAACACACGTTGAGAATTCAACAATTAGAAAGATTAAAGTTCCTTCAATTGAGTTCCATAGACCATCAATTATTCGTGCTTCTGGTCATACATTTGAGTATCTTGGATATGGTCCTGGAAACTATTCTACGGGTCTTCCACAGGTTCAGGACAGAACAATCACAGAAAGAGAAGAGTTCTTGTCACAGGCACAGGAAAGGTCTTCTGGTCTCGTTGTTTATACTGGTATGAATAACAAAGGTGATTTCTATATTGGAAATCAGAAGAAATCATCTGCAACTGGTGAAGAAACTAATTTTGATATTCCAGTTCCGACTGTGACTGGTGAAGACCCATCAAGATTAAGTGCAGTATTTGATGAAGTTACAATTAAAGAAAGATTAGTTGTAGAAGGTGGAGATTCTGGACAGGTTCTCTCACAATTTGGTGGTCCTGTTACTTTTGATAAAGATGTAAGAATCAAAGAAGAACTTAAAGTTACTGGTGACACTAAATTAAAAAATCTTTCATCAACCACAAATATTCTACCTATTAATGATAATGTTGATGTTGATGGATCTATCACAGCAGATCAGTTTATTGCAACAACACCATCATTCACAAATATAAATGGAAACGACATATATCATATGTTGCGTTCCAATGGAACTCAAGGTCTCATAACAAGTGGAGAAGTTACAAATGCACTTGGATTTACTCCTGCTTCGATTGGATCAATTACTGGAGATTTTCCTCTTGGCAACTCTATTGTAGTTGATGATATTTCATCACAATTTAATGGAACTCTTACAGATTTTGCATTACTTCGTGCTAGTGCCGCATTTATACCTGCCGGAAGTTCTGCAAACTTAATTGTTTCTCTTGGTGGAGTTATTCAAAAACCAGGGTCTGATTATTTTATTGTTCAATCTGGAGGAGAAAACACAAATACAATAAGGTTCACGACAGCACCTTTATCTGGAACAAGTGCTTTTATTAT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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6e8a5bec529203bc26e55ec562eb64a3871d5a9239eaf27942fd98f072e1d2e4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,8368
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50