Protein
- Genbank accession
- UVD42130.1 [GenBank]
- Protein name
- non-contractile tail tubular protein
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MILDGVYPSFLKGVSQQTPQERSDGQLSAQLNLLSDAVTGLRRRGGVKFQAKLAGIPNSSYIRLIDINGVNYIMIVDTVTGTLKIYNFNGSLIKTHQTNYLKASNGKASIRSTVSRNNCFVLNTEQVITKTPIGGTNPTPNPSTMGYISIRSGQFSKMYSVDIKSGTYSVSLQVSTHGTDAALASPEYVATKFMENITADTTLNSRYDVVREGSTVALKAKSATDTNLLVIESGTGSTYIQTSNSSRVQGKQDIIANLPNILDKYIIAVGTVGNSAYYQYNATTSTWKECGVYEAPYKFTNEPIYWYFDDTDTIQVKSLDIQPRAAGDDDNNPLPKFVDFGITGISAYQSRLVLLSGSYVNMSATADFNVYMRTTVEELQDDDPIEVSSTALSAAQFEYAVPYNKDLVLLAQNQQAVIPANSTVLTPKTAVIYPSSKANISMASEPQVVSRSLYYTYQRGTDYYQVGEMIPNDYADAQYYAQNLADHIPLYATGVCTSITGSTTDNMAVFSSDQKELLVHQYLWAGEDRPLMSFHKWELPYDVLHVQFLQEYLVLFMDVGDDLVVGTINVQLNQLDNKPIPFLDIYQYVDIVDGEGTLPEFLPKGELVAAVYSSETMRHAMVQYEIEGTKIKCQFNGRIYLGVPYESSLTLTPPFVKDSKGRVVAGSNSIVVDLTMTFKGTGEFEYHVSDAYGDVFDGETSAQAWSEAQLGCTRVNTVSDVKFPCGTLLSSTEFSLRTTGTTELNIISTGYNIRIPNRGRRRL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 763 AA molecular weight: 84140,58520 Da isoelectric point: 4,99753 aromaticity: 0,09961 hydropathy: -0,20341
Domains
Domains [InterPro]
IPR058003
7–761
7–761
1
763
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Acinetobacter phage AbpL [NCBI] |
2972532 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UVD42130.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OP171942
[NCBI]
CDS location
range 26500 -> 28791
strand +
strand +
CDS
ATGATTCTTGATGGAGTGTACCCGTCATTCTTGAAAGGTGTATCACAGCAAACACCTCAAGAGCGTAGTGACGGACAATTAAGCGCACAGCTTAATTTATTATCTGATGCTGTAACAGGTTTACGTAGACGTGGTGGGGTTAAATTCCAAGCCAAGTTAGCAGGTATTCCTAATAGTAGTTATATACGTTTAATTGACATCAATGGCGTTAATTATATTATGATCGTAGATACTGTTACTGGTACTTTGAAGATTTATAATTTTAATGGTTCTTTAATTAAAACACATCAAACAAATTACCTTAAGGCTTCCAACGGTAAGGCTAGTATTCGTAGTACAGTGTCTCGTAATAATTGCTTCGTATTAAACACTGAACAAGTTATTACTAAGACACCTATAGGCGGTACTAACCCAACACCTAACCCAAGTACTATGGGGTATATCAGTATTAGGTCTGGACAGTTCTCTAAGATGTACTCCGTAGACATTAAGTCTGGAACATACTCCGTAAGTTTACAAGTATCTACTCATGGTACAGATGCAGCATTAGCGTCTCCTGAATATGTTGCTACGAAGTTTATGGAAAACATAACCGCAGACACAACATTAAATAGTCGTTATGATGTTGTACGTGAGGGTAGTACGGTTGCATTAAAAGCTAAGTCTGCTACAGATACTAACTTATTAGTAATCGAGTCTGGTACAGGTAGTACCTATATTCAGACGAGTAATTCTAGTCGTGTACAGGGTAAGCAAGACATTATTGCTAATCTACCTAATATCCTAGATAAGTACATTATTGCAGTAGGTACAGTAGGTAACTCAGCTTATTACCAATACAATGCTACTACAAGTACTTGGAAAGAGTGTGGTGTATACGAAGCACCTTATAAGTTCACTAATGAGCCTATTTACTGGTACTTTGACGATACTGATACTATTCAAGTTAAAAGCCTAGATATTCAGCCACGCGCAGCAGGTGATGATGATAATAACCCATTACCGAAGTTCGTGGATTTTGGTATTACAGGTATTAGTGCTTACCAATCACGTTTAGTACTACTTAGTGGTTCATACGTTAATATGAGTGCTACAGCAGACTTTAATGTATATATGCGTACCACTGTAGAGGAATTACAGGATGATGATCCTATTGAGGTATCTAGTACTGCTTTAAGTGCTGCACAGTTTGAATATGCTGTTCCATATAATAAAGATTTAGTTTTATTGGCTCAGAATCAACAAGCTGTTATCCCAGCCAATAGTACTGTACTTACACCTAAGACGGCTGTTATCTACCCAAGTTCAAAAGCTAATATTAGTATGGCTAGTGAACCACAGGTAGTGTCTCGTAGTTTGTATTATACATATCAACGTGGTACAGATTATTATCAAGTTGGTGAGATGATTCCTAATGATTATGCAGATGCTCAGTACTATGCACAGAACTTAGCAGACCATATTCCGTTATATGCTACGGGTGTTTGTACTTCAATCACAGGTAGTACTACAGATAATATGGCAGTGTTCAGTTCAGACCAGAAAGAGTTACTTGTACACCAGTACTTGTGGGCAGGTGAAGACCGTCCATTAATGAGCTTCCATAAATGGGAATTACCTTATGATGTGCTTCATGTACAGTTCCTACAAGAGTATTTAGTGCTGTTTATGGATGTAGGTGATGATCTGGTAGTTGGTACTATTAATGTACAGCTAAACCAACTAGATAATAAACCTATCCCATTCTTAGATATTTATCAATACGTAGATATTGTGGATGGGGAAGGTACATTACCTGAGTTCCTACCAAAAGGTGAGTTAGTAGCTGCGGTATATAGTTCTGAGACTATGCGTCATGCTATGGTTCAATATGAAATCGAAGGTACTAAGATTAAGTGTCAATTCAATGGACGTATTTATCTAGGTGTACCTTATGAAAGTTCACTCACACTAACACCTCCTTTTGTTAAAGATAGTAAAGGTCGCGTAGTTGCTGGAAGTAACAGTATAGTTGTCGATCTTACAATGACATTCAAGGGCACAGGTGAGTTTGAGTACCATGTTTCTGATGCTTATGGTGATGTGTTTGATGGTGAAACGTCTGCACAAGCTTGGTCGGAAGCACAACTAGGGTGTACGAGAGTAAATACAGTTAGTGATGTTAAATTCCCGTGTGGTACGCTATTAAGTTCAACAGAGTTTAGTCTTAGGACCACAGGTACAACGGAACTAAATATCATTAGCACTGGTTATAATATTCGTATACCTAATAGAGGACGGAGACGTTTATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
5203fc72e245206a308b07cb9acab9829d89fba16149489468cbff40e758c6ff
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Characterization of terminal redundancy phage AbpL with therapeutic potential against Acinetobacter baumannii skin infections | Liu,D., Lu,S. and Qian,Y. | 2024-11-07 | — | GenBank |