Protein

Genbank accession
AIX43616.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MPLNYLTGRVSRLQVGFPGFSTAKDLTVDVAGAIGIDTQNPRAAADFPDVSIRGDIVDSVGFTGGIGYFLAQDVQGVRWVEAPPINSNAILVLDNGVIVGAGSFIGLNFDSGKDEDFLSVVPDPLNPQIAKIAYDVRWVRYNYGNNKGISTGFGDNGDYSSIPGYGTTEAVGVTSVGIGTNQPLDDFQVGIGSTGVTINGPLGLVDAEIIKAKSISVEGNLEVESLIVRPGVATLTTLDVLNEAFIPVEYVGFSSIQDANIDALFANQLLAGITTLGFGGEDVFILNDLYVQGGLGTFDGDVFVGGDLTVKGETFFNQINAVNLSVSGIATIVQAEIAVGLVTDLKVSGFSTLSDFSFNIGVGTYLELEDLDVSGVGSFGVVNSGDINVSGGLTASEIDADKGYIGILTADSIVSGAGTIGSIESDGNLTTLNDIIVGGASTFVGLGTFQDDLFVGGDLFVRGDVTFKNINGEQLLISGIGTIKELVFDSGIGTSLEVRDQITTGISTINEADIQDAAVERLTVGDAEIIGIATITEIDVDRGRVGILTGTDLSYAGIGTITEIDVDQGRVGLVTGDTLLYYEQSRINRVTFFDNYLSVNQSLRVSGLSTFVGTGTFFNDLYVGGDLYVAGELNFKQLNGENLYLTGVGTIYDLRNTVGFITNLFVEESVTGLATISSLVGSSATITDFTGQSLLIQNPFNPMPLDPTGIPGQGVIDSLLVRNLTSSNNILANDIDANFVDTDDLKAGVGTITDLEWTTAVGDDTTTNTLQVTDTATINIIDANQIDAEDANIGVATLSSLLVTGVTTFKGQVDIEDIEFVDQSVTGISSINILKFNVGYGTYLEVTDSVTGVGTIGLASITTAQVSFLDVRDEVVGASTIGVLSVTEGFAVSGFSTFVGFTTYKGDVFVDGNLTVTGFVSFTQLNADQSQIGILTVFDALDARTGVGTFKHLETVDSAVLSGVSTIGLTTFKNGDVNINRNLTVGGITTFIGNVFIEDTEFVELSVTNQANINKLFVNSGVATQFSIGVATITQSLTGIATIGDLNVTGLSTFVGLATFQGDVYVDSYLEVSKDVVVGSALTVPNLTFTDGDGQFLNIQEEVVGVSTIGFASITDEIVGTSTIFRSNIRDLAVSGLSTFIGDVLMGSNLDVVGDISGTNISIAQSVTSDTLFTRFADIEGSNTGVATIGFATITELFTEDLTVVGTSTFVGFTTMTGDLNIEGNLNVTGVVTFQQLDATQSQIGILTVFNYLDNQGDLRVVGFSTLGDFSANSGILTSIESGEIDVTGDVSIGGTLGVAGEVGFSSNFYTVGITTLASGTGIVTTGGDLYVGGNLFVYNDIVYDEIIGRNLDISGIGTIADLRVGLGSIADLRGTTLRYQTGIITSLRAEDSEVGRHIGTSVVVENITATGPSTFVGVVTTTNELFVGTNLFVGNNADIQGDIFGRNLTLELNASGTTLDFDSGQIDDLISQYILSDDLFVTGITTSVAAQINFLNVSGVTTSPIINSTLLTNSGLVTTGSLYVQGLAQVETTLLVDGNSIFNGPALFNDTVTVNDDINVTGDITFNDISGINGNFAGIVTATKLKSNFLEVNGQTAITGLATFFSGLNVRGGPLVVDNQIFANSGFVTTIQGTDLTYTDGIFLGDLQVNKDTTINQNLRVVGITTSTNLDVSAQTETSLLSVTGVGTIPILYSTNGEFKTSLKTDQLFFNTGLGTYLSVTDLNVVGVATIPTLDIEFLEADRAEIGILTVTNRTDISDTSSIFSYRLTTSGSATNVTLYDSSVYRSFEANIQVSTGSSFQSSKMHGLSDDNSTPNVLFNETSYLSNGGELAEFDVSGSAGNNVILTVTPYTVGITTYILSVTAVRV
Physico‐chemical
properties
protein length:1868 AA
molecular weight: 195169,86030 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,07976
hydropathy:0,29995

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX43616.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019150 [NCBI]
CDS location
range 196015 -> 201621
strand +
CDS
ATGCCTCTAAATTATCTTACCGGAAGAGTAAGTAGATTACAAGTTGGATTTCCAGGGTTTTCAACAGCAAAGGACCTTACAGTTGATGTAGCAGGTGCCATTGGTATTGATACCCAAAACCCAAGAGCAGCTGCCGACTTCCCAGATGTCAGTATCCGTGGTGATATTGTTGACTCTGTTGGATTTACCGGTGGTATTGGGTATTTTCTAGCGCAAGATGTTCAGGGTGTTCGGTGGGTAGAGGCTCCACCTATCAACTCTAACGCCATCTTAGTGTTAGACAATGGAGTTATCGTTGGTGCTGGATCATTCATTGGTCTAAACTTTGACTCTGGTAAGGATGAGGACTTCCTCTCGGTTGTTCCTGACCCACTAAACCCACAGATTGCAAAGATTGCATATGATGTTCGTTGGGTAAGATATAATTACGGTAATAATAAAGGTATCTCCACAGGTTTTGGAGATAATGGTGACTACTCCTCTATCCCTGGTTATGGAACCACAGAGGCAGTTGGTGTTACCTCAGTTGGTATTGGTACTAACCAACCACTAGATGACTTCCAAGTTGGTATTGGATCTACTGGTGTTACTATCAACGGACCTCTAGGTCTAGTTGATGCAGAAATTATTAAAGCAAAATCAATCTCGGTTGAAGGAAACCTAGAGGTTGAATCACTTATTGTTAGACCTGGTGTTGCCACTCTAACCACTCTAGATGTATTGAACGAGGCGTTCATACCAGTAGAGTATGTTGGTTTCTCCAGCATTCAAGATGCAAATATTGATGCTCTCTTTGCTAATCAGTTACTAGCAGGTATTACTACCCTAGGTTTCGGTGGTGAAGATGTATTCATCCTCAACGACTTATATGTTCAGGGTGGTTTAGGTACCTTCGATGGCGACGTATTCGTTGGTGGAGACCTAACTGTTAAGGGTGAGACGTTCTTCAACCAGATTAACGCAGTCAACTTATCAGTATCTGGTATTGCCACTATCGTCCAAGCGGAGATAGCTGTTGGTTTAGTTACCGATCTAAAAGTATCTGGTTTCTCTACACTATCAGATTTCTCATTCAACATTGGTGTTGGTACATACCTAGAACTAGAAGATCTAGATGTATCTGGTGTTGGTAGTTTTGGTGTTGTCAACTCTGGTGATATTAATGTTAGTGGTGGTTTAACCGCTAGTGAGATTGATGCAGATAAGGGATACATTGGTATTCTCACAGCAGACTCTATTGTATCTGGTGCAGGTACTATTGGTTCTATCGAGTCTGATGGGAACCTAACAACACTTAATGATATTATTGTTGGTGGTGCTTCAACCTTCGTTGGTTTGGGTACTTTCCAAGACGATCTCTTTGTTGGTGGTGACCTCTTTGTTAGAGGTGATGTTACCTTTAAGAATATTAATGGTGAACAACTACTAATCAGTGGTATTGGTACCATCAAGGAACTAGTCTTTGATAGTGGTATTGGAACCTCACTAGAAGTGAGAGATCAGATTACGACTGGTATATCTACGATCAATGAAGCAGATATTCAAGATGCCGCTGTTGAGAGACTTACTGTTGGTGATGCAGAGATCATCGGTATCGCAACTATTACCGAGATTGATGTAGATAGAGGTAGAGTTGGTATCCTAACTGGTACAGACCTCTCCTATGCTGGTATCGGTACTATCACGGAGATTGATGTTGACCAGGGTAGAGTTGGTCTAGTCACTGGTGACACACTACTATACTACGAACAGTCTAGGATCAATAGAGTTACCTTCTTTGATAACTACCTATCAGTTAATCAGAGTCTAAGAGTTTCTGGTCTCTCCACCTTTGTTGGAACAGGTACATTCTTCAATGACTTGTATGTTGGTGGTGACCTATATGTTGCTGGTGAACTAAACTTCAAACAACTCAATGGTGAGAACCTATACCTAACTGGTGTTGGTACCATCTATGATCTACGTAACACCGTTGGTTTCATCACCAACCTATTTGTAGAAGAGTCTGTAACTGGTTTAGCAACCATCAGTAGTCTAGTTGGTTCTTCCGCTACCATCACAGACTTCACTGGACAGTCACTACTCATCCAGAATCCATTCAACCCAATGCCTTTGGATCCAACTGGGATCCCAGGACAGGGTGTTATTGATAGTCTCCTAGTTAGAAACCTAACTTCTTCTAACAACATTCTAGCCAATGACATTGATGCCAACTTCGTTGACACCGATGATCTAAAGGCTGGTGTTGGTACTATCACTGACCTAGAGTGGACTACCGCTGTTGGTGATGACACTACTACCAATACTCTACAGGTTACTGATACAGCAACCATTAACATCATCGATGCCAATCAGATCGATGCCGAAGATGCTAATATTGGAGTTGCCACCCTCTCTAGTCTCCTAGTAACTGGTGTCACTACCTTCAAGGGTCAGGTTGATATTGAGGATATTGAGTTCGTTGACCAGAGTGTCACCGGTATTTCCTCTATCAACATCCTCAAGTTCAATGTTGGTTATGGAACTTACCTAGAGGTCACTGACTCAGTAACTGGTGTTGGAACTATTGGTCTTGCCAGTATCACAACCGCTCAGGTATCCTTCCTAGATGTAAGAGATGAGGTAGTTGGAGCATCCACTATTGGTGTTCTATCAGTAACTGAAGGATTTGCAGTATCTGGTTTCTCCACCTTTGTTGGTTTCACTACCTATAAAGGAGATGTATTTGTTGATGGTAACTTAACTGTTACTGGTTTCGTTAGTTTCACACAACTAAACGCTGATCAATCACAGATTGGTATCCTAACTGTATTCGATGCGTTAGACGCTAGAACGGGTGTTGGTACATTCAAACACCTAGAGACAGTAGATAGTGCAGTTCTATCAGGTGTATCTACCATTGGACTCACAACCTTCAAGAATGGTGATGTTAATATCAACCGCAACTTAACAGTTGGTGGTATCACTACCTTCATTGGTAATGTTTTCATTGAGGATACTGAGTTTGTAGAACTAAGTGTTACCAATCAGGCTAACATTAACAAACTATTTGTAAACTCTGGTGTTGCAACTCAGTTTAGTATTGGTGTTGCTACTATCACCCAGTCACTAACAGGTATCGCCACTATTGGTGACCTCAATGTAACTGGTCTTTCTACCTTCGTTGGTCTCGCTACCTTCCAGGGTGATGTTTATGTTGATAGTTACCTAGAAGTATCTAAGGATGTTGTAGTTGGTTCAGCACTAACAGTTCCTAACCTTACATTCACTGATGGTGATGGACAGTTCCTCAATATTCAGGAAGAGGTTGTTGGTGTATCCACTATTGGTTTTGCTAGTATTACAGATGAGATAGTAGGAACTTCCACTATCTTTAGATCCAATATTCGTGACCTAGCAGTATCCGGTCTCTCCACCTTTATTGGTGATGTGTTGATGGGTTCCAACCTAGATGTGGTTGGTGATATATCTGGAACTAATATATCAATTGCACAATCAGTAACCTCCGACACCCTATTCACTAGGTTTGCTGATATTGAGGGATCCAATACTGGTGTTGCTACTATTGGTTTCGCCACTATAACCGAACTCTTCACTGAGGATCTAACGGTTGTAGGAACCTCCACCTTCGTTGGTTTCACAACGATGACGGGAGACCTAAACATTGAGGGTAACCTTAATGTAACTGGTGTTGTTACCTTCCAACAGTTAGACGCAACTCAGTCACAGATTGGTATCCTAACGGTATTCAACTACCTAGACAACCAAGGAGACCTAAGAGTAGTTGGTTTCTCCACACTCGGTGACTTCTCAGCCAACTCCGGTATCCTTACCAGTATTGAATCTGGTGAGATTGATGTAACCGGTGATGTTTCTATCGGTGGAACACTAGGTGTTGCTGGTGAAGTTGGTTTCTCTAGTAACTTCTATACCGTTGGTATTACTACCCTCGCTTCTGGAACTGGTATTGTTACTACTGGTGGTGACCTCTATGTTGGTGGTAACCTATTCGTATATAACGATATTGTATATGATGAAATCATTGGTCGTAACCTAGACATCAGTGGTATTGGTACTATCGCAGACCTCAGAGTAGGTCTTGGTAGTATCGCAGACCTTAGAGGTACAACACTCAGGTATCAGACTGGTATTATTACTTCACTCAGAGCAGAAGATTCTGAAGTTGGAAGACACATTGGTACTTCAGTTGTTGTAGAGAACATAACTGCAACAGGTCCTTCTACTTTCGTTGGTGTTGTTACTACTACTAACGAACTCTTTGTTGGAACTAACCTATTCGTAGGTAACAACGCAGATATCCAAGGTGATATCTTCGGTAGAAACCTAACACTCGAACTAAACGCCTCTGGTACTACACTAGACTTTGATTCAGGTCAGATCGATGACCTTATCTCACAGTATATACTCTCTGATGACTTGTTTGTCACTGGTATTACTACTTCAGTTGCGGCACAAATCAACTTCCTGAATGTATCTGGTGTAACTACTTCACCTATCATTAACTCCACACTACTAACCAACTCTGGTTTAGTTACAACTGGTAGTCTATATGTTCAGGGTCTAGCACAGGTAGAAACAACTCTACTTGTAGATGGTAACTCCATCTTCAATGGTCCAGCACTCTTCAATGATACAGTTACAGTCAATGACGACATTAATGTAACAGGTGATATCACCTTCAACGATATCAGTGGTATTAATGGTAACTTCGCTGGTATTGTTACCGCAACGAAACTCAAGTCCAACTTCCTAGAGGTTAATGGTCAAACAGCCATTACTGGTTTGGCTACCTTCTTCAGTGGATTGAATGTAAGAGGTGGTCCTCTAGTAGTAGATAATCAGATCTTCGCTAACTCTGGTTTCGTTACTACCATTCAGGGTACTGACTTAACATATACTGATGGTATTTTCTTAGGTGATCTACAGGTCAATAAGGATACAACCATCAACCAGAACCTAAGAGTTGTTGGTATCACTAC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
3d43ea692393ae5dffc0ed66b2982585ec4e5beded5b110b46ae190cbb906411
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4727
Evidence 0,4727
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank