Protein
View in Explore- Genbank accession
- XDJ03344.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTSPTF
- Protein sequence
-
MADLEKIQFLRSTVAGKTPTTSQLADGELAINMADYAIYTKNGSSIVQLAGKGIPETNTKKLTVDGPSALNDTVTVAEGKTITFTNENLSGEITRHIVGKCASNDGWYIGSGGTSNNGILEIGTIDDGTETIQIVQRGAGNVEARKLVLLDSSGNTTLPGDLRLTTNKAVKISNGSDLVLEMGVGSNDVYIKNLRGVGVLQLTNDSNLTFRNSQVYYAMSGRGPGKDGTLLTNVENARQLEQDNFPISSGTEARWTKVALLKDPGSNQSRLQLMVTNGGNYGSTRGSIDFIDCSARNFPSTLTSANIRNHLQVRRIGDPGIDNTNQMRYSLVRTSEGLELWFMQRAFISSVKVALLSIAGDTQYYLPTGYTTTSTAPEGLVESVAIRIYDEINKPNLDNGTDGILSIAKGGTGASTADAARTNLGLGTAATRDVGEGAGNVLENGAYGLGGNGGKSISDIISNADMLTRLKSYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANNTALAAGDVKYNELYGTANKPSKADVGLDNLTNDAQVKKAGDTMSGDLLISKESPGLFLNATNDTGNSVIWFRNKGVETGAVWAIPNTESSGEVRIRARTTAGVTGGEFKFKSDGTFTSPGSIDITNGAFNGKTVNTEYANFNNTSSTTTEQTVTISGSQHTPLLLDRPTNSNLSIGFKLSGMNMKRLGIDVNGDIRYGEAENQENNAWLLTSDTVNRWIVNFGRDINVAGVVNSTGGFAGPVTAYDLAGAKLDLNDLTLTGATPGHVKVYSCPSVGGGSNITNKPSGAVGNFIVIVECLRKINDTDYTNRQVLRTSDSKRSWERWVTVSGTSKIWTPWRVNIVNGNDDDVSFKSVTTTTGNLNSGNDLIVANNTRVGGNLGLGGASSTKYADKGVVIGSGSALLETTDGRVIIGSSGGGNAVELRPGGPTQTNNRIKVTATSGSGGDTAIEYEQGAKIRSNNGGDLIVSAKAGQAIYLRPQGDASSTNETRIDSNGSITVNGNINANGTLTCTGGAVNGYLTVSGNVDITGNQLKTTSLWVTGDAAVNGVLTVDGRARFNQEFIVSTSVNVQNTGNSHLVFRKADGTEKGLIWADEPGSVSIRAGGVSGPTWNFWNSGSCQFPGAISNFNGVNSTTNYPGGGSGAYLNTAGLTSRFSNGAYVSLYFQEYVGNYHQAILNVNGYGRDDNFYFRAGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDLRAKSDVKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEILPEAVTQDNEEDGGMLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKNLKAEIEELKSK
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1338 AA molecular weight: 141251,68820 Da isoelectric point: 5,41331 aromaticity: 0,06652 hydropathy: -0,31510
Domains
Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
2–600
ATT
2–600
DC_1942
ATT
574–692
ATT
574–692
IPR030392
CHP
1238–1293
CHP
1238–1293
1
1338
Architecture
ATT 2-692 | RBD 696-778 | STR 779-865 | RBD 866-1338
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1338
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 333 | 333 | 0,0560 |
| Central domain | 334 | 540 | 208 | 0,3248 |
| C-terminal | 541 | 1338 | 797 | 0,6097 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 316 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 316 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-333
1-333
Central
334-540
334-540
C-terminal
541-1338
541-1338
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Klebsiella phage K14-2 [NCBI] |
3156075 | No lineage information |
| Host |
Klebsiella pneumoniae [NCBI] |
573 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XDJ03344.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP978606.1
[NCBI]
CDS location
range 130939 -> 134955
strand -
strand -
CDS
ATGGCTGATTTAGAAAAAATTCAATTCCTACGTAGCACAGTTGCGGGGAAAACACCTACTACAAGTCAGCTTGCAGATGGTGAACTGGCGATCAACATGGCTGATTATGCCATTTACACGAAAAATGGTTCTTCGATCGTTCAGTTAGCGGGTAAAGGTATCCCAGAAACAAATACCAAAAAATTAACAGTTGATGGGCCTAGTGCTCTTAATGATACCGTTACCGTAGCGGAAGGTAAAACTATTACTTTCACCAACGAGAATTTAAGTGGTGAAATAACTCGTCATATCGTCGGTAAATGTGCCAGCAATGATGGATGGTACATCGGTTCCGGTGGTACAAGCAATAACGGCATTCTTGAAATCGGTACTATTGACGATGGTACTGAAACAATCCAGATCGTACAGCGCGGCGCAGGAAACGTTGAAGCTAGAAAACTGGTCTTACTTGATAGCTCTGGTAATACTACTCTTCCAGGCGATTTAAGATTAACTACTAATAAAGCCGTTAAAATTAGTAATGGAAGCGACCTTGTTCTTGAAATGGGCGTAGGCTCTAATGACGTTTATATTAAAAACCTGAGAGGCGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGATAGTAACCTGACGTTCAGAAATTCCCAGGTTTATTATGCTATGAGTGGAAGAGGCCCTGGTAAAGATGGTACTCTTCTGACTAATGTAGAAAACGCGCGTCAGCTTGAGCAAGATAATTTCCCTATATCTTCAGGCACCGAAGCTCGGTGGACTAAAGTTGCTCTTTTAAAAGATCCTGGATCAAACCAGAGTCGCCTGCAACTGATGGTGACTAACGGCGGTAACTATGGTTCTACGCGTGGATCTATCGACTTTATCGATTGTAGCGCTAGAAACTTTCCATCCACTTTAACAAGCGCTAATATTCGTAATCATCTACAGGTTCGTCGAATCGGTGATCCTGGAATTGATAACACTAACCAAATGCGTTATAGTCTGGTTCGTACCTCTGAGGGTTTAGAACTGTGGTTTATGCAACGCGCATTCATTAGTAGTGTTAAAGTTGCTCTGCTGTCTATTGCTGGCGATACTCAGTATTATCTGCCTACTGGTTACACGACTACTTCAACTGCTCCAGAAGGTTTAGTTGAGAGTGTGGCTATTCGTATCTATGACGAAATTAATAAACCTAACCTTGACAATGGTACTGATGGTATTCTGTCTATTGCTAAAGGTGGTACAGGCGCAAGTACAGCGGATGCTGCTCGTACAAACTTAGGGTTGGGTACTGCTGCAACCCGCGATGTCGGCGAAGGTGCTGGTAATGTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGCGGTAATGGTGGTAAATCCATTAGCGACATTATCTCTAATGCGGATATGTTGACCCGCTTAAAATCATACGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGTGTTAGCGTTCAAAATGGTCTTTATAGTCATGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCAGCCATTAATATCGACTATGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATACGCGGCTAACAATACGGCCCTTGCCGCAGGAGATGTCAAATACAACGAACTTTACGGTACAGCAAATAAACCGTCTAAGGCCGACGTAGGGCTTGATAATCTGACAAATGACGCTCAGGTTAAAAAAGCCGGTGATACAATGTCTGGTGATTTGCTTATCAGTAAAGAGTCACCTGGGTTGTTTTTGAATGCCACTAATGATACCGGAAACTCTGTAATTTGGTTTAGAAACAAAGGAGTTGAGACAGGTGCTGTATGGGCAATACCTAACACCGAGTCTTCGGGTGAGGTTCGAATTCGTGCTAGAACGACTGCTGGGGTCACAGGCGGCGAGTTCAAATTTAAATCTGACGGTACATTTACATCTCCAGGTAGTATTGATATTACTAATGGTGCCTTTAATGGTAAAACGGTTAATACCGAATATGCCAACTTTAATAACACAAGTTCAACCACAACCGAACAAACCGTTACTATTAGTGGTTCACAGCACACTCCGCTGTTACTGGATAGACCGACTAACTCGAACTTGTCTATCGGGTTTAAACTTTCCGGAATGAACATGAAACGTTTGGGTATTGATGTAAACGGTGATATTCGTTACGGTGAAGCAGAAAACCAGGAAAACAACGCATGGCTGTTGACTTCGGATACGGTAAACAGATGGATTGTTAACTTTGGTCGTGATATTAACGTTGCTGGTGTGGTTAATTCGACTGGTGGATTTGCTGGCCCTGTTACTGCGTATGATTTGGCTGGTGCTAAACTAGATCTTAATGATTTAACGCTAACTGGCGCTACCCCAGGCCATGTTAAAGTTTATTCATGCCCTAGTGTGGGTGGCGGTAGTAACATCACCAATAAACCTTCTGGCGCAGTTGGGAACTTTATTGTTATTGTTGAATGTCTCCGTAAAATAAACGATACCGATTACACTAACCGTCAAGTATTACGCACATCTGATAGTAAGCGCAGTTGGGAACGTTGGGTAACTGTTAGCGGTACTTCTAAAATCTGGACACCGTGGCGTGTTAATATTGTTAATGGGAATGATGACGATGTATCATTTAAATCTGTTACCACGACTACAGGAAACCTGAACAGTGGTAATGATCTGATTGTTGCTAACAACACTCGCGTAGGTGGTAACTTAGGGTTAGGTGGTGCTTCTTCCACGAAATACGCTGATAAAGGTGTTGTGATCGGTAGTGGTAGTGCTCTGTTAGAAACTACAGATGGTCGTGTGATTATTGGTAGTTCTGGTGGTGGTAATGCTGTTGAATTGCGTCCTGGTGGCCCAACTCAAACCAACAACAGGATCAAAGTAACTGCTACCTCTGGAAGTGGTGGTGATACTGCGATCGAGTATGAACAAGGGGCGAAAATTCGTTCTAATAATGGTGGTGATTTGATTGTTTCTGCTAAAGCAGGTCAAGCAATTTATCTGCGACCGCAGGGTGATGCATCCAGCACAAACGAAACCCGTATTGATTCAAACGGTAGTATCACGGTTAACGGCAATATTAATGCCAATGGTACATTAACTTGTACTGGCGGTGCTGTTAACGGCTACTTGACTGTATCAGGAAACGTAGATATCACTGGAAACCAGTTAAAAACTACATCACTTTGGGTTACGGGAGACGCTGCTGTTAATGGTGTTTTAACTGTTGATGGAAGGGCTAGGTTTAATCAAGAGTTCATTGTATCAACTTCGGTTAACGTCCAGAACACTGGTAACAGTCATTTGGTCTTCCGTAAAGCTGATGGTACAGAAAAAGGACTTATTTGGGCTGATGAGCCTGGTAGCGTTAGTATAAGAGCAGGTGGTGTCTCTGGGCCAACGTGGAATTTCTGGAACAGCGGTTCTTGCCAATTCCCGGGTGCTATTAGTAACTTTAATGGTGTTAATAGTACTACTAATTACCCTGGCGGCGGAAGTGGCGCGTATTTAAATACCGCTGGCTTAACAAGTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGTTTCCTTATACTTCCAAGAATATGTAGGAAATTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAACGGCTATGGTCGAGATGACAATTTCTATTTCAGGGCTGGCGGCGACTTCTTCTGTACTCGCAATGGCTCTTTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCTTAGAGCTAAATCCGATGTTAAAGTTATCGAAAACGCTTTAGAAAAGGTTGAAACATTATCTGGTAATACTTATGAACTTCATAACACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCTGGGTTGATTGCTCAGGAAGTTCAAGAAATCTTACCGGAAGCAGTTACTCAAGATAATGAAGAAGATGGCGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACTCAGTAATTGCACTTCTCGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCCGAAGTTAAAAATCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
7b4e4ce35ec8c490bf28c5a63f3a7d1a19fbda41c96407cb818aab062fe261fe
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50