Protein

Genbank accession
WBY52763.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKIAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHKNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIQYINESGDSKYWTFNRNGSFIVDNGSIEVRAGNISASGNINSATGFVSAPRVNTKNINLSSKTFIPNNDTGYDIVSLPTWIYNPPADGSDRDTNGLNYMRKMRASNTSSIFHEIVDCRSGKPQEISWWTGVGPSSFQWAFDTSGRITAGKSISVGLPDNGTNGRYPLESAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVYDLMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWDFPNNNQAMFTARTDIDGNNNNGDGQTHIGYSSNSKMYHYFRGTGRMSVNMGDGLLVEPGILDIKTGSNRVAIRADGTFDSTQRISMRTGLFLSGDDNTNALSFKAPTGVDGTKTINWDAGTRNGQNKNTVTIKAWGNSFNSTPGNRETVFEVSDSQGYYFYAQRTNPASGQTVGPVNFKFNGTVETGHIVGLGNISASGTGSFGGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSESNLYIIPTPKGAGESGGISNLRPLIIELNTGTVKMSHDVHLGDSGSGTGLLQVSNSLKTIKMICPVTINERNAALTLDSPSSSSANYLQGSKAGIRSWYVGLGGAGSDLSLYSQSYGHGLVISDNFVSISKPLKVGNAQLGTDGNITNGSGNFANLNTTLDRKVTTGWINYSVDSGWYKLATVTMPQGVATVQFKITGGSGFNVGTFRQATINEIVLRSGNNSPKGINGVLWQRETDAIKDIAYINTSGDEYDVYINCGTYLNRLTLEYSTSENASVVVHGLYGPTQSPVEELPVDTVKGRVFKLLNNSSGVFDAGSSNISTNATFVANTTIGFRHKSNGDESGSAAALFYNDGTTFHILLTDKNTDTDKTKASGSYNSLRPFSINIDSGKVTISNSMSVSGVSEFYNGLNIKNNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKTPGGANRFVVNNATVAGINQTNSFGININNALGGNSIAFGDNDTGIKQSADGVLDIITNAARRMRFQTGDTYSDMNINAPNVYIRSDIRLKSNFRPIENALEKVEQLDGLIYDKADYIGGEIVQTEAGIVAQTLQDVLPEAVREVEDIKGNKILTVSSQSQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1268 AA
molecular weight: 135973,22150 Da
isoelectric point:6,92290
aromaticity:0,08438
hydropathy:-0,35276

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
512–652
IPR048390 G3DSA:6.20.80.10 IPR030392
IPR048388
701–773
IPR048388 IPR030392 Coil
WBY52763.1
1 1268
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage REP1
[NCBI] 		3022451 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WBY52763.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ174500 [NCBI]
CDS location
range 159598 -> 163404
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAATCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGACTTAAGCATTTCCGCTGGCGGTAATATCAGTGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAATGGAACATATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACTGCTGGTAATGGTGCTTGGGCAAACCAACATAAAAATAAAGCTCCTATCTTTACCGATTTGAGTTCAACTACTTCTACTTCAGAATACCATCCGCTAATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGTTGGTACGTTAGTAAATGAAGGAAGTTTTAAAATTCAATATATCAATGAATCTGGTGATTCAAAATATTGGACTTTTAATCGAAACGGTAGTTTTATTGTAGATAATGGCAGTATTGAAGTCCGTGCAGGTAATATTTCGGCTTCAGGTAATATTAACTCGGCAACTGGATTTGTTTCTGCACCGCGCGTCAATACAAAAAATATTAACCTGAGTTCTAAAACCTTTATACCGAATAATGACACGGGTTATGACATTGTTTCTTTACCTACTTGGATTTATAATCCACCAGCAGATGGTTCTGACCGTGATACAAACGGATTGAACTACATGCGTAAAATGCGGGCTTCAAATACTTCTAGCATTTTCCATGAAATAGTTGACTGTCGTTCGGGAAAGCCGCAAGAAATTTCTTGGTGGACCGGCGTAGGACCTTCGTCTTTCCAGTGGGCGTTTGATACCTCTGGACGTATTACCGCAGGTAAATCTATTTCAGTAGGTCTTCCTGATAATGGTACAAATGGGCGTTATCCTTTAGAGTCTGCCATTTCCATTGGTATTGCAATTGGCGATAACGATACTGGTATTAAATGGGTCCGTGATGGCGTTTATGACCTGATGGCTAACGGTATTTCATCCGCTACCATTTTGAATAATGGTATTAATAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCCGGTTCTACTTGGGATTTCCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACTGCACGCACCGATATTGATGGTAATAATAATAACGGCGACGGTCAGACTCATATCGGTTATAGCAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGCACGGGTCGTATGTCTGTTAACATGGGCGATGGACTTCTTGTTGAGCCAGGTATTTTAGATATTAAAACTGGGTCTAATAGAGTTGCTATTAGAGCAGATGGTACATTTGACTCAACCCAACGTATTTCAATGCGTACCGGGTTATTTTTATCAGGTGATGACAATACCAATGCTTTGTCATTTAAAGCGCCTACAGGTGTTGACGGAACAAAAACCATTAACTGGGATGCAGGCACTCGTAATGGTCAGAATAAAAATACTGTAACCATTAAAGCATGGGGTAACTCATTTAACTCAACTCCAGGTAATAGAGAAACTGTATTCGAAGTTTCAGATTCACAAGGTTATTATTTCTACGCTCAACGTACTAATCCTGCGTCAGGTCAAACAGTAGGTCCGGTTAACTTTAAATTTAACGGAACTGTCGAAACTGGACATATTGTCGGGCTCGGAAATATAAGTGCCTCTGGTACAGGTTCTTTTGGTGGCAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAGGTAAAAATTGGTGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATATGGTGCTATTTTCCGCCGTTCGGAAAGTAATCTTTATATTATCCCGACTCCTAAAGGTGCCGGAGAATCAGGCGGTATAAGTAATCTTAGACCATTGATAATAGAACTGAACACCGGCACAGTTAAAATGTCGCATGATGTTCATTTAGGAGATTCTGGATCTGGTACAGGATTATTACAAGTAAGTAATAGTCTTAAAACTATTAAAATGATATGTCCAGTAACTATTAATGAACGTAATGCAGCGCTTACTCTAGATTCTCCTTCATCTTCTTCTGCTAATTATTTACAAGGTTCTAAAGCTGGAATTAGATCGTGGTATGTTGGTCTTGGTGGCGCTGGAAGTGATTTATCGCTTTATAGTCAATCTTATGGACACGGTCTTGTTATAAGCGATAATTTCGTGTCAATCAGTAAACCTCTTAAAGTCGGAAATGCCCAACTAGGAACTGACGGTAATATTACCAACGGTTCTGGTAATTTTGCTAACTTAAACACTACTTTAGACCGTAAAGTAACTACCGGCTGGATTAATTATTCTGTCGATAGCGGTTGGTATAAATTGGCAACAGTAACTATGCCTCAAGGTGTGGCTACAGTTCAATTTAAAATTACTGGTGGTTCTGGATTTAACGTTGGTACTTTTAGACAAGCAACAATTAATGAAATTGTATTGCGTTCAGGTAATAACAGCCCTAAAGGAATTAATGGTGTTTTATGGCAACGCGAAACAGATGCTATTAAAGATATTGCGTATATTAATACCTCAGGCGATGAGTATGATGTTTATATTAATTGTGGCACTTATTTAAATAGACTTACATTAGAATATAGCACTTCAGAAAACGCTTCAGTAGTAGTTCATGGATTATATGGGCCTACACAATCACCAGTAGAAGAGCTTCCTGTAGATACTGTTAAAGGTCGTGTTTTTAAACTTCTTAATAATAGCTCAGGCGTTTTTGATGCAGGTAGTTCTAATATTTCTACAAATGCAACTTTTGTGGCAAATACTACTATAGGATTCCGTCACAAATCTAACGGCGACGAAAGTGGCTCTGCAGCTGCTCTGTTTTATAATGATGGTACTACGTTCCATATATTATTAACAGATAAAAATACCGATACTGATAAAACTAAAGCCTCCGGTTCTTATAATAGCTTGAGACCTTTTTCTATCAATATCGATTCAGGTAAAGTAACTATTTCAAACTCTATGAGCGTTTCTGGGGTATCAGAGTTTTATAATGGCCTTAACATCAAAAATAATGGAAGTATTAACTTTGATAAGTCTGGTGCTAACCCGAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGTGATGCTTCTCGCGGTAACCGCATTGAAATTGCAGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAACTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTAGCTGGTATTAATCAAACAAATTCATTTGGTATTAATATCAATAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGTGATAATGATACCGGAATTAAACAATCCGCTGACGGAGTTCTTGATATCATTACTAATGCCGCACGCCGAATGAGATTCCAAACGGGTGACACTTATTCTGACATGAATATAAATGCCCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTGAAATCTAATTTCAGACCTATTGAAAATGCTCTTGAAAAGGTTGAACAGCTTGATGGTTTAATCTATGATAAAGCTGACTATATAGGCGGTGAAATTGTTCAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACACTGCAAGATGTTTTACCAGAAGCAGTTCGTGAAGTTGAAGATATTAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAATCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
4b34e89a956d02262cbe8c6341cba4cb1fe5acf51cfaf8eb2897db76a55aa029
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5196
Evidence 0,5196
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Swapped genetic code blocks viral infections and gene transfer Nyerges,A., Vinke,S., Flynn,R., Owen,S.V., Rand,E.A., Budnik,B., Keen,E., Narasimhan,K., Marchand,J.A., Baas-Thomas,M., Liu,M., Chen,K., Chiappino-Pepe,A., Hu,F., Baym,M. and Church,G.M. 2022 — GenBank