Protein

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Genbank accession
AJA73391.1 [GenBank]
Protein name
host specificity protein J
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MRIYGAKGGGGSSHTPIEAPETGRSKQIVNIVELLCEGEIEGLVDGFKSIYLDGTQIQNDDGTYNFNNVSGQLNVGTQDQDVLDGYDSSQNEVNVGVEIKKKNGAIVRTVTDERINRLRLTLGVRSLFHQNNQGDTNTTNVDLKITIGTRQYSHSFNGKYSSQYLESVVFDNLPPVPFNISVERLTEDSNSQRLQNGTIWSSYTEIIDTEFTYPNSAVAGISFDSEYFNNIPTRNYLIKAKKVKVPSNYDPVKRTYTGFWDGTFKVAWTNNPAWEIYDLAPILSKMLGVEISFDKWALYDVSRYCDQLVPDGMGGQEPRFTCDVWLTEVKTAYDLLNDFCSVFRAIPIWTGTEVSVIIDRPRDPVWTYTNANVVSGFERSYSARKSRHNAVQVTYSDKTNGYESAIEYVSDDEEIKKHGLNLSQITAFGCTSRGQAHRTGKWILETEKREKETITFTVGREGLMHLPGDIIRVADSHYAGTEIGGRVLAINGRKVTLDREISIDNASYFTYINGEATHSTIKIQSVNGKEITLDSTPTGLETYGVWSLSTKQISSGLYRSISIVENADGTNTITALQHEPQKEAIVDNSAHFVETARTLYKAPQINAVEVSTGYDGKLYITGDISSGDGKLTYDIKITKDGNLYQYKKGLSDPNIELSDLPNGDYTVIIYGKNAKGQIVTEKTQTFTIDRPPAPTGVVVTGGLGQITLEWDWVNEVTQTEIFAAETDNFALAKKIAKVTARTYAHTLKGNKVVRYYWLRHTRGINVGPFYQQQGVRGQTAVDLDARLTELNTQLSRNIVNEVFDVAAPARGLELVKTVANLTDKGTKLASSQVYNQADGKLYTWNGTAYSATVAAEDVTGKLSKSKIDTSLISQLTGADNTANLARRLAETAQSNINQEITNRQDAVTAEANNRTKAIQAESANLTKKIQAEATARGAAVTQLQNVDAQQAQLISAVTAKADNALSGLEEEKTARANADKAESQAREALTARMGAAESNIVTIQRTVANNAQSISEVSQNLNAKIDNINIGGRNLLRDSEFNAYNKWGSPQIEFAENANRRTIKVTSTGTNGPVGIVSSNRHSTSYFQQGETYTLSLFARGSKALDYLYLMRQDGNNVRLPVINVASETEFNYYKLTFKAPFTTQQGYFLVGFFQSTPNQFVEFHSLKLEKGNVATDWTPAPEDVDSAVSAVSADLTSYKQTQAATDSAQAQQLNQLSVNLTKAESNLNAKITEEKNARVNADKANAEKLTDITSRVANAESTITNFQSTKANKSEVASIAQQNLQSIWRTDAQSAVDALKIGGANLLVDSEYLTTARWGGSSRVASSQYGDRRLTQVFVTQAGTGHFGVTQGTQKATTRIRQGETYTLSLNAQGTAGFTRTGLNYVYLIREDGGNFRLPTLPLTASLSQRPKVTFTAPWTSNQVRLLIGANGIFEATDWFAFHSVKLEMGNVATGWTPTAKDIDDKVSAVQSNLTAYQAAQAKADQAKATQISGLTTRMGAAESNLTRTERAVTELNQTTVTTLRDLTARTKTTEGSLSRLETAKANKTEVASIAQSSLQSIWKADAKSAVDSLSIGARNLLIDSTYNQHINYNTKMSSITRTVYRGNMLIRLGMLGGAGVAGIVQAPAAQVSNIRQGQEYTLSLNVQGTAGIQKTGLNYVFLMRADGANQRLATIPVIASLANRPKITFTAEWTSERAYLLVGVNGTYENTDWLAFHSVKLEKGNVATDWTPAPEDVESSVSAVSAKIDTIQETLANADSALSSRIDTVTASVGSNLAKITQVSNAVAGVDGKLSSTHTIKTETIAGGRKAIAGIALGAAADNRNAESSVIVMADKFEVVKNAQDGQPVRLFGVAQNKVAINGDLIATGTIKGSHIDADSVRAGILTAGAIRTEHLAAGQISADKLAIGLGGNLLVNPIFATPDLSIAPFGWNYWRGEVGDRLNIDTRTIFNRNEQDNYGLKKGGLPNELVFSMRYSTTKETSDTGRIGWLSQDINVVPNKKYIASVWLACHRGQAKLVIENIEKPGGAYLGRIGNSEVITGYSAHQGEFKNMKRVKVVFTAPTSGCIRFALRLDNIQGKANPFLFARRPMLEEASDNVTDITQPSPWQNAGVTAIHGGSIVTNTVTAQQIAANTITANEIAAGTIAARNMAANSINASHIVGSSITADKLNVNNLAAISANLGKVTAGTITGTTITGNTISGGSINGTTISGTTISGGTIKGARLEGATGKFTGELEVSQLIGGGVIEQVTGKLKYSHRNRIYEGQEYGENSSSPIYRHEYIYKATVTINAAPTRRYIEIIGSESFILEANQSITKTIEKSLNRNASGSSLDFIVLAYSISTAKYISIS
Physico‐chemical
properties
protein length:2352 AA
molecular weight: 255003,89850 Da
isoelectric point:7,36232
aromaticity:0,07313
hydropathy:-0,32585

Domains

Domains [InterPro]
DC_0463
STR
1–1064
DC_0463 DC_2057 Coil DC_2138 DC_2102
IPR053171
Unmapped
3–1026
IPR053171 Coil DC_0568 IPR015406 G3DSA:2.60.120.260
IPR055385
ATT
90–209
IPR055385 IPR032876 DC_1502
AJA73391.1
1 2352
Architecture
STR
ATT
STR
ATT
STR
STR
RBD
STR 1-89 | ATT 90-209 | STR 210-327 | ATT 328-490 | STR 491-1064 | STR 1188-2244 | RBD 2245-2351 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Mannheimia phage vB_MhS_3927AP1
[NCBI] 		1572749 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AJA73391.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KP137439 [NCBI]
CDS location
range 17533 -> 24591
strand +
CDS
ATGCGTATTTACGGAGCAAAAGGTGGTGGCGGCAGTAGCCATACCCCGATTGAAGCACCGGAAACCGGTCGCTCAAAACAGATTGTGAATATTGTGGAATTGCTGTGCGAGGGCGAAATTGAAGGCTTGGTTGATGGCTTTAAATCGATTTACCTAGACGGCACGCAGATCCAAAACGATGACGGCACCTATAATTTTAATAATGTGAGCGGTCAGCTAAATGTCGGTACGCAAGATCAAGATGTGTTGGACGGTTACGATAGCTCACAGAATGAAGTGAATGTGGGTGTTGAGATTAAGAAAAAGAATGGGGCTATTGTCCGCACCGTAACTGATGAACGAATTAACCGCTTGCGTTTAACGTTGGGAGTAAGGTCATTATTCCACCAAAATAATCAAGGCGATACCAATACCACCAATGTTGATTTAAAAATCACGATTGGCACACGGCAATATTCGCATAGCTTTAACGGCAAATACAGCTCGCAATACCTTGAATCTGTGGTGTTTGATAACCTGCCGCCTGTGCCATTTAATATCTCAGTTGAGCGTCTAACCGAGGATAGCAATTCGCAACGCTTACAAAACGGTACAATTTGGAGTAGTTACACCGAAATTATCGATACCGAGTTTACCTACCCTAATTCAGCGGTTGCCGGTATCAGTTTTGATTCGGAGTATTTTAATAATATCCCGACCCGAAACTACCTAATTAAAGCGAAAAAAGTCAAAGTGCCAAGCAATTATGATCCAGTTAAACGCACTTACACCGGCTTTTGGGACGGCACATTTAAAGTTGCGTGGACGAACAACCCTGCTTGGGAAATTTACGATTTAGCTCCGATTTTAAGCAAAATGCTTGGGGTTGAAATCAGCTTTGATAAATGGGCGTTGTATGACGTCTCTCGCTATTGCGATCAGCTTGTGCCGGACGGTATGGGCGGACAAGAGCCACGTTTTACCTGTGATGTATGGCTCACGGAAGTTAAAACTGCCTATGATTTATTAAATGATTTCTGCTCGGTATTCCGTGCGATTCCGATTTGGACCGGCACGGAAGTCTCCGTGATTATCGACCGTCCTCGTGATCCGGTTTGGACTTATACCAACGCTAATGTAGTCAGCGGTTTTGAACGCTCATATTCTGCCCGCAAATCTCGCCATAATGCGGTACAAGTGACCTATTCGGATAAAACGAATGGCTATGAAAGTGCGATTGAATATGTCTCTGACGATGAAGAAATAAAAAAGCACGGCTTAAATTTAAGTCAAATTACCGCCTTTGGTTGCACCTCTCGGGGACAAGCACACCGTACCGGTAAATGGATTTTAGAAACCGAAAAACGAGAAAAGGAAACCATTACCTTTACCGTTGGACGTGAGGGCTTAATGCACTTACCGGGCGATATTATCCGTGTAGCCGATAGCCATTATGCCGGCACGGAAATTGGCGGACGAGTGTTGGCGATTAATGGGCGAAAAGTTACCCTTGACCGTGAAATTAGCATTGATAACGCCAGTTATTTTACTTACATCAACGGTGAGGCGACACACTCAACCATCAAAATCCAATCTGTAAACGGCAAAGAAATTACGCTGGATAGTACACCAACCGGCTTAGAAACCTACGGTGTTTGGTCGTTATCGACTAAACAAATCAGCTCTGGATTATATCGCTCAATCTCGATTGTCGAAAATGCGGACGGCACAAACACTATCACAGCGTTACAACACGAACCGCAGAAAGAGGCAATTGTTGATAACTCCGCTCACTTTGTGGAAACGGCTAGAACACTCTACAAAGCTCCACAAATTAACGCAGTGGAAGTCTCGACCGGTTATGACGGTAAGCTCTACATTACCGGTGATATTAGCTCCGGTGATGGCAAGCTAACCTATGATATTAAAATTACCAAAGATGGCAATTTATATCAATACAAAAAAGGCTTAAGCGATCCGAACATTGAACTAAGTGATTTACCTAACGGCGATTATACCGTCATTATTTACGGCAAAAACGCCAAAGGGCAAATCGTCACCGAAAAAACACAAACCTTTACTATTGATCGACCTCCAGCTCCGACCGGTGTAGTAGTAACAGGTGGATTAGGGCAAATTACCCTCGAATGGGATTGGGTAAATGAGGTTACGCAAACCGAGATTTTCGCGGCCGAAACCGATAATTTCGCCCTTGCAAAAAAAATCGCAAAAGTGACCGCTAGAACCTACGCTCACACACTAAAAGGTAACAAGGTTGTACGCTATTATTGGCTACGTCATACCAGAGGCATTAATGTCGGACCGTTTTATCAACAACAGGGGGTAAGAGGACAAACAGCGGTTGATTTGGATGCTCGATTAACCGAATTAAACACTCAGTTATCACGCAATATTGTTAATGAGGTTTTTGATGTTGCTGCACCGGCAAGAGGTTTAGAATTAGTGAAAACAGTCGCTAATTTGACCGACAAAGGTACTAAACTGGCGTCATCTCAAGTTTACAATCAGGCTGACGGCAAGCTCTATACTTGGAACGGTACAGCATACTCAGCTACAGTGGCTGCGGAAGATGTTACCGGCAAATTATCAAAATCTAAAATTGATACGTCCCTTATTTCGCAATTAACAGGTGCAGATAACACCGCAAATTTGGCAAGAAGATTAGCGGAAACAGCTCAAAGCAACATTAACCAAGAGATTACTAACCGACAAGATGCCGTTACTGCCGAAGCAAATAACCGTACTAAAGCCATTCAAGCCGAAAGTGCGAATTTAACGAAAAAAATTCAAGCTGAAGCAACCGCTCGTGGGGCTGCTGTTACACAGTTACAAAATGTTGATGCTCAACAAGCACAGTTGATTTCTGCTGTCACAGCAAAAGCTGATAATGCTCTTTCAGGCTTGGAAGAAGAAAAAACAGCACGAGCAAACGCCGATAAAGCGGAGTCTCAAGCACGTGAAGCATTAACAGCAAGAATGGGAGCAGCTGAAAGCAATATCGTAACTATTCAACGTACGGTAGCAAATAATGCCCAAAGCATTAGTGAAGTCAGTCAGAATTTAAATGCTAAGATTGATAATATTAATATCGGCGGTCGGAATTTATTAAGAGACAGCGAGTTCAATGCGTACAATAAATGGGGTAGCCCACAAATTGAATTTGCTGAAAATGCAAATCGCCGAACTATCAAAGTAACCTCAACAGGTACTAACGGTCCTGTTGGTATTGTTTCATCTAATCGCCATTCCACATCTTATTTCCAACAAGGAGAAACTTATACACTCTCATTATTTGCTCGAGGAAGTAAGGCACTAGACTATCTCTATCTAATGCGTCAAGATGGGAATAACGTTAGATTACCAGTGATTAACGTTGCCTCTGAAACAGAGTTCAATTATTACAAACTGACGTTCAAAGCACCGTTTACCACACAACAAGGCTATTTCTTAGTTGGTTTTTTCCAATCTACTCCAAATCAATTTGTTGAGTTTCATAGTTTAAAGCTAGAAAAAGGCAACGTAGCCACAGACTGGACGCCAGCACCGGAAGATGTGGACAGTGCGGTTAGTGCAGTTTCCGCTGATTTAACGAGTTATAAACAAACTCAGGCGGCTACCGATTCAGCACAAGCACAGCAACTTAATCAGTTATCTGTGAACTTGACCAAAGCAGAGAGCAATTTAAATGCCAAAATCACGGAAGAAAAAAATGCTCGTGTGAATGCCGATAAAGCGAATGCAGAGAAGCTCACAGACATAACAAGCCGTGTTGCAAATGCGGAATCAACTATTACCAATTTCCAATCAACCAAAGCGAATAAAAGTGAGGTGGCAAGTATTGCCCAGCAGAACTTACAGAGCATTTGGCGCACCGATGCGCAAAGTGCGGTGGATGCCTTGAAAATCGGTGGTGCAAATCTACTGGTTGATAGTGAGTATTTGACGACAGCCCGTTGGGGCGGTAGCTCACGAGTGGCAAGCTCGCAATATGGTGATCGTCGCTTGACTCAAGTGTTTGTGACCCAAGCAGGCACAGGGCATTTTGGTGTGACTCAAGGCACACAAAAAGCCACTACGCGTATTCGTCAGGGTGAAACCTATACCTTGTCACTAAATGCGCAGGGGACGGCAGGTTTTACCCGCACAGGGTTAAACTATGTGTACCTTATCCGCGAAGATGGTGGCAATTTTAGATTGCCAACTTTGCCGCTTACTGCATCATTGTCCCAACGCCCTAAAGTGACATTTACTGCGCCGTGGACGAGCAATCAAGTTCGGTTACTGATTGGCGCAAATGGCATATTTGAGGCGACAGACTGGTTCGCATTTCACAGCGTTAAGCTCGAAATGGGTAATGTTGCCACAGGCTGGACACCAACCGCCAAGGATATTGACGACAAAGTATCAGCGGTTCAGTCCAACCTCACCGCTTATCAGGCGGCACAAGCTAAAGCAGATCAAGCCAAAGCTACGCAGATTTCGGGGCTCACAACCCGAATGGGGGCAGCGGAAAGTAACCTCACTCGCACCGAACGGGCAGTGACGGAACTTAATCAGACAACGGTGACGACACTGCGTGATCTAACCGCGCGCACCAAAACAACGGAAGGTTCGCTCTCTCGTTTGGAAACCGCCAAAGCAAATAAAACTGAGGTGGCAAGTATTGCTCAAAGCTCCTTACAGTCAATTTGGAAAGCTGATGCAAAATCTGCCGTTGATTCACTTTCTATCGGTGCAAGGAACTTACTGATAGACAGTACTTACAACCAACACATCAACTACAATACAAAAATGTCATCAATCACACGCACAGTCTATCGCGGCAATATGTTGATACGACTCGGAATGCTTGGTGGCGCAGGTGTGGCCGGTATTGTACAAGCACCAGCCGCTCAAGTAAGTAATATCAGACAGGGTCAAGAGTACACACTTAGCCTGAATGTACAGGGTACAGCCGGCATACAAAAAACGGGGCTCAACTATGTATTCTTGATGCGTGC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
efe600e154fbf8f2ead4f513c185b4ffeda1942e24f178efc3e20c6430cdf6bc
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6489
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50