Protein

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Genbank accession
CAB4167057.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MARKFLTPIDLNKLELQNARVQNLASAPASPVVGQIYFDTALGYLRSWNGTAWINTSTGAQGATGTTGSQGTTGTTGSQGTTGTTGSQGTTGTQGTTGNTGSQGTTGTTGSQGTTGTTGSQGTTGTTGSQGTVGNTGSQGTTGDTGSQGTTGSTGSQGTTGNTGSQGTTGTQGTDGTQGIAGSTGSQGTTGATGSQGTTGTTGSQGTTGTTGSQGTTGTQGGQGDTYSSTSTTSFTLGSSGSQTITTASTVLDYSVGQDIVVAYDVSNIQYGIVSSYSAGTLIFEKVKFIGSGTYSSWSVNLDGAVGVAGAQGTTGTTGSQGTTGTTGSQGTTGDTGSQGTTGSTGSQGTTGNTGSQGTTGSTGSQGTTGSQGTIGSTGSQGTTGDTGSQGTTGSQGTVGSTGSQGTTGNTGSQGTTGTTGSQGTTGNTGSQGTTGSQGATGTQGTTGNTGSQGTTGSQGTEGLAGDTYSSTSTTSFTLGSSGSQTITTASTTLDYSVGQDIVVAYDVNNIQYGIVSSYSAGTLVFEKVKFIGSGTYSSWSVNLDGAVGVAGSQGTTGTTGSQGTTGTTGSQGTTGTTGSQGTTGSQGTTGTQGTDGTQGTTGSQGTIGSTGSQGTTGTTGSQGTTGSQGTTGSTGSQGTTGSTGSQGTTGSQGTIGSTGSQGTTGTTGSQGTTGNTGSQGTTGSQGIQGTNAGILSVGSGLSLSGGGALTVDTTVIATKAYVDATATGLDVKASVRAATTANGTLATAFANSSVIDGVTLATGDRILIKNQATGADNGIYTVNSSGAPTRSTDADSSAEVTAGLFTFVSEGTINGNNGYVLTTDDVITLDTTALVFTQFSGAGAFTAGAGLTLTGTTFAVGQGTGITVNADDVAIDTAVVVRKYAATITPVSPYSATEFTLTHGLATTDIQVTVYEISSAMEVITDVTYITTNTVTIGFAVAPASGETYRVVVHA
Physico‐chemical
properties
protein length:956 AA
molecular weight: 91206,10190 Da
isoelectric point:4,08584
aromaticity:0,04498
hydropathy:-0,30805

Domains

Domains [InterPro]
DC_2298
STR
7–124
DC_2298 IPR008160 IPR008160 IPR008160 IPR008160 IPR008160 DC_1609
IPR050938
Unmapped
53–472
IPR050938 DC_0656
IPR008160
STR
59–116
IPR008160 DC_1245 DC_1245
DC_1453
STR
106–190
DC_1453 DC_1453
CAB4167057.1
1 956
Architecture
STR
STR
STR 7-691 | STR 700-956
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Uroviricota > Caudoviricetes > Peduoviridae > Maltschvirus maltsch >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4167057.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796798 [NCBI]
CDS location
range 96634 -> 99504
strand +
CDS
ATGGCAAGAAAATTTCTTACACCAATTGATTTAAATAAGTTAGAACTTCAAAATGCAAGAGTTCAAAACTTAGCCTCCGCACCAGCCTCACCAGTTGTTGGTCAAATTTATTTTGATACAGCACTTGGTTATCTTCGTTCATGGAACGGCACTGCTTGGATTAACACAAGCACAGGTGCACAGGGTGCGACAGGCACAACAGGCTCTCAAGGCACAACAGGTACGACTGGTTCTCAAGGCACTACTGGAACAACAGGTAGTCAGGGAACAACAGGTACACAAGGTACTACTGGTAACACAGGCTCACAAGGTACAACTGGTACTACTGGAAGCCAAGGAACAACAGGAACTACTGGCAGCCAAGGTACTACTGGAACAACAGGTTCTCAGGGAACTGTTGGTAATACTGGTTCACAAGGAACAACAGGTGATACTGGCAGCCAAGGAACAACAGGTTCTACAGGTTCTCAAGGAACCACTGGTAATACTGGTTCACAAGGAACTACAGGTACACAAGGTACTGATGGTACTCAGGGAATTGCAGGTTCAACAGGCTCACAGGGAACAACAGGAGCTACTGGCTCTCAAGGTACTACTGGAACTACGGGTTCACAAGGTACAACTGGTACTACTGGTTCTCAAGGTACAACAGGTACTCAAGGTGGACAAGGAGATACCTATTCCTCTACATCTACAACTTCATTTACTTTAGGTTCAAGTGGTAGCCAAACAATTACTACTGCCTCAACTGTTTTAGATTACTCCGTAGGTCAAGATATTGTCGTTGCATACGATGTATCAAATATTCAGTACGGTATTGTTTCTTCGTACAGTGCTGGAACTTTAATCTTTGAAAAAGTTAAATTTATTGGTTCTGGAACATACTCATCTTGGTCTGTAAACCTAGATGGCGCAGTCGGTGTTGCTGGAGCACAAGGTACTACTGGTACAACTGGTTCTCAAGGAACCACTGGTACTACAGGCTCACAAGGAACAACAGGTGATACTGGCAGCCAAGGAACAACAGGTTCTACTGGTAGCCAGGGAACCACTGGTAATACTGGTTCACAAGGAACTACAGGTTCTACAGGTTCTCAGGGAACAACTGGTAGCCAAGGAACCATCGGTTCTACTGGTAGCCAGGGAACCACTGGTGACACTGGTTCACAAGGAACAACAGGTTCTCAGGGAACTGTTGGTTCTACTGGTTCCCAAGGAACTACAGGTAACACTGGAAGCCAAGGAACAACAGGTACTACAGGTTCTCAAGGAACCACTGGTAATACTGGTTCACAAGGAACCACGGGCTCTCAAGGAGCTACTGGTACACAGGGAACAACAGGTAACACTGGTTCCCAAGGTACAACGGGCTCACAGGGAACTGAGGGTCTCGCTGGAGATACCTACTCTTCTACTTCTACAACGTCCTTTACACTGGGGTCAAGTGGTAGTCAAACAATTACTACTGCTTCAACCACACTAGATTATTCTGTCGGTCAAGACATTGTTGTTGCCTATGACGTAAACAATATTCAATACGGTATTGTATCTTCTTATAGCGCTGGAACTTTAGTTTTTGAAAAAGTTAAATTTATTGGTTCTGGAACTTATTCATCTTGGTCTGTTAACTTAGATGGTGCTGTTGGTGTTGCTGGTTCTCAAGGTACAACAGGAACCACTGGCAGCCAAGGTACAACAGGTACAACAGGTAGTCAGGGAACTACGGGTACAACTGGTTCTCAAGGTACTACAGGCTCACAAGGCACTACTGGTACACAGGGTACTGATGGTACTCAGGGAACTACAGGTTCACAGGGAACTATTGGCTCTACAGGCTCACAAGGAACTACAGGAACCACAGGCAGCCAAGGAACAACAGGTAGCCAGGGAACCACAGGCTCCACTGGTAGCCAAGGAACTACAGGTTCTACAGGTTCTCAGGGAACAACTGGTAGCCAAGGAACCATCGGTTCTACTGGTAGCCAAGGTACTACAGGAACCACAGGTTCCCAAGGAACTACAGGTAACACTGGAAGCCAAGGAACTACTGGTTCACAAGGTATCCAAGGTACTAACGCTGGAATCTTAAGCGTTGGTTCTGGTCTATCACTTTCAGGTGGTGGAGCACTCACTGTTGATACTACAGTAATTGCTACTAAGGCTTATGTAGATGCAACTGCAACTGGGCTAGATGTCAAGGCATCGGTCCGCGCAGCAACAACTGCTAATGGAACTCTTGCTACAGCATTTGCAAATAGTTCAGTCATAGATGGTGTCACACTTGCAACTGGCGATAGAATCCTTATTAAGAACCAGGCAACTGGTGCTGATAATGGTATCTATACCGTTAACTCATCGGGAGCCCCTACCCGTTCAACGGATGCCGATTCAAGTGCGGAAGTTACAGCAGGACTGTTTACCTTCGTATCAGAAGGTACCATTAATGGAAATAATGGCTACGTTTTAACAACTGATGATGTTATTACTCTAGACACCACAGCGTTAGTATTTACACAGTTCTCTGGCGCTGGAGCATTCACTGCTGGTGCTGGTCTTACTCTAACTGGAACAACATTTGCAGTTGGTCAAGGAACAGGAATTACAGTAAATGCTGATGATGTAGCAATTGATACTGCAGTAGTGGTACGCAAGTACGCAGCCACCATCACTCCAGTCTCACCGTACTCTGCTACAGAGTTCACACTTACTCACGGACTAGCAACTACAGACATTCAAGTGACTGTCTATGAAATTTCTAGCGCGATGGAAGTTATTACTGATGTTACATACATTACTACTAACACTGTTACAATCGGATTCGCAGTAGCGCCTGCTTCTGGGGAGACATACCGAGTCGTAGTACACGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
3b7b17429984397b7725a9ec05a884c6f135aa458655a4d637e3c10b71c8a6d9
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2986
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50