Protein

Genbank accession
AHX01182.1 [GenBank]
Protein name
putative tail fiber protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,72
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MEKQITRLLPSQEHEVAGVDMFSVVYQKAPIMSPDLYKVQQGITLQEVADELVHPLHHDKMQVWVNGNMVKDLSYKPTNKDVVHVCLTPQGAVVPVWALVTAAISFVAGFLLFKPSIPDFTRPEVGENKQLSRIRGARNEARAYDVIPVVLGKRQVVPAYQATPYTEIRGEDEWFKMLLCVGYGPMQIENIRIGDAPITNYEHRMAIVDHYQNTSLSALRQIWPADIVQETVNVPLAFEGTRTIVNRATVAQIDRVSVDFFYPRGIYRINESTGREQSRTVAVMHEYQDPTDNEWVIVAHSGNVPSAALPFVFKTVDGVSYIKGYTGLVNSVVRSGSTARQRRSNITYEVPNVSQAINVRSRKVSPQDTPDDTKLQDSVEWSVLRSIRNTSEQQFLNLIGDKVPPRYIDGQPVKVFRPVIIALEIKATDQLNGIIDNLNVDATMCVPSDWNVDWRDWTNKTLTPSENPADAYRWLLQGPMNASPLRNARLDLEGMLVWRNRNIQDGWKISSLIDYESTLLKELGQVAFTGRAEFGFIDGRYGVVEKIARYTPVQIFTPKNSRDFSSARTYPEVTDGIKFQFDNREKDYQKDEDIFYDLTIPTNERRGRFTGVDFWGVADRDLAYKHSRFGYYETKLRREVYKLTTDFEGLRATRGDLVRIQNDVIDVGLGSGRIKAITGNQIVIDEMEGLPSEIAETVFWNNSTILFNSDEVFWNNGDDVVVYGFQIRCSNGTISTITATYLGDNTWGTSDPIPVCADVGDLIVYGEAGRETLDCIVDNIEYQNDLVCVLTLINAANEIFELDDDFIPEFESGLTERPDYKVPTPPEFQVGLAGFDIARGLMYVSIGAVPDINEVTGYQLQVRRVSDDPEITLDWVDYEVPQNASQFVVSDVTRGDTYELRARTIGSNRLFSPFTAISTVEVPEGLPAQQIVGVSFDHTLDGTLIKWDQATDADFQYYELRTNVNFSDDVGLVTRTTSNVFNVGYLLGGQTYYVSAKTRFGVYSNTPTQINVSSPVVGTPTSLDIELIRDKTRITWQTPSSSYPIEDYDVRKNTPQTGTGLENSILLTTIKTTLFEIASEEAGEYVYWVRAKDIAGNISDYVTNQVHILSPSTPTGLVATGLFRSVQLNWDQPTYFGHDFTEIYRSLTNDIGDAVKVGDTTGNYFVDAVDGGDTFYYFIRNISVTGTPSNFSASASVTTPANADVLKQDLLNQIGYDQFDVASGVFPVRLVTELPELPNPLYPVGAIVSLAPHGELFNSTGTTWEGVIADIEDGSITTTKIADDAITTPKIFANAITAGKIAAGAVIADKIGANAVTTDKLDANAVTVEKIVAGAVTADKLDVTELSAITGNMGILTAGKIESQQVDSKNKPLVELDLDNANFSLRSAATGGRLEITDERIDVYDANNVLRVRLGRLD
Physico‐chemical
properties
protein length:1418 AA
molecular weight: 157558,94320 Da
isoelectric point:4,70686
aromaticity:0,09309
hydropathy:-0,22511

Domains

Domains [InterPro]
IPR003961
822–925
IPR003961 IPR013783 IPR013783
IPR036116
850–929
IPR036116
AHX01182.1
1 1418
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Nitrincola phage 1M3-16
[NCBI] 		1472912 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Nitrincola
[NCBI] 		267849 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Oceanospirillales > Oceanospirillaceae >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHX01182.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ534580 [NCBI]
CDS location
range 59390 -> 63646
strand -
CDS
ATGGAAAAGCAGATTACAAGGCTTCTACCGTCACAAGAACATGAAGTAGCAGGTGTTGATATGTTTTCGGTGGTTTATCAGAAAGCCCCGATAATGTCCCCCGATCTATATAAAGTTCAGCAAGGCATTACTCTACAAGAAGTTGCAGATGAACTTGTCCACCCGCTTCATCATGATAAGATGCAGGTGTGGGTGAATGGGAACATGGTTAAAGACCTTTCCTACAAACCTACTAACAAAGATGTGGTTCATGTCTGCTTGACTCCTCAAGGGGCTGTTGTGCCTGTATGGGCATTAGTCACTGCTGCTATTTCTTTTGTGGCAGGCTTCCTCTTATTCAAGCCAAGTATTCCTGACTTCACCCGTCCAGAAGTGGGCGAGAATAAACAACTTTCACGTATTCGTGGCGCACGTAATGAGGCTAGAGCCTATGATGTTATTCCTGTTGTATTAGGCAAGCGGCAGGTTGTTCCTGCATATCAAGCAACACCCTATACAGAGATACGTGGTGAAGATGAGTGGTTTAAGATGTTGTTGTGCGTAGGCTATGGTCCTATGCAGATTGAGAACATCCGAATTGGTGATGCCCCTATTACCAACTACGAACACCGTATGGCGATTGTGGATCATTACCAGAATACAAGTCTCTCAGCGTTACGTCAGATTTGGCCTGCTGATATTGTTCAGGAGACTGTTAACGTTCCCCTAGCCTTTGAAGGCACACGTACCATCGTAAACAGGGCTACAGTCGCCCAAATTGACCGTGTAAGCGTAGATTTCTTCTATCCTAGGGGAATATACCGTATTAACGAAAGTACTGGCAGAGAGCAATCTAGGACGGTTGCAGTGATGCACGAATACCAAGACCCAACTGATAATGAATGGGTTATTGTTGCACACTCAGGAAACGTACCTTCAGCAGCCCTACCGTTTGTATTCAAGACGGTTGATGGTGTGAGTTATATCAAAGGTTATACGGGTCTGGTTAACTCTGTTGTACGTTCTGGATCAACTGCCAGACAGCGTAGAAGCAACATTACTTATGAAGTCCCTAATGTATCACAAGCTATCAATGTTCGATCACGTAAGGTAAGCCCTCAAGACACCCCTGATGACACCAAGCTGCAAGATAGTGTAGAGTGGAGCGTACTACGTTCTATCCGAAATACATCTGAACAACAGTTCCTCAATCTCATTGGTGATAAAGTTCCACCAAGATATATTGATGGACAGCCTGTTAAAGTATTCCGTCCCGTTATCATTGCTTTAGAGATTAAGGCAACAGATCAGCTTAATGGTATTATTGATAACCTGAACGTTGATGCGACAATGTGTGTTCCGTCTGATTGGAATGTTGATTGGAGAGACTGGACGAATAAAACTCTAACTCCATCAGAGAATCCTGCTGATGCATATCGTTGGCTGCTGCAAGGTCCAATGAATGCTTCCCCATTACGTAATGCCAGACTAGATCTTGAGGGTATGCTTGTATGGCGGAATCGAAACATTCAAGATGGTTGGAAGATTTCTAGCCTTATTGATTATGAATCAACTTTATTGAAAGAGTTGGGGCAAGTTGCATTTACAGGACGTGCTGAGTTTGGGTTTATTGATGGTAGGTATGGTGTGGTTGAAAAGATTGCACGGTATACACCTGTTCAAATATTTACACCAAAGAACAGCCGAGACTTCTCTTCCGCAAGAACTTATCCAGAAGTAACAGACGGAATAAAATTTCAGTTTGATAACCGAGAGAAAGATTACCAAAAAGACGAGGATATATTCTATGACCTGACAATCCCTACAAATGAACGTAGGGGACGATTTACAGGTGTAGATTTCTGGGGCGTTGCTGATAGAGATTTAGCCTACAAACATTCACGGTTTGGTTACTATGAAACCAAGCTAAGACGTGAAGTGTATAAGCTGACGACAGACTTCGAAGGTTTACGTGCCACACGTGGTGATCTTGTACGTATTCAAAATGACGTGATTGATGTTGGATTAGGTAGTGGTCGTATTAAGGCTATTACAGGGAATCAAATAGTTATAGATGAGATGGAAGGGTTGCCTTCAGAAATCGCAGAGACTGTGTTTTGGAACAACTCAACTATACTATTTAATAGTGATGAAGTTTTTTGGAATAATGGCGACGATGTTGTGGTATATGGTTTCCAGATTCGCTGCTCCAATGGAACCATTTCCACTATTACAGCTACATACTTAGGTGATAACACATGGGGAACATCTGACCCAATTCCTGTATGTGCAGATGTTGGGGACTTAATCGTCTACGGAGAAGCTGGTAGAGAAACACTTGACTGCATCGTTGATAACATTGAATACCAAAATGACTTGGTATGTGTTCTTACCTTAATCAATGCAGCCAATGAAATCTTTGAACTTGATGACGATTTTATCCCCGAGTTTGAATCGGGATTAACAGAACGTCCTGATTATAAAGTTCCAACACCACCTGAGTTCCAAGTAGGTTTGGCTGGATTTGATATTGCCCGTGGGCTGATGTACGTGAGTATTGGTGCTGTTCCTGATATTAATGAGGTTACAGGTTATCAGTTACAAGTTAGACGTGTAAGCGATGACCCAGAGATAACATTAGATTGGGTTGATTATGAAGTGCCTCAGAACGCCTCACAATTCGTTGTGAGCGATGTTACGAGAGGAGATACCTATGAGCTAAGAGCCAGAACAATCGGCTCTAACAGGCTATTTAGCCCCTTCACGGCGATTTCTACAGTAGAGGTTCCAGAAGGATTGCCTGCACAGCAGATCGTTGGTGTCAGCTTTGATCATACTCTTGATGGCACATTGATTAAATGGGATCAGGCAACAGATGCCGATTTCCAATATTATGAGCTGCGTACCAATGTTAACTTCAGTGATGATGTTGGGTTAGTTACAAGAACAACAAGTAATGTGTTCAATGTAGGTTATTTGCTTGGTGGTCAGACGTATTATGTTTCTGCCAAGACTCGGTTTGGTGTGTACAGCAATACGCCTACACAGATCAATGTAAGTAGTCCTGTTGTTGGTACACCTACAAGTCTTGATATTGAGCTGATCAGGGATAAAACCAGAATCACTTGGCAAACACCTTCTAGCAGCTATCCTATTGAAGATTACGATGTTCGTAAGAATACACCACAAACAGGAACTGGGTTAGAGAATAGTATTCTATTGACCACAATAAAAACCACCCTGTTTGAAATAGCTTCAGAAGAAGCTGGGGAATATGTTTATTGGGTAAGGGCTAAGGATATTGCTGGTAATATTTCTGATTATGTTACAAATCAGGTGCATATACTGTCTCCCAGCACACCTACAGGATTGGTGGCAACAGGTTTGTTCAGAAGTGTTCAGTTAAATTGGGATCAACCAACATATTTCGGACACGATTTCACCGAGATATATCGCAGCCTTACGAATGATATAGGAGATGCTGTAAAGGTTGGGGATACAACTGGTAATTACTTTGTAGATGCCGTTGATGGTGGCGACACTTTTTACTACTTCATTAGGAACATCTCTGTCACAGGAACACCCAGTAATTTCTCAGCAAGTGCTTCTGTTACCACTCCTGCGAATGCAGACGTTTTGAAGCAGGATTTGCTGAACCAGATAGGTTATGACCAGTTCGATGTGGCTAGTGGAGTATTTCCTGTACGTCTTGTAACAGAACTTCCTGAATTACCTAATCCTTTATACCCTGTTGGGGCGATTGTATCCTTAGCTCCACATGGAGAGCTGTTCAATAGTACAGGCACTACGTGGGAAGGCGTTATAGCAGACATAGAAGATGGCAGTATCACCACCACAAAGATTGCGGATGATGCTATTACTACACCCAAAATATTTGCTAACGCCATCACTGCTGGTAAGATTGCAGCAGGGGCTGTCATAGCCGATAAGATTGGAGCAAATGCTGTCACAACAGATAAGCTGGATGCTAATGCTGTAACGGTTGAAAAGATTGTAGCAGGGGCTGTGACGGCTGATAAACTTGATGTTACAGAGCTGAGCGCCATTACTGGTAATATGGGGATACTGACTGCTGGTAAGATTGAGTCTCAACAAGTTGACTCAAAGAACAAACCTCTGGTAGAGTTAGATTTAGATAATGCAAATTTCTCTTTGAGGTCTGCTGCGACAGGTGGTAGGTTGGAAATAACAGATGAGAGAATTGACGTTTACGACGCTAATAATGTTTTAAGGGTTAGGTTGGGGAGGTTAGATTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
63e9b7b5bee3e0f1e52663300a02a4033df09523fb51d580c2fbd5b15cfb44bf
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,7553
Evidence 0,7553
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Complete Genome Sequence of a Haloalkaliphilic Bacteriophage, Isolated from Lake Magadi in Kenya's Great Rift Valley Movassaghi,M., Lobo,N., Moulton,K.D., Mwaura,F., Rothschild,L.J. and Duboise,S.M. 2011-07 — GenBank