Protein

Genbank accession
CAB4124088.1 [GenBank]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,90
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MSNTIIQIKRSANQNTPNTLAWGELAYSFVANTLYIGDQANVPVPVGATSAMANLAYGAANSAANTVRVSQNGISTLSAQQLNFVNTSTILITVTPGSGAAAGNANISFDITSPTQGTTGTQGIQGVQGTRGIQGFDGVKGESGGESYEYLFNQDYSLITDPGTGHLSFDAYPILQATYLQINYNDANGQNVYNMLQAIDDSTSGVKGTFKVYNRANTLEYGFYVITGNHFHNGEPFFQVPVDGLDATVDNFSADADLIITFVRTGDIGDTGAQGTQGDVGIQGAQGTLGVQGSSGYVGADGMQGATGSGAQGTQGLAGIQGLFGVQGAFGTQGAQGIQGQIGIQGLGGIQGSFGVQGSLGNQGTTGAQGVVGSQGLSGTQGSLGTQGSIGLQGTIGAQGLAGIQGSLGTQGTIGSQGTIGSQGTIGAQGLNGTQGAFGTQGTLGSQGTIGAQGLVGTQGTLGTKGDTGSFGGASFDYTFLTNTANTDPASGNTKFNNTTLISSTELYIDYNDRFGANVFNYLQTIDDSTSTIKGSFKVANTANVNEFAYFSITGLHWHDTSGSPTSSYFAVPIAGLSSTLVSATFTNLTNVVVTFVRTGDKGDQGIQGLNGTQGAIGTQGSFGTQGTIGSQGTVGAQGTSGSQGTIGAQGTIGSQGSQGTQGTLGRQGTTGSQGLNGTQGTIGTQGTVGAGTQGTIGSQGTIGSQGTIGSQGLAGIQGTLGSQGTVGAGTQGTIGSQGTIGAGTQGSTGSGTQGSTGSQGSTGSGTQGAIGSQGSTGSGTQGSTGSGTQGAIGSQGTTGAGTQGSTGSGTQGSTGSGTQGAIGSQGTTGAGTQGSTGSGTQGSTGTQGSTGSGTQGSTGTQGTVGSQGLAGTQGLLGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLVGTQGTIGSQGLNGTQGSLGTQGTIGSQGLAGTQGSLGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLVGTQGSLGTQGTVGSQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLVGTQGTIGSQGLNGTQGTIGSQGTLGTQGTQGTIGAQGLSGIQGSLGTQGAQGVKGNDGTSVNIKGSVATANAANFTAADPSPALGDGFIATDTGHLWVYTSTGPIVGFSDVGTIVGPQGTTGTTGSQGTIGTQGTIGAQGLAGTQGTFGSQGTLGAQGTIGSQGIIGSQGTVGSQGLAGTQGTGGSQGLAGTQGALGTQGSLGTQGTTGSQGLAGTQGTIGTQGTIGSQGLAGTQGTIGTQGLAGTQGTIGTQGTIGSQGLAGTQGTIGTQGTVGSQGL
Physico‐chemical
properties
protein length:1336 AA
molecular weight: 127089,12230 Da
isoelectric point:4,32621
aromaticity:0,04341
hydropathy:-0,18174

Domains

Domains [InterPro]
IPR008160
412–469
IPR008160 IPR008160 IPR050938
IPR008160
1061–1115
IPR008160 IPR008160 IPR008160
CAB4124088.1
1 1336
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4124088.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796178 [NCBI]
CDS location
range 2 -> 4009
strand -
CDS
ATGTCAAATACTATTATTCAGATTAAAAGATCGGCAAATCAGAATACACCTAATACACTAGCATGGGGCGAATTAGCATATTCGTTCGTAGCAAATACTCTCTATATCGGCGATCAAGCTAATGTTCCTGTGCCAGTTGGCGCAACTTCAGCGATGGCAAATCTAGCCTATGGCGCTGCAAATTCAGCTGCAAATACTGTTAGAGTTTCACAAAATGGAATATCAACATTATCTGCGCAACAATTAAACTTCGTAAATACTAGCACAATACTAATTACTGTAACTCCTGGATCTGGCGCTGCCGCAGGAAATGCTAATATTTCGTTTGATATTACATCGCCAACCCAAGGAACAACTGGAACTCAGGGCATTCAGGGCGTTCAAGGAACTCGCGGCATTCAAGGATTTGATGGCGTTAAGGGCGAGTCCGGTGGCGAATCTTATGAGTATTTGTTTAATCAGGATTATTCTCTAATAACTGATCCTGGAACAGGACATTTAAGTTTTGACGCATATCCTATTCTTCAAGCAACATATCTACAAATTAATTATAATGATGCGAATGGACAAAATGTCTACAATATGTTGCAGGCGATTGATGACTCTACATCAGGAGTTAAAGGAACATTTAAAGTCTATAATAGAGCGAATACTCTAGAGTATGGTTTTTATGTTATTACAGGAAATCATTTTCATAATGGTGAACCATTCTTCCAGGTTCCAGTTGATGGCTTAGATGCAACAGTTGATAACTTTTCAGCAGATGCAGATCTAATTATCACATTCGTTAGAACTGGCGATATTGGCGACACGGGTGCTCAAGGAACACAGGGCGATGTAGGTATTCAAGGCGCGCAAGGAACTTTAGGCGTTCAAGGAAGTTCTGGTTATGTTGGCGCTGACGGTATGCAAGGTGCAACTGGATCTGGTGCCCAAGGAACGCAAGGTCTTGCTGGAATTCAAGGTTTGTTTGGCGTTCAAGGAGCATTCGGTACACAGGGCGCTCAAGGTATTCAAGGTCAAATTGGTATTCAAGGTCTTGGCGGAATTCAAGGTTCGTTTGGTGTTCAAGGTTCTTTAGGTAATCAGGGAACTACTGGTGCCCAAGGTGTAGTTGGATCACAGGGTCTGTCTGGCACGCAAGGTTCACTCGGTACTCAAGGGTCTATAGGTCTACAGGGAACTATTGGTGCACAAGGATTAGCTGGTATTCAAGGATCATTAGGCACTCAAGGAACCATAGGATCACAGGGCACGATTGGATCACAGGGAACTATTGGGGCACAAGGTCTTAATGGCACTCAAGGTGCATTTGGCACTCAAGGAACTCTGGGTTCACAAGGAACTATTGGCGCACAAGGATTAGTTGGAACTCAAGGAACACTGGGAACTAAAGGTGATACCGGAAGTTTTGGCGGCGCAAGTTTCGACTATACGTTCTTAACTAATACAGCAAATACTGATCCAGCTTCAGGTAATACTAAGTTTAATAATACAACTCTTATAAGTTCAACTGAGTTGTATATCGACTATAATGATAGATTCGGTGCTAATGTATTTAACTACCTACAGACAATTGATGATTCTACGTCAACAATTAAAGGTTCATTTAAAGTTGCAAATACTGCTAATGTTAATGAATTCGCATATTTCAGTATAACTGGACTACATTGGCACGATACTAGTGGCTCACCAACTAGCTCATATTTTGCTGTCCCTATCGCAGGATTATCTTCCACTTTAGTATCTGCCACTTTCACTAACTTAACTAATGTGGTGGTGACTTTCGTTAGAACTGGTGATAAGGGCGACCAAGGTATTCAAGGTCTTAATGGAACACAGGGCGCAATAGGAACGCAAGGTTCTTTTGGGACGCAAGGAACGATTGGTTCACAAGGAACCGTTGGTGCACAAGGAACATCAGGTAGTCAAGGAACTATTGGCGCACAAGGAACGATTGGATCGCAAGGTTCGCAAGGAACTCAAGGAACACTAGGCAGACAGGGTACAACTGGATCCCAAGGTCTTAATGGAACTCAAGGAACCATTGGAACTCAAGGAACTGTTGGTGCTGGAACTCAAGGAACCATTGGGTCTCAAGGAACCATTGGGTCTCAAGGAACCATTGGGTCACAAGGTCTAGCAGGAATCCAAGGAACTCTAGGCTCACAGGGTACAGTTGGCGCAGGAACCCAAGGAACGATAGGTTCGCAAGGAACGATCGGTGCTGGAACGCAAGGATCTACTGGATCTGGAACACAGGGGTCTACTGGATCTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACTCAAGGTGCGATAGGTTCACAAGGATCTACTGGATCTGGAACACAGGGGTCTACTGGATCTGGAACTCAAGGTGCGATAGGTTCACAAGGAACAACTGGTGCTGGAACTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACTCAAGGTGCGATAGGTTCACAAGGAACAACTGGTGCTGGAACTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACACAGGGGTCTACTGGAACTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACACAGGGGTCTACTGGAACTCAAGGAACTGTTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAGGGATTATTAGGTACTCAAGGAACCATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACCATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGGTCACAAGGTCTAGTTGGAACTCAAGGAACAATTGGGTCACAAGGTCTTAATGGAACTCAGGGATCATTAGGTACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAGGGATCATTAGGTACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACCATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACCATTGGGTCGCAAGGTCTAGTTGGAACTCAGGGATCATTAGGCACTCAAGGAACTGTTGGGTCACAGGGAACTATAGGGTCACAAGGATTAGCTGGAACCCAAGGAACAATTGGGTCACAAGGTCTAGTTGGAACTCAAGGAACAATTGGGTCACAAGGTCTTAATGGAACTCAGGGAACTATTGGATCCCAAGGAACATTAGGAACCCAAGGTACTCAGGGAACTATCGGTGCACAAGGTCTTAGTGGAATTCAAGGATCATTAGGAACTCAGGGTGCGCAGGGTGTTAAAGGAAATGATGGTACTTCTGTAAATATTAAAGGGAGTGTTGCTACTGCTAATGCTGCCAATTTTACTGCAGCAGATCCATCGCCAGCCTTAGGCGATGGCTTTATTGCTACTGATACTGGACATCTTTGGGTATACACTTCAACTGGACCAATTGTAGGGTTTTCTGACGTAGGAACTATTGTTGGTCCACAAGGAACGACCGGCACTACTGGTTCCCAAGGAACTATTGGTACGCAGGGAACAATTGGGGCACAAGGTCTAGCAGGAACTCAAGGAACATTCGGTTCACAGGGCACTCTTGGGGCACAAGGAACTATTGGGTCGCAGGGAATTATTGGTTCACAAGGAACTGTTGGTTCACAAGGTCTAGCTGGCACCCAAGGAACTGGTGGTTCGCAAGGTTTAGCTGGAACTCAAGGTGCATTAGGTACTCAGGGATCATTAGGCACTCAAGGAACGACAGGATCACAAGGATTAGCTGGAACACAAGGAACGATTGGGACACAAGGAACCATAGGATCACAAGGATTAGCTGGAACACAAGGAACGATTGGGACACAAGGATTAGCTGGAACACAAGGAACGATTGGGACACAAGGAACCATAGGATCACAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGAACTCAAGGAACAGTTGGGTCACAAGGATTA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
7cf7b04fc71fceef9c249aab5b808f89d955dab958806d8c9df6132dc4c95db4
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,4633
Evidence 0,4633
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Literature

No literature entries available.