Protein
- Genbank accession
- QBJ03487.1 [GenBank]
- Protein name
- tail lysin
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MASNSITSITTNQTSVPLIELKLYTEHNIINLKYDNSIKTNNKSLTSGVVSFQTKNAMEDDSSAFSIILSGDFKWDYVIFPNDIISLGVKTNQTGVKNDKNTKLITGMITEVHRVDNYDSDNVVYQLNGRSMANAFMQYKIGLIEEVQESISSMGWLWDTNMDYEAETASGTSSDDTGMQTSVSGGTNARKVWNYWKKQGVSDAGVAGILGNIAYEDGTFDPHTIQHGGGGAVGLYQFDPNGELPGYRNWVSGRKGGIYNLLNQCNYVYHVVHGTAWYNTSIKRAKNAGSAAQSWEKNFERPRVLQDRSDKANAYLKKFKGKSGDSSDDSSDSNSSSSSSKVSGNTNATQEEINNEKSNSKGVAFLGNSCATIESEIMDRFLPYMKYSYGTKGYSLDHFINYSSMTSWDSYEKLQDSSSFVNFKGSLYELQDAILHKPFVEMFYDTDYNGLAHLVVRRTPFNPSDWNGVDSKGNYEIPRVVINSNQVINDDLSKTNSEAYSVFNVNPATANYTGIKNAGELGSLPQFNQQLVNIYGYSILEVTSLYLKGSSTGPLANNTKASGKNSKVLASAGTPYTASDINKLLNKVKLKTLRQKQSTYAQKIANNANNISGQQAAELVSAYLINEKHLTQTKMNGILDTENGGGQSCIGGEGISYKKWLDIVKTYSDAKTYMQECKTTFNNTDDEVLFELRGKYASGGNKLSQKDFKSLLKKYQVSSQNTKIKDEAIDLKFFTQMLFNWYSDDINFLAGNITVPGDSKYRIGEIAEVINENDPKDSMEFYIESVEHTFSFTSGWQTVLGVTRGLKNLGKDRFKHMWGKNQDFLGGYMGEAALNMLAYGTEPTKSSGGSDSTGGAAGGKWGLPFKGHGTIDTNPAQNFGSPRGQGTHDGTDFGFSNFSNGGSIRAIHGGTVKYVGSGAGSWTNSVIIITESDDGYSVCYQEFGTTANAKVKKGDKVKTGDIIGTRNYSGHDHVHVGVTKHGWRKLYNGSYSTSGFEDPLKLIAGKNHGSV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1011 AA molecular weight: 110906,59120 Da isoelectric point: 6,59943 aromaticity: 0,10386 hydropathy: -0,56588
Domains
Domains [InterPro]
G3DSA:1.10.530.10
176–319
176–319
IPR041219
187–319
187–319
IPR011055
877–982
877–982
IPR016047
887–982
887–982
cd12797
888–978
888–978
1
1011
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Lactobacillus phage 521B [NCBI] |
2510942 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QBJ03487.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
MK504443
[NCBI]
CDS location
range 85177 -> 88212
strand +
strand +
CDS
ATGGCATCTAATAGCATAACTAGTATAACTACTAATCAAACATCTGTTCCACTAATTGAATTGAAGCTGTACACAGAACATAATATTATTAATTTAAAATATGATAATTCTATAAAAACTAATAATAAAAGTTTAACTTCTGGTGTCGTTAGTTTTCAAACAAAGAATGCTATGGAAGATGACTCGTCTGCTTTTAGCATAATCCTATCTGGAGACTTTAAGTGGGACTACGTTATCTTCCCTAATGATATTATTTCTCTAGGAGTCAAGACTAATCAAACTGGTGTTAAAAATGATAAAAATACTAAGCTAATTACTGGAATGATTACAGAAGTCCATAGAGTTGACAACTATGATTCAGATAATGTTGTCTATCAGCTTAATGGCCGTTCTATGGCAAACGCTTTTATGCAATATAAAATTGGACTTATTGAAGAAGTTCAAGAAAGTATTAGTTCTATGGGTTGGCTATGGGATACTAATATGGATTATGAAGCTGAAACTGCAAGTGGTACTTCTTCCGATGATACTGGTATGCAAACCAGTGTTTCTGGAGGTACAAATGCAAGAAAAGTATGGAATTATTGGAAAAAGCAGGGAGTTAGTGATGCAGGAGTTGCCGGAATACTTGGTAATATCGCTTATGAAGATGGTACTTTTGATCCTCATACTATCCAACATGGGGGAGGAGGGGCAGTAGGCCTATACCAATTTGACCCGAATGGTGAGCTTCCCGGATATAGAAACTGGGTTTCAGGTAGAAAAGGTGGTATATACAACCTACTTAATCAATGTAATTATGTATATCATGTAGTTCATGGTACTGCTTGGTATAATACATCTATAAAAAGGGCGAAAAATGCAGGAAGTGCCGCACAATCTTGGGAAAAGAACTTTGAACGGCCAAGGGTATTACAAGATAGAAGTGACAAGGCAAATGCGTATTTAAAAAAGTTTAAGGGTAAATCTGGGGATTCTTCTGATGATAGCTCTGATAGTAATTCTTCCTCATCAAGTTCAAAAGTATCCGGCAATACAAATGCTACGCAAGAAGAGATAAATAATGAAAAGTCTAACTCAAAAGGGGTTGCTTTTTTAGGAAACTCCTGTGCTACTATTGAATCTGAAATAATGGATAGGTTTTTACCTTACATGAAATATTCTTATGGTACAAAAGGGTATAGCCTAGACCACTTTATTAATTATTCATCAATGACTAGCTGGGATTCTTACGAAAAACTACAAGATTCTTCTTCATTTGTAAACTTTAAAGGAAGCTTATATGAATTACAAGATGCAATCCTTCATAAACCATTTGTAGAAATGTTCTATGATACTGATTATAATGGTTTAGCACATTTAGTAGTAAGAAGAACTCCTTTTAATCCATCAGACTGGAATGGAGTGGATTCTAAAGGTAATTATGAAATACCTAGGGTTGTTATTAATAGTAATCAAGTTATTAATGACGATTTGAGTAAAACTAATAGTGAGGCCTATTCGGTATTCAATGTCAATCCAGCTACTGCTAACTATACAGGTATTAAAAATGCCGGAGAATTAGGATCACTTCCACAGTTTAACCAACAGTTAGTTAATATATATGGATATAGCATTCTAGAAGTTACTAGTCTTTATTTAAAAGGAAGTAGTACGGGGCCTTTAGCTAATAATACTAAAGCATCTGGTAAAAACTCTAAAGTATTAGCTAGTGCAGGAACTCCTTATACCGCATCTGATATTAATAAGCTTTTGAATAAAGTTAAACTAAAAACACTTAGACAGAAGCAATCCACTTATGCTCAAAAAATAGCTAATAATGCTAATAATATTTCTGGCCAGCAAGCCGCAGAATTAGTTAGTGCTTATTTAATTAATGAAAAGCATTTAACGCAAACTAAAATGAACGGAATATTAGATACAGAAAATGGCGGTGGTCAAAGCTGTATTGGTGGAGAAGGAATAAGCTATAAGAAATGGCTAGATATTGTTAAAACATATTCTGATGCTAAAACCTATATGCAAGAATGTAAAACAACTTTTAATAATACAGATGATGAGGTATTATTTGAACTTCGAGGAAAGTATGCTAGTGGTGGTAACAAGCTTTCTCAAAAAGATTTTAAGTCATTACTTAAAAAGTATCAAGTTTCTAGTCAAAATACAAAAATTAAGGATGAAGCTATTGATTTAAAATTCTTTACTCAAATGTTATTTAATTGGTATTCAGATGATATTAATTTCTTAGCAGGAAACATAACAGTTCCCGGTGACTCTAAATATAGAATTGGGGAAATAGCAGAAGTAATTAATGAAAATGATCCTAAAGATTCAATGGAATTCTATATAGAGTCTGTTGAACACACTTTTAGCTTTACTTCTGGATGGCAGACTGTTTTAGGAGTTACTAGAGGGCTTAAAAACTTAGGAAAAGATAGGTTTAAGCATATGTGGGGTAAAAACCAAGACTTCTTAGGAGGATATATGGGAGAAGCCGCACTTAATATGCTTGCTTATGGTACGGAACCTACTAAATCTTCTGGAGGAAGTGACTCAACAGGAGGTGCCGCTGGAGGAAAATGGGGGCTTCCTTTTAAAGGACATGGAACTATTGATACCAACCCTGCACAAAACTTCGGATCTCCTAGAGGACAAGGAACCCATGATGGAACAGACTTTGGATTTTCTAATTTCTCTAATGGGGGATCAATTAGGGCTATCCATGGGGGAACCGTAAAATACGTGGGATCTGGGGCAGGTTCTTGGACAAATTCTGTTATTATTATTACGGAATCTGATGATGGATATTCAGTATGCTATCAAGAATTTGGAACAACGGCCAATGCTAAAGTTAAAAAAGGAGATAAAGTAAAAACAGGAGATATAATTGGAACAAGAAACTACAGTGGGCATGATCATGTACATGTAGGAGTAACCAAGCATGGATGGAGAAAATTATATAATGGTAGCTATTCTACTAGTGGGTTTGAAGACCCTTTAAAATTAATTGCTGGTAAAAACCATGGAAGTGTTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
53f1acb763d7b2458587e648d58fb7ff494120f8b446d33ec7114825d44de88f
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Isolation of virulent Lactobacillus brevis phages | Feyereisen,M., Mahony,J., O'Sullivan,T. and van Sinderen,D. | 2019-04-26 | — | GenBank |