Protein

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Genbank accession
UQT03243.1 [GenBank]
Protein name
outer surface protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,55
Protein sequence
MFVDPDKPLPPAGAKVDTLGSVLEAIIEIGNAKAVSTGDAAEFERRVTEALQDVDKIIDGFQQDATNAIKAHTDLQGAVHGETKTTVGLDKKENWKMATPQEHLDGESQDTFCNPVGLAALVKKYMSIDPDNYIRSRLMPIASGGQLGNVPQWPFNWKEGEVVESPKPAMDYYTETPWQFSTDQGVRLYPAMNGSDILTQARPDTGRARRAVTPWGGTDVRVYNSTLDLRRTRPGVLRAESNIEPNNQLLRGSPHLFDRHCVYYVEDQSVKVRAFNKIRLPFDILDNAGLFAKNWEGIVESRESTIYNPIVTIQRGNLGSGDSVYLAIDLDLYSFVEHGTAAKDGPGNPSETVATLGDKYTTINWQVGNNKFKIYNRPNTGVKGVYLDIKSILNFTQAQLDGFWNNFNHSHAKHVAFTWLNRLKGEFAIRIPIGFYTKDKKHYINYYMDLSFKSKEVGDGKTATVTIDSLRDIDSNIQTLDDNYQVKPTGRFVEYNADVTNDIFHPLVFNGIFESQGGHIKTYTYYNRQYVGYYQHNVGDTKEWIANGDEIKPKLIKYNYGQISTLNQDGLYGDHLRHIPLNVENGTVNYLTLTRDWANTYRWGICNANLDNKPVMYSSGDHAYGPWRNTLTWMNPNYTRIPDFLVVNEENSSNFDTSCLVFNTQNEFKGYAKFSFDTADTQATVKGVDPVGVDDQILSYIATLGGGWTKNHRQMFYFQNRLYFFSQCLSVAEWPADNVDCYYGWVSGAYIDVTDGVRTIKINGNLKDQVTAKPLKVNNKRSATADWTSVFGRDRFESTDTYLMLMNRNGNVSKYKLMVNLAPHNNFYFEFELTVDAGQGTTTLQPDPGAIDPVFPYDSTTGYNVDYEAVSAYKTLVPHHMHVNFQSPVMMKKSLWSYRKTPGIYGVFSMSGKTTLVNGGLMNAIEGTNIYPMGSLVTIGGGNSLVKLPVDAADKLYPDADELFVRQNGTALELYGRKYNPNNYETEPNAGVVPCGFLKNSTFTHYDQDGWRNALLPVIDSLRMNYYGYGSSFPAFMGIYGEGKPINRFFLNIKGTTFKWDTAQGRAVPLTGSNAIKINGQAVQPNGTGVYNIPSSYTGVVTLEISGLLELKWGKGLVELVEIGSSVSTLNFKNSTDFTITAELPGNVIDLDHTFEGATGSTYKGIEKWDTSNISSMEATFKNAVNFNADISNWDVNNVKSMKEMFMGTKKFNQPIGNWNYHKVLTMESMFENALAFNQNFSNNSPNSLQSASKMFKGTTVFDGDMTNWLTATITDVSGMFKNAQAFTGKGVAKWVVTHLTNAEDMFSATKAFMTSGDLSNWKLTSCVNLRGMFEDSNFNAKVDNWVLAVDVDCTRMFSGTPTFNQPLTNWNFGNIKYVTGMFQQAKGFNQPMPNITWTRCASFNTMFYASVFNSTVKGWKFADANSTAGKNGIDFNYMFAFTKDFNDPDIVDWDTSNVVSMEGTFKNTNLFNQPIGKWNTKSLQTIQGMFRAAVVFNQDISMWDTSKVVDMSEVFMKAAKFNQDISAWNTDSVTSMYSMFETTGAFGTNGNKFSLSKWNTKSVRAANRMFAESKYNASVEGCSWGLSADLTGMFQNNTEFNQPLTGWVVNNVRYVKNMFYGATAFNSSVKDLNWEKCEDFSSMFEGATKFNQDLGTWQFSKWPNGIILSANMFKDCPTFKGIGLDKWTGLNFTSVAGMFQNCTVFEADISNWTINRITNLISTFEGCSSFNCDLTRWDTSKVTLMTSTFKGCSMFNGDISNWNTGMVSDMTSMFMDCTNFKGDISGWNVKNVVRFTDMFNNASAFDADLSAWDTTTCINYSGMFKSAVSFNKNIGSWKTSRAVNMNDMFNGAAKFNQPIGSWDTSIVTDMISMFMGALSFNQDLSKWDVKRVNKHANFDTNAPSWVAPKPNFVL
Physico‐chemical
properties
protein length:1915 AA
molecular weight: 214635,56480 Da
isoelectric point:5,86353
aromaticity:0,12742
hydropathy:-0,38052

Domains

Domains [InterPro]
DC_0481
STR
1–1268
DC_0481 DC_1935 IPR005046 IPR005046 IPR011889 IPR011889 DC_1935
IPR005046
STR
1150–1269
IPR005046 IPR005046 DC_0103 DC_1935
DC_1384
RBD
1574–1670
DC_1384 IPR005046
UQT03243.1
1 1915
Architecture
STR
STR
STR 1-1269 | STR 1282-1912 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
UQT03243.1
1 1915
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 130 130 0,9859
Central domain 131 703 574 0,9627
C-terminal 704 1915 1211 0,0349
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-130
Central
131-703
C-terminal
704-1915

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Serratia phage vB_SmaM-Yubaba
[NCBI] 		2943838 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Serratia marcescens
[NCBI] 		615 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UQT03243.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON287375 [NCBI]
CDS location
range 42930 -> 48677
strand +
CDS
ATGTTTGTAGATCCGGATAAGCCCTTACCACCTGCTGGTGCTAAGGTCGATACACTCGGTTCCGTCTTAGAAGCAATCATTGAAATCGGCAATGCAAAGGCTGTAAGTACAGGTGATGCAGCTGAATTTGAAAGACGTGTAACTGAAGCATTGCAAGATGTTGATAAAATCATCGATGGCTTCCAACAGGATGCAACAAACGCAATTAAAGCCCACACTGACCTTCAAGGTGCGGTGCACGGTGAAACTAAAACTACAGTAGGTTTGGATAAGAAAGAAAACTGGAAAATGGCTACACCTCAAGAACACTTGGATGGTGAGTCCCAGGATACCTTTTGTAACCCAGTTGGTTTAGCCGCGCTTGTTAAAAAGTATATGTCGATAGATCCAGATAACTATATCAGATCTCGACTGATGCCTATTGCATCTGGTGGTCAATTGGGTAACGTCCCTCAATGGCCATTCAACTGGAAAGAAGGTGAAGTAGTAGAATCACCAAAACCAGCGATGGATTATTACACTGAGACCCCTTGGCAGTTCTCTACTGACCAGGGCGTGCGTTTATATCCAGCCATGAATGGTTCCGATATCCTCACGCAGGCAAGACCTGATACAGGCCGTGCTAGACGAGCTGTAACGCCTTGGGGCGGCACAGATGTTCGTGTTTATAATAGCACCTTAGATTTACGCAGAACCCGTCCTGGCGTCTTACGTGCTGAATCTAATATCGAACCAAATAACCAACTGCTCAGAGGTTCACCTCACTTATTTGATCGTCACTGTGTCTACTATGTTGAAGATCAGTCGGTTAAGGTGAGAGCTTTTAACAAAATCAGGCTTCCTTTCGATATCCTTGATAACGCTGGCTTGTTTGCTAAGAACTGGGAAGGTATTGTTGAATCTCGTGAATCTACGATCTATAACCCAATTGTTACTATCCAACGTGGTAACTTAGGTTCTGGCGATAGTGTTTATTTGGCTATTGATCTCGATCTGTATAGCTTTGTTGAACACGGTACAGCTGCAAAAGACGGTCCTGGTAATCCATCGGAAACAGTTGCGACGTTAGGTGATAAATACACCACCATTAACTGGCAGGTTGGTAACAATAAGTTCAAGATTTATAACCGTCCTAATACTGGGGTTAAAGGTGTTTACTTGGATATCAAAAGTATCCTTAATTTCACTCAAGCACAGTTAGATGGTTTCTGGAATAACTTTAACCACTCTCATGCCAAACACGTTGCATTTACCTGGCTCAACCGTTTGAAAGGTGAGTTTGCTATTCGTATCCCGATTGGTTTCTACACCAAGGATAAGAAGCACTACATCAACTACTACATGGACCTGTCATTTAAGTCCAAAGAAGTTGGTGACGGTAAAACAGCAACTGTCACGATTGACTCATTAAGAGATATTGATAGCAATATCCAAACTCTTGATGACAACTATCAGGTTAAACCTACTGGTCGTTTTGTTGAGTATAACGCCGATGTAACCAATGATATTTTCCACCCGCTTGTCTTTAATGGGATCTTTGAATCTCAAGGTGGTCATATCAAAACGTATACTTATTACAATCGTCAGTATGTTGGTTATTATCAACACAACGTTGGTGATACTAAAGAGTGGATTGCTAATGGTGATGAGATCAAACCTAAGCTTATCAAGTATAACTACGGTCAAATCTCTACACTGAACCAAGATGGATTGTACGGCGACCATTTACGTCATATCCCACTTAATGTGGAAAATGGAACTGTAAATTACCTCACTCTAACTCGTGACTGGGCTAACACTTATCGTTGGGGTATTTGTAACGCTAACCTCGATAATAAACCAGTTATGTACAGTAGCGGTGATCATGCTTACGGTCCTTGGCGCAATACCTTAACCTGGATGAACCCTAACTACACTCGCATCCCTGACTTCTTGGTTGTGAATGAAGAGAACTCATCTAACTTTGATACTAGTTGTTTGGTATTCAATACCCAGAACGAGTTTAAGGGTTATGCTAAGTTCAGCTTTGATACTGCTGATACTCAAGCCACAGTTAAAGGTGTTGACCCAGTAGGGGTAGATGACCAGATTCTTTCTTATATCGCTACATTAGGTGGTGGTTGGACTAAGAACCATCGTCAGATGTTCTACTTCCAAAACCGTCTGTATTTCTTCTCTCAGTGTTTATCTGTGGCAGAATGGCCAGCTGATAATGTTGACTGTTATTACGGTTGGGTTAGTGGTGCTTATATTGATGTGACTGATGGTGTCAGAACCATCAAGATCAATGGTAACTTAAAAGATCAAGTTACGGCTAAACCACTCAAGGTAAATAATAAGAGATCTGCAACTGCAGATTGGACTAGTGTATTTGGTCGCGATCGTTTCGAATCTACCGACACCTACCTGATGTTGATGAATCGTAATGGGAACGTTTCCAAATATAAGTTGATGGTCAACCTAGCGCCTCATAACAACTTCTATTTCGAGTTTGAGTTGACAGTTGATGCTGGACAAGGGACTACCACACTTCAGCCTGATCCAGGTGCTATTGACCCAGTATTCCCTTATGACTCAACAACTGGTTATAATGTGGACTACGAAGCAGTATCTGCATATAAAACCCTAGTTCCCCACCACATGCATGTCAACTTCCAATCCCCTGTGATGATGAAGAAATCCTTGTGGAGTTATCGTAAGACTCCTGGGATTTATGGTGTATTTTCCATGTCAGGAAAAACCACTCTCGTCAATGGCGGATTGATGAATGCTATCGAAGGGACCAACATTTACCCTATGGGTTCATTGGTAACCATTGGTGGCGGCAACAGCTTGGTGAAACTTCCTGTTGATGCTGCGGATAAGTTATATCCTGATGCTGATGAACTCTTTGTTCGGCAGAATGGTACTGCCCTTGAGTTGTATGGGAGAAAGTATAATCCTAACAACTATGAGACTGAACCAAACGCCGGTGTTGTGCCGTGTGGATTCTTGAAGAATAGTACATTTACCCACTATGACCAAGATGGTTGGCGTAATGCCTTACTTCCGGTCATCGATAGCTTGCGAATGAACTACTATGGTTATGGTTCATCCTTCCCTGCTTTCATGGGTATCTATGGTGAAGGTAAACCTATTAACCGCTTCTTCTTGAATATCAAAGGAACGACATTTAAATGGGATACTGCTCAAGGCCGAGCTGTTCCACTAACAGGTTCTAATGCCATTAAGATCAATGGTCAGGCTGTACAACCTAATGGAACCGGTGTTTACAATATCCCTAGTTCGTATACTGGTGTCGTAACCTTAGAGATCTCTGGACTCTTAGAGTTGAAATGGGGTAAAGGTCTGGTTGAGTTAGTTGAGATTGGTTCTAGTGTTTCTACACTCAACTTTAAGAACTCTACTGATTTCACCATTACTGCTGAACTACCTGGAAACGTTATTGACTTAGATCATACCTTTGAGGGAGCTACTGGTTCCACGTATAAAGGGATTGAGAAGTGGGATACCTCCAATATCAGTAGTATGGAAGCGACCTTTAAGAATGCAGTTAACTTCAATGCTGACATTAGCAACTGGGATGTTAATAATGTTAAATCCATGAAAGAAATGTTCATGGGGACTAAGAAGTTTAACCAACCCATCGGTAACTGGAATTATCATAAAGTCTTGACCATGGAATCCATGTTTGAGAACGCACTGGCGTTTAACCAGAACTTTAGTAACAACTCACCAAACAGTCTTCAAAGTGCATCTAAGATGTTCAAAGGGACAACAGTGTTTGATGGAGATATGACTAACTGGTTAACAGCTACAATTACTGATGTTTCTGGTATGTTTAAGAATGCTCAGGCATTCACAGGTAAAGGTGTTGCTAAGTGGGTAGTTACACATCTCACTAATGCTGAAGACATGTTCTCAGCAACCAAGGCATTCATGACTAGTGGGGATCTAAGCAATTGGAAACTGACTAGTTGCGTTAACCTGAGAGGGATGTTTGAGGACTCCAACTTTAATGCTAAAGTTGATAACTGGGTATTGGCGGTAGATGTCGATTGTACCAGAATGTTCTCAGGGACTCCTACCTTTAACCAGCCACTTACTAACTGGAACTTTGGGAATATCAAATATGTAACAGGTATGTTCCAACAGGCTAAAGGTTTTAATCAACCGATGCCGAACATCACTTGGACTCGTTGTGCTTCCTTTAATACCATGTTCTATGCATCAGTGTTCAACTCCACTGTTAAAGGTTGGAAGTTTGCAGATGCCAATAGTACAGCCGGTAAGAATGGAATTGACTTCAACTACATGTTTGCATTTACCAAGGACTTTAACGATCCAGACATCGTTGATTGGGATACGTCTAACGTTGTTAGCATGGAAGGTACATTTAAAAATACCAACCTGTTTAACCAGCCAATTGGTAAATGGAATACCAAGTCTCTCCAGACCATCCAAGGGATGTTCCGGGCCGCAGTTGTCTTCAACCAAGATATTTCGATGTGGGATACTTCTAAAGTTGTAGATATGTCTGAAGTATTTATGAAAGCAGCTAAATTCAACCAAGACATTTCTGCTTGGAATACTGATTCTGTCACATCCATGTACTCCATGTTTGAAACAACTGGTGCTTTCGGGACTAACGGCAATAAGTTCTCTCTTAGTAAATGGAACACCAAATCCGTTAGGGCGGCAAATAGGATGTTTGCCGAAAGTAAGTACAACGCCAGTGTTGAAGGATGTTCTTGGGGGTTATCTGCTGACCTTACCGGGATGTTCCAAAATAACACTGAGTTTAACCAACCACTCACAGGGTGGGTAGTTAACAACGTTAGGTATGTCAAAAACATGTTCTATGGTGCAACAGCATTTAACAGTTCTGTTAAGGATTTGAACTGGGAAAAATGCGAAGACTTTAGTTCCATGTTTGAAGGCGCCACTAAGTTCAATCAAGATTTAGGTACATGGCAGTTCAGTAAATGGCCGAATGGAATCATTCTTAGCGCCAACATGTTTAAGGACTGTCCGACATTTAAAGGAATTGGACTTGACAAATGGACTGGATTGAATTTCACCAGTGTTGCCGGTATGTTCCAGAACTGTACTGTTTTTGAAGCAGATATCAGTAATTGGACGATTAACCGTATCACTAACTTGATTAGTACATTTGAAGGATGTTCTTCTTTCAACTGCGACCTAACCAGATGGGACACTTCTAAAGTTACCTTGATGACCAGTACCTTCAAAGGCTGTTCGATGTTCAATGGTGACATTAGTAATTGGAACACTGGTATGGTTTCTGACATGACTTCAATGTTCATGGACTGTACTAACTTCAAAGGTGATATTAGTGGGTGGAATGTTAAGAATGTAGTCAGGTTCACCGACATGTTCAATAACGCCTCTGCTTTCGATGCCGATCTTTCTGCCTGGGATACAACTACCTGTATCAACTACTCTGGCATGTTTAAATCTGCGGTGTCCTTTAATAAGAACATTGGTAGTTGGAAAACTAGCCGAGCAGTTAACATGAATGACATGTTTAATGGTGCTGCTAAATTCAACCAACCAATCGGTTCGTGGGATACGAGCATTGTCACAGACATGATCTCCATGTTCATGGGTGCATTGTCCTTTAACCAAGACTTGTCTAAGTGGGATGTGAAACGTGTTAACAAACACGCTAACTTCGACACGAACGCTCCGTCTTGGGTTGCTCCAAAACCTAACTTTGTACTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
dfb3ca87c5b204205d227b3f773ab3644f0d5ad4ee02c36e25658f0d437dea13
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6928
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50