Protein

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Genbank accession

QCW18942.1 [GenBank]

Protein name

tail fiber protein

RBP type

Evidence GenBank

Probability 1,00

Evidence Phold

Probability 1,00

Evidence RBPdetect2

Probability 0,96

Protein sequence

MYSIKTDLDVSGNGTINKDLLVKGNAVVKGDLKVEGTVDFAHATFTQIDVSGTANLKDITSTGTAALTTVSVSGNTTLGDASTDTLNVKATSTFDAPVTLNGNVTQTTGTAAFKATSVDSLTVAGESQLNGDLVMGTGTKATMKDLETDTLKVNGDSVIGGTLNVTGASTFGDVVINGTLSGNYTMDAGNFNSIKVAQLSDLNNVNIKGTTTITGNITASNSTMNLKHLYMRGADAIIDFDYADPSRPTDIKSSVEPYQISSNYFLSKNIKSNAAEIGVVGGTEGLHAIGRANIDYLNITGNSTIGDQTQLQVAGKSVFTGKTTVGDLEITGSVTGLSFSDLNVDSLTVSGLSQLQGGVSVGGNITGSTTSIASFSTITVRDGTGGNHGIIQFAYSDENRPTDIKSSIEPYQISSNNFLGKELKTNSAEIGVVGGTEGLHAIGKATIDYLKIAGNSTIGTASPQLEVTGKSILGDVDFTGTVTGLTVDVSGQDLTPNSVTTAAGVVGETLESKTTTKVGTNLTVGGTASVTGNASFGGDVNVTGQTVTVKDLVVTGSVTGVTAEANVDGLDIAPNSVTSTTYVKSATLEVSGASTLQDVTVKGTISGDAGAAVQVNKLNSAGTITATGNISAPSAQFTGSDVALDVTNNATIGGTLNVTGKTTVGDLTVTGTLIPGNLDLSQTDIASQSITTTGNANIGGDLVVTGTVDLSSADVSVKSLTTPGIVTSTDLVNASKLPVLNSNTITATEIDATDLTVTGQSVVKDLSASGKVTAGSVQTATITNADGITLSNNTTASGDLTVNGTLVLAGALDLSSVDIEAKSIHTTENASFDGNLSVGGTVDLTGADVTAISFTASDTVKTNTFPVLSSTTATIANATVTDLNATTSKVGTLTATGNTTLAGLTAGASVLESATVTGDATINGNITSTNSTVAIDKNTSVTGDLAVSGTLTAGVIDLSTTDVSVKSLDSLGNAHVAGDLTVDGQFDLSATNLQAASLASTGNTTVGADLVLTTGIITGSPKISGTLNVTGATTLAGLNAGSSTLNSATVTTTLNVSGATTLADLSATSATAGTLSTTGKATLNSAEIATNAVVKGNLTIEGILLPQGGLDLTGADIEANSITLAAGASVGSTLNVTGLSTLAGVNSGNHSITGTLNVSGESKLSDVSVGNNLTVTGTTTLTDNLTVNGANTTLKKTKTDNLHVGTLTWDEAKYIAEIGGDVHISGNIDVDGLITADLDLTGRSIAPRQVTTSADVTVGTTLNVIGQSTMASAIIGDVGSVNNNLQINGNTVCTGDFTVQGKIIGTLDQSTSDVVAKSVTASTFVKAATAEITSTSSFGGKVTASAGVSVTGGTTSDTITTTGLATLDSAKVTTSLGVTGDTTVGGTLGVTGETTLAATTISSLTVSGESGFTGKATFVDLESTGSITAKDVTITGTLNTDIADLVTSSVTTSKYEVKAAASEVVGATWTPDGSSNVYNITLSEPTLDIPTFPYRQGYAGSWFIYVTQPAAGGCTINWVPPFGLIGDSKINEAANSVSICQVVYSGVGDKLDVFIAQRNL

Physico‐chemical properties

protein length:	1560 AA
molecular weight:	155765,15440 Da
isoelectric point:	4,28858
aromaticity:	0,03269
hydropathy:	0,12500

Domains

Domains [InterPro]

DC_0092
STR
1–171

DC_0092 DC_0092 DC_0092 DC_0931

DC_0092
STR
143–322

DC_0092 DC_0062 DC_0092 IPR058970

QCW18942.1

1 1560

Architecture

STR

RBD

STR 1-790 | STR 862-1210 | RBD 1211-1560

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0092	STR	DC_0092	1	171	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	143	322	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	306	539	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0062	STR	DC_0062	508	790	Novel HMM	DC_0062	Central	Low	Positional only	50 proteins / 50 hits
DC_0092	STR	DC_0092	862	1051	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1013	1210	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0931	RBD	DC_0931	1159	1560	Novel HMM	DC_0931	C-terminal	Low	Positional only	65 proteins / 65 hits
IPR058970	RBD	DC_0552	1469	1549	InterPro cluster	Putative phage tail fibre, C-terminal domain	C-terminal	Low	Positional only	292 proteins / 292 hits

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Salmonella phage 7t3 [NCBI]	2575254	Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi [NCBI]	90370	Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Salmonella

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

QCW18942.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

MK773491.1 [NCBI]

CDS location

range 203507 -> 208189
strand -

CDS

ATGTATTCTATTAAAACTGATCTAGACGTTTCTGGGAATGGTACAATCAATAAAGATCTACTTGTTAAAGGTAATGCTGTCGTTAAAGGTGATCTTAAAGTTGAAGGTACTGTGGACTTTGCACATGCAACGTTTACCCAAATTGACGTTTCTGGAACAGCTAACCTTAAAGATATTACATCTACTGGAACAGCAGCACTAACTACTGTCTCAGTATCCGGTAATACCACATTAGGCGATGCAAGTACAGATACACTAAATGTAAAAGCCACAAGCACATTTGATGCACCTGTGACTTTAAACGGTAACGTCACACAAACTACCGGAACTGCTGCATTTAAAGCAACTTCTGTTGATTCATTAACCGTAGCTGGTGAATCTCAATTAAACGGTGACCTAGTAATGGGAACTGGTACAAAAGCTACGATGAAAGATTTAGAAACTGATACATTAAAAGTAAATGGTGATTCAGTAATCGGTGGAACACTAAATGTTACAGGTGCAAGTACCTTTGGTGATGTTGTTATTAACGGTACACTTTCAGGTAACTACACAATGGATGCTGGTAACTTTAACAGCATTAAAGTAGCACAATTAAGTGATCTAAACAACGTAAACATTAAAGGTACTACAACTATTACCGGTAATATTACCGCATCTAATAGTACTATGAACCTAAAACACCTATATATGCGTGGTGCTGATGCTATTATCGATTTCGATTATGCTGACCCATCTCGTCCAACTGATATTAAATCAAGTGTTGAACCATATCAAATTAGTTCTAACTATTTCCTAAGTAAAAATATCAAATCTAATGCTGCTGAAATCGGTGTTGTTGGTGGTACTGAAGGACTACATGCTATCGGTAGAGCAAACATTGATTATCTAAACATTACTGGTAACAGTACTATTGGTGATCAAACACAACTACAAGTTGCTGGTAAATCCGTTTTCACTGGTAAAACAACTGTTGGTGATTTAGAAATTACTGGTTCTGTAACAGGTCTATCCTTTAGTGATCTAAATGTAGATTCTCTAACTGTTTCTGGTTTATCTCAACTACAGGGTGGTGTATCCGTAGGTGGAAACATTACTGGTTCTACAACCTCCATCGCATCATTCAGTACTATTACTGTTCGAGATGGCACTGGTGGTAATCACGGTATTATTCAATTTGCTTATTCTGATGAGAATCGCCCAACTGATATTAAATCAAGTATTGAGCCATATCAAATTAGTTCTAACAACTTCCTTGGTAAAGAACTAAAAACTAATTCCGCTGAAATCGGTGTTGTTGGTGGTACTGAAGGTCTACATGCTATTGGTAAAGCAACTATTGATTACTTAAAAATTGCTGGTAATAGTACAATTGGTACTGCATCACCACAATTGGAAGTAACTGGTAAGTCAATTCTTGGTGATGTTGATTTCACTGGTACTGTAACTGGTCTAACTGTTGATGTTTCTGGTCAAGACCTAACACCAAACTCAGTAACAACTGCTGCTGGTGTTGTTGGTGAAACTCTAGAATCTAAAACTACAACTAAAGTTGGAACCAACCTAACTGTAGGTGGCACTGCATCTGTAACCGGAAATGCCTCTTTTGGTGGCGATGTAAATGTAACTGGTCAAACTGTAACCGTCAAAGATTTAGTAGTAACTGGTTCCGTTACTGGTGTAACTGCTGAAGCTAACGTAGATGGTCTAGATATTGCTCCTAATTCTGTAACTTCTACTACCTATGTTAAATCAGCAACACTAGAAGTTTCCGGTGCAAGTACATTACAAGACGTGACAGTAAAAGGTACTATTAGTGGTGATGCTGGGGCTGCGGTTCAAGTTAATAAACTAAATTCCGCTGGTACTATTACAGCAACTGGTAACATTTCTGCACCGTCTGCACAATTTACTGGTTCTGATGTAGCACTAGACGTTACAAATAACGCAACAATCGGTGGTACTTTAAATGTAACTGGTAAAACAACTGTTGGTGATCTAACAGTAACTGGAACTCTCATTCCGGGTAATCTTGATCTATCACAAACTGATATTGCATCACAATCTATTACTACTACTGGTAATGCAAATATCGGTGGCGATTTAGTTGTTACTGGTACTGTAGATTTATCTTCTGCTGATGTTAGTGTTAAATCCTTAACTACTCCGGGTATTGTAACTTCAACTGATTTGGTTAATGCTAGCAAACTACCTGTATTAAACTCTAATACAATAACTGCAACCGAAATTGATGCAACAGACCTTACCGTAACTGGTCAATCAGTTGTTAAAGATCTATCTGCAAGTGGTAAAGTTACTGCTGGTTCAGTTCAGACTGCAACTATTACAAATGCTGATGGTATTACATTATCAAACAATACTACCGCTTCTGGTGATCTAACTGTTAATGGTACTCTAGTTTTAGCTGGTGCTCTTGATTTAAGTTCTGTAGATATTGAAGCAAAATCAATTCATACAACTGAAAACGCATCATTCGACGGTAACCTATCAGTCGGTGGAACAGTTGACTTAACTGGTGCTGATGTAACAGCTATTAGTTTCACTGCATCTGATACTGTTAAGACTAATACATTCCCTGTATTATCTTCAACTACTGCAACAATTGCAAATGCAACTGTCACAGATTTGAATGCAACAACTTCTAAAGTTGGAACATTAACTGCAACTGGTAATACCACTCTTGCTGGTCTCACTGCTGGTGCAAGTGTGTTAGAATCTGCAACTGTAACTGGTGATGCAACAATCAATGGTAATATTACATCAACTAATAGTACTGTTGCAATTGATAAAAATACTTCAGTAACTGGCGATCTAGCCGTGTCTGGTACATTAACTGCTGGTGTTATTGATTTAAGTACAACTGATGTATCTGTTAAATCTCTAGATTCTCTAGGTAATGCACACGTTGCTGGTGATTTAACCGTTGATGGTCAATTCGATCTAAGTGCAACTAATCTACAGGCTGCATCTCTAGCAAGTACCGGGAATACTACAGTTGGTGCAGATCTAGTACTAACAACTGGAATTATTACTGGTTCTCCAAAAATTAGTGGCACATTAAATGTAACTGGTGCAACTACACTTGCTGGTTTAAATGCTGGTTCTAGTACTCTAAATTCTGCAACTGTAACTACTACATTAAATGTATCTGGTGCAACTACACTTGCTGATCTATCAGCTACTTCAGCAACTGCGGGTACACTAAGCACAACTGGTAAAGCAACTCTTAATTCTGCGGAAATTGCAACAAACGCGGTAGTTAAGGGAAATCTAACAATTGAAGGTATCCTACTACCTCAAGGTGGTTTAGACCTAACTGGTGCAGATATTGAAGCAAATAGTATTACACTAGCTGCTGGTGCATCTGTTGGCTCAACCTTAAATGTTACAGGTCTAAGTACACTAGCTGGTGTTAACTCAGGTAATCATTCTATTACTGGAACTTTAAATGTTTCTGGTGAAAGTAAACTAAGTGATGTTTCTGTTGGTAATAACTTAACTGTTACGGGTACTACTACTCTAACTGATAACTTAACAGTAAACGGTGCAAACACCACATTGAAGAAAACTAAAACTGACAATCTACATGTTGGTACTCTAACTTGGGATGAAGCGAAATATATTGCTGAAATTGGCGGTGACGTCCATATTAGTGGTAATATCGATGTTGATGGTTTAATCACTGCTGACCTTGACTTAACTGGTCGTTCTATTGCACCACGTCAGGTTACAACATCTGCTGATGTAACTGTTGGTACAACTTTAAATGTTATCGGTCAAAGTACTATGGCATCTGCTATCATTGGTGATGTTGGTTCTGTGAATAACAACCTACAAATTAATGGTAATACTGTATGTACTGGTGACTTCACAGTACAAGGTAAAATTATCGGTACACTAGACCAATCAACATCTGACGTTGTTGCTAAGTCTGTTACTGCTTCTACTTTTGTTAAAGCCGCAACTGCTGAAATTACTTCTACATCTTCATTTGGTGGTAAAGTGACTGCTTCTGCTGGTGTTAGTGTAACAGGTGGTACAACCTCAGATACTATTACTACCACAGGTCTAGCAACACTAGATTCTGCCAAAGTAACTACTTCACTTGGTGTTACTGGTGATACTACTGTTGGTGGTACTTTAGGCGTTACTGGTGAAACTACATTAGCTGCAACTACCATTAGTTCACTAACTGTAAGTGGTGAAAGTGGATTTACTGGTAAAGCAACGTTTGTAGATCTTGAAAGTACTGGTTCTATTACTGCTAAGGATGTAACCATTACTGGTACTCTAAATACTGATATTGCTGATCTAGTAACAAGTTCTGTAACAACTAGCAAATACGAAGTTAAAGCCGCAGCGTCTGAAGTTGTTGGTGCAACATGGACACCTGATGGTTCTAGTAACGTGTATAACATTACTTTATCTGAACCAACATTGGATATTCCAACATTCCCATATCGTCAAGGATATGCTGGTTCTTGGTTCATTTATGTTACTCAGCCAGCAGCGGGCGGTTGCACAATAAATTGGGTTCCACCGTTTGGTCTAATTGGTGATTCTAAAATCAACGAAGCAGCAAACTCCGTATCCATCTGTCAAGTAGTTTACAGTGGTGTTGGTGATAAACTCGATGTGTTCATTGCACAACGTAATCTATAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

fd4e40ef6847d11f36d9431c1c88d89a6c42e1d8c17e0867bc7bf04890d32b12

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,5350

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence