Protein
- Genbank accession
- XCI77916.1 [GenBank]
- Protein name
- tail protein
- RBP type
-
TSPTSPTSPTF
- Protein sequence
-
MASVITIAGEKLFATKAQANEQLDIDTFIFANVPAQDATAPINREEGLPTDHVVHQQIVQQVGRINDNVVVYSTVLDSITGPFEFNWVGLYSSINNTLVAINHIPTTPKTATAAGVAGNTLNRNFGIEYSGIADLTGITVAPETWQLDFTARLQGMDKLTQKLAKDLNGTDSFIDDGFKVVSRSTANTFSVLPGVGYVNGLRVEILEEQILIADSYPKNVYINAYFDGDASSVWEPKNNVSITNEELTDYIDGNGKNHYLVKLANIIAADQVEDMRVDFNLVKNSTERNFATVDEAKNDKLLKVGQKITIDERDGAKFKVVDSAGLFIDEYAIISTCKNSNALKIEIEGNSVTLISLGAKDDGVEGDGLGSPATGFDNGPVLQAAQRLREENKCNVKITRKDKGVYRYRQTIIAEKDSFSIIGEQSDNIFESGAKLYFDPENGEKVGFKSLQPSSIFSYVFFDSINRFSGIEHVSASHVDINNKQDVDIIFDRCTFRNFENAVSVEGRGFLAYDCSFSVGRNALKIDWPDGFIEGELPEKSKYMGMRGYTQRNCEYHAMNGHAIVNQGGNAINANNINIIGANADTSIGLLKGSARDSTFESNNLTQGEMEVFDIGSGKLENVSVSGGLLMGMNAESGGRRGLRGVLLALAGSTIRDVSFSGVNMSEIDRNVFYCAGDVDGLTINGGVVSKFMNDNISSLSYRNYINLINATSVKDVKVNNVLLKNKDYENNPNELISVKLEHLSNVHVSSVIYDGSVIDLLPENLTGSAYNLKKLTYTGDGEAAKIIYTGNRVIETVIVSERNGSSRPNATYIATEFGASSDPIEIQGGSNVMARDHFNESGAVYQAVIYF
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 852 AA molecular weight: 92856,65400 Da isoelectric point: 4,84367 aromaticity: 0,08333 hydropathy: -0,22383
Domains
Domains [InterPro]
IPR022225
3–156
3–156
1
852
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudoalteromonas phage vB_Psp_PY3 [NCBI] |
3155224 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XCI77916.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP793001
[NCBI]
CDS location
range 27680 -> 30238
strand +
strand +
CDS
ATGGCTTCAGTAATTACAATCGCAGGTGAAAAGCTTTTTGCTACTAAAGCGCAAGCTAATGAGCAACTAGACATAGATACGTTTATATTTGCAAACGTACCCGCGCAAGACGCAACAGCCCCAATAAACCGCGAAGAGGGCCTACCAACCGATCACGTAGTGCATCAACAAATTGTGCAGCAAGTTGGCCGCATAAACGACAACGTAGTTGTTTACTCAACAGTACTCGACAGCATTACAGGCCCGTTTGAGTTTAACTGGGTGGGTTTATATTCATCAATTAATAATACATTGGTAGCAATTAACCACATACCAACCACACCAAAAACAGCTACCGCCGCAGGTGTTGCAGGTAATACCCTAAATCGTAACTTTGGTATTGAGTACTCAGGCATTGCCGACCTAACTGGTATTACTGTAGCACCAGAGACATGGCAACTAGACTTTACCGCCCGCTTGCAAGGCATGGACAAACTAACCCAAAAGTTAGCTAAAGATTTAAATGGCACCGACTCATTTATTGATGATGGTTTTAAAGTGGTTTCAAGATCTACAGCAAATACTTTTAGCGTTTTGCCAGGCGTTGGTTATGTTAACGGCCTGCGAGTAGAGATTTTAGAAGAGCAGATTTTAATTGCAGATAGCTACCCTAAAAATGTTTATATAAATGCCTATTTTGACGGTGATGCATCTAGCGTGTGGGAACCAAAAAACAATGTAAGCATCACGAATGAAGAGCTAACAGATTATATCGACGGAAACGGTAAAAACCACTACCTAGTAAAATTGGCTAACATAATTGCCGCTGATCAAGTTGAGGACATGCGCGTTGATTTTAACCTAGTGAAAAACAGCACTGAGAGAAACTTTGCAACAGTCGATGAAGCCAAAAACGATAAATTGTTAAAAGTAGGGCAAAAAATCACGATTGATGAGCGTGACGGCGCTAAGTTTAAAGTTGTTGATAGTGCCGGATTGTTTATTGATGAATATGCAATCATATCAACATGTAAAAATTCGAATGCGCTTAAGATAGAAATAGAAGGTAACAGCGTAACATTGATTTCATTGGGCGCTAAAGATGATGGAGTAGAAGGCGATGGGCTGGGTAGTCCAGCAACAGGGTTTGACAATGGCCCAGTACTACAAGCAGCACAGAGATTAAGAGAAGAAAATAAATGCAATGTAAAAATAACCAGAAAAGATAAAGGCGTATATCGCTACAGACAAACAATTATAGCTGAAAAAGACAGTTTTTCGATTATAGGTGAGCAGTCTGACAACATATTTGAGAGTGGAGCTAAGCTTTACTTTGACCCCGAAAACGGTGAAAAGGTTGGTTTTAAAAGTCTGCAGCCGAGTTCAATTTTTTCGTATGTTTTTTTTGATAGTATCAATAGGTTTTCGGGAATTGAACATGTTAGTGCTAGCCACGTTGATATTAATAACAAACAGGATGTTGATATTATTTTTGATCGCTGCACTTTTAGAAATTTCGAAAATGCAGTCAGTGTTGAAGGGAGGGGGTTCCTGGCATACGATTGCTCATTTTCAGTGGGTAGAAATGCATTGAAAATTGATTGGCCTGATGGTTTTATTGAGGGCGAATTACCAGAAAAATCAAAATACATGGGGATGCGCGGTTATACACAAAGGAATTGCGAATATCACGCAATGAATGGACACGCTATTGTTAATCAGGGAGGCAATGCCATAAATGCTAATAATATCAATATAATTGGTGCTAATGCAGATACGAGTATAGGATTATTAAAAGGTAGCGCTAGAGATTCTACATTTGAAAGTAATAACTTGACACAAGGAGAGATGGAGGTTTTCGATATTGGCTCAGGTAAGCTAGAAAATGTCAGTGTTTCAGGTGGTTTATTAATGGGAATGAATGCTGAATCAGGGGGAAGAAGGGGCTTAAGGGGCGTATTGTTAGCGCTTGCAGGTTCAACAATTAGAGATGTTAGTTTTAGTGGTGTAAATATGTCTGAAATTGACAGAAATGTATTTTATTGCGCAGGTGATGTTGATGGTTTAACTATTAATGGCGGCGTAGTAAGTAAGTTTATGAACGATAACATAAGCTCATTGAGCTACCGAAATTACATTAATTTAATTAATGCGACTTCAGTGAAAGACGTAAAAGTAAACAATGTTTTGCTAAAAAACAAAGACTATGAAAACAACCCTAATGAACTCATATCAGTAAAGTTGGAGCACTTGTCAAACGTGCATGTGTCCAGCGTTATTTATGATGGTTCAGTAATTGATTTATTGCCAGAAAACCTTACCGGGTCAGCATATAACTTAAAAAAGTTAACTTACACAGGAGACGGTGAAGCCGCAAAAATTATCTATACGGGAAACAGAGTAATAGAAACCGTGATAGTGTCAGAGCGAAATGGCAGCAGCAGACCCAATGCAACATACATTGCGACAGAGTTTGGAGCATCGTCCGATCCGATAGAAATACAAGGGGGTAGTAATGTTATGGCGCGTGACCACTTCAATGAGTCAGGAGCGGTTTATCAAGCTGTTATATATTTTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID
a3cc7f517fe93b931780c11a69f8514d43ecf70b6f85781790a38b1aec64dc1a
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Characterization of bacteriophages from antarctic seawater | Rojas,N., Araneda,D., Bastias,R., Olivares,J., Plaza,N., Katharios,P., Garcia,K., Alcaman,M.E. and Higuera,G. | 2009-01 | — | GenBank |