Protein

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Genbank accession
SOK59030.1 [GenBank]
Protein name
autotransporter
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MYSIKTDLDVSGNQTISKDLLVNGNAVVANNLTVNGTITFAEATFTQITITGPSNLADVNSTGTAALKDVTISGNTTIGNSDTNTVTVNGTSSFNAPITAHSDVSIEGNTVIGNASTDTLTVNATSTFVAPATFNNNVIVGDAAADTLTVNSTTDFKNNVTIGETSADVLAVNSNTNLNNNVTIGDASTDSLIVNSTADFKNNVTIGDLSTDILTVNSTSNFNNNVAIGSDSSDTLTIKSTTDIQGDLHATGETTLESLVVEGSTNLNSNLSMGTGTTATFEDVVINGTLSGDYSIANGNFTTITVTGQSTLNSVVLNGNLTGTTSSATLQTYNVAGASGIIQFNYNDPARPSDIKSAIEPYKISSSEFQGQKSTISRGTFGDVTFADYGLTSKGKSSIDYLDIVGNSTTGTSRPQLTVAGSSTLGATTTVNNLVVTGTTTGISADVAGQDITPNSVTATANIEAATLHSTGGTTVGTTLGVTGNTTLSGTLGVTGSSTFTGNVTVNGQTTTIKDLIVTGTTTGVTVEANVDGLDIKPATIESTGDVTVGGIFTASQDAVFDGGVTFNSGVTAGIIGTGSLNATTITATGPSNFVGINSSGTSQLENLNVSGTLDIEGLSTFSNATVTETATIKDLIVTGTTTGVTAEANVDGLDIAPKSVVSTEGITVGTILKTDTLDVKTTSGILTVSANTNFENPVSTTGNLTVNGNLYGANVHKIVNGQEISPFSVAASSADITSLTAGTLSVTSTMNLADVTVSGIISSSPADGTIHFADNVTMDKALTVTGVFTPAGGLDLSSANITSVSLTTTGNVNVGGDLVVDGTFDLSASDVAVKSITATEASTLPILGSTTATIGTANVTSLSVTGVSALAGVTASGTLGVTGATTLAGLTASSATVSGVTTLNGNITSANATVAIIKNTSITGNLTVSGTLTPGSVDLSTANVTVAAITSSGNAHIEGDLTVDGVFDLSATNLVAASLESSGTTTVGTNLVLTTGNITGSPKVSGTLNVTGTSTLSTLSTSGLATLNSASVTTTLSVTGTSTLGTLGTSGLATLASATITGALTANGNTTIGDASTDTLTVNATSTFANNVTVNGTLTPTGGLNLGAAALNVASVTTTGAVSVGTTLGVTGLTTLAGLNSGNHAITGTLSASGASTLAAVSATNITASGTLGVTGNSTLTGTLTVNGVGTSKIQLLQVGTGTPVADKALNVFGNTTITGDLDVTGVINAQIDLTSRDISPRNVTASGNISSTGSATIGTSLTAATAIIGASGSTNNNLQVNGNVTTTGNFTVTGLIIGTLDQSTSDITVKSITTTTGDVHIGGAAALVLGSTGRITGNASINGSATVSGTFGVTGLTTLAGLNSGNHAITGTLSASGASTLAAVSATNITASGTLGVTGNTTLSGTLGVTGLTTVNNLTVTGTLNANLSSLVTTSFKTGTYFVAQHAAESISTSTWTPDGTSNVYNVSVTANTSIQPITGVNGAGSWFIYVTQDATGGHAVTWDNTYSIIGGEVNTAANAVSICQVVYCGIGSKYDVFIAQRP
Physico‐chemical
properties
protein length:1545 AA
molecular weight: 152197,24840 Da
isoelectric point:4,10232
aromaticity:0,03301
hydropathy:0,22731

Domains

Domains [InterPro]
DC_0092
STR
1–232
DC_0092 IPR006626 IPR006626 IPR006626 DC_0092 IPR006626 DC_0092
IPR006626
Unmapped
67–90
IPR006626 IPR006626 IPR006626 DC_0092 IPR006626 DC_0092 IPR058970
SOK59030.1
1 1545
Architecture
STR
STR
STR
STR 1-569 | STR 715-1046 | STR 1201-1545
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Yersinia phage fHe-Yen9-03
[NCBI] 		2052743 Uroviricota > Caudoviricetes > Eneladusvirus >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
SOK59030.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LT960552 [NCBI]
CDS location
range 133044 -> 137681
strand -
CDS
ATGTATTCTATAAAGACTGATCTTGATGTATCTGGTAATCAAACGATTTCTAAAGATCTTTTGGTTAATGGTAATGCAGTCGTTGCAAATAATCTTACTGTAAATGGTACGATTACTTTTGCAGAGGCGACATTTACACAGATCACGATCACTGGTCCATCAAACCTTGCTGATGTTAACTCTACTGGTACTGCTGCACTAAAAGACGTTACAATTTCTGGTAACACCACAATTGGTAATTCCGATACCAATACTGTTACTGTAAATGGAACCTCATCTTTTAATGCTCCAATCACTGCACATAGTGATGTATCAATTGAAGGAAACACTGTAATAGGAAATGCTAGTACAGATACACTAACTGTTAATGCAACTTCAACATTTGTTGCTCCAGCTACTTTTAACAACAATGTTATTGTTGGTGATGCTGCTGCTGATACATTGACTGTGAATTCTACTACAGATTTCAAAAATAATGTAACGATTGGTGAAACTTCTGCTGATGTACTAGCAGTTAATTCAAATACCAATTTAAATAATAATGTAACCATTGGTGACGCAAGTACTGATTCTTTGATTGTTAATTCAACCGCTGATTTCAAAAATAACGTAACTATTGGTGATTTAAGTACTGATATTCTAACTGTTAATTCTACCTCTAATTTTAATAATAATGTAGCAATTGGCTCAGATTCATCTGATACTTTAACAATAAAATCAACAACCGATATTCAAGGTGATTTACACGCTACTGGCGAAACCACATTGGAAAGTTTAGTTGTTGAAGGAAGTACAAATTTAAATAGTAATCTATCAATGGGTACTGGAACTACTGCTACATTTGAAGATGTAGTTATAAATGGTACACTAAGTGGTGATTATTCTATTGCAAACGGTAATTTCACAACCATTACAGTTACTGGTCAAAGTACTTTAAACAGCGTTGTTTTAAATGGTAACTTAACAGGAACAACAAGCTCAGCTACTTTACAAACTTATAATGTGGCTGGTGCTTCTGGTATCATTCAATTTAACTATAATGACCCAGCACGTCCTTCCGATATTAAATCAGCTATTGAACCATATAAAATAAGTTCTAGCGAATTCCAAGGACAAAAATCAACCATTTCACGTGGTACTTTTGGTGATGTAACATTTGCCGATTACGGTTTAACCTCTAAAGGTAAATCAAGTATTGATTATTTGGATATTGTCGGTAATAGTACTACCGGAACTTCTAGACCACAATTAACTGTAGCTGGTTCAAGTACTTTAGGTGCTACCACAACTGTTAACAATTTAGTAGTTACTGGAACAACAACGGGTATTTCTGCTGATGTAGCTGGTCAAGATATTACACCAAATAGTGTTACCGCAACTGCTAATATTGAAGCTGCAACTTTACATAGTACTGGTGGAACAACTGTTGGAACAACATTAGGTGTTACTGGAAATACTACATTAAGTGGTACTTTAGGTGTTACTGGTTCAAGTACATTTACTGGTAATGTTACTGTCAATGGTCAAACAACTACAATCAAAGATTTAATAGTTACTGGAACAACAACTGGTGTTACTGTTGAAGCTAATGTTGACGGTTTAGATATTAAACCTGCAACAATAGAAAGTACTGGTGATGTAACAGTTGGTGGAATCTTCACAGCATCACAAGATGCAGTATTTGATGGTGGCGTAACCTTTAATTCTGGTGTTACCGCAGGAATTATAGGTACTGGTTCACTAAATGCAACTACCATTACAGCAACTGGTCCAAGTAATTTTGTTGGAATTAATTCATCTGGTACAAGCCAACTGGAAAATCTAAATGTTTCTGGAACACTTGATATTGAAGGATTGAGTACTTTTAGTAATGCAACAGTTACTGAAACCGCAACAATCAAAGATTTAATAGTTACTGGAACAACAACTGGTGTTACTGCTGAAGCTAATGTTGATGGTTTAGATATTGCTCCAAAATCAGTAGTAAGTACTGAAGGAATAACTGTTGGTACTATATTAAAAACAGATACATTAGATGTTAAAACAACATCTGGTATTTTAACTGTTTCAGCTAATACTAACTTTGAGAATCCAGTTTCAACCACTGGTAATTTAACAGTTAATGGTAATTTATATGGTGCTAATGTTCATAAAATTGTTAATGGACAAGAAATTTCTCCATTCTCAGTTGCAGCTAGCTCTGCTGATATTACAAGTTTAACTGCTGGAACATTAAGTGTTACTAGTACAATGAATTTAGCTGACGTAACTGTATCTGGAATAATTAGTTCAAGCCCAGCAGACGGTACTATTCATTTTGCAGATAATGTAACTATGGATAAAGCTTTAACTGTAACTGGTGTGTTTACTCCTGCTGGTGGTTTAGATTTAAGTTCAGCAAATATAACTTCAGTATCGTTAACTACTACTGGAAATGTTAATGTTGGTGGCGATTTAGTAGTTGATGGTACGTTTGATTTAAGTGCATCTGATGTAGCTGTTAAATCAATAACTGCAACTGAAGCTTCAACTCTTCCAATTTTAGGTTCAACAACTGCTACAATCGGAACAGCAAATGTAACAAGTCTTTCTGTTACTGGTGTAAGTGCATTAGCTGGTGTTACTGCTAGTGGAACATTAGGTGTTACTGGTGCAACTACTTTAGCTGGATTAACCGCAAGCTCTGCAACTGTATCTGGTGTTACAACTCTAAATGGTAATATTACTAGTGCAAATGCTACTGTAGCAATTATAAAAAATACTTCAATAACTGGTAATTTAACAGTTTCAGGTACATTAACACCAGGTTCTGTAGATTTAAGTACTGCTAACGTAACAGTAGCTGCTATTACATCTTCTGGTAATGCTCATATTGAAGGTGATTTAACAGTTGATGGTGTGTTTGATTTAAGTGCCACTAATTTAGTAGCTGCTTCATTAGAAAGTTCAGGTACTACAACAGTAGGAACTAACTTAGTATTAACTACTGGTAATATTACTGGATCTCCTAAAGTTTCTGGTACATTAAATGTTACTGGTACAAGTACATTAAGTACATTAAGTACTTCTGGTTTAGCAACTTTAAACAGTGCTTCTGTTACTACAACATTAAGTGTTACTGGTACAAGTACTTTGGGTACTTTGGGTACTTCTGGTTTAGCAACATTAGCATCTGCAACCATAACTGGTGCATTAACTGCTAATGGTAATACTACAATAGGTGATGCAAGTACTGATACTCTAACTGTTAACGCAACAAGTACATTTGCTAATAATGTAACAGTTAATGGTACATTAACACCAACTGGTGGATTAAACTTAGGAGCAGCAGCATTAAATGTGGCTTCTGTAACTACTACTGGTGCAGTATCTGTAGGTACTACTTTAGGTGTAACAGGTTTAACAACTCTTGCAGGTCTAAACTCTGGTAATCATGCAATTACTGGTACATTAAGTGCATCAGGTGCAAGTACATTAGCTGCTGTTTCTGCAACTAATATTACTGCTTCTGGTACTCTAGGTGTTACTGGAAACAGTACATTAACTGGTACATTAACTGTTAATGGTGTTGGAACTTCTAAAATTCAATTATTACAAGTAGGTACTGGTACTCCAGTTGCTGATAAAGCGTTGAATGTATTTGGTAACACCACAATTACTGGTGACTTGGATGTAACTGGTGTTATTAATGCACAGATTGATTTAACTTCACGTGATATTTCACCACGTAACGTAACTGCTAGTGGTAATATATCATCTACTGGTTCAGCTACTATAGGAACTTCATTAACTGCTGCAACAGCAATAATTGGTGCAAGTGGTAGTACTAATAATAACTTACAAGTTAATGGTAATGTAACTACTACTGGTAACTTCACTGTTACTGGATTAATTATAGGTACATTAGACCAAAGTACTTCAGATATTACTGTAAAAAGTATTACTACAACAACTGGTGATGTTCATATTGGTGGTGCTGCTGCCTTAGTGTTAGGTTCAACTGGTAGAATTACTGGTAATGCTTCAATTAATGGTAGTGCAACAGTCTCTGGTACATTTGGTGTAACTGGATTAACTACTTTAGCAGGTCTAAACTCTGGTAATCATGCAATTACTGGTACATTAAGTGCATCAGGTGCAAGTACGTTAGCTGCTGTTTCTGCAACTAATATTACTGCTTCTGGTACTCTAGGTGTTACTGGAAATACTACTTTATCAGGTACTTTAGGTGTTACTGGTTTGACTACAGTTAATAACTTAACCGTTACTGGTACTTTGAATGCTAACTTATCTTCATTGGTAACTACTTCATTCAAAACTGGAACATATTTTGTAGCACAACATGCTGCTGAATCTATCAGTACTTCTACATGGACACCAGATGGAACTTCAAACGTTTATAACGTTTCAGTAACTGCAAATACTTCTATTCAACCAATTACTGGTGTGAATGGTGCAGGTTCTTGGTTCATTTATGTAACACAAGACGCAACTGGTGGACACGCAGTAACTTGGGATAATACTTACTCTATCATTGGTGGTGAAGTTAATACTGCTGCTAATGCAGTAAGCATTTGTCAAGTAGTTTATTGTGGTATTGGTTCTAAATATGATGTGTTCATTGCACAAAGACCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
055e10a4065640ba69175f4205c58401325b458d7bd8c8b88ee2bcc1cf25fed3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6269
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50