Protein

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Genbank accession

XMR01800.1 [GenBank]

Protein name

hypothetical protein

RBP type

Evidence RBPdetect2

Probability 0,95

Protein sequence

MYSIKTDLDVTGGATVNKDLLVKGNAVFEKNVTVNGTVSFANATFTAIEAATANITSTLDVAGKASLNGGVDIKGNSVIGDAVVGSDTATVNSNASFNGTASFANDINQTAGSAVLKHTTVDQLEVTGTTQFDGNITAGVGTTAAFDTLTANEATITAISSETITGTGTANFKDVNISGILGGTFSLDDVNATSLNVSGASGLQGAVTFGANVTGINSTATFKDIKLGANSASSTYRLSFTYSASGQRPTVVLQNEIQSELMSPTNLNVLKSATFGDESLDTYGITGKGLNKLDYVSISGNAVQSPATPLLEVTKGLTKVTDFEVTGNATIPNIESTGTANFNDININGVLGGTFSLDDINATSLNVSGASGLNGAVTLGANITGINTTATFKDIKLGANAASSTDRLSFTYSGSGLRPTVVLQNEIQSELMSPTNLNVLKTATFGDESLSTYSIASKGLNKLDYVTISGNLTQDPSTPLLEVTKGLTKVTDLEVTGTATLPNIESTGTANFNNINVSGTLGGTFDLDDIQATSLNVSGATGLNGAVTLGANITGNNTTATVKAINLGQNVANADVKLGFAYSAPGQRPTVLLQNEIQSESMAPVTLTVQKTATFGDESLATYGITGKGLNKLDYVEILGNSTQSPATPRLKVNGKTILNDVDFTGVVTGLTVDVSGQDLTPNSVIAAGEIKSSSLESTGGATINANLLVGGTANVTGALNSGAITSTGNVKGVGGEFSGNVSGVDGTFTGNVSGVNGTFSGDVSGAAGAFSGNVTVTGQTVTVKDLVVTGTTTGVVADANVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGNSTLADVSAGAITATGNVSAAAISGSSLKVTGNIEGVAIAGSSMNLTGAATTGSLSTGTLTSPTINGNTTFTDNVTVTGTLTPGAIDLSTTDVSAQSISTTAGASIGGNLVVAGTVDLSAADVSVKSLTTPGIVTSTNATDANVLPVLNSNTATVGTANVTALNVSGASNVASLDATGAVSVGSTLDVTGASTLGSVITPLISNADGIQIANDTTISANLAVTGTLTPGAIDLATTDVSAKSITTTEGANIGGNLVVAGTVDLSAADVSVKSLSSAGIIQSTDLVNANVLPVLKSTTATINAVNATELSVEGPTNISSLRTSADAVIGTTLTVSGQATAVSLVTPTISNETGVEIASNTKVTGDLTVTGTVTPGAIDLATTDVSAKSITTTGGANIGGDLVVAGTFDLSASDVTANTLASVGNTTVGADLVLTTGNVTGSPAVSGNLSVAGTSTLTGAATVGNKLTVNTGGIQVVAGGVRVDTGSITAQGANISGTATLENASVTSNAAVGGTLGVTGAATLNGGLTSSALTVTGDSVVQKLTVKGEFIPEGGLDLSGADITANSLDVATTLKATGLSTLSGGVSTTDISGSGKITTVDAQTGTLTVTGNQTVGGTLGVTGKATTGSLDTGAVSATSGTFSSTLGVTGAATFADAVTVNGVFTPVGGLDLSTSDITANSLDVATTIKSTAGATIGGDSTIAGTLGVTGAVSAPSLTLSNASGTGLDVKGNAIVAGTLSTTGAVTLGNTLGVTGKATTGSLDTGAVSATSIVGTAGLTMAGNSSFTNDLTVSGTFTPAGGLDLTTSDIVANSLSTSSTIHSDTNGTFGGTLGVTSNATIGGTLGVTGAVSAPSLALSAASGDALTVTADAKVTGKVTSGSLETGTVKTGANLVVGVKVGDQPETVQIFPDTFIAGKLRVEGGINADIDVSGQTLEPYAIEASATLSAVGNISTDAAVIANSGTFGAVGSQNNNLTVNGNVVTTGNFTVGGVLYANVDQSNADVNVKSLTSTNLVKGGSMQSTGNLTVGGAATITGTLGSGAITSTGKVKGVDGEFSGNVSGVGGTFTGAVTVGTTLGVTGAATVGGTLGVTGKATLAEASVTNLTTSGTATIGSTLAVTGTSTLAAVNISGALTTTGSVTLGDAAADVITVNGTSTFIEKATFEKGIEVAGVFTTDEANFVTTSVTTKKYDVIPSQVTSSTVAPAGTWTPDGSTSVYFITLDQNTTLAPIAGLIGGGKAASIFMYAKQDATGNRVLTADPSYSIVDGEQNLAANSVTIYQAVYDGVSNVIDLFIAQRTS

Physico‐chemical properties

protein length:	2120 AA
molecular weight:	207003,10320 Da
isoelectric point:	4,17809
aromaticity:	0,03302
hydropathy:	0,24552

Domains

Domains [InterPro]

DC_0092
STR
118–330

DC_0092 DC_0092 DC_0092 DC_0092 DC_0092 IPR058970

DC_0092
STR
307–501

DC_0092 DC_0092 DC_0092 DC_0092 DC_0092

XMR01800.1

1 2120

Architecture

STR

STR 118-1314 | STR 1389-2120

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Domains [InterPro]

Domain ID	Category	Cluster	Start	End	Layer	Name	Pref Zone	Confidence	Evidence	Support
DC_0092	STR	DC_0092	118	330	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	307	501	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	477	783	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	772	983	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	956	1122	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1103	1314	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1389	1570	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1541	1754	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1704	1921	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
DC_0092	STR	DC_0092	1876	2120	Novel HMM	DC_0092	Central	Low	Positional only	72 proteins / 72 hits
IPR058970	RBD	DC_0552	2029	2108	InterPro cluster	Putative phage tail fibre, C-terminal domain	C-terminal	Low	Positional only	292 proteins / 292 hits

Taxonomy

	Name	Taxonomy ID	Lineage
Phage	Escherichia phage Turkey5 [NCBI]	3375711	No lineage information
Host	Escherichia coli [NCBI]	562	cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Genbank protein accession

XMR01800.1 [NCBI]

Genbank nucleotide accession

PQ471516 [NCBI]

CDS location

range 143000 -> 149362
strand -

CDS

ATGTACTCTATAAAGACGGATCTAGATGTTACTGGTGGTGCTACGGTAAATAAAGATCTTTTGGTTAAAGGTAATGCTGTATTTGAGAAAAATGTAACCGTAAATGGTACAGTTTCTTTCGCAAATGCAACATTTACTGCAATTGAAGCAGCAACTGCTAATATCACTTCTACTCTAGATGTAGCTGGTAAAGCTTCCCTTAATGGTGGTGTAGATATTAAAGGTAATTCTGTAATTGGTGATGCTGTTGTCGGTTCTGATACTGCAACTGTTAACTCAAATGCATCTTTTAACGGCACTGCGTCATTTGCCAACGATATTAATCAAACTGCTGGTTCTGCTGTTCTTAAACACACAACAGTTGACCAATTAGAAGTTACCGGAACTACACAATTTGATGGTAACATTACTGCTGGTGTAGGTACAACCGCTGCTTTTGATACATTAACTGCAAATGAAGCAACAATCACTGCAATTTCTAGTGAAACTATCACTGGTACTGGTACAGCAAACTTCAAAGATGTTAATATTAGTGGCATTCTAGGCGGTACATTCAGCCTTGATGACGTTAATGCAACTTCATTGAACGTAAGTGGTGCTTCTGGCCTACAAGGTGCTGTTACATTTGGTGCTAACGTTACTGGTATCAATAGTACTGCAACATTCAAAGACATTAAATTGGGTGCAAACTCAGCAAGCAGCACTTATCGCTTAAGTTTTACCTATTCAGCGTCTGGTCAGCGTCCAACTGTTGTTCTACAGAACGAAATTCAATCCGAATTAATGTCACCAACTAACCTAAACGTACTCAAAAGTGCGACATTTGGTGATGAGTCACTCGATACTTATGGTATCACAGGTAAAGGTCTAAACAAATTAGATTATGTATCTATTAGTGGTAACGCAGTTCAATCACCAGCCACCCCATTACTTGAAGTAACTAAAGGTTTAACTAAAGTAACTGATTTCGAAGTAACTGGGAACGCAACTATACCTAATATTGAAAGTACTGGTACGGCTAACTTCAATGATATTAACATAAATGGTGTTCTTGGTGGTACATTCAGTCTTGATGACATTAATGCAACTTCATTGAACGTAAGTGGTGCTTCTGGTCTTAACGGAGCAGTTACATTAGGTGCGAATATCACTGGTATCAACACAACTGCAACATTCAAAGACATTAAATTGGGTGCTAACGCAGCAAGTAGTACTGATCGCTTGAGTTTTACATATTCAGGGTCTGGGCTTCGTCCAACTGTTGTTCTACAGAACGAAATTCAGTCAGAACTAATGTCACCAACTAACCTAAACGTACTAAAAACTGCAACGTTTGGTGATGAATCTCTTTCTACCTATAGTATCGCAAGTAAAGGTCTAAACAAATTAGATTATGTAACTATTAGTGGTAACTTAACACAAGATCCTAGTACTCCTTTACTAGAAGTAACCAAAGGACTAACTAAGGTAACTGATTTAGAAGTAACTGGTACTGCAACACTACCTAATATTGAAAGTACTGGTACTGCAAACTTCAATAACATCAATGTTTCTGGAACATTAGGTGGTACATTTGATCTAGATGATATCCAGGCTACCAGTTTGAACGTAAGTGGTGCTACTGGTCTTAACGGAGCAGTTACATTAGGTGCGAACATCACTGGTAACAACACAACTGCAACTGTTAAAGCCATTAACCTTGGTCAAAACGTTGCGAATGCTGACGTTAAACTTGGTTTTGCTTATTCAGCCCCAGGTCAGCGTCCAACAGTCCTACTACAGAACGAAATCCAGTCCGAATCTATGGCTCCGGTAACTCTTACTGTACAAAAAACGGCAACATTTGGTGATGAGTCTCTTGCTACCTATGGTATTACTGGCAAAGGTCTAAACAAATTAGATTATGTAGAAATTCTAGGTAACTCAACACAAAGCCCAGCAACACCTCGTCTAAAAGTTAATGGTAAAACCATTCTTAATGATGTAGACTTCACTGGTGTCGTAACTGGTCTAACAGTTGATGTGAGTGGTCAGGATTTAACACCTAATTCCGTCATTGCGGCTGGTGAAATTAAATCTTCATCATTAGAATCAACTGGTGGTGCAACTATTAATGCTAACTTACTCGTTGGTGGAACTGCTAACGTGACTGGAGCACTAAACTCTGGAGCAATTACCAGTACTGGTAACGTAAAAGGTGTTGGTGGTGAGTTCAGTGGTAATGTGAGCGGTGTTGATGGTACATTTACTGGCAATGTAAGTGGTGTGAACGGTACATTCAGTGGTGATGTAAGTGGTGCAGCGGGTGCATTTAGCGGGAATGTGACAGTAACTGGTCAAACAGTAACAGTTAAAGACCTAGTAGTAACTGGAACTACAACTGGTGTTGTAGCAGATGCTAACGTTGATGGCCTTGATATTGCTCCTAATAAAGTTGATGTAACCACAACCCTAAGTGTTGCTGGTAATAGTACCCTAGCCGATGTAAGTGCTGGTGCAATCACTGCAACTGGTAACGTTAGTGCAGCAGCTATTTCTGGTTCGTCTTTGAAAGTAACTGGTAATATCGAAGGTGTAGCTATCGCTGGTTCTTCTATGAATTTAACTGGTGCAGCAACTACTGGTTCATTATCAACTGGAACTCTAACTTCACCAACTATTAACGGTAACACTACTTTTACTGATAATGTAACTGTCACTGGTACACTTACCCCAGGTGCAATTGATCTATCAACGACTGATGTTAGTGCTCAATCCATATCTACAACTGCTGGTGCATCTATCGGTGGCAACTTAGTAGTAGCTGGTACAGTTGATCTTAGTGCAGCAGACGTTAGTGTTAAATCTTTAACTACTCCAGGTATTGTAACTTCTACTAACGCAACTGATGCAAACGTACTTCCAGTACTTAATAGTAACACAGCAACTGTTGGAACTGCAAATGTAACCGCACTAAATGTTAGTGGTGCATCTAATGTAGCTTCACTCGATGCTACTGGTGCAGTATCTGTTGGTTCTACTCTTGATGTAACTGGTGCAAGTACTTTAGGTTCAGTGATTACCCCATTGATTTCTAATGCTGATGGTATTCAAATTGCAAATGATACAACTATCTCTGCAAACCTAGCTGTTACTGGAACATTGACTCCAGGTGCAATTGACCTAGCAACAACTGATGTTAGTGCAAAATCTATTACAACTACTGAAGGTGCAAACATTGGTGGTAACTTAGTCGTAGCTGGTACTGTTGATCTTAGTGCTGCTGATGTTAGTGTTAAATCACTATCTTCTGCTGGTATTATTCAAAGTACTGACTTAGTTAATGCAAACGTACTTCCAGTACTTAAATCTACTACTGCAACTATTAATGCAGTTAATGCAACTGAACTATCAGTTGAAGGTCCAACTAATATATCAAGTCTACGCACAAGTGCAGATGCAGTAATTGGAACTACACTAACAGTATCTGGACAAGCAACTGCTGTTTCCTTGGTAACTCCAACCATTTCTAACGAAACTGGTGTGGAAATTGCAAGCAACACTAAAGTAACAGGTGATTTAACTGTAACCGGAACTGTAACTCCAGGTGCAATTGACCTAGCAACAACTGATGTTAGTGCTAAATCAATCACTACTACTGGTGGTGCAAATATCGGTGGTGACTTGGTAGTAGCTGGTACATTTGACCTATCTGCTTCTGATGTAACTGCAAACACTTTAGCTTCTGTCGGTAACACTACTGTTGGTGCGGATCTAGTTCTAACAACTGGTAATGTAACTGGTAGCCCAGCCGTTTCTGGTAACTTGTCTGTAGCTGGTACAAGCACTCTAACTGGTGCAGCAACTGTTGGTAATAAACTAACTGTTAATACAGGTGGTATTCAAGTTGTAGCTGGTGGTGTACGTGTTGATACTGGTAGTATCACTGCACAAGGTGCAAATATCTCCGGTACTGCAACTCTAGAAAACGCTTCAGTAACTTCTAATGCGGCGGTCGGTGGTACACTTGGTGTTACTGGTGCAGCAACTTTAAACGGCGGTTTAACTTCTTCTGCTCTAACCGTAACTGGTGATTCAGTAGTTCAAAAACTAACTGTTAAAGGTGAATTTATTCCTGAAGGTGGTTTGGATCTAAGTGGTGCAGACATTACAGCAAACAGTCTTGATGTTGCAACAACCCTAAAAGCAACTGGCTTGAGTACTCTAAGTGGTGGCGTATCTACTACTGATATCAGTGGTTCAGGTAAAATCACAACTGTTGATGCACAAACTGGGACTCTTACTGTTACCGGAAATCAAACTGTTGGTGGTACTCTTGGTGTAACAGGTAAAGCAACTACTGGTTCGTTGGATACTGGTGCAGTTTCTGCAACATCTGGAACATTTAGTAGTACACTAGGTGTAACTGGTGCTGCAACATTTGCTGATGCTGTAACGGTTAACGGTGTATTCACTCCAGTGGGTGGTTTGGATCTATCTACTTCTGATATTACTGCAAACAGCCTTGACGTGGCAACCACAATTAAGAGCACTGCGGGTGCAACTATTGGTGGTGACTCAACTATCGCTGGTACACTAGGTGTAACTGGTGCGGTTTCTGCTCCGTCCCTAACATTGTCCAATGCTTCTGGTACTGGTCTTGATGTTAAAGGTAATGCTATCGTAGCTGGTACTTTATCTACAACTGGTGCTGTTACTTTAGGTAATACTTTAGGTGTAACTGGTAAAGCAACAACTGGTTCACTAGATACTGGTGCAGTTTCTGCAACAAGTATTGTTGGTACTGCTGGTTTAACTATGGCTGGTAATTCATCTTTCACTAATGACCTAACAGTAAGCGGTACATTTACTCCTGCTGGTGGTTTAGACCTAACAACATCTGATATCGTTGCGAATAGTTTATCTACTTCTTCTACTATCCACAGTGATACAAACGGTACATTCGGTGGCACACTAGGTGTAACAAGTAACGCAACTATTGGTGGAACTTTAGGTGTAACTGGTGCAGTTTCTGCTCCATCCTTGGCATTGTCTGCTGCATCCGGCGATGCACTAACTGTAACTGCTGATGCAAAAGTAACTGGTAAAGTAACTTCTGGTTCACTAGAAACTGGTACAGTTAAAACTGGTGCAAACCTAGTAGTTGGTGTTAAAGTTGGTGATCAACCTGAAACTGTTCAGATTTTCCCTGATACGTTTATTGCTGGTAAACTACGCGTTGAAGGTGGTATTAACGCCGACATCGACGTAAGTGGTCAAACACTAGAACCATATGCAATAGAAGCTTCTGCAACTCTATCAGCAGTTGGTAACATTTCAACTGACGCAGCAGTTATTGCAAACTCTGGTACATTTGGTGCAGTTGGATCACAAAACAACAACTTAACAGTTAACGGTAACGTTGTTACTACTGGTAACTTTACAGTTGGTGGCGTTCTATATGCCAACGTTGACCAATCAAATGCTGATGTAAACGTTAAATCACTAACAAGTACTAACCTAGTTAAAGGTGGTTCAATGCAATCAACTGGTAACTTAACAGTTGGTGGAGCAGCGACAATCACTGGTACTTTAGGTTCTGGTGCAATCACCAGTACTGGTAAAGTTAAAGGCGTTGATGGTGAGTTCAGTGGTAACGTAAGTGGTGTTGGTGGAACCTTCACTGGTGCAGTAACTGTTGGAACTACTTTAGGCGTAACTGGTGCAGCAACTGTAGGTGGTACACTAGGTGTAACTGGTAAAGCAACACTAGCAGAAGCTTCTGTTACTAACCTAACAACTTCTGGCACTGCAACAATCGGTTCAACTCTAGCAGTAACTGGTACAAGTACCCTAGCGGCTGTAAATATATCTGGTGCACTAACTACCACTGGTAGCGTAACACTAGGTGATGCAGCAGCAGATGTTATCACAGTTAACGGAACAAGTACTTTCATTGAGAAAGCTACTTTCGAAAAAGGTATTGAAGTTGCTGGTGTATTCACTACTGACGAAGCTAACTTTGTAACTACTTCTGTAACTACTAAGAAGTATGATGTTATCCCATCACAAGTTACTTCCAGTACTGTTGCTCCGGCTGGTACATGGACTCCTGATGGCTCTACTAGTGTGTACTTTATCACTCTAGACCAGAACACCACACTAGCACCAATTGCTGGCCTGATTGGTGGTGGTAAAGCTGCATCTATCTTCATGTATGCGAAGCAAGATGCAACTGGTAACCGTGTACTAACTGCTGACCCATCTTACTCTATTGTGGATGGTGAACAGAACCTAGCAGCGAACAGTGTTACTATCTACCAAGCAGTATATGATGGTGTAAGTAACGTTATTGACTTGTTTATTGCTCAACGTACTTCATAA

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID

f3a33ebaae23704f97ce7326340a91c2574b9cf05a95515b671bb1fa1b432317

ColabFold

Source ColabFold

Method ColabFold

Resolution 0,5085

Oligomeric State monomer

Download PDB

Model Confidence

Very high
pLDDT > 90

High
90 > pLDDT > 70

Low
70 > pLDDT > 50

Very low
pLDDT < 50

Literature

Title	Authors	Date	PMID	Source
Transient expression effect of genes from a Jumbo E. coli phage	Petrzik,K. and Brazdova,S.	2023-07-26	—	GenBank

Protein

Domains

Domains [InterPro]

Domains [InterPro]

Taxonomy

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

Predicted Aligned Error (PAE)

Model Confidence

Literature