Protein

Genbank accession
XMR01800.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MYSIKTDLDVTGGATVNKDLLVKGNAVFEKNVTVNGTVSFANATFTAIEAATANITSTLDVAGKASLNGGVDIKGNSVIGDAVVGSDTATVNSNASFNGTASFANDINQTAGSAVLKHTTVDQLEVTGTTQFDGNITAGVGTTAAFDTLTANEATITAISSETITGTGTANFKDVNISGILGGTFSLDDVNATSLNVSGASGLQGAVTFGANVTGINSTATFKDIKLGANSASSTYRLSFTYSASGQRPTVVLQNEIQSELMSPTNLNVLKSATFGDESLDTYGITGKGLNKLDYVSISGNAVQSPATPLLEVTKGLTKVTDFEVTGNATIPNIESTGTANFNDININGVLGGTFSLDDINATSLNVSGASGLNGAVTLGANITGINTTATFKDIKLGANAASSTDRLSFTYSGSGLRPTVVLQNEIQSELMSPTNLNVLKTATFGDESLSTYSIASKGLNKLDYVTISGNLTQDPSTPLLEVTKGLTKVTDLEVTGTATLPNIESTGTANFNNINVSGTLGGTFDLDDIQATSLNVSGATGLNGAVTLGANITGNNTTATVKAINLGQNVANADVKLGFAYSAPGQRPTVLLQNEIQSESMAPVTLTVQKTATFGDESLATYGITGKGLNKLDYVEILGNSTQSPATPRLKVNGKTILNDVDFTGVVTGLTVDVSGQDLTPNSVIAAGEIKSSSLESTGGATINANLLVGGTANVTGALNSGAITSTGNVKGVGGEFSGNVSGVDGTFTGNVSGVNGTFSGDVSGAAGAFSGNVTVTGQTVTVKDLVVTGTTTGVVADANVDGLDIAPNKVDVTTTLSVAGNSTLADVSAGAITATGNVSAAAISGSSLKVTGNIEGVAIAGSSMNLTGAATTGSLSTGTLTSPTINGNTTFTDNVTVTGTLTPGAIDLSTTDVSAQSISTTAGASIGGNLVVAGTVDLSAADVSVKSLTTPGIVTSTNATDANVLPVLNSNTATVGTANVTALNVSGASNVASLDATGAVSVGSTLDVTGASTLGSVITPLISNADGIQIANDTTISANLAVTGTLTPGAIDLATTDVSAKSITTTEGANIGGNLVVAGTVDLSAADVSVKSLSSAGIIQSTDLVNANVLPVLKSTTATINAVNATELSVEGPTNISSLRTSADAVIGTTLTVSGQATAVSLVTPTISNETGVEIASNTKVTGDLTVTGTVTPGAIDLATTDVSAKSITTTGGANIGGDLVVAGTFDLSASDVTANTLASVGNTTVGADLVLTTGNVTGSPAVSGNLSVAGTSTLTGAATVGNKLTVNTGGIQVVAGGVRVDTGSITAQGANISGTATLENASVTSNAAVGGTLGVTGAATLNGGLTSSALTVTGDSVVQKLTVKGEFIPEGGLDLSGADITANSLDVATTLKATGLSTLSGGVSTTDISGSGKITTVDAQTGTLTVTGNQTVGGTLGVTGKATTGSLDTGAVSATSGTFSSTLGVTGAATFADAVTVNGVFTPVGGLDLSTSDITANSLDVATTIKSTAGATIGGDSTIAGTLGVTGAVSAPSLTLSNASGTGLDVKGNAIVAGTLSTTGAVTLGNTLGVTGKATTGSLDTGAVSATSIVGTAGLTMAGNSSFTNDLTVSGTFTPAGGLDLTTSDIVANSLSTSSTIHSDTNGTFGGTLGVTSNATIGGTLGVTGAVSAPSLALSAASGDALTVTADAKVTGKVTSGSLETGTVKTGANLVVGVKVGDQPETVQIFPDTFIAGKLRVEGGINADIDVSGQTLEPYAIEASATLSAVGNISTDAAVIANSGTFGAVGSQNNNLTVNGNVVTTGNFTVGGVLYANVDQSNADVNVKSLTSTNLVKGGSMQSTGNLTVGGAATITGTLGSGAITSTGKVKGVDGEFSGNVSGVGGTFTGAVTVGTTLGVTGAATVGGTLGVTGKATLAEASVTNLTTSGTATIGSTLAVTGTSTLAAVNISGALTTTGSVTLGDAAADVITVNGTSTFIEKATFEKGIEVAGVFTTDEANFVTTSVTTKKYDVIPSQVTSSTVAPAGTWTPDGSTSVYFITLDQNTTLAPIAGLIGGGKAASIFMYAKQDATGNRVLTADPSYSIVDGEQNLAANSVTIYQAVYDGVSNVIDLFIAQRTS
Physico‐chemical
properties
protein length:2120 AA
molecular weight: 207003,10320 Da
isoelectric point:4,17809
aromaticity:0,03302
hydropathy:0,24552

Domains

Domains [InterPro]
IPR058970
2029–2108
IPR058970
XMR01800.1
1 2120
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Turkey5
[NCBI] 		3375711 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XMR01800.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ471516 [NCBI]
CDS location
range 143000 -> 149362
strand -
CDS
ATGTACTCTATAAAGACGGATCTAGATGTTACTGGTGGTGCTACGGTAAATAAAGATCTTTTGGTTAAAGGTAATGCTGTATTTGAGAAAAATGTAACCGTAAATGGTACAGTTTCTTTCGCAAATGCAACATTTACTGCAATTGAAGCAGCAACTGCTAATATCACTTCTACTCTAGATGTAGCTGGTAAAGCTTCCCTTAATGGTGGTGTAGATATTAAAGGTAATTCTGTAATTGGTGATGCTGTTGTCGGTTCTGATACTGCAACTGTTAACTCAAATGCATCTTTTAACGGCACTGCGTCATTTGCCAACGATATTAATCAAACTGCTGGTTCTGCTGTTCTTAAACACACAACAGTTGACCAATTAGAAGTTACCGGAACTACACAATTTGATGGTAACATTACTGCTGGTGTAGGTACAACCGCTGCTTTTGATACATTAACTGCAAATGAAGCAACAATCACTGCAATTTCTAGTGAAACTATCACTGGTACTGGTACAGCAAACTTCAAAGATGTTAATATTAGTGGCATTCTAGGCGGTACATTCAGCCTTGATGACGTTAATGCAACTTCATTGAACGTAAGTGGTGCTTCTGGCCTACAAGGTGCTGTTACATTTGGTGCTAACGTTACTGGTATCAATAGTACTGCAACATTCAAAGACATTAAATTGGGTGCAAACTCAGCAAGCAGCACTTATCGCTTAAGTTTTACCTATTCAGCGTCTGGTCAGCGTCCAACTGTTGTTCTACAGAACGAAATTCAATCCGAATTAATGTCACCAACTAACCTAAACGTACTCAAAAGTGCGACATTTGGTGATGAGTCACTCGATACTTATGGTATCACAGGTAAAGGTCTAAACAAATTAGATTATGTATCTATTAGTGGTAACGCAGTTCAATCACCAGCCACCCCATTACTTGAAGTAACTAAAGGTTTAACTAAAGTAACTGATTTCGAAGTAACTGGGAACGCAACTATACCTAATATTGAAAGTACTGGTACGGCTAACTTCAATGATATTAACATAAATGGTGTTCTTGGTGGTACATTCAGTCTTGATGACATTAATGCAACTTCATTGAACGTAAGTGGTGCTTCTGGTCTTAACGGAGCAGTTACATTAGGTGCGAATATCACTGGTATCAACACAACTGCAACATTCAAAGACATTAAATTGGGTGCTAACGCAGCAAGTAGTACTGATCGCTTGAGTTTTACATATTCAGGGTCTGGGCTTCGTCCAACTGTTGTTCTACAGAACGAAATTCAGTCAGAACTAATGTCACCAACTAACCTAAACGTACTAAAAACTGCAACGTTTGGTGATGAATCTCTTTCTACCTATAGTATCGCAAGTAAAGGTCTAAACAAATTAGATTATGTAACTATTAGTGGTAACTTAACACAAGATCCTAGTACTCCTTTACTAGAAGTAACCAAAGGACTAACTAAGGTAACTGATTTAGAAGTAACTGGTACTGCAACACTACCTAATATTGAAAGTACTGGTACTGCAAACTTCAATAACATCAATGTTTCTGGAACATTAGGTGGTACATTTGATCTAGATGATATCCAGGCTACCAGTTTGAACGTAAGTGGTGCTACTGGTCTTAACGGAGCAGTTACATTAGGTGCGAACATCACTGGTAACAACACAACTGCAACTGTTAAAGCCATTAACCTTGGTCAAAACGTTGCGAATGCTGACGTTAAACTTGGTTTTGCTTATTCAGCCCCAGGTCAGCGTCCAACAGTCCTACTACAGAACGAAATCCAGTCCGAATCTATGGCTCCGGTAACTCTTACTGTACAAAAAACGGCAACATTTGGTGATGAGTCTCTTGCTACCTATGGTATTACTGGCAAAGGTCTAAACAAATTAGATTATGTAGAAATTCTAGGTAACTCAACACAAAGCCCAGCAACACCTCGTCTAAAAGTTAATGGTAAAACCATTCTTAATGATGTAGACTTCACTGGTGTCGTAACTGGTCTAACAGTTGATGTGAGTGGTCAGGATTTAACACCTAATTCCGTCATTGCGGCTGGTGAAATTAAATCTTCATCATTAGAATCAACTGGTGGTGCAACTATTAATGCTAACTTACTCGTTGGTGGAACTGCTAACGTGACTGGAGCACTAAACTCTGGAGCAATTACCAGTACTGGTAACGTAAAAGGTGTTGGTGGTGAGTTCAGTGGTAATGTGAGCGGTGTTGATGGTACATTTACTGGCAATGTAAGTGGTGTGAACGGTACATTCAGTGGTGATGTAAGTGGTGCAGCGGGTGCATTTAGCGGGAATGTGACAGTAACTGGTCAAACAGTAACAGTTAAAGACCTAGTAGTAACTGGAACTACAACTGGTGTTGTAGCAGATGCTAACGTTGATGGCCTTGATATTGCTCCTAATAAAGTTGATGTAACCACAACCCTAAGTGTTGCTGGTAATAGTACCCTAGCCGATGTAAGTGCTGGTGCAATCACTGCAACTGGTAACGTTAGTGCAGCAGCTATTTCTGGTTCGTCTTTGAAAGTAACTGGTAATATCGAAGGTGTAGCTATCGCTGGTTCTTCTATGAATTTAACTGGTGCAGCAACTACTGGTTCATTATCAACTGGAACTCTAACTTCACCAACTATTAACGGTAACACTACTTTTACTGATAATGTAACTGTCACTGGTACACTTACCCCAGGTGCAATTGATCTATCAACGACTGATGTTAGTGCTCAATCCATATCTACAACTGCTGGTGCATCTATCGGTGGCAACTTAGTAGTAGCTGGTACAGTTGATCTTAGTGCAGCAGACGTTAGTGTTAAATCTTTAACTACTCCAGGTATTGTAACTTCTACTAACGCAACTGATGCAAACGTACTTCCAGTACTTAATAGTAACACAGCAACTGTTGGAACTGCAAATGTAACCGCACTAAATGTTAGTGGTGCATCTAATGTAGCTTCACTCGATGCTACTGGTGCAGTATCTGTTGGTTCTACTCTTGATGTAACTGGTGCAAGTACTTTAGGTTCAGTGATTACCCCATTGATTTCTAATGCTGATGGTATTCAAATTGCAAATGATACAACTATCTCTGCAAACCTAGCTGTTACTGGAACATTGACTCCAGGTGCAATTGACCTAGCAACAACTGATGTTAGTGCAAAATCTATTACAACTACTGAAGGTGCAAACATTGGTGGTAACTTAGTCGTAGCTGGTACTGTTGATCTTAGTGCTGCTGATGTTAGTGTTAAATCACTATCTTCTGCTGGTATTATTCAAAGTACTGACTTAGTTAATGCAAACGTACTTCCAGTACTTAAATCTACTACTGCAACTATTAATGCAGTTAATGCAACTGAACTATCAGTTGAAGGTCCAACTAATATATCAAGTCTACGCACAAGTGCAGATGCAGTAATTGGAACTACACTAACAGTATCTGGACAAGCAACTGCTGTTTCCTTGGTAACTCCAACCATTTCTAACGAAACTGGTGTGGAAATTGCAAGCAACACTAAAGTAACAGGTGATTTAACTGTAACCGGAACTGTAACTCCAGGTGCAATTGACCTAGCAACAACTGATGTTAGTGCTAAATCAATCACTACTACTGGTGGTGCAAATATCGGTGGTGACTTGGTAGTAGCTGGTACATTTGACCTATCTGCTTCTGATGTAACTGCAAACACTTTAGCTTCTGTCGGTAACACTACTGTTGGTGCGGATCTAGTTCTAACAACTGGTAATGTAACTGGTAGCCCAGCCGTTTCTGGTAACTTGTCTGTAGCTGGTACAAGCACTCTAACTGGTGCAGCAACTGTTGGTAATAAACTAACTGTTAATACAGGTGGTATTCAAGTTGTAGCTGGTGGTGTACGTGTTGATACTGGTAGTATCACTGCACAAGGTGCAAATATCTCCGGTACTGCAACTCTAGAAAACGCTTCAGTAACTTCTAATGCGGCGGTCGGTGGTACACTTGGTGTTACTGGTGCAGCAACTTTAAACGGCGGTTTAACTTCTTCTGCTCTAACCGTAACTGGTGATTCAGTAGTTCAAAAACTAACTGTTAAAGGTGAATTTATTCCTGAAGGTGGTTTGGATCTAAGTGGTGCAGACATTACAGCAAACAGTCTTGATGTTGCAACAACCCTAAAAGCAACTGGCTTGAGTACTCTAAGTGGTGGCGTATCTACTACTGATATCAGTGGTTCAGGTAAAATCACAACTGTTGATGCACAAACTGGGACTCTTACTGTTACCGGAAATCAAACTGTTGGTGGTACTCTTGGTGTAACAGGTAAAGCAACTACTGGTTCGTTGGATACTGGTGCAGTTTCTGCAACATCTGGAACATTTAGTAGTACACTAGGTGTAACTGGTGCTGCAACATTTGCTGATGCTGTAACGGTTAACGGTGTATTCACTCCAGTGGGTGGTTTGGATCTATCTACTTCTGATATTACTGCAAACAGCCTTGACGTGGCAACCACAATTAAGAGCACTGCGGGTGCAACTATTGGTGGTGACTCAACTATCGCTGGTACACTAGGTGTAACTGGTGCGGTTTCTGCTCCGTCCCTAACATTGTCCAATGCTTCTGGTACTGGTCTTGATGTTAAAGGTAATGCTATCGTAGCTGGTACTTTATCTACAACTGGTGCTGTTACTTTAGGTAATACTTTAGGTGTAACTGGTAAAGCAACAACTGGTTCACTAGATACTGGTGCAGTTTCTGCAACAAGTATTGTTGGTACTGCTGGTTTAACTATGGCTGGTAATTCATCTTTCACTAATGACCTAACAGTAAGCGGTACATTTACTCCTGCTGGTGGTTTAGACCTAACAACATCTGATATCGTTGCGAATAGTTTATCTACTTCTTCTACTATCCACAGTGATACAAACGGTACATTCGGTGGCACACTAGGTGTAACAAGTAACGCAACTATTGGTGGAACTTTAGGTGTAAC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
f3a33ebaae23704f97ce7326340a91c2574b9cf05a95515b671bb1fa1b432317
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5047
Evidence 0,5047
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Transient expression effect of genes from a Jumbo E. coli phage Petrzik,K. and Brazdova,S. 2023-07-26 — GenBank