Protein

View in Explore
UniProt accession
A0A0E3XC60 [UniProt]
Protein name
Glycerophosphoryl diester phosphodiesterase
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MVKRRFQAGLGSEIKRVYKEGQQINTLLLAQVIQVNYKYNTVDLLALQHKEVFQNSYANEGRFSARLPMEFGGRNIVGQPYGQVNPIAVGTVVLVGFINSDKDMPIVISVYNNNDVSKQLSRTQFSNSDPKDLELIGDMHQKFSLYPSLTYDSVDGEGGRVVTFSGKSFIAFDTKEVANSSTTDAGYGTKYEDLETSYYNNGDLIEPMKGRAPNVLFKHQGVLDDDGKPDLHDLLIHINPDGTYRTSMMNKEEDWRTLFEMTPDGRVKLRKQDSINIDGGIEISELGINNEGFVYLRNGDMDLEVRKDGIYSQGKLFTADVDLSDVYDKLNGLSIQIKETNGQLEIIANGVEEQNGKISELSTEITIVAGKVESKVTKTEVQDMIDSSFVDMSDAIKKAQEDADKANKVIADMSSDNRLTPSEKIDLLKEWDIIKNEYPSYLEQAETYEVDSKDYTAKYNSLELFVTPILADMESTSSVDGATLRKTFNSYYTARIALLNSISKKLKDGITEAMKKASQASLDATQAMADASQAKIDADNANKLISDIASDNKLTPSEKYQLKKEWDVIVKEYPTTIAQAEKYAVDTAEYTAKYKALELFVEPLFKDMDETSIVDGERLRATFSDYYASKIALLKEVTDSAKTELDAYGNKISVMETNITQTSEAITLLATRVQTVEDGVQSNKAQIEIQAEQISQKVTASEVKGIVDDSINNLTLGGTNLFVIKTQTAGLLNENDGTVGTAVDNSVVSDYIKVNQKTPYIATLYGNTGTNMIITDWYDKNRTFISGEAVADSGDFSKKYVSPDNAVYARVSYKKANYVNIKFEAGTKATDYSPSWEDIKGDQTALEEYIKKVEEQAKKAQQDAENAKNDAENANNAIADMSNDNMLAPNEKKQILLQWEQIKTEYPINLDQATKFGVSSQQYTTAYNALDEYLKPILADMTTTSVVVGSTLRNTFNNYYDKRTTLLNRISDVAKNVADKAQETADTINDNLQNIGGYNYVGFSSGDNMLPRLMIKNVGYYTLGSSTTEFIDSMVAVKGDATTQPFDYTVGTSDKEIAGGGLADYRMKEVKEGQWLTASANVQVIGGGSARLAIYTLEGDNWVGSNSTPIQVSDGLKRVVAQRKVTGLTKGVLIRIESADTNVKEFRFGNVQLEVGIIPTPWKKSDIDIQEDINNVVQNIKTYTAWANDLQGLDFTREKVEGKTYMYVGTSMKDSDNYSDYTWRLTDEHIEGQINGKEGAWIYSPTAPTNPSQGLIWVDLSKVPNQPKRWVDSETGWVALTPEEVKDLPWGEDGTNLADWVAQAEQRISSDSIINTVLGSEDFTSVFDTKANTTDLDNLATYEDLDSIKEDYNRLIKEGINGIDFTPYVTNSELQQLKDSFNFSVQQAGGVNMLKNSLGFSGLDFWDGTVGKNLLANSTWNLGFGRWGGYSILQFEILPPEDDKPTSNILASMPSRSATKEIGNIPHPIKVSSGETYTISFDYKEDPITYMSDRPIFAIRVFPDENTDQWSQFAIEEWTVNGNSSKEDLTVWKRYEKTVTINTSGYLDVYPKNILEHWTHRSYWRELKIEEGSQATTWVPNKEDGAFTGGIVETTQTEELANLGFGSGFVSSKRASSSLTQSVALPEIGENLEYALSFYMKVTTNNPVADFKCGIRVYEGDALTYTLGVEDATQPIPVGFQQYKLVFTPTNTSTKIEMFVENGQEASVIISGIMYNIGNIPLKWQPYPSEIYNTNVKIDINGVTVKNNQTDGYTMITPQEFSGYSRIDGNIERIFTLNGQVTEVKMLKAEKRITMEPVSVFAMNTVTDTKRIRGWAFVPSFE
Physico‐chemical
properties
protein length:1822 AA
molecular weight: 202917,10400 Da
isoelectric point:4,69242
aromaticity:0,09166
hydropathy:-0,46828

Domains

Domains [InterPro]
DC_1874
ATT
72–503
DC_1874 DC_0015 Coil DC_0015
Coil
Unmapped
396–416
Coil DC_0015 G3DSA:2.60.120.260
A0A0E3XC60
1 1822
Architecture
ATT
STR
ATT 72-503 | STR 523-1822
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Enterococcus phage EFLK1
[NCBI] 		1640885 Uroviricota > Caudoviricetes > Herelleviridae > Kochikohdavirus > Kochikohdavirus EFLK1
Host Enterococcus faecalis
[NCBI] 		1351 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Lactobacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AKC05133.2 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KR049063 [NCBI]
CDS location
range 95066 -> 100534
strand -
CDS
TTGGTAAAACGTAGATTTCAAGCAGGTCTAGGCTCAGAAATTAAAAGAGTATATAAAGAAGGACAACAAATTAATACGCTACTATTAGCACAAGTAATTCAAGTAAACTATAAATATAATACAGTAGACCTACTAGCTTTACAGCATAAAGAAGTATTTCAAAATTCCTATGCAAATGAGGGACGTTTTTCTGCAAGACTTCCTATGGAATTTGGCGGTAGAAATATCGTTGGACAGCCTTATGGACAGGTTAACCCGATAGCAGTAGGGACAGTAGTATTAGTTGGTTTTATTAATTCCGATAAAGACATGCCTATTGTAATTAGTGTTTATAATAATAACGATGTAAGCAAGCAACTTTCAAGAACACAATTTTCAAATTCAGACCCTAAAGATTTAGAGTTAATTGGAGATATGCACCAAAAATTTAGTTTGTACCCTTCATTGACATACGATAGCGTTGATGGAGAAGGAGGACGTGTCGTTACTTTTTCTGGTAAATCATTTATTGCTTTTGATACAAAAGAAGTAGCTAACTCCTCTACAACTGATGCAGGTTATGGTACTAAGTATGAGGACTTAGAGACATCATACTATAATAATGGTGACCTAATAGAGCCTATGAAAGGTAGAGCACCAAATGTACTGTTTAAGCATCAAGGGGTGCTTGATGATGATGGAAAACCAGATTTGCACGATTTACTAATTCATATTAACCCAGATGGTACTTATAGAACTTCTATGATGAACAAAGAAGAGGATTGGCGCACACTATTTGAAATGACACCAGATGGCAGAGTTAAATTAAGAAAACAAGACTCTATTAATATTGATGGTGGCATAGAAATAAGTGAGCTAGGAATCAACAATGAGGGGTTCGTTTATTTACGTAATGGGGATATGGATTTAGAAGTACGAAAAGACGGTATCTATTCACAAGGGAAACTGTTTACAGCCGATGTAGACTTATCCGATGTATATGACAAACTAAATGGGTTGTCTATACAGATTAAGGAAACAAATGGTCAATTAGAGATTATAGCTAATGGTGTAGAAGAACAAAATGGAAAAATATCAGAACTTTCTACAGAAATAACAATTGTAGCAGGTAAAGTTGAATCAAAAGTAACAAAGACAGAAGTTCAGGATATGATTGACAGTTCTTTTGTAGATATGTCTGATGCGATTAAAAAAGCACAAGAAGATGCTGACAAAGCAAATAAAGTGATTGCAGATATGTCTAGTGATAACAGACTGACTCCAAGTGAAAAAATAGATTTATTAAAAGAATGGGATATTATAAAAAATGAATATCCAAGCTATCTCGAACAAGCAGAAACCTACGAGGTTGATAGTAAAGACTACACTGCTAAGTATAATTCATTAGAGCTATTTGTTACCCCTATATTGGCTGACATGGAATCAACTAGCTCGGTAGACGGAGCAACACTCCGCAAAACGTTTAATTCTTACTATACAGCAAGAATAGCTTTACTAAATTCTATTAGTAAAAAACTAAAAGACGGTATCACAGAGGCTATGAAAAAAGCATCCCAAGCATCACTAGATGCAACACAAGCAATGGCAGATGCTTCACAAGCTAAGATTGATGCAGATAATGCTAACAAACTTATATCTGATATAGCAAGTGATAACAAGCTAACACCTTCTGAAAAATACCAACTTAAAAAGGAATGGGATGTAATTGTTAAGGAATACCCTACAACAATTGCACAAGCAGAGAAGTACGCAGTAGACACAGCAGAGTATACAGCTAAATATAAAGCCCTAGAGCTGTTTGTAGAGCCTTTGTTTAAAGACATGGATGAAACTAGTATAGTAGACGGAGAACGCCTTAGAGCGACATTCTCGGACTATTACGCAAGTAAGATTGCTTTACTAAAAGAAGTAACGGACTCAGCTAAAACAGAGCTAGATGCCTATGGTAATAAAATATCTGTAATGGAAACAAACATTACTCAAACATCAGAAGCTATTACTTTACTAGCTACTAGAGTACAAACTGTAGAAGACGGTGTACAATCGAATAAGGCACAAATCGAAATACAAGCTGAACAAATTAGTCAAAAAGTAACTGCTAGTGAGGTTAAAGGAATTGTAGACGATTCTATTAACAATCTAACATTAGGTGGAACTAACTTATTTGTTATAAAGACACAGACAGCAGGTTTACTAAACGAGAATGATGGAACTGTAGGTACTGCAGTAGATAACTCAGTGGTGTCAGACTACATTAAAGTTAATCAAAAAACACCATATATTGCTACACTTTATGGTAACACTGGCACAAACATGATTATAACAGACTGGTACGATAAAAATAGAACATTTATTTCTGGGGAAGCTGTGGCAGACTCTGGGGATTTTAGTAAAAAGTATGTGTCACCTGATAATGCAGTCTATGCTAGGGTAAGTTATAAGAAAGCAAACTATGTGAATATCAAATTCGAGGCAGGTACAAAGGCTACTGATTACAGCCCTTCATGGGAAGACATAAAAGGTGACCAAACTGCTTTAGAGGAATACATTAAAAAAGTAGAAGAACAAGCCAAGAAAGCTCAACAAGATGCTGAAAATGCTAAAAATGATGCTGAAAATGCAAATAACGCAATAGCTGACATGTCGAATGACAATATGTTAGCACCGAATGAGAAAAAACAAATACTCTTACAATGGGAACAGATTAAAACAGAGTATCCAATAAACTTAGACCAAGCAACTAAATTTGGGGTGTCTTCTCAACAGTATACAACAGCATATAACGCACTAGACGAGTACTTAAAACCAATACTAGCTGACATGACAACAACTTCTGTAGTAGTTGGTTCTACTTTAAGAAATACGTTTAACAACTATTATGACAAAAGAACTACTTTGCTAAACAGAATATCTGACGTAGCAAAAAATGTAGCAGACAAGGCACAAGAAACTGCAGATACTATCAATGATAATTTACAAAATATTGGTGGGTACAACTATGTAGGGTTCTCTTCCGGAGACAATATGTTGCCTAGACTGATGATTAAAAACGTTGGTTACTACACATTAGGTTCGTCAACCACAGAGTTCATTGACAGCATGGTAGCTGTAAAAGGTGATGCAACGACCCAACCTTTCGATTATACTGTAGGTACTTCTGATAAAGAAATTGCTGGTGGCGGTTTAGCTGATTATCGTATGAAAGAAGTAAAAGAAGGTCAGTGGCTAACAGCTTCTGCGAATGTGCAGGTAATAGGTGGTGGCTCTGCTAGACTAGCTATCTACACTTTAGAAGGGGATAACTGGGTAGGCTCTAATAGTACGCCTATACAAGTAAGTGATGGTTTGAAACGTGTTGTGGCTCAAAGAAAAGTAACAGGCTTAACAAAAGGTGTGTTAATACGTATTGAGTCAGCCGACACTAATGTTAAAGAGTTTCGATTCGGTAATGTTCAACTAGAAGTAGGTATCATTCCAACTCCTTGGAAAAAGTCTGATATAGATATTCAAGAGGACATAAACAATGTTGTTCAGAATATCAAAACATACACTGCTTGGGCTAACGATTTACAGGGTCTTGATTTTACAAGAGAAAAGGTTGAAGGAAAAACTTACATGTATGTAGGTACCTCTATGAAAGATAGTGATAACTATTCAGATTATACATGGAGGCTAACTGATGAACATATAGAAGGTCAGATTAATGGTAAGGAAGGCGCATGGATTTATTCTCCAACAGCCCCTACTAACCCATCGCAAGGGCTTATATGGGTAGACTTGTCAAAAGTACCTAACCAACCTAAGCGTTGGGTAGATTCAGAAACTGGGTGGGTTGCATTAACACCAGAAGAGGTTAAAGATTTACCTTGGGGTGAAGACGGCACAAACTTAGCTGACTGGGTAGCACAGGCAGAGCAGAGAATATCTTCCGATAGCATTATAAATACTGTACTAGGTTCTGAGGATTTTACTAGTGTGTTCGATACAAAGGCTAACACTACTGACCTAGATAACTTAGCTACCTATGAAGATTTAGACTCAATAAAAGAGGACTATAACCGACTAATCAAAGAAGGTATAAACGGTATTGATTTTACCCCTTATGTAACTAACTCCGAACTACAACAGCTTAAAGACAGCTTTAACTTCTCTGTTCAACAAGCCGGAGGGGTTAACATGCTTAAAAACTCTTTAGGATTCTCTGGGTTAGACTTCTGGGATGGTACAGTAGGGAAAAACTTGTTAGCTAACTCCACATGGAATCTAGGCTTTGGTCGATGGGGTGGATATTCAATACTTCAATTTGAAATACTTCCACCAGAAGATGACAAGCCAACAAGCAACATACTAGCCTCAATGCCGTCACGTTCTGCTACTAAAGAAATAGGTAATATACCTCACCCAATAAAAGTTAGTTCCGGTGAAACATACACGATAAGCTTCGACTATAAAGAAGACCCGATAACTTACATGAGTGATAGACCTATTTTTGCTATACGTGTATTCCCTGATGAGAACACCGACCAATGGTCTCAATTTGCTATTGAAGAGTGGACAGTCAATGGTAACAGCAGTAAAGAAGATTTAACTGTATGGAAGAGATATGAAAAAACGGTGACAATTAACACTAGTGGGTACCTTGATGTCTATCCTAAAAATATACTAGAACACTGGACACATCGTTCTTATTGGAGAGAGCTAAAAATAGAGGAAGGGTCACAAGCTACTACTTGGGTGCCCAACAAGGAAGATGGAGCGTTTACCGGTGGTATTGTTGAAACTACTCAAACAGAGGAGTTAGCTAACCTAGGGTTTGGTTCTGGGTTTGTTAGCTCCAAAAGAGCTAGCTCTTCACTAACACAGTCTGTGGCACTCCCTGAAATAGGGGAGAACCTTGAGTATGCTCTATCTTTCTATATGAAAGTAACAACAAACAATCCTGTAGCTGACTTTAAATGTGGTATTAGAGTTTATGAAGGAGATGCCCTAACTTATACTTTAGGTGTAGAGGATGCAACACAACCTATACCAGTAGGATTTCAACAATACAAACTTGTATTCACTCCTACGAATACCTCTACTAAAATAGAAATGTTTGTAGAAAATGGACAAGAGGCATCTGTTATTATATCAGGTATCATGTACAATATCGGGAATATACCTCTTAAATGGCAACCATATCCAAGTGAGATATACAATACGAATGTTAAGATTGATATTAATGGGGTAACTGTTAAAAACAATCAAACAGATGGGTACACAATGATTACCCCCCAAGAGTTTTCAGGCTACTCTCGTATTGATGGTAACATAGAACGTATTTTCACTTTAAATGGGCAGGTAACAGAAGTTAAAATGTTAAAGGCTGAAAAACGTATAACTATGGAACCAGTGTCTGTATTTGCTATGAATACAGTAACAGATACAAAAAGAATTAGAGGTTGGGCATTTGTACCATCATTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Gene Ontology

Description Category Evidence (source)
GO:0008889 glycerophosphodiester phosphodiesterase activity Molecular Function IEA:UniProtKB-EC (UniProt)

Tertiary structure

PDB ID
3c3082115859590858c7fec2e225a88d7d0580242c3636bd13d8252ca90de8a3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7271
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
— — 26586876 PubMed