Protein

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Genbank accession
YP_009322459.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence UniProt/TrEMBL
Probability 1,00
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,87
Protein sequence
MPLSRLENFLKNVEGNILYVNPTDLDATDSIDNQGNSLTRPFKTIQRALLEAARFSYQIGLNNDKFNRTTILLYPGTHEVDNRPGYNVIQSGSNAIYRDRNGVEVSLNQLSSGSNYNIDDSANELHKYNSVEGGVIVPRGVSIVGLDLRKTNIRPKFVPDPTDDAILRSAIFRITGGCYFWQFTVFDGDSKGSVYRDYTNNRYTPSFSHHKLTVFEYADGVNGVGIGTSTTTTDLSMYYHKIQKAYGDSSGRGIADFPANRDMQAKLPEYEIVGPVSAIDVGITSIRAGAGSKTNTSTTITVDCETPHNLVVDSEFRVSGVNTYPNIYNGNFVVTGVSSERIFTYRSSSPPTDGLPDLDGDEKIIADTDTVSGASPYIFNCSLRSVYGMCGMHADGSKATGFKSMVVAQYTGVGLQKDNNAFLFYNEANGQYDTNSTVDDSEKPLYLNSKAVYRPSYENYHVKASNKSVIQIVSVFAIGYAQHFLAESGGDQSITNSNSNFGAKSLIANGFQDESFSRDNRGYVTHVVPPRRLSKSEKSVEWLTLNVGLTTSPVGVGTIQKIFIDEFTDPDVPPPVVVEGFRLGAKSTFSQDKLCTNPDLLNISIAGVGTFSAPIRMLNKDGTSGPSRTKEYNVGFVGAANSITTSVLTLQENHELYAGESIRVISDDGSLPDGIESNTIYYAVTNDSTNETLNPDQIKLARTENEAILGGSGNFISISNNRGGRLRINSRVTDKQPGEFGHPVQYDTTNSNWYINSDISPVTNRIYNALVTNGPAIGARTNKSFFTRREDNRSINDKLYKLRYVLPKESEDARPPIPGFVIQDSSTVGVTTASDFTDNIPNATIQRNIRILKGLNRDSNSGVTTFVTEKPHNFEVGDTVNFLNIKSSGNTVGAANSGYNISRVVTGISSSKGFQVNFSNDPGSFINNISTRDDGLPTVSRKSAKETFTVYRVETLKAHEYNKQDGVYHLICVDSSIKPTVNEFGNFGYTQQIENLYPQFDGDNFVMDPSQASSFAVATPQGKVVTNDLRYSITKEFTNRYIRSNGIGIGITFAEGSTQGITTIYTDREHNLNSIISVGLGSTGLNYGAGVSTTLYNASLTYSGIETGKGATANIDIDANGGITGITIVDGGSAYGVGHTLNITGVETSASHVQGWITVNKISNNIGDAIEIVGVGTSLARYVSGYNGIHTITAIRPRAVEYNNGFWPGYYDVNTVGLATGFMMYAGPVPDISNVVYDSSVGVVTVTTTSAHGLNVNNPFKIVGVAQTIFNTENIVRERVSTTQFNFKFNEDYDAATYTSGGSVLPVNYAARGGITEFGNERIAQRHVPFRTGIQTAMSGSSLNATSTSLTLGDSSGFQKGDYVQIDGEIIRVSSDFSANSATVLRGQLGSRSAAHDGGSLVKKLRILATEKRRHSILRASGHTFEYLGYGPGNYSSGLPQKQDRILSREEQFLSQAQTPNGGAVVYTGMNDAGDFYIGNKVINAQDGTEATFNIPVPTVTGADQDGSGTGTRLDAIFDSLTVREGITVDGNNNSTTRFNGPVVTNEKLTNTSSDGIETVQISINGGLTENRTITYSPSKPTTSGTTGDIVFNSNPSFGQYVGWIYTQESWKRFGLISTEVDETQLSLNTVGVGSTSASRIGQQDGVDVRGTIVADAFVCAGVCTFSGNVTFASITFSEITVAGVGTFSNRLDVPGNSNFVGVTTLRDVESIKVSGISTFNGNVNIGNATSDTLTLTSRIAGRLDPSANATYDIGRGNRQWRNIVASGVVTATSFVGDGSNLTNTGATLSAASGSQRVVLTSLTSGTMTSAATEAALAYNASTNTLTATTFSGNATTATSATTATTATNATNITVADESADTTCFPVFTTAATGNRPPKTGSNLTFNSSTGRLSATSFAGNGASLTGVVATTAIDATNSTNLNLRARNTENATHYVTFGTSTTGNQRLNTDTGLTYNPSTNTLTATTFSGNATTATTATTATTATTATTATTATNCTNFDVAADNTTDATHYPIFTGGATGNQRPNSDTDLTYNPNSGVLSSAEFSATSDERLKKNIETITDALDKVTHLRGVEYDLKSNDRHQIGVIAQEVEKVIPSVVSERDDNGTKTVAYGNMVGLLIEAIKEQQIQIQEQQTQIQELKAKVDDLSK
Physico‐chemical
properties
protein length:2150 AA
molecular weight: 229968,57890 Da
isoelectric point:5,32231
aromaticity:0,08140
hydropathy:-0,31940

Domains

Domains [InterPro]
DC_0066
STR
1–1876
DC_0066 DC_1985
IPR036388
RBD
2037–2149
IPR036388
IPR030392
CHP
2049–2100
IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
2049–2138
IPR030392
YP_009322459.1
1 2150
Architecture
STR
RBD
STR 1-1876 | RBD 1894-2150
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
YP_009322459.1
1 2150
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 79 79 0,8202
Central domain 80 308 230 0,9253
C-terminal 309 2150 1841 0,1583
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-79
Central
80-308
C-terminal
309-2150

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM9
[NCBI] 		1883369 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Kanaloavirus > Kanaloavirus scam9
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009322459.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_031922.1 [NCBI]
CDS location
range 17779 -> 24231
strand +
CDS
ATGCCTTTAAGTAGACTAGAGAATTTCCTAAAGAACGTTGAAGGTAACATTCTTTATGTAAACCCAACTGATCTTGATGCTACTGATAGTATTGATAATCAGGGTAACTCCTTAACGAGGCCTTTCAAAACTATTCAAAGAGCTTTATTAGAAGCTGCTAGATTTTCATATCAAATTGGACTGAATAACGATAAGTTCAATAGAACAACAATTCTGTTGTATCCTGGAACTCATGAAGTTGATAACAGACCTGGATATAACGTTATACAGTCTGGTTCCAACGCGATCTATCGCGACAGAAATGGAGTTGAGGTATCTTTAAATCAGTTAAGTTCGGGTAGTAATTATAATATCGATGACTCTGCAAACGAACTGCACAAATATAACTCTGTAGAAGGTGGGGTTATTGTGCCCCGTGGTGTCTCTATTGTTGGTTTGGATCTACGTAAGACCAACATTAGACCAAAGTTTGTTCCTGATCCAACAGATGATGCGATTCTGAGATCTGCAATCTTCCGTATTACTGGTGGGTGTTACTTCTGGCAGTTCACTGTTTTTGATGGTGATTCAAAAGGTTCTGTTTATAGAGACTACACAAATAACAGATATACTCCAAGTTTTTCACACCACAAACTTACTGTATTTGAATATGCAGATGGTGTAAATGGTGTTGGTATTGGTACGTCTACGACTACCACTGACCTTTCGATGTATTATCATAAGATTCAAAAGGCTTATGGTGACAGTTCTGGTCGTGGAATTGCAGATTTCCCAGCTAATAGAGATATGCAGGCTAAACTGCCTGAATATGAGATTGTTGGACCTGTTTCTGCGATTGATGTAGGTATTACAAGTATCCGTGCGGGTGCTGGTTCTAAAACAAATACTTCTACAACAATTACTGTTGATTGTGAAACACCACACAACCTGGTTGTTGACAGTGAATTTAGAGTATCGGGTGTTAATACATATCCAAATATTTACAACGGTAACTTTGTTGTAACTGGTGTATCTTCTGAAAGAATCTTTACATATCGATCAAGTTCTCCACCGACAGATGGATTACCAGATCTTGACGGTGATGAAAAGATAATTGCTGATACTGACACTGTATCAGGTGCATCTCCATATATTTTCAACTGTTCTTTGAGATCTGTTTATGGTATGTGTGGTATGCACGCTGATGGATCTAAAGCTACAGGCTTTAAGTCCATGGTTGTTGCTCAATATACTGGTGTTGGTCTGCAGAAAGATAACAACGCATTCCTCTTCTATAATGAAGCAAATGGTCAATATGATACTAATTCCACAGTTGATGATAGTGAAAAACCACTTTACTTAAACAGTAAGGCAGTTTATAGACCATCTTACGAAAATTATCATGTAAAGGCCTCTAATAAATCTGTTATCCAGATCGTATCCGTCTTTGCTATCGGTTACGCACAACACTTTCTTGCAGAGTCTGGTGGTGACCAATCAATTACCAACTCCAACTCTAACTTTGGTGCAAAATCTCTGATTGCAAATGGATTCCAAGATGAATCATTTAGTAGAGATAACAGAGGATATGTAACACACGTCGTTCCTCCTCGTAGATTAAGTAAATCTGAAAAATCTGTAGAGTGGTTAACCCTTAATGTTGGTCTTACAACAAGTCCTGTTGGTGTTGGAACTATTCAGAAGATTTTCATTGATGAATTTACCGATCCAGATGTTCCACCCCCAGTTGTTGTAGAGGGTTTTAGACTTGGTGCGAAATCTACGTTTAGTCAAGACAAACTTTGCACAAATCCAGATCTTCTCAATATTTCTATTGCTGGTGTAGGAACATTTTCTGCTCCAATTAGAATGCTGAACAAGGATGGTACTAGTGGACCATCGAGAACAAAAGAATATAATGTTGGATTCGTTGGTGCAGCTAACAGCATTACAACTAGTGTTTTAACTCTTCAGGAAAATCATGAACTATACGCTGGAGAAAGTATTCGTGTAATCTCTGATGATGGTTCTTTACCTGATGGCATTGAAAGTAATACAATTTATTATGCAGTTACAAATGATTCTACTAATGAAACTCTGAACCCCGATCAGATCAAACTTGCAAGAACAGAAAACGAAGCTATTCTTGGTGGATCTGGTAACTTTATTTCAATCAGTAATAACAGAGGTGGTAGACTTAGAATTAATTCCAGAGTTACTGATAAACAACCTGGAGAATTTGGACACCCAGTTCAGTATGATACTACCAACTCTAACTGGTATATTAACAGTGACATTAGTCCAGTCACTAACAGAATTTATAATGCTCTGGTAACAAACGGCCCTGCTATTGGTGCAAGAACCAATAAGTCGTTCTTTACTAGAAGAGAAGACAATAGATCTATTAATGATAAACTGTATAAACTTCGTTATGTGCTTCCTAAAGAATCTGAAGATGCACGTCCACCTATTCCTGGATTTGTAATTCAAGATTCTAGTACTGTCGGTGTAACAACTGCAAGTGATTTCACTGACAATATTCCAAATGCGACTATTCAAAGAAATATTCGTATTCTCAAGGGTTTGAATCGCGATTCAAATAGTGGTGTTACAACGTTTGTCACTGAGAAACCTCACAATTTTGAAGTTGGAGATACTGTTAACTTCCTGAACATTAAGAGTTCGGGTAACACAGTTGGTGCAGCTAACAGTGGATACAACATTTCCAGAGTTGTTACTGGAATCAGTAGCTCTAAGGGATTTCAGGTTAATTTCTCCAATGATCCTGGAAGTTTCATCAACAACATTTCCACAAGAGATGATGGTCTTCCTACAGTATCCAGAAAGTCCGCTAAAGAAACTTTCACAGTATACCGTGTTGAAACTCTAAAAGCCCATGAGTATAACAAACAAGATGGTGTTTATCATTTGATCTGTGTTGATAGTAGTATCAAACCAACCGTTAATGAATTTGGAAATTTTGGTTATACACAACAAATTGAAAACTTGTATCCTCAATTTGATGGTGATAACTTTGTCATGGATCCCTCTCAGGCATCCAGTTTTGCTGTCGCAACTCCTCAAGGTAAGGTTGTAACAAACGATCTTCGTTATAGCATCACAAAAGAATTTACCAACAGATACATTAGAAGTAATGGTATTGGTATTGGAATTACTTTTGCAGAAGGATCCACCCAAGGTATTACCACGATTTACACAGATCGTGAACACAATCTGAACAGTATTATATCTGTTGGTTTAGGTTCTACTGGTCTTAACTATGGTGCAGGTGTATCCACGACTCTCTACAACGCCTCTCTGACCTATTCTGGTATTGAGACTGGTAAGGGTGCAACAGCTAACATTGACATTGATGCGAATGGTGGTATTACAGGTATTACAATTGTTGATGGTGGTTCTGCATATGGAGTTGGACATACCCTGAATATCACGGGTGTAGAAACTTCTGCAAGTCATGTTCAAGGTTGGATCACAGTTAATAAGATCTCTAATAATATTGGTGATGCAATTGAAATCGTTGGTGTTGGTACTTCTCTTGCACGTTATGTGAGTGGATACAACGGAATCCATACAATTACTGCGATCAGACCAAGAGCAGTTGAATACAACAATGGATTCTGGCCTGGTTATTATGATGTGAATACAGTTGGTCTTGCAACTGGATTCATGATGTACGCTGGTCCTGTACCAGACATTTCTAATGTTGTGTATGACAGTTCTGTTGGTGTTGTCACTGTCACGACTACATCGGCTCATGGACTCAACGTCAATAATCCATTCAAGATTGTTGGTGTTGCACAGACTATCTTTAACACTGAAAATATTGTTAGAGAAAGAGTTAGTACGACTCAATTCAACTTCAAGTTCAATGAAGATTATGATGCTGCAACTTATACCTCTGGTGGTTCTGTCTTACCTGTCAACTATGCAGCTCGTGGTGGAATAACTGAGTTTGGCAATGAAAGAATTGCACAAAGACATGTTCCTTTCAGAACTGGTATTCAGACTGCAATGTCTGGTTCGAGTCTGAATGCTACTTCTACAAGTCTTACTCTTGGTGACAGTTCTGGATTCCAGAAAGGTGATTATGTACAGATTGATGGTGAAATCATTCGTGTATCTTCTGACTTCTCTGCAAACTCAGCTACAGTTCTGAGAGGTCAACTTGGCTCTCGTTCTGCTGCTCATGATGGTGGATCTCTGGTCAAGAAACTTCGCATTCTTGCAACTGAGAAGAGAAGACACTCCATTCTTCGTGCATCTGGTCACACATTTGAATATCTTGGTTATGGTCCTGGTAACTATTCCAGTGGTCTTCCTCAGAAACAGGATAGGATTCTTTCTAGAGAAGAACAATTCCTGAGTCAGGCACAAACACCTAATGGTGGTGCAGTTGTTTACACTGGTATGAATGATGCTGGTGACTTCTACATTGGTAACAAAGTCATCAATGCACAAGATGGTACTGAAGCTACCTTCAATATTCCTGTTCCAACTGTAACTGGTGCTGACCAAGATGGATCTGGAACTGGCACAAGACTTGATGCTATCTTCGATTCCTTAACTGTCAGGGAGGGTATCACAGTTGATGGTAACAACAATAGCACTACTAGATTTAATGGTCCAGTTGTTACAAATGAAAAACTGACTAATACCAGTTCTGATGGTATTGAAACTGTTCAGATTTCTATCAACGGTGGTCTTACCGAAAACAGAACTATCACATATTCTCCTTCTAAACCAACCACGTCTGGAACAACTGGTGACATTGTTTTCAACTCCAATCCAAGTTTCGGACAATATGTTGGTTGGATTTATACTCAAGAATCTTGGAAGAGATTTGGCCTTATTTCTACAGAAGTTGATGAGACACAACTCAGTCTCAACACTGTTGGTGTTGGATCCACAAGTGCTTCTAGAATTGGTCAACAGGATGGTGTTGATGTTCGCGGTACTATTGTTGCTGACGCATTTGTTTGTGCAGGTGTTTGTACATTCTCTGGTAATGTCACATTTGCATCGATCACATTCTCCGAGATTACTGTAGCTGGTGTTGGAACTTTCTCAAATAGACTTGATGTTCCTGGAAACTCCAACTTTGTTGGTGTAACAACTCTGAGAGATGTTGAATCTATCAAAGTTTCTGGTATTTCTACATTTAACGGAAATGTAAATATCGGTAATGCAACTTCTGATACTCTTACATTAACTTCTAGGATTGCTGGAAGACTTGATCCATCGGCTAATGCAACTTACGATATTGGTCGTGGTAACAGACAATGGAGAAATATTGTTGCATCTGGTGTTGTAACGGCTACATCTTTTGTTGGTGATGGTTCTAATCTGACCAATACTGGTGCAACCCTGAGTGCTGCTTCTGGATCACAGAGAGTTGTTCTTACTAGTTTGACTAGTGGCACAATGACATCTGCAGCTACTGAAGCTGCCCTTGCATACAATGCAAGTACTAACACTCTTACCGCGACTACATTTAGTGGTAACGCGACAACTGCTACAAGTGCAACTACTGCGACAACTGCCACTAATGCTACTAACATTACTGTTGCAGATGAGTCTGCTGATACCACTTGTTTCCCAGTATTCACCACAGCAGCAACAGGAAATCGACCACCTAAAACTGGATCTAATTTAACTTTTAATTCCAGTACTGGTAGATTATCTGCGACATCATTTGCTGGAAATGGAGCTTCACTTACTGGTGTTGTTGCAACCACTGCAATTGATGCAACTAATTCCACCAATTTAAATCTTCGTGCAAGAAATACAGAGAATGCAACTCATTATGTTACATTTGGCACATCAACCACTGGTAATCAGAGACTTAATACTGACACTGGATTAACTTATAATCCAAGTACTAACACTCTCACCGCAACTACATTTAGTGGTAATGCGACCACTGCCACTACTGCCACTACGGCTACCACGGCCACTACTGCAACTACTGCAACTACTGCGACAAATTGCACCAATTTTGATGTTGCAGCTGACAACACTACTGATGCTACTCATTATCCTATCTTTACTGGCGGAGCCACTGGAAATCAACGTCCCAATAGTGACACTGATTTAACTTATAATCCAAACAGTGGAGTTTTAAGTTCTGCAGAATTTTCCGCAACATCTGACGAAAGACTTAAGAAAAACATTGAAACTATCACTGATGCACTTGATAAAGTCACACATCTCCGTGGTGTTGAATATGACTTGAAGAGTAACGACAGACATCAAATTGGTGTTATCGCTCAAGAGGTTGAAAAAGTTATTCCTTCTGTTGTTTCTGAACGTGATGATAATGGTACAAAGACAGTCGCTTATGGTAACATGGTCGGTCTTTTAATTGAAGCTATTAAAGAACAACAGATTCAAATTCAAGAACAACAAACTCAGATACAAGAACTGAAGGCTAAGGTTGATGATCTATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f16312d78fa17f02d280c9d596d3b627cabf80e55e8ee80ba5cc6c4d7fe5fae1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7681
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50