Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A8D9C8A9 [UniProt]
- Protein name
- Putative photosystem II stability/assembly factor
- RBP type
-
TSP
- Protein sequence
-
MWVQNPNTGIWERQRDRLPKENYNDIRQDLEDLRFYSKCLDGTSYLPINNLDSIYDILPFQERESWYVTGPYAVGGSGDKEINSSTIDEEYFKYKEEYGLTLKNLFTPAKVINDQINNFLQVDVATTEEISDILVPKPGLVIDETRIKNGHRILVKDQKTFVTLLNTVDPDTYFDGNYYITDVDTTTTSYFYFNEENGIYLFTNNSLVKTDDLDDYDTNIRYSVHVKLGTENRQTQYHLSRLKTGYYPLTSDNEVIEFLLKKNWVLRNQVEYQNILDIDFYDSLKHSSQIVGSYSIAERSVFVGDFGSIFVHQDNYLNIINNKFKFDLRDITEVEEYYWTVGKEGSALRIDKVDFSLKSIDMGTLNDLTSIDFYNNLRGIIVGDLNEIHYTFNGGESWKKLEFPEFENFRYNKVAWTDLNTVFVVGDNGTLIELTYDGINWTSNKKNPIKIESEDDEFELVDNVRDIISFSYSSTTPWSLTYSAGTSSMITEGKEGLLFVGDNDLIFLYDRNNFLPDQDYIYFSLTQSVGDIKAVESTGQDFYIISDKHYSFDINSFTAIGLTSNIVDGSITLVNENEYNNIYNWDDTELQFVGDNLTLESYTFSNPTVINDKVSTDFKDKLKSKLLFLDYDMGSKLNFFGDDLTYRVPEEVVVPICITGSSYSIIELDSKSGEVSWISYHKDKLKQFKYNTALATANQVDYSSTFRGITSSNDFTIVASQSTNDFVEVEDLLNVVAPTSPTYSLFMYDNLMIVKTDPNYDVLEGDIISMSSSIVSGEFMANRVELLGGDQFVYMYARFDETITNDITSSTQSFDFKNLNTWNDVDEFVESWNEHPVGYSYEVTSGGTYSSGTYGVCSDITFTPKYDEKNAYYNLQGTITDNSFGGSYDMDYTELFLSFGYTANYNILDYLSNIDPTFTSGTTFYSMPAYAGLPVANLGVIVDDNKLSFHPDFKFQWDTFWEKTFIDITVDGTSTEVTEKAFILRKYYDEDLDRYLIDLHKEIEEPTTSTTIDITSRRTLGEISDDLNEINNIQTNLKDSTAGAFSNYQRELNFKFNTDSYAKILLSYAPIKEVLSAIVYTDYKNEIALNLIDLGEQRDVEISSIASIPTIDGLKAKVITSTDHGLSIGDAVFISTDDKQYDGLQIVRDIVSATQFVTNAAFILTGGSGTMTQFIFDPYLNYIPSDIIDLGIDGKGKIAVLIKPDNVQENADETISLVNLDLTKYKFNLIEGLYVGLVAEKYPWILEAEITNATIGEDEDGVVWYDGVWHCGRWFGGTWYSGIWIDGEWYNGVWNSNFVTVTQISGKVDRNILDDQFSKWFGGNFHGGIWNNGSWYGGRWINGTWENGDWFDGQWDQGTHNDGRFMAGTWIFGEWNNGQFNCDQGQSIWIDGTWNGGDFECGIWKDGKFTQFDPDIKSRFGTRSTNSRKSIWESGKFFSGEFHSILREDEEGNPLYSLNHKYTVWYTGKWNNGSWYGGTAYNILWDNGTWIDGVLMEISIDELSNTSEGGVFKVPGVYPFNRNDEFHVIDNIDPIGTYSAIGTNDSPTKYLVKDVDYEIIGGVETNTFITTYVTFSVTGAGDINSSIVSKYKGAEWVNGIWFNGIFDGDVFRGGMWLRGVHRKGEFL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1627 AA molecular weight: 185440,75020 Da isoelectric point: 4,34457 aromaticity: 0,14382 hydropathy: -0,37425
Domains
Domains [InterPro]
SSF110296
STR
367–450
STR
367–450
1
1627
Architecture
STR 367-450 | STR 957-1192 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
1627
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 712 | 712 | 0,8917 |
| Central domain | 713 | 1616 | 905 | 0,3494 |
| C-terminal | 1617 | 1627 | 10 | 0,1461 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
C-terminal too short, adjusted boundary
C-terminal too short, adjusted boundary
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-712
1-712
Central
713-1616
713-1616
C-terminal
1617-1627
1617-1627
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
uncultured marine phage [NCBI] |
707152 | No lineage information |
| Host | No host information | ||
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAG7579736.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OU342829
[NCBI]
CDS location
range 33007 -> 37890
strand +
strand +
CDS
ATGTGGGTACAGAATCCAAACACAGGTATCTGGGAAAGACAAAGAGATAGATTACCTAAAGAAAATTATAATGATATAAGACAAGATTTAGAAGACTTGAGATTTTACTCAAAGTGTCTAGATGGAACATCTTATTTACCTATCAATAACCTTGATAGTATTTATGATATTTTACCCTTCCAAGAAAGAGAATCATGGTATGTAACTGGACCTTATGCAGTTGGTGGTAGTGGTGATAAAGAAATTAATTCATCTACAATTGATGAAGAATACTTCAAATATAAAGAAGAGTATGGTCTTACATTAAAGAATCTATTCACTCCAGCTAAGGTAATTAATGATCAAATTAATAACTTCTTACAAGTAGATGTTGCTACAACAGAAGAGATTTCAGATATTTTAGTACCAAAACCTGGACTTGTAATTGACGAAACTAGAATTAAGAATGGTCATAGAATACTTGTTAAGGATCAGAAAACATTTGTCACTCTACTTAACACAGTTGACCCAGATACTTATTTCGATGGTAATTATTACATTACAGATGTGGACACAACTACAACTTCCTATTTCTATTTCAATGAAGAAAATGGTATCTATTTATTTACAAATAATTCTTTAGTGAAGACTGATGATCTGGATGATTATGACACTAATATTAGATATTCTGTTCATGTTAAATTAGGAACTGAAAATAGACAAACACAATATCATTTATCTAGATTAAAGACTGGATATTACCCACTCACTTCTGATAATGAGGTAATCGAATTCTTATTAAAGAAAAATTGGGTACTTAGAAATCAAGTTGAATATCAAAATATTCTAGATATTGATTTTTATGATAGTTTGAAACATTCATCACAAATTGTTGGATCTTACAGTATTGCTGAAAGATCTGTATTTGTTGGTGACTTCGGATCTATATTTGTTCATCAAGATAATTACTTAAATATTATTAATAATAAATTTAAATTCGACCTTAGAGATATTACTGAGGTTGAAGAGTATTATTGGACAGTTGGGAAAGAAGGATCTGCTCTTAGAATTGATAAAGTGGATTTCTCTCTCAAGTCGATTGACATGGGAACACTTAACGATTTAACTTCTATTGATTTCTACAATAACCTGAGAGGTATTATAGTAGGAGATCTAAATGAGATTCACTATACATTTAATGGTGGTGAGTCATGGAAGAAACTTGAATTCCCAGAATTTGAGAACTTTAGATATAATAAAGTTGCTTGGACTGATCTGAATACAGTATTCGTTGTTGGGGATAATGGTACTTTAATTGAACTTACTTATGATGGTATTAATTGGACATCAAATAAGAAAAATCCTATTAAGATTGAATCTGAGGATGATGAGTTTGAATTAGTGGATAATGTTAGAGATATCATTAGTTTTTCTTATTCATCAACTACACCGTGGAGTTTAACTTACTCAGCGGGTACTTCTTCTATGATTACAGAAGGGAAAGAAGGACTTTTATTTGTAGGAGATAATGATTTGATTTTCCTATATGATAGAAATAATTTCCTTCCTGATCAAGACTATATTTATTTCTCCCTAACTCAAAGTGTTGGAGATATTAAAGCAGTCGAATCAACGGGGCAAGATTTCTATATTATTTCAGATAAACATTATTCATTTGATATTAATTCATTCACTGCTATTGGACTAACATCTAATATCGTTGATGGAAGTATTACACTTGTTAATGAAAATGAATACAATAACATATATAATTGGGATGATACTGAACTACAATTTGTAGGAGATAACTTAACGTTAGAGAGTTACACATTCTCTAATCCGACAGTTATAAATGATAAAGTATCAACTGACTTTAAAGATAAACTAAAGTCTAAATTATTATTCTTAGATTATGATATGGGATCTAAACTTAATTTCTTTGGGGATGATCTAACATATAGAGTTCCAGAAGAAGTTGTAGTCCCAATTTGCATCACAGGATCTAGTTATTCAATTATTGAATTGGATAGTAAATCTGGTGAAGTATCTTGGATTAGTTATCATAAGGATAAACTAAAACAGTTTAAATATAATACTGCACTTGCTACGGCTAACCAAGTTGATTATTCTTCTACATTTAGAGGGATAACTTCAAGTAATGATTTCACAATTGTAGCATCTCAATCTACGAATGATTTTGTTGAGGTAGAAGATCTACTAAATGTGGTAGCTCCTACATCACCTACATACTCATTATTCATGTACGATAACTTAATGATCGTTAAAACCGATCCTAATTATGATGTACTTGAGGGAGATATAATCTCAATGAGTTCATCTATTGTTAGTGGGGAATTCATGGCCAATAGAGTAGAACTATTGGGTGGAGATCAGTTCGTATATATGTATGCTAGATTTGATGAAACAATAACAAATGATATCACCTCATCTACTCAATCATTCGACTTTAAGAACTTAAATACTTGGAATGATGTTGATGAATTTGTAGAATCATGGAATGAACATCCTGTTGGATATTCATACGAAGTTACATCTGGTGGGACTTATTCATCTGGTACTTATGGAGTATGTTCAGATATAACATTTACTCCTAAATATGATGAAAAGAATGCTTACTATAACTTACAAGGAACTATAACAGATAATAGTTTTGGTGGATCTTACGACATGGACTACACAGAATTATTCCTTAGTTTCGGCTATACCGCTAATTATAATATTTTAGATTACTTATCTAATATAGATCCAACATTTACAAGTGGTACGACATTCTATTCAATGCCTGCTTATGCTGGACTTCCAGTCGCTAACTTAGGTGTTATAGTTGATGATAATAAGTTATCTTTCCACCCAGATTTTAAATTCCAATGGGATACATTCTGGGAAAAGACATTTATCGATATAACAGTAGATGGGACTTCTACGGAAGTAACAGAAAAGGCATTTATTTTAAGAAAATATTATGATGAAGATCTTGATAGGTATTTGATCGATTTACATAAAGAGATTGAAGAACCTACAACTTCAACTACAATTGATATTACCTCAAGAAGAACTCTTGGAGAAATATCAGATGATTTAAATGAGATTAACAATATACAAACAAATCTAAAAGATTCAACTGCTGGAGCTTTCAGTAATTATCAAAGAGAATTAAACTTCAAGTTTAATACAGACTCTTACGCTAAGATCTTATTATCTTACGCCCCAATTAAAGAAGTATTATCAGCAATTGTTTATACTGACTATAAGAATGAGATAGCTCTAAACTTAATCGATTTAGGTGAACAAAGGGATGTTGAGATCTCAAGTATTGCTAGTATTCCGACAATTGACGGACTTAAAGCAAAAGTTATTACATCAACAGATCATGGATTATCCATCGGTGATGCAGTATTCATCTCAACGGATGATAAACAATATGATGGATTACAAATTGTAAGAGATATTGTCTCAGCTACTCAATTCGTAACAAACGCCGCCTTTATATTAACAGGTGGATCTGGTACTATGACTCAGTTTATTTTTGATCCTTATTTAAATTATATCCCTAGTGATATAATTGACTTAGGAATTGATGGTAAAGGTAAAATAGCAGTACTTATTAAACCTGATAATGTACAAGAAAATGCTGATGAAACTATATCACTTGTTAATTTAGATCTTACTAAATATAAATTTAATCTTATCGAAGGTCTTTATGTTGGTCTTGTAGCTGAAAAGTATCCTTGGATCTTAGAAGCTGAGATAACAAATGCTACCATTGGTGAAGATGAAGATGGAGTTGTTTGGTATGATGGTGTATGGCATTGTGGTAGATGGTTCGGGGGAACTTGGTATAGTGGTATATGGATAGATGGTGAGTGGTATAATGGAGTTTGGAATTCCAATTTTGTAACAGTTACTCAGATATCAGGTAAAGTAGATAGAAATATTTTAGACGATCAATTCTCTAAATGGTTTGGTGGTAATTTCCACGGTGGTATATGGAACAATGGTTCTTGGTATGGTGGTCGTTGGATTAACGGAACATGGGAGAATGGTGACTGGTTCGATGGACAATGGGATCAAGGAACTCATAATGATGGTAGATTTATGGCTGGTACTTGGATCTTCGGTGAATGGAATAACGGTCAATTTAATTGTGATCAAGGACAATCTATTTGGATAGATGGTACTTGGAATGGTGGTGACTTTGAGTGTGGAATATGGAAAGATGGTAAATTCACACAGTTCGACCCTGATATCAAATCAAGATTTGGTACAAGATCTACTAACTCAAGAAAATCTATATGGGAATCTGGTAAGTTTTTCTCTGGTGAATTCCACTCTATACTTCGTGAAGATGAAGAGGGTAATCCACTTTATTCTCTTAACCATAAATATACTGTTTGGTATACTGGTAAATGGAACAATGGTTCTTGGTACGGTGGTACTGCATACAATATCCTTTGGGATAATGGTACATGGATAGATGGTGTCTTAATGGAAATAAGTATTGATGAACTATCTAACACATCTGAGGGTGGTGTATTTAAAGTACCTGGAGTATATCCATTCAATAGAAATGATGAATTCCACGTAATTGATAATATAGACCCAATTGGTACATACTCAGCTATCGGAACAAATGATTCTCCGACTAAATATCTTGTTAAGGATGTTGATTATGAGATTATTGGGGGAGTTGAAACTAATACATTTATTACAACTTATGTTACATTCTCTGTAACAGGGGCTGGTGATATCAATTCAAGTATTGTGTCTAAATATAAAGGTGCTGAATGGGTGAACGGAATTTGGTTCAATGGTATCTTTGATGGGGATGTATTTAGAGGTGGAATGTGGTTAAGAGGTGTCCACAGAAAAGGTGAATTCTTATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
71740d0c6916e9ce6e71da99d2b60b58aae044b483c55469fad09b237ddbfaa6
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50