Protein

Genbank accession
AIX16787.1 [GenBank]
Protein name
baseplate wedge initiator
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MAYLLSNGGVIINDSREIVNAGVVTATAFFGDGSGLSGIATISDGGISIGDANITGNLNVSGISTVEFLNASDINVGGALTVTGDLSVGGDLSFDEVSGRNLNITGISTLGTVKISNGIVTATSGVVTYYGDGSNLTGIDITDSDVRLRNLSVTGVSTFTGDVSFGANASLVGDLTSGRNANLSGIATVNDIYIDNLLYDSNNNVGAAGSILVTAGGKLQWLPPDQAGIATVFQPGNTFFVSKNGDDSSDGLSMEKSFATISYALSQISSGTNNVLLITAGDYEEVFPLSVPDGLTVKGVGQRAVLVRPTSATETNDGFQLGNASTVEDLTIGQMFKPQGASNNNYAFTYRSGATISSRGPYVSRVTVLNKGSVTSTSDPFGYGSADAYPTTAPGGAGVLADGSVLNSASLEASFLLNEVTTFTAGNIGIDMVNGARVEWLNGFSYFASEGVKGRADQSTGLYGAGKTRLRVENASGGLVNGNTIELYDIDGTTSLASGTIDGTSGAYTTLTTGGTGTFAIAGSRKAKAASFVDTASLSTTQAKFGNASLDVTGQSTDCINVDPSSDFGFGTGDFTAEFWLYRTSATAGATILDMRDAADTDSALSIRENTSDVIEVLVGNSVVLTSSTSAIGNAAWYHIAVARLGSTMELFINGAQEASASNSSDLGLSQSLTFGADYANANGTIAFLDELRIEKGAAKYTNPFTPSTVPLEGDRGTAILLHFDGSNGATEAPDDIQIFQDIRISGGNTADRLSLADYSQFGAELRSSGCAVEYGNKGVVGDGAGVALRLIGINFSFVGALGDLTNDPNLAVQANEVTETNNAEVSFTSIDQGGDFRVGESFYVNQETGDVSFNNTTTDLTSLSSLTITDGTNNSLITPTSGRFGNVQISGQQVASVSGDLDLVTAGGGEVNIYGNTNVVGILTAQVVEINAIQKGDTSIALDDTGTDGTIRFNTDGSEAGRFTKDNDLAVTHNFRVGGIGTIPNLVSTTATITTLNVENLVSSGSTSGGGGTGIGSTAINSPNLNISGQANFNNVNVSGVATVPDLTVTNSFTNTGYSTITGDAEVGGNLWLKGDLNVIGSQNVSEFFATNMEISGIATFGTVKVNSNVHCDDTVFVGGAVTITGPITAVDIFATGIGTIPVADVGHADVDSINVTGISTISQVDIGKITVGDFTVTGFATVTDGLEVIGPVSFGGSITQLPLPTGQGGVWFDNSVVGVGTLLATNASISGLLGVGNSLGVAGDAYIDGNIIGSGGTISNYNEIITPLLTATDIDAATLDVSGNVTIDGNVDLGDTSADFVRINGRVSTSFIPSTDSATDLGSNGLRWKELFVDKLTLTDDAAIGGDLSVGGSVSADYVDTTELNVSGVATFAQISIGGGGGGISTNGVIINNVTVTDQSTLNNLIVSGVSTFVGVSTFKGDVYIDGNLIIDGDNSQDLISGTNLLVSGIATIGTLGVTTNLTVGGDVLVSGAMTAGSYNGDGSQLDNLPAASITTSITPTTRVNGDTLQTGDLWYDSSELRQYTYYDDGGSVQWVPSAPEPTIPDFTYAGNTGIGTLSLGDDTFSVVGDGTNVVTTASGVTTTVTISLSDSVAIAGSMTAGSFLGENLNVSGVSTFVGVTTFRGDVFIEGNLIIDGDESQDLVSGTNLIITGIATIGTLGVTTTTTNTLTVLDTFTLDNPVNSIGISSDLGGAGAAHTALASQLAIKQYIDANNSDQNLNFTGDTGSGSIGLGTEFLEVRGTAQQVTTIGVGNSVVIGLPNTVRVPQRLYVGGGAFTQVMDANSASGVVFANKIVTINKGLTLSSSDLTGVRNLVQTGIATLGTVNFSGVTTTVGNAFVGNDLSVLGTVNANDFNSTSDATRKEDVVEIEDALAKVLDLRGVTFNWKNGEGSSAGVLAQEVQMVLPEIVKGDVGNMSVQYNGIIALLVQAVKELSSEVEELKRTKSDKRRKKS
Physico‐chemical
properties
protein length:1956 AA
molecular weight: 199334,99600 Da
isoelectric point:4,05605
aromaticity:0,06288
hydropathy:0,10716

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.60.120.200
504–703
G3DSA:2.60.120.200 IPR030392
IPR013320
539–696
IPR013320 IPR030392 Coil
PF13385
568–697
PF13385
AIX16787.1
1 1956
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014f
[NCBI] 		1493511 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX16787.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019037 [NCBI]
CDS location
range 207920 -> 213790
strand +
CDS
ATGGCATATTTACTTTCTAATGGGGGCGTTATTATTAACGACTCCAGAGAAATCGTAAATGCTGGGGTTGTAACTGCTACTGCGTTCTTTGGGGACGGTTCTGGTTTATCTGGAATCGCAACCATTTCTGATGGGGGAATCTCCATCGGCGACGCAAACATCACTGGAAACTTAAATGTTTCTGGTATTTCTACCGTAGAATTCTTAAACGCTTCTGACATTAATGTCGGCGGTGCTTTAACAGTCACAGGTGATCTATCTGTCGGTGGTGATTTATCTTTTGATGAGGTTTCTGGTAGAAACCTAAACATCACTGGTATTTCCACACTCGGAACAGTTAAGATTTCAAATGGCATTGTAACCGCCACTAGTGGCGTTGTTACATATTACGGTGATGGTAGCAATCTAACCGGCATTGACATCACAGATAGTGATGTAAGACTCAGAAACCTTTCGGTTACTGGTGTCTCTACATTCACAGGTGATGTATCTTTTGGAGCAAACGCTTCTCTAGTAGGCGACCTAACTTCTGGTCGTAACGCAAACCTTTCAGGTATTGCGACAGTAAATGATATCTATATTGATAACTTACTTTATGATTCCAACAATAATGTTGGAGCAGCTGGTTCAATTCTTGTAACCGCAGGTGGAAAGTTACAGTGGCTACCGCCCGATCAAGCGGGTATTGCTACAGTATTCCAACCAGGAAATACATTCTTTGTTTCTAAGAATGGTGATGATAGTAGTGATGGTCTCTCCATGGAGAAATCATTTGCTACCATTTCCTACGCTCTGTCTCAGATTTCATCAGGGACAAACAACGTTCTCTTAATCACCGCTGGTGATTATGAAGAAGTATTCCCACTATCAGTTCCCGATGGACTGACTGTTAAGGGTGTTGGACAACGTGCGGTTCTAGTTAGACCCACTTCAGCTACAGAAACCAACGATGGTTTCCAACTTGGTAACGCATCCACAGTTGAAGATTTGACCATTGGTCAGATGTTTAAACCTCAAGGTGCTTCCAATAATAACTACGCTTTCACATATAGAAGTGGTGCTACCATTTCATCTCGTGGACCTTATGTTTCTAGAGTTACGGTTCTAAACAAAGGTAGCGTAACTTCTACCTCTGACCCATTTGGATATGGTTCAGCTGATGCTTATCCAACGACTGCCCCTGGTGGTGCTGGTGTATTGGCTGATGGTAGTGTTCTTAACTCCGCCTCACTAGAAGCCTCATTCCTACTTAACGAAGTCACCACCTTCACTGCCGGTAACATCGGTATTGATATGGTCAACGGTGCTCGTGTTGAGTGGTTGAATGGTTTCTCCTACTTCGCATCCGAGGGTGTTAAAGGTAGAGCTGACCAGTCAACTGGTTTGTATGGTGCAGGTAAGACGAGACTAAGAGTTGAGAACGCCTCTGGTGGTCTAGTCAATGGTAATACCATTGAACTCTATGATATTGATGGCACGACTAGCCTTGCTAGTGGTACTATTGACGGCACCAGTGGTGCATACACGACCCTGACTACTGGTGGTACTGGTACCTTCGCTATTGCAGGAAGTCGTAAGGCGAAAGCTGCCTCATTCGTTGATACAGCCTCTCTATCTACAACACAAGCCAAATTCGGGAATGCTTCACTAGATGTAACTGGTCAGTCTACTGATTGTATCAATGTTGATCCAAGCAGTGACTTCGGTTTCGGTACTGGTGACTTTACAGCTGAATTCTGGTTGTATAGAACATCAGCTACTGCTGGTGCTACTATTCTCGATATGAGAGATGCAGCTGATACTGATTCAGCTCTATCTATTAGAGAGAACACTAGTGATGTTATTGAAGTTCTTGTCGGCAACTCTGTTGTTCTAACTTCATCCACAAGTGCTATTGGTAATGCCGCTTGGTATCACATTGCTGTTGCCCGTTTGGGTAGCACAATGGAACTATTCATTAATGGTGCCCAGGAAGCTTCAGCATCCAATTCATCTGACTTAGGTCTAAGCCAGTCACTCACCTTTGGTGCTGACTATGCTAACGCCAATGGTACTATTGCGTTCTTAGATGAACTCCGTATCGAGAAGGGTGCTGCTAAGTACACGAATCCGTTTACTCCTTCCACTGTACCCCTTGAGGGTGACCGTGGTACAGCTATCCTACTCCACTTTGATGGATCAAATGGAGCAACTGAAGCTCCTGATGATATTCAGATATTCCAGGATATCCGTATCAGTGGTGGTAACACAGCTGATAGACTATCACTTGCTGACTACAGTCAGTTTGGTGCTGAGTTGCGTTCCTCTGGTTGTGCTGTTGAGTATGGTAACAAAGGTGTCGTCGGAGACGGTGCTGGTGTTGCTCTAAGACTCATCGGTATTAACTTCAGTTTCGTAGGTGCCCTAGGTGATCTAACTAACGATCCAAACCTAGCCGTTCAGGCTAATGAAGTTACAGAAACCAACAATGCTGAGGTATCTTTCACCAGTATTGATCAAGGTGGTGACTTCCGTGTTGGTGAATCCTTCTATGTTAACCAGGAAACTGGTGATGTATCATTCAACAACACAACAACTGATCTAACCTCACTATCTAGTCTAACCATCACTGATGGTACTAACAACTCACTTATCACTCCTACCTCTGGTAGATTTGGTAATGTTCAGATCTCTGGACAGCAAGTTGCTTCTGTATCTGGTGACCTAGACCTAGTAACCGCTGGTGGTGGTGAAGTTAACATCTACGGTAATACTAACGTTGTTGGTATTCTAACCGCACAGGTTGTTGAGATCAACGCTATCCAGAAGGGTGATACTTCTATCGCTCTAGATGATACCGGTACTGATGGTACTATCCGGTTTAACACCGATGGTTCTGAGGCAGGTAGATTCACTAAGGATAACGACCTTGCAGTAACACACAACTTCCGCGTTGGTGGAATTGGTACTATTCCAAACTTGGTAAGTACTACTGCAACCATCACAACTCTAAATGTTGAGAACCTTGTCAGTAGTGGTAGCACTAGTGGCGGTGGCGGAACTGGTATCGGTTCTACCGCTATCAATTCACCTAACCTTAATATTTCTGGTCAGGCAAACTTCAACAACGTCAACGTTTCTGGTGTTGCCACGGTTCCTGATCTAACTGTAACCAACTCCTTTACTAATACTGGTTATTCAACCATCACTGGTGACGCCGAAGTTGGTGGAAATCTATGGTTGAAGGGTGACCTCAATGTTATCGGTTCCCAGAATGTTAGCGAGTTCTTCGCTACCAATATGGAGATCTCTGGTATCGCTACCTTCGGTACCGTAAAGGTCAACAGTAATGTCCATTGTGACGATACTGTATTTGTTGGCGGTGCTGTAACAATCACTGGTCCAATCACAGCAGTGGATATCTTTGCCACTGGTATTGGAACCATTCCTGTAGCAGATGTTGGACATGCCGATGTTGATTCTATCAATGTCACTGGTATCTCTACTATCTCTCAGGTTGATATCGGTAAGATTACCGTAGGTGACTTCACTGTAACTGGATTTGCAACTGTCACTGACGGACTTGAAGTTATCGGTCCTGTCTCATTTGGTGGTTCTATCACACAACTACCTCTACCAACTGGTCAAGGTGGTGTTTGGTTTGACAACTCTGTTGTGGGTGTCGGCACACTACTCGCCACTAATGCATCAATTAGCGGACTCCTCGGAGTTGGTAATTCATTGGGTGTTGCTGGTGATGCCTACATCGATGGAAACATCATTGGTTCTGGTGGTACTATCTCTAATTACAACGAGATTATTACACCTCTCCTAACCGCAACTGATATCGATGCAGCTACACTCGATGTTAGTGGTAACGTAACCATTGATGGAAACGTAGACCTTGGTGACACATCTGCCGACTTCGTTAGAATCAACGGTAGAGTAAGTACTTCCTTTATTCCTTCTACTGATAGTGCAACTGACTTAGGTAGCAATGGTCTCAGGTGGAAAGAACTCTTCGTTGATAAACTCACCCTCACAGATGATGCTGCTATTGGTGGTGATCTATCTGTTGGTGGTAGTGTATCTGCCGATTATGTAGATACTACTGAACTCAATGTCAGTGGTGTTGCAACCTTCGCTCAGATTTCAATTGGTGGTGGCGGCGGTGGTATTAGTACCAACGGCGTTATTATTAACAATGTTACTGTTACTGACCAGAGTACTCTTAACAACCTCATTGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGTGTTTCTACCTTCAAGGGTGATGTCTATATCGATGGTAACCTAATCATTGATGGTGATAACAGTCAGGATCTAATCAGTGGTACTAACCTACTCGTCAGTGGTATTGCTACCATCGGCACACTAGGTGTAACTACAAACTTAACTGTTGGTGGTGATGTACTTGTCAGTGGTGCTATGACCGCTGGTTCATACAATGGTGATGGTTCTCAGTTAGATAATCTACCTGCAGCATCAATCACAACCTCCATAACACCTACAACTAGGGTGAATGGTGATACACTACAGACTGGTGATCTATGGTATGACTCTTCTGAGTTACGCCAGTATACTTACTATGATGATGGTGGATCCGTTCAGTGGGTACCTTCAGCCCCAGAACCTACTATTCCTGATTTTACCTACGCAGGTAACACAGGTATTGGTACTCTATCCTTAGGGGATGATACTTTCTCTGTTGTTGGTGATGGTACAAACGTAGTCACTACTGCAAGTGGTGTAACTACTACCGTAACCATTTCACTATCCGATAGTGTGGCAATCGCCGGTTCTATGACCGCTGGTAGCTTCCTTGGTGAGAACCTCAATGTTTCTGGTGTATCAACCTTCGTTGGCGTTACAACCTTCAGAGGTGATGTCTTCATCGAAGGTAACCTAATCATTGATGGTGATGAGAGTCAGGATCTAGTCAGTGGTACTAACCTAATTATTACTGGTATTGCTACCATTGGTACATTAGGAGTAACTACTACTACTACCAATACTCTCACCGTACTCGATACCTTCACTCTAGATAACCCAGTCAATTCTATCGGAATTAGTTCTGATCTAGGTGGTGCCGGTGCTGCTCACACAGCTCTTGCTTCCCAGTTAGCAATCAAACAATACATTGATGCTAATAACTCAGATCAAAACCTAAACTTCACTGGTGATACTGGTTCTGGCTCGATTGGTCTTGGTACTGAATTCCTAGAGGTTCGTGGTACAGCACAACAGGTTACAACCATTGGTGTTGGTAACAGTGTTGTTATTGGACTACCTAACACAGTAAGAGTACCACAGAGACTATATGTTGGTGGTGGTGCCTTTACTCAGGTTATGGATGCCAACTCCGCTTCTGGTGTGGTATTTGCCAATAAGATTGTTACGATCAACAAAGGTCTAACCCTCAGTAGTAGTGACCTAACCGGAGTTCGTAACCTAGTTCAGACTGGTATTGCAACTCTCGGTACAGTTAACTTCTCTGGTGTAACAACCACTGTAGGTAACGCATTCGTTGGTAATGACTTAAGTGTCTTAGGCACAGTCAACGCTAATGACTTTAACTCTACTTCTGACGCTACTAGAAAAGAAGACGTAGTTGAGATTGAAGATGCACTCGCTAAGGTCCTAGACCTACGTGGTGTAACATTCAACTGGAAGAATGGTGAAGGATCATCTGCTGGTGTTCTTGCACAAGAAGTTCAGATGGTTCTACCTGAGATTGTTAAGGGTGATGTAGGCAATATGTCCGTTCAGTATAACGGTATTATAGCACTTCTCGTCCAAGCAGTCAAGGAACTCTCTTCTGAAGTTGAAGAACTTAAGAGAACCAAGAGTGACAAGAGAAGGAAGAAATCCTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
b3bb9beaa3f66af1d7b7af603f141275e7d9f9b91cc9e8a0dc9184b032791449
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6427
Evidence 0,6427
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank