Protein

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Genbank accession
ARM71074.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MTGYIPIKDTIEVYEGDDITIPFKAGMGNITGYTVTLQARISMASRYSILDVQGVITNGTAGEYNVVFPSASTLGKGHSKPYFYDIKLTAPNGKIYTDRQGELFIEPRTTEIDPSKVPLQYGDMNKSVYDTDDNGIVDSAEKVAGADSANAGEYYGKNSNGVLGWHTPVGAGGGNIDVSTLTDNALIKWDASAQKFVNSGVKSNDDGSLSLEPSSLDLGSHTLSSSAENLMVTNKVSKQIYAPLWQEVGYNKDTGYIRKYGTAKTNPIQTVNDQDLTNPSFTIPVVDNITNFGCDIELAQDATNIEIHVTDVVTDEDIWSIALGDLTAGKHHIDFYNPADFRAGNTYRVKIHSTDGSDVVLKGGTGFGNQLIPAFTTYFTDWSDLTVTTTKDIERLDSNDDGAVDLADKLTGADQAGNSKYYGTDNTGSVGFHNLPLSNSNDLDISNLNQGDIPYWDSTDNALKASGIRKIAEQTIAEPSGFYLGDVNISSDGHGILISPLDDPKTYKVLTQAISANKDEAFIRAYGNPQEKVIHSDYSSQVENPTVSFSSDKDATIVSMDIRSSEVIKELLINFRNADNENIWAETFFNLEAGSNTLTLATPPDVLSGEVVTLTFSGKDHADNPIKMDGTGSTPYLKLNLMQWVEKKIATEEYVNSGVNSIETIVEDTDRRVDNLDTTMSALSQRVGELQSFFVFRGKTLPVFPNIAQSGYFSVLHDLTKNEVLSLPNQGRHYDGALFFLKNEDKTHTVTLIAPTGLTINGGTSINLPPQNTLWLVHNNTDWVVLMSGFVPTSYDSFIADIKSHVANASLGITVDDGVNNFGDIDLLKLKGITATRPDGDSIDSVTLTAATTWGTLGDASSNAKGSIVLAEPPLQSYADPDDADAVRLRLQEGTFEAIHAPGYLAYLNTDIVIIGKTHTATSHADGAIYPTDIVVDNGTYIVKDMKAKAIGLQEADQGDPNVTGGTDYLVAFRIALEGEAPADGFVQIYLAEKAEFGQPVKYLEDSNGHPLVVRRYYHLGDKLGSLETVGVVNAKGLKEFTMHVVDSFDKDDITIMPRDRGVSGVMVQALLPTSKSGLASLQYEVDTEQNIEFTRYYMGNEMTNIDWLSSYVMPLSEGTGGEGADFPDGLHLNNISNLMVGFVDGRMVLKDNGSNMVDFVFGKIEDAVPTYAMREKVLSVKLALTNKDAAFRVALLQWTGKPDEYTQELFTTRSGGAPAFQSGWSLVDSLFIPKDVANEDHEVTHEFTVPKTAVNYAVVIYPESVQQPTELKLKTFNVGAKDPFYFYHIHQSRKLNELHLEYDNEFYESVQDATGLYSLRYTLGDAADGNPVPCGTHRKGKADITLDPMVNQIPGSSASGGEGALKFGKDGQATVNTLLNIASEQAQASNHPTEFWWVTVASDGTMSEIPDSRTSFPISGSSSGMYSMTPFTFAVKAGDRIALRAKSDMPDGAYLISVADKVPLVDVSINFKELTEPTEDDPFANIDLHQFDHIYTNSLTVTKDVGNVSSVTFPITIEDTDHLVVLGAVKQLPNNSIRPVKALDWDYNNEDHTLKVSFGETVLIGRVTLGIYRD
Physico‐chemical
properties
protein length:1575 AA
molecular weight: 171384,68010 Da
isoelectric point:4,60341
aromaticity:0,08698
hydropathy:-0,27816

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Vibrio phage pVco-5
[NCBI] 		1965485 Uroviricota > Caudoviricetes > Schitoviridae > Vicoquintavirus Pvco5 >
Host Vibrio coralliilyticus
[NCBI] 		190893 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Vibrionales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ARM71074.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KY612839.1 [NCBI]
CDS location
range 27602 -> 32329
strand -
CDS
ATGACTGGATATATACCTATCAAGGATACTATTGAGGTATACGAAGGTGATGATATAACTATACCTTTTAAGGCAGGTATGGGTAACATTACCGGATATACTGTCACACTTCAGGCAAGGATTAGTATGGCATCTCGGTATTCCATATTGGATGTGCAGGGAGTAATTACTAATGGAACTGCCGGAGAATACAATGTGGTATTTCCTAGTGCATCTACACTGGGTAAGGGCCATTCCAAACCTTATTTTTACGATATTAAACTGACTGCCCCTAATGGTAAAATTTATACTGATAGACAAGGTGAGTTATTTATCGAACCAAGAACAACTGAAATAGACCCTTCTAAGGTTCCTCTCCAATATGGAGATATGAATAAATCAGTCTATGATACTGATGATAATGGTATTGTAGATTCTGCTGAAAAAGTTGCAGGTGCGGATTCAGCTAATGCTGGTGAGTACTATGGTAAAAACTCTAACGGAGTATTAGGTTGGCATACACCTGTTGGTGCAGGTGGGGGTAATATTGATGTATCTACACTAACCGACAATGCATTAATCAAATGGGACGCTTCAGCGCAAAAGTTTGTTAATTCCGGTGTTAAGTCTAACGATGATGGTTCATTAAGTTTAGAACCTAGTTCACTTGATTTAGGTTCACATACCTTATCTAGTAGTGCTGAAAATCTTATGGTAACTAATAAAGTTAGCAAACAGATATATGCACCCTTATGGCAAGAAGTAGGATATAACAAAGATACAGGTTATATACGTAAGTACGGGACAGCTAAGACTAACCCTATTCAAACAGTTAATGACCAAGATTTAACTAATCCTTCCTTTACTATACCTGTTGTAGATAATATCACTAACTTTGGTTGTGATATTGAATTAGCACAAGATGCTACAAATATTGAAATACATGTTACTGATGTAGTAACCGATGAAGATATTTGGTCTATTGCTTTAGGTGATTTAACTGCTGGTAAACATCATATAGATTTTTATAACCCTGCTGACTTTAGGGCGGGTAATACGTATAGGGTTAAGATACATAGTACTGATGGTTCAGATGTAGTACTTAAAGGTGGGACTGGTTTTGGTAATCAGCTTATCCCTGCTTTTACTACATACTTCACTGACTGGTCAGACCTTACAGTAACTACTACTAAAGATATCGAAAGACTTGATTCTAATGATGATGGTGCAGTAGATTTAGCGGATAAATTAACAGGTGCAGACCAAGCTGGCAATTCCAAATACTATGGTACAGATAATACTGGTTCTGTTGGTTTTCATAATCTTCCTTTAAGTAACTCTAATGATTTAGATATATCAAACCTAAACCAAGGTGATATACCTTATTGGGATAGTACTGACAATGCTTTAAAAGCATCTGGTATACGTAAGATTGCTGAGCAAACTATTGCGGAGCCTTCAGGTTTTTATTTAGGGGATGTAAATATTTCTTCTGATGGTCACGGAATATTAATAAGTCCTCTAGATGACCCTAAAACGTATAAGGTACTTACGCAGGCCATTTCAGCCAATAAAGATGAGGCATTTATTAGAGCTTATGGTAATCCTCAAGAGAAAGTAATTCATTCTGATTATAGTTCTCAAGTTGAGAACCCTACGGTTTCCTTTAGTTCTGATAAAGATGCTACGATTGTATCAATGGACATCCGTTCCTCTGAGGTTATCAAAGAACTACTTATCAATTTCCGAAATGCTGATAATGAGAACATCTGGGCTGAGACCTTCTTCAACCTCGAAGCTGGTAGTAATACCCTCACTCTCGCTACACCTCCTGATGTACTTTCTGGTGAGGTAGTCACGTTGACTTTCTCTGGTAAGGACCATGCTGATAACCCTATTAAAATGGATGGTACTGGTTCAACCCCTTACCTAAAATTAAACCTTATGCAGTGGGTTGAGAAAAAGATTGCTACCGAAGAATATGTCAATTCTGGTGTTAACTCCATTGAAACCATTGTAGAGGATACTGACCGCAGGGTAGATAACTTAGATACTACTATGTCAGCACTATCACAAAGAGTAGGTGAGCTTCAGAGTTTCTTCGTGTTCCGTGGGAAGACTTTACCAGTATTCCCTAATATAGCACAGTCAGGTTACTTCAGTGTCCTTCACGACCTAACCAAAAATGAAGTTCTTTCATTACCTAACCAAGGTAGACATTATGATGGAGCTCTCTTCTTCCTAAAGAATGAAGATAAGACTCATACAGTCACCTTAATAGCCCCAACGGGACTTACAATTAATGGTGGGACATCTATCAATCTACCTCCCCAGAATACCTTATGGCTTGTCCATAATAATACTGATTGGGTGGTATTGATGTCAGGTTTTGTTCCTACATCTTATGATTCTTTTATTGCTGATATTAAGTCCCATGTCGCGAATGCTTCATTAGGAATTACAGTGGATGATGGAGTAAATAACTTTGGTGATATTGACTTACTTAAATTGAAAGGTATAACTGCTACCCGTCCTGATGGTGACTCTATTGATTCCGTAACATTAACCGCTGCAACCACTTGGGGAACCTTGGGTGATGCGTCAAGTAATGCAAAAGGTTCAATTGTATTAGCAGAACCTCCATTACAATCCTATGCTGACCCTGATGATGCTGATGCGGTTCGATTAAGATTACAGGAAGGTACGTTTGAGGCTATCCATGCTCCGGGATACTTAGCTTACCTTAATACTGATATAGTTATTATAGGTAAAACTCACACAGCTACATCACACGCTGATGGAGCTATTTACCCTACCGATATTGTTGTTGATAATGGTACATATATTGTCAAGGATATGAAAGCTAAGGCCATTGGTTTGCAAGAGGCTGACCAAGGTGACCCTAATGTTACTGGTGGTACTGACTACTTAGTAGCCTTCAGGATTGCATTGGAAGGTGAAGCACCTGCTGATGGTTTTGTTCAAATCTATTTGGCTGAGAAAGCTGAGTTTGGACAACCAGTGAAGTACCTAGAGGATTCCAATGGTCACCCATTAGTGGTACGTCGATACTACCATTTAGGTGACAAACTAGGCTCATTAGAAACTGTTGGTGTTGTTAATGCTAAGGGCTTGAAAGAGTTCACAATGCACGTTGTTGATTCCTTTGATAAGGATGATATTACCATCATGCCAAGAGATAGAGGTGTTTCAGGTGTTATGGTACAAGCCCTTCTACCTACCTCTAAATCTGGTCTAGCCTCCCTACAGTATGAAGTGGATACCGAGCAGAACATTGAGTTCACTCGTTATTACATGGGCAATGAGATGACCAACATTGATTGGCTATCTTCTTATGTAATGCCTCTTTCGGAAGGTACAGGTGGTGAAGGGGCTGACTTCCCTGATGGTCTTCATTTGAATAACATCTCGAACCTCATGGTAGGCTTCGTCGATGGTCGAATGGTGCTCAAAGATAACGGTTCCAACATGGTTGACTTTGTCTTCGGTAAGATTGAGGATGCAGTACCAACTTATGCTATGCGTGAGAAGGTATTGAGTGTGAAGCTTGCCCTAACAAACAAAGATGCCGCCTTTAGGGTTGCCTTGTTGCAATGGACAGGTAAACCTGATGAGTACACTCAGGAACTCTTCACTACACGTAGTGGTGGAGCACCTGCGTTCCAATCTGGTTGGTCCCTAGTGGATTCTCTATTCATCCCTAAAGATGTTGCCAATGAAGACCACGAGGTTACCCATGAGTTCACAGTACCTAAAACTGCTGTTAACTATGCTGTAGTAATCTATCCTGAGTCCGTACAGCAACCTACTGAATTGAAACTTAAAACGTTCAATGTAGGTGCAAAAGACCCATTCTACTTCTATCATATCCACCAATCACGTAAGCTTAATGAGTTACACTTGGAGTATGATAATGAGTTCTATGAGTCCGTTCAGGATGCTACAGGTCTATATTCACTACGTTACACACTTGGAGATGCCGCTGATGGTAATCCAGTTCCTTGTGGAACACATCGTAAAGGTAAAGCCGATATTACGTTAGACCCTATGGTGAATCAGATTCCCGGTTCTTCCGCTAGTGGTGGTGAAGGTGCATTAAAGTTTGGTAAAGATGGACAAGCAACGGTCAATACGTTACTTAACATCGCCTCTGAACAAGCTCAAGCCTCAAACCATCCTACGGAGTTTTGGTGGGTTACTGTGGCCTCTGATGGTACTATGAGTGAGATTCCAGACTCTAGAACAAGCTTCCCAATTAGTGGAAGCTCCTCTGGTATGTACTCAATGACTCCTTTCACTTTTGCTGTTAAAGCAGGTGATAGGATTGCTCTAAGAGCTAAGTCTGATATGCCAGATGGTGCTTACTTAATTTCTGTGGCTGATAAAGTTCCCCTTGTTGATGTTTCAATCAACTTTAAAGAACTCACGGAGCCCACAGAGGATGACCCGTTTGCCAATATTGACCTTCACCAGTTTGACCATATTTATACTAATAGCTTAACTGTAACTAAAGATGTTGGTAATGTAAGTTCTGTGACCTTCCCTATAACAATCGAAGACACAGACCACTTAGTAGTTTTAGGTGCTGTTAAGCAGTTGCCTAATAATTCAATCCGTCCTGTAAAGGCACTGGATTGGGACTATAACAATGAAGACCATACCTTGAAGGTTTCCTTCGGAGAAACTGTATTGATTGGTCGAGTAACATTAGGGATTTATCGTGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
017549f50a94028f51163f3c62560303092a43c3c12a3626aa6f8b6a2d147a82
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6599
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Comeplete genome sequence of Bacteriophage pVco-5, that infects Vibrio corallilyticus Kim,H.J. and Park,S.C. 2018-01-11 — GenBank