Protein

Genbank accession
XYM57794.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MSFNINSDKEFISGSKPQFIGTTQFSIRAGGGVDEKEVVRALLDSEEKLPRVGINRTGQRVNNINVLTSGSGYTTEPTVTVSPPPDSPTAVQALASAFIFNGRVVSIAINNPGAGYSTAPTVTITGGNGGGCSAVAELDTVDYELDINGAIRTSTSIISDTARILNLDIDNFVTPDLNLRGPNLKTYVNNSGTIWVANTIVQENSYRYFGANVYQALNAGQTGPAAPEHLDGIVLNGEVNFKHIGFRVNDENAFKYGETGEAGIYPRSITPLLGDRSDKIATTEYVLNLATNDVGGRIYVSSQIGNDLNDGRSAVNPVRSVKKAAQLAWATPGVKETIIISGGDYVEDNPISLPPDASVVGDNLRLVIIRPNNPGKHIFKFGDKNYVTGVTYRDKIDANGDAIATWDFAMVFDDKQRIIVDSEVNGDFGVNFPIGHQVFGPDKFRINGFQNNTGLSALVSGLEAVGVNTGARGIISNVIFTETSGNNAYQNGSLDIVITSGSFLEGEGFRYIISGNVGSSVGSSTGTVGINQIAITSDPTPLGLIVSSYIYLDGVSNSQVSTGFYEIIQIDDDNAPTQWELTLAPILNATGWRETESGTINISSASITEGQFDSTKINSIRAEGEVVFEDADFDTSLPIIRMDFSKQGDPSIAQDGFQSDIFGNAEDPGGVILYTSALAGRQNFHDFKEGQEILIEGLPTVSPDLSFMNGRQRIYKVLEDADGRARRFVIPKKVPASLGLNANDNFDPGQFATVKSASRSVTFSLLNSPNKFPLSQPVDRRFQDACTFIRNNRDFIADEVVGRINREFAQDYHSVYEIGGQSSASYTATDATYDPSTGEFEITIPTHGLSVGEGIRIADDSFVFTCAMDGNKTEHALPEAGQYASGKSLPIISTTTNTVTVNVGASGPNEFFTPSNATYDPTLGTLQLIIGAHTLSPGEGVVIDDNSLSFKCAMDGYDSTKTYPRPNIDPFAGRSIPIQSVTADSITLQVGISRENFSLTPTTGTTYDAATGDLVMNVGQHGLGVGRNVVLNDNSFTFTCDIDGNVSQHTYPRPGTDPYAGKSIEITNVGFTEHTPTNVSYNAATGVVEFTINSHGFNNGDYIMVADGSLVFTCDLDGNVAQKAYPRAGYDLPSNRWMEVSIVSGDVFSINVGPSSYTGTHTWISAASNAIKRQDGYLTINVGNAGSAAGSNHTFVAATSGAVKHEPRSNHLFQGATTNAVRHLPQSAHTYVRSTSGGITTGGSSFKIYLGQTEHEHTYVSGGTVTFGGSDYTMTNFEYDALVSGVATVTTTNSIPGLAEDDIVKLADILISCEAGQKVYPSYSSPTSGGNALVSNGDEQCKQDLVHFMNAVIRDLEYGTNHNVIDAANKYIVNEKITYIEDEIVQNMRAIEYARQLLIFAVCNWRTEDRTPGDPIYVPQYSSLPRYFDDTVITATAGTPACANVVSAIDVLSFLWVDVITNNASGTLLDAAYLIMRNADLIADQALIDTKQQYPTLNLSDIMERKCKRDIKIVLEGLAKDLCLGGNSGIVAVAESYFSGTALTAISEAQRQETIYAYQRVQQHAIAAMRNWTGGNVIDLTPSSAQYNSTTGQLTVTFPDPLLPITTNDRIAFKEEALTFNCSFGSGGDHANPRPGDANYGKSQAITGVTSSGGATTVTTNVGDAGAAAGLVHTLTAALTDGTIIIYDPIETTSAIPQYEDWNILIDVNGTASSIQVTPTGATYNPANGVFVVTANGHGASVGDQVAFDAESFVFTCAMDGNKTEHALPGPGQPAYNNLITIDAADANTFTLNVGASGPDVQFTPTGITYDPATGDMVMEIGPHSLSVGEGIVIDDNSLTFTCAMDDNQSQKTYPRPGIDPFAGRSMLITSTSATTITVDAGKSGPNKYFTPTNATYNPSTGDMVLTVGQHGLGVGRNVTLANNSFTFTCAADGNATQHTYPRSGQDPFADNKSIAITAVGTTSHTPTNAAYDASTGIVTFTLASHGFANGDYIKVDDGSLTYTCALDGNTVQKSYPRAGYDYPSGRWLQISGVTTNQFKINVGPSSYTGTHLFVSAAADAIKRQDGTFTLNVGTSSDTSAHTFVSATTDAVRHEPQSAHTFISATTDAVKHLPQSAHTFVRASQNAIEVYPPGSAPLCASVASTIATSMNLFESILDGTIQAGATTVTYGTLYDTSNVITYPDSYITDQNDVRMAIRADYDDYPIIEASPYTQNASVISFLGGGGAEVDGDKVKQPNCPFPGLEIDGTASFPNQGKSMVAAAFTIVSFGGTGYKIVNDGYTQLVSVFVIFCADGVLSESGGYASITNSATNFGIYALRATGFRRDPYVFDAGYFAGSTYVRATITNVSQTPTGRTIFTIENLGREPLEHYILKIDGHTNSDPDTEYFIDEVTQVGAGPPFTATCIFDDGSGGSVSVIDDSNGQAVTPANLDGAYVGLHRPSIVNSSSHTWEFAGSGTNYLALPENGGTKVEANEQFNENYGRVYVSGTDELGDFKVGTFAKIENRTGAITFTGTVTISEVEFLKLKGGDVVVTGFDDSNTLGGANSSNSKIPTQKAVRDFITNNLGAYIQKEYSTNSVPRALVELTDSGKISLDQIPALRPFQVFTIPDQAARLSIEGALAGDIAIQQDNNTSFILNNDNGSQFLAFTVDPSLSFTLNDIFEGSVSGGQIQATEYRQGVLYQINITEAGSGYTQPPVVTISGGSPQAGAVAAVATCTIANGQVVTITIEEQNSYVGGKGYTVQPVINIAAPPGGGTQAEALGLIESRLYGNIVNNIKIVDTDTFQSSDVPAETINITRAINTSSSNANNWVSLSTTTVDARDITGGPIATDLLSTNSTAANSNTFLRGDQSYALAVQSLKGPEERYFAKLSVPAQSGGITMIFASNQNALKGHIIRNTVTGVQEDTIITSVITENNLTTISFSQEKALTATIPTGTIIEFQRPPSPIKFDSTFTQGNFVEEVIIANGGSGFTNGTYYNQTVTGGSGTGFKVTYIVANNSITEVIITTGGAGYTTDFQVNTAPTELGSGTGLDLRCKISTINRQYANVTVDIDRVVSASLDPEYGTTGVARFDKNQFFIGDAGDGSIRLKTASNSIDSGLDADLLDGKQGSFYQNAGSLSAGTLDSDRLSGTYNIDISGQSQKCIRLLTGTNNPSSNPSPNTFSEGIICNTKNNNADQLLDGGTKHMVMTLRPGPDATFGGIRQLAFTDNDNMWLRGSGTGVTTFGTWAQIWTSENDGIDTGLDADKLDNREGTWYQNALNINFGTISANRLPSFMKASGFRNTLKVKTFNGDPKYRIYVSGKVLTAFPAPNPFTPGNTVNLYNAQSQATGTIEIDNIITNDDLNDDRNDYSILIGRLTNGNFQNAVTIGTAALPVIFHDFTIEDDNVIDIVTMESDGGTANIKLGRKDGVASNPGIYFSSSQLVANYNSSIVATGGNATDGSGTLNAQVADANGFSVNGNIVWNEGNVQFNSTNVLGTAVIRDATGSFEAHRITLVADVNGIEGELIGKASKNVLKEGDTMTGTLNISGAQSNFSVQGTSGFTGNVVMSNDLTVATDVLFVDASDEEVGIGTTNPLDKLSVIGGAFVINSGNSGNSISTPNALGITYDSSAARGHIIVDHQSASTSLDFETSNSGTLSSKMRLDNVGHVFPLSSTQDLGKDSTNERWRNLYAKNVYADEKLTIEDAASNAGAPAYFLGASGFRNFRLGNQLLADDTFEITASTANGGQVWGSTPALFIQGATNRIAINTTNFSGTDTSGASPVVRDYQLNIEGDLNFNGQLFQNNEEFVTSRWTLNKTTNNIWRISRVGINQANPDYQLDVNGSLNVRGSTFVSGSNTDVISVNGDVQYVDSYGVFKTNRNTVNENVTIPAATNAVSAGPLTINNGVTITIANGSSWSVV
Physico‐chemical
properties
protein length:3901 AA
molecular weight: 413706,57010 Da
isoelectric point:4,57988
aromaticity:0,08331
hydropathy:-0,18452

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH3
[NCBI] 		3413214 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57794.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340851 [NCBI]
CDS location
range 93979 -> 105684
strand +
CDS
ATGAGTTTTAACATTAATTCTGATAAAGAATTTATCTCAGGGTCAAAACCTCAATTTATTGGTACAACTCAGTTCTCTATTCGCGCTGGTGGCGGTGTGGATGAGAAAGAAGTAGTTAGAGCACTTCTCGATTCGGAGGAGAAACTACCTCGTGTTGGTATTAATAGAACGGGACAAAGGGTCAACAACATCAATGTGTTGACTAGTGGTTCTGGATACACCACGGAGCCTACAGTTACCGTCAGTCCTCCCCCTGATAGTCCTACTGCCGTACAGGCACTAGCATCTGCTTTTATTTTCAATGGTCGCGTTGTTAGCATTGCTATCAATAATCCTGGTGCTGGTTATTCTACTGCACCTACTGTTACAATTACTGGTGGTAATGGTGGTGGTTGTTCTGCAGTCGCAGAACTTGATACCGTTGATTACGAACTTGACATTAACGGTGCAATTAGAACTTCTACGTCTATTATTTCCGACACGGCGAGAATTCTAAACCTGGATATCGACAACTTCGTTACTCCAGACTTAAACCTGAGAGGTCCAAACCTTAAGACTTATGTTAATAACTCAGGTACTATCTGGGTTGCTAATACTATTGTCCAAGAGAACTCCTATAGATACTTCGGTGCCAATGTCTACCAGGCATTGAACGCTGGTCAGACTGGTCCTGCTGCTCCTGAGCACCTGGATGGTATTGTCCTTAACGGCGAAGTCAACTTCAAGCACATTGGTTTCCGAGTCAATGATGAAAATGCATTTAAGTATGGTGAAACTGGCGAAGCAGGTATCTACCCACGTTCTATCACACCTCTACTAGGTGATAGATCTGACAAGATTGCAACTACAGAATACGTCCTCAACCTAGCAACGAATGACGTTGGTGGTCGTATCTACGTTTCCTCGCAGATTGGTAATGACCTAAACGATGGTCGATCTGCAGTCAACCCAGTTAGATCTGTCAAGAAAGCAGCACAATTGGCATGGGCAACGCCTGGTGTCAAAGAAACTATTATCATCTCTGGTGGTGACTACGTAGAAGATAACCCAATCTCTTTGCCACCTGATGCATCGGTTGTTGGTGATAACCTACGTCTAGTAATCATCAGACCTAACAACCCTGGCAAGCACATCTTTAAGTTCGGTGATAAGAACTACGTTACTGGTGTTACTTACCGAGATAAAATTGATGCTAACGGTGACGCTATTGCGACGTGGGACTTCGCAATGGTATTCGACGATAAGCAGCGTATCATCGTCGATTCTGAAGTCAATGGCGACTTCGGTGTCAACTTCCCAATTGGTCACCAAGTATTTGGTCCTGACAAATTTAGAATTAATGGATTCCAGAACAACACTGGTCTGTCAGCACTTGTCTCTGGACTAGAAGCAGTTGGTGTTAACACTGGTGCTAGAGGTATTATTTCCAACGTTATCTTTACTGAGACATCAGGAAACAATGCATATCAAAATGGTTCTCTAGACATTGTTATTACCAGTGGTTCTTTCCTGGAAGGTGAAGGATTCAGATATATTATTTCTGGTAATGTAGGATCATCTGTTGGTAGTTCTACGGGAACTGTTGGAATTAATCAGATTGCCATTACTTCAGATCCAACACCACTAGGTCTGATTGTTAGTTCTTATATCTACCTGGATGGTGTATCCAACTCCCAGGTATCAACTGGATTCTATGAAATCATTCAGATTGATGATGACAATGCTCCTACCCAATGGGAACTTACCCTTGCTCCAATTCTAAATGCTACTGGATGGAGAGAGACTGAATCTGGAACTATCAATATCAGTAGTGCATCTATTACTGAAGGTCAGTTTGACTCCACAAAGATCAACTCGATCCGAGCAGAAGGTGAAGTTGTATTTGAAGATGCAGACTTCGATACTTCTCTGCCTATTATTAGAATGGATTTCTCCAAGCAAGGAGATCCTTCTATTGCACAAGATGGTTTCCAGTCTGATATCTTTGGTAACGCAGAAGATCCAGGTGGTGTCATTCTGTATACCAGTGCTCTTGCTGGTAGACAAAACTTCCACGACTTCAAAGAAGGTCAAGAAATTCTAATTGAGGGTCTACCAACTGTATCTCCTGATCTGTCGTTCATGAACGGCAGACAAAGGATTTATAAGGTTCTAGAAGATGCTGATGGTCGTGCAAGACGTTTCGTCATTCCCAAAAAAGTTCCTGCTAGTTTAGGACTTAATGCTAACGATAACTTTGATCCTGGTCAGTTTGCAACTGTCAAATCTGCATCCAGATCGGTTACGTTCTCTCTGCTGAACTCTCCCAACAAATTCCCATTATCTCAGCCTGTTGATAGAAGATTCCAGGACGCATGTACATTCATCCGTAACAACAGAGACTTCATCGCAGATGAAGTTGTAGGAAGAATCAACCGAGAGTTTGCTCAAGACTATCATTCTGTATATGAAATTGGTGGTCAGTCTTCTGCTTCCTATACGGCAACAGATGCTACCTATGATCCTAGCACTGGTGAGTTTGAAATCACCATTCCTACTCATGGTTTATCGGTTGGCGAAGGTATCAGAATTGCTGATGATTCTTTCGTGTTCACTTGTGCCATGGATGGTAACAAGACTGAACACGCACTACCAGAAGCAGGTCAGTATGCTAGTGGCAAGTCTCTGCCTATCATATCAACCACTACAAATACTGTTACGGTCAACGTAGGTGCATCTGGTCCTAATGAGTTCTTCACACCTTCTAATGCTACCTACGATCCTACACTAGGTACACTACAATTAATTATTGGTGCTCATACACTATCACCTGGGGAAGGTGTTGTCATCGACGACAACTCTCTGTCCTTTAAGTGTGCAATGGATGGATATGATTCTACTAAAACATATCCACGCCCTAACATTGATCCATTTGCTGGTAGATCTATTCCTATTCAGTCTGTTACAGCAGACTCTATTACTCTACAAGTTGGTATCTCCAGAGAGAATTTCTCCCTGACACCTACTACTGGCACGACATATGATGCTGCAACTGGCGATCTGGTAATGAACGTTGGTCAGCATGGTCTTGGTGTTGGTCGTAATGTTGTTCTTAATGATAACTCTTTCACCTTTACGTGTGATATAGATGGCAACGTTTCCCAGCACACCTATCCACGTCCTGGTACTGATCCATATGCTGGTAAGTCCATTGAGATTACAAATGTTGGATTTACTGAGCATACTCCTACCAACGTATCTTATAATGCTGCCACTGGCGTAGTTGAATTCACGATCAATAGTCATGGATTCAACAACGGCGACTATATTATGGTCGCTGATGGATCTCTGGTATTTACCTGCGATCTCGATGGTAACGTTGCACAGAAAGCATATCCCCGCGCTGGATATGATCTACCATCTAATCGTTGGATGGAAGTTTCTATTGTTAGTGGTGATGTATTCAGCATTAACGTTGGTCCTTCCTCTTACACAGGTACTCACACCTGGATCTCTGCCGCTTCTAATGCAATTAAGAGGCAAGATGGATATCTCACAATCAACGTTGGAAACGCTGGTTCTGCTGCTGGTTCTAACCACACATTTGTGGCTGCTACCAGTGGTGCTGTTAAGCATGAACCAAGATCGAATCACCTATTCCAAGGAGCAACTACAAACGCGGTTCGCCACCTTCCTCAGTCTGCTCATACTTATGTAAGATCCACATCTGGTGGTATTACTACTGGTGGTTCTTCATTCAAGATCTATCTGGGTCAAACAGAGCATGAGCATACCTACGTAAGCGGTGGTACTGTCACCTTCGGTGGTTCTGACTACACGATGACTAATTTTGAGTATGACGCTCTGGTAAGTGGTGTCGCCACTGTCACTACAACGAATTCTATCCCAGGTCTTGCTGAAGATGATATCGTAAAACTTGCTGATATTCTAATCAGTTGTGAAGCTGGTCAAAAGGTTTATCCCTCTTATAGTTCACCTACTTCTGGTGGTAATGCTCTAGTAAGTAATGGCGATGAGCAATGTAAGCAAGACCTTGTTCACTTCATGAATGCTGTCATTCGTGACTTGGAATATGGCACTAACCATAATGTCATCGATGCTGCCAATAAGTATATTGTCAATGAAAAGATTACATACATTGAAGATGAAATTGTACAGAACATGCGTGCTATTGAATATGCACGTCAACTTCTAATCTTTGCTGTTTGTAACTGGAGAACTGAAGACAGAACACCTGGAGATCCTATCTATGTTCCTCAGTATTCTTCTCTACCAAGATACTTTGACGACACTGTTATCACAGCAACAGCAGGTACTCCTGCTTGTGCTAACGTCGTATCTGCAATTGATGTTCTATCCTTCCTATGGGTAGATGTTATTACTAACAATGCATCTGGCACTCTACTGGATGCAGCATATCTGATTATGCGTAACGCTGATCTAATTGCTGATCAGGCATTGATCGATACCAAACAACAGTATCCTACACTCAACCTTTCCGATATTATGGAAAGGAAGTGTAAGCGTGACATTAAGATTGTTCTAGAAGGTCTAGCAAAAGACCTTTGCTTGGGTGGTAACTCTGGTATCGTTGCTGTCGCTGAGTCTTACTTCTCTGGCACTGCACTGACTGCAATTTCTGAAGCACAGAGACAAGAAACAATCTACGCTTACCAGAGAGTTCAGCAGCATGCTATTGCTGCTATGAGAAACTGGACTGGTGGTAATGTCATCGACCTTACTCCTTCTAGTGCTCAGTACAACTCCACGACAGGTCAACTTACTGTTACCTTCCCCGATCCACTTCTTCCTATTACTACAAACGATAGAATTGCATTCAAGGAAGAGGCACTTACTTTCAACTGCTCATTCGGTAGCGGTGGCGATCATGCTAACCCACGCCCTGGTGATGCAAACTATGGCAAGTCGCAAGCAATCACTGGTGTAACATCTTCTGGTGGGGCAACTACCGTTACTACTAACGTAGGTGATGCTGGCGC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.