Protein
View in Explore- Genbank accession
- XYM57794.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTSP
- Protein sequence
-
MSFNINSDKEFISGSKPQFIGTTQFSIRAGGGVDEKEVVRALLDSEEKLPRVGINRTGQRVNNINVLTSGSGYTTEPTVTVSPPPDSPTAVQALASAFIFNGRVVSIAINNPGAGYSTAPTVTITGGNGGGCSAVAELDTVDYELDINGAIRTSTSIISDTARILNLDIDNFVTPDLNLRGPNLKTYVNNSGTIWVANTIVQENSYRYFGANVYQALNAGQTGPAAPEHLDGIVLNGEVNFKHIGFRVNDENAFKYGETGEAGIYPRSITPLLGDRSDKIATTEYVLNLATNDVGGRIYVSSQIGNDLNDGRSAVNPVRSVKKAAQLAWATPGVKETIIISGGDYVEDNPISLPPDASVVGDNLRLVIIRPNNPGKHIFKFGDKNYVTGVTYRDKIDANGDAIATWDFAMVFDDKQRIIVDSEVNGDFGVNFPIGHQVFGPDKFRINGFQNNTGLSALVSGLEAVGVNTGARGIISNVIFTETSGNNAYQNGSLDIVITSGSFLEGEGFRYIISGNVGSSVGSSTGTVGINQIAITSDPTPLGLIVSSYIYLDGVSNSQVSTGFYEIIQIDDDNAPTQWELTLAPILNATGWRETESGTINISSASITEGQFDSTKINSIRAEGEVVFEDADFDTSLPIIRMDFSKQGDPSIAQDGFQSDIFGNAEDPGGVILYTSALAGRQNFHDFKEGQEILIEGLPTVSPDLSFMNGRQRIYKVLEDADGRARRFVIPKKVPASLGLNANDNFDPGQFATVKSASRSVTFSLLNSPNKFPLSQPVDRRFQDACTFIRNNRDFIADEVVGRINREFAQDYHSVYEIGGQSSASYTATDATYDPSTGEFEITIPTHGLSVGEGIRIADDSFVFTCAMDGNKTEHALPEAGQYASGKSLPIISTTTNTVTVNVGASGPNEFFTPSNATYDPTLGTLQLIIGAHTLSPGEGVVIDDNSLSFKCAMDGYDSTKTYPRPNIDPFAGRSIPIQSVTADSITLQVGISRENFSLTPTTGTTYDAATGDLVMNVGQHGLGVGRNVVLNDNSFTFTCDIDGNVSQHTYPRPGTDPYAGKSIEITNVGFTEHTPTNVSYNAATGVVEFTINSHGFNNGDYIMVADGSLVFTCDLDGNVAQKAYPRAGYDLPSNRWMEVSIVSGDVFSINVGPSSYTGTHTWISAASNAIKRQDGYLTINVGNAGSAAGSNHTFVAATSGAVKHEPRSNHLFQGATTNAVRHLPQSAHTYVRSTSGGITTGGSSFKIYLGQTEHEHTYVSGGTVTFGGSDYTMTNFEYDALVSGVATVTTTNSIPGLAEDDIVKLADILISCEAGQKVYPSYSSPTSGGNALVSNGDEQCKQDLVHFMNAVIRDLEYGTNHNVIDAANKYIVNEKITYIEDEIVQNMRAIEYARQLLIFAVCNWRTEDRTPGDPIYVPQYSSLPRYFDDTVITATAGTPACANVVSAIDVLSFLWVDVITNNASGTLLDAAYLIMRNADLIADQALIDTKQQYPTLNLSDIMERKCKRDIKIVLEGLAKDLCLGGNSGIVAVAESYFSGTALTAISEAQRQETIYAYQRVQQHAIAAMRNWTGGNVIDLTPSSAQYNSTTGQLTVTFPDPLLPITTNDRIAFKEEALTFNCSFGSGGDHANPRPGDANYGKSQAITGVTSSGGATTVTTNVGDAGAAAGLVHTLTAALTDGTIIIYDPIETTSAIPQYEDWNILIDVNGTASSIQVTPTGATYNPANGVFVVTANGHGASVGDQVAFDAESFVFTCAMDGNKTEHALPGPGQPAYNNLITIDAADANTFTLNVGASGPDVQFTPTGITYDPATGDMVMEIGPHSLSVGEGIVIDDNSLTFTCAMDDNQSQKTYPRPGIDPFAGRSMLITSTSATTITVDAGKSGPNKYFTPTNATYNPSTGDMVLTVGQHGLGVGRNVTLANNSFTFTCAADGNATQHTYPRSGQDPFADNKSIAITAVGTTSHTPTNAAYDASTGIVTFTLASHGFANGDYIKVDDGSLTYTCALDGNTVQKSYPRAGYDYPSGRWLQISGVTTNQFKINVGPSSYTGTHLFVSAAADAIKRQDGTFTLNVGTSSDTSAHTFVSATTDAVRHEPQSAHTFISATTDAVKHLPQSAHTFVRASQNAIEVYPPGSAPLCASVASTIATSMNLFESILDGTIQAGATTVTYGTLYDTSNVITYPDSYITDQNDVRMAIRADYDDYPIIEASPYTQNASVISFLGGGGAEVDGDKVKQPNCPFPGLEIDGTASFPNQGKSMVAAAFTIVSFGGTGYKIVNDGYTQLVSVFVIFCADGVLSESGGYASITNSATNFGIYALRATGFRRDPYVFDAGYFAGSTYVRATITNVSQTPTGRTIFTIENLGREPLEHYILKIDGHTNSDPDTEYFIDEVTQVGAGPPFTATCIFDDGSGGSVSVIDDSNGQAVTPANLDGAYVGLHRPSIVNSSSHTWEFAGSGTNYLALPENGGTKVEANEQFNENYGRVYVSGTDELGDFKVGTFAKIENRTGAITFTGTVTISEVEFLKLKGGDVVVTGFDDSNTLGGANSSNSKIPTQKAVRDFITNNLGAYIQKEYSTNSVPRALVELTDSGKISLDQIPALRPFQVFTIPDQAARLSIEGALAGDIAIQQDNNTSFILNNDNGSQFLAFTVDPSLSFTLNDIFEGSVSGGQIQATEYRQGVLYQINITEAGSGYTQPPVVTISGGSPQAGAVAAVATCTIANGQVVTITIEEQNSYVGGKGYTVQPVINIAAPPGGGTQAEALGLIESRLYGNIVNNIKIVDTDTFQSSDVPAETINITRAINTSSSNANNWVSLSTTTVDARDITGGPIATDLLSTNSTAANSNTFLRGDQSYALAVQSLKGPEERYFAKLSVPAQSGGITMIFASNQNALKGHIIRNTVTGVQEDTIITSVITENNLTTISFSQEKALTATIPTGTIIEFQRPPSPIKFDSTFTQGNFVEEVIIANGGSGFTNGTYYNQTVTGGSGTGFKVTYIVANNSITEVIITTGGAGYTTDFQVNTAPTELGSGTGLDLRCKISTINRQYANVTVDIDRVVSASLDPEYGTTGVARFDKNQFFIGDAGDGSIRLKTASNSIDSGLDADLLDGKQGSFYQNAGSLSAGTLDSDRLSGTYNIDISGQSQKCIRLLTGTNNPSSNPSPNTFSEGIICNTKNNNADQLLDGGTKHMVMTLRPGPDATFGGIRQLAFTDNDNMWLRGSGTGVTTFGTWAQIWTSENDGIDTGLDADKLDNREGTWYQNALNINFGTISANRLPSFMKASGFRNTLKVKTFNGDPKYRIYVSGKVLTAFPAPNPFTPGNTVNLYNAQSQATGTIEIDNIITNDDLNDDRNDYSILIGRLTNGNFQNAVTIGTAALPVIFHDFTIEDDNVIDIVTMESDGGTANIKLGRKDGVASNPGIYFSSSQLVANYNSSIVATGGNATDGSGTLNAQVADANGFSVNGNIVWNEGNVQFNSTNVLGTAVIRDATGSFEAHRITLVADVNGIEGELIGKASKNVLKEGDTMTGTLNISGAQSNFSVQGTSGFTGNVVMSNDLTVATDVLFVDASDEEVGIGTTNPLDKLSVIGGAFVINSGNSGNSISTPNALGITYDSSAARGHIIVDHQSASTSLDFETSNSGTLSSKMRLDNVGHVFPLSSTQDLGKDSTNERWRNLYAKNVYADEKLTIEDAASNAGAPAYFLGASGFRNFRLGNQLLADDTFEITASTANGGQVWGSTPALFIQGATNRIAINTTNFSGTDTSGASPVVRDYQLNIEGDLNFNGQLFQNNEEFVTSRWTLNKTTNNIWRISRVGINQANPDYQLDVNGSLNVRGSTFVSGSNTDVISVNGDVQYVDSYGVFKTNRNTVNENVTIPAATNAVSAGPLTINNGVTITIANGSSWSVV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 3901 AA molecular weight: 413706,57010 Da isoelectric point: 4,57988 aromaticity: 0,08331 hydropathy: -0,18452
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Tail Spike Domain Segmentation
Tail Spike Domain Segmentation
This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.
Domain Layout
1
3901
| Domain | Start | End | Length (AA) | Confidence |
|---|---|---|---|---|
| N-terminal | 1 | 375 | 375 | 0,9448 |
| Central domain | 376 | 732 | 358 | 0,6164 |
| C-terminal | 733 | 3901 | 3168 | 0,1797 |
Note: Constraints were applied during segmentation.
Fixed 6 C-terminal predictions appearing before Central domain
Fixed 6 C-terminal predictions appearing before Central domain
Legend:
N-terminal
Central domain
C-terminal
3D Structure with Domain Coloring
The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).
Domain Coloring
N-terminal
1-375
1-375
Central
376-732
376-732
C-terminal
733-3901
733-3901
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57794.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340851.1
[NCBI]
CDS location
range 93979 -> 105684
strand +
strand +
CDS
ATGAGTTTTAACATTAATTCTGATAAAGAATTTATCTCAGGGTCAAAACCTCAATTTATTGGTACAACTCAGTTCTCTATTCGCGCTGGTGGCGGTGTGGATGAGAAAGAAGTAGTTAGAGCACTTCTCGATTCGGAGGAGAAACTACCTCGTGTTGGTATTAATAGAACGGGACAAAGGGTCAACAACATCAATGTGTTGACTAGTGGTTCTGGATACACCACGGAGCCTACAGTTACCGTCAGTCCTCCCCCTGATAGTCCTACTGCCGTACAGGCACTAGCATCTGCTTTTATTTTCAATGGTCGCGTTGTTAGCATTGCTATCAATAATCCTGGTGCTGGTTATTCTACTGCACCTACTGTTACAATTACTGGTGGTAATGGTGGTGGTTGTTCTGCAGTCGCAGAACTTGATACCGTTGATTACGAACTTGACATTAACGGTGCAATTAGAACTTCTACGTCTATTATTTCCGACACGGCGAGAATTCTAAACCTGGATATCGACAACTTCGTTACTCCAGACTTAAACCTGAGAGGTCCAAACCTTAAGACTTATGTTAATAACTCAGGTACTATCTGGGTTGCTAATACTATTGTCCAAGAGAACTCCTATAGATACTTCGGTGCCAATGTCTACCAGGCATTGAACGCTGGTCAGACTGGTCCTGCTGCTCCTGAGCACCTGGATGGTATTGTCCTTAACGGCGAAGTCAACTTCAAGCACATTGGTTTCCGAGTCAATGATGAAAATGCATTTAAGTATGGTGAAACTGGCGAAGCAGGTATCTACCCACGTTCTATCACACCTCTACTAGGTGATAGATCTGACAAGATTGCAACTACAGAATACGTCCTCAACCTAGCAACGAATGACGTTGGTGGTCGTATCTACGTTTCCTCGCAGATTGGTAATGACCTAAACGATGGTCGATCTGCAGTCAACCCAGTTAGATCTGTCAAGAAAGCAGCACAATTGGCATGGGCAACGCCTGGTGTCAAAGAAACTATTATCATCTCTGGTGGTGACTACGTAGAAGATAACCCAATCTCTTTGCCACCTGATGCATCGGTTGTTGGTGATAACCTACGTCTAGTAATCATCAGACCTAACAACCCTGGCAAGCACATCTTTAAGTTCGGTGATAAGAACTACGTTACTGGTGTTACTTACCGAGATAAAATTGATGCTAACGGTGACGCTATTGCGACGTGGGACTTCGCAATGGTATTCGACGATAAGCAGCGTATCATCGTCGATTCTGAAGTCAATGGCGACTTCGGTGTCAACTTCCCAATTGGTCACCAAGTATTTGGTCCTGACAAATTTAGAATTAATGGATTCCAGAACAACACTGGTCTGTCAGCACTTGTCTCTGGACTAGAAGCAGTTGGTGTTAACACTGGTGCTAGAGGTATTATTTCCAACGTTATCTTTACTGAGACATCAGGAAACAATGCATATCAAAATGGTTCTCTAGACATTGTTATTACCAGTGGTTCTTTCCTGGAAGGTGAAGGATTCAGATATATTATTTCTGGTAATGTAGGATCATCTGTTGGTAGTTCTACGGGAACTGTTGGAATTAATCAGATTGCCATTACTTCAGATCCAACACCACTAGGTCTGATTGTTAGTTCTTATATCTACCTGGATGGTGTATCCAACTCCCAGGTATCAACTGGATTCTATGAAATCATTCAGATTGATGATGACAATGCTCCTACCCAATGGGAACTTACCCTTGCTCCAATTCTAAATGCTACTGGATGGAGAGAGACTGAATCTGGAACTATCAATATCAGTAGTGCATCTATTACTGAAGGTCAGTTTGACTCCACAAAGATCAACTCGATCCGAGCAGAAGGTGAAGTTGTATTTGAAGATGCAGACTTCGATACTTCTCTGCCTATTATTAGAATGGATTTCTCCAAGCAAGGAGATCCTTCTATTGCACAAGATGGTTTCCAGTCTGATATCTTTGGTAACGCAGAAGATCCAGGTGGTGTCATTCTGTATACCAGTGCTCTTGCTGGTAGACAAAACTTCCACGACTTCAAAGAAGGTCAAGAAATTCTAATTGAGGGTCTACCAACTGTATCTCCTGATCTGTCGTTCATGAACGGCAGACAAAGGATTTATAAGGTTCTAGAAGATGCTGATGGTCGTGCAAGACGTTTCGTCATTCCCAAAAAAGTTCCTGCTAGTTTAGGACTTAATGCTAACGATAACTTTGATCCTGGTCAGTTTGCAACTGTCAAATCTGCATCCAGATCGGTTACGTTCTCTCTGCTGAACTCTCCCAACAAATTCCCATTATCTCAGCCTGTTGATAGAAGATTCCAGGACGCATGTACATTCATCCGTAACAACAGAGACTTCATCGCAGATGAAGTTGTAGGAAGAATCAACCGAGAGTTTGCTCAAGACTATCATTCTGTATATGAAATTGGTGGTCAGTCTTCTGCTTCCTATACGGCAACAGATGCTACCTATGATCCTAGCACTGGTGAGTTTGAAATCACCATTCCTACTCATGGTTTATCGGTTGGCGAAGGTATCAGAATTGCTGATGATTCTTTCGTGTTCACTTGTGCCATGGATGGTAACAAGACTGAACACGCACTACCAGAAGCAGGTCAGTATGCTAGTGGCAAGTCTCTGCCTATCATATCAACCACTACAAATACTGTTACGGTCAACGTAGGTGCATCTGGTCCTAATGAGTTCTTCACACCTTCTAATGCTACCTACGATCCTACACTAGGTACACTACAATTAATTATTGGTGCTCATACACTATCACCTGGGGAAGGTGTTGTCATCGACGACAACTCTCTGTCCTTTAAGTGTGCAATGGATGGATATGATTCTACTAAAACATATCCACGCCCTAACATTGATCCATTTGCTGGTAGATCTATTCCTATTCAGTCTGTTACAGCAGACTCTATTACTCTACAAGTTGGTATCTCCAGAGAGAATTTCTCCCTGACACCTACTACTGGCACGACATATGATGCTGCAACTGGCGATCTGGTAATGAACGTTGGTCAGCATGGTCTTGGTGTTGGTCGTAATGTTGTTCTTAATGATAACTCTTTCACCTTTACGTGTGATATAGATGGCAACGTTTCCCAGCACACCTATCCACGTCCTGGTACTGATCCATATGCTGGTAAGTCCATTGAGATTACAAATGTTGGATTTACTGAGCATACTCCTACCAACGTATCTTATAATGCTGCCACTGGCGTAGTTGAATTCACGATCAATAGTCATGGATTCAACAACGGCGACTATATTATGGTCGCTGATGGATCTCTGGTATTTACCTGCGATCTCGATGGTAACGTTGCACAGAAAGCATATCCCCGCGCTGGATATGATCTACCATCTAATCGTTGGATGGAAGTTTCTATTGTTAGTGGTGATGTATTCAGCATTAACGTTGGTCCTTCCTCTTACACAGGTACTCACACCTGGATCTCTGCCGCTTCTAATGCAATTAAGAGGCAAGATGGATATCTCACAATCAACGTTGGAAACGCTGGTTCTGCTGCTGGTTCTAACCACACATTTGTGGCTGCTACCAGTGGTGCTGTTAAGCATGAACCAAGATCGAATCACCTATTCCAAGGAGCAACTACAAACGCGGTTCGCCACCTTCCTCAGTCTGCTCATACTTATGTAAGATCCACATCTGGTGGTATTACTACTGGTGGTTCTTCATTCAAGATCTATCTGGGTCAAACAGAGCATGAGCATACCTACGTAAGCGGTGGTACTGTCACCTTCGGTGGTTCTGACTACACGATGACTAATTTTGAGTATGACGCTCTGGTAAGTGGTGTCGCCACTGTCACTACAACGAATTCTATCCCAGGTCTTGCTGAAGATGATATCGTAAAACTTGCTGATATTCTAATCAGTTGTGAAGCTGGTCAAAAGGTTTATCCCTCTTATAGTTCACCTACTTCTGGTGGTAATGCTCTAGTAAGTAATGGCGATGAGCAATGTAAGCAAGACCTTGTTCACTTCATGAATGCTGTCATTCGTGACTTGGAATATGGCACTAACCATAATGTCATCGATGCTGCCAATAAGTATATTGTCAATGAAAAGATTACATACATTGAAGATGAAATTGTACAGAACATGCGTGCTATTGAATATGCACGTCAACTTCTAATCTTTGCTGTTTGTAACTGGAGAACTGAAGACAGAACACCTGGAGATCCTATCTATGTTCCTCAGTATTCTTCTCTACCAAGATACTTTGACGACACTGTTATCACAGCAACAGCAGGTACTCCTGCTTGTGCTAACGTCGTATCTGCAATTGATGTTCTATCCTTCCTATGGGTAGATGTTATTACTAACAATGCATCTGGCACTCTACTGGATGCAGCATATCTGATTATGCGTAACGCTGATCTAATTGCTGATCAGGCATTGATCGATACCAAACAACAGTATCCTACACTCAACCTTTCCGATATTATGGAAAGGAAGTGTAAGCGTGACATTAAGATTGTTCTAGAAGGTCTAGCAAAAGACCTTTGCTTGGGTGGTAACTCTGGTATCGTTGCTGTCGCTGAGTCTTACTTCTCTGGCACTGCACTGACTGCAATTTCTGAAGCACAGAGACAAGAAACAATCTACGCTTACCAGAGAGTTCAGCAGCATGCTATTGCTGCTATGAGAAACTGGACTGGTGGTAATGTCATCGACCTTACTCCTTCTAGTGCTCAGTACAACTCCACGACAGGTCAACTTACTGTTACCTTCCCCGATCCACTTCTTCCTATTACTACAAACGATAGAATTGCATTCAAGGAAGAGGCACTTACTTTCAACTGCTCATTCGGTAGCGGTGGCGATCATGCTAACCCACGCCCTGGTGATGCAAACTATGGCAAGTCGCAAGCAATCACTGGTGTAACATCTTCTGGTGGGGCAACTACCGTTACTACTAACGTAGGTGATGCTGGCGC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AGATCGATAATATCATTACAAATGATGATCTAAATGATGACAGAAATGACTACTCGATTCTCATTGGTAGACTGACTAATGGTAACTTCCAGAACGCTGTTACGATTGGTACTGCTGCTCTACCTGTTATCTTCCATGACTTTACTATTGAGGATGACAACGTTATCGATATCGTCACGATGGAAAGTGATGGTGGCACCGCTAACATTAAACTTGGTAGAAAGGACGGTGTAGCATCCAACCCTGGTATCTACTTCAGTTCTTCTCAGTTGGTTGCTAACTACAACTCTTCGATTGTTGCAACTGGTGGTAACGCAACTGATGGTTCTGGTACACTGAACGCACAAGTTGCTGATGCTAATGGATTTAGCGTCAATGGCAACATCGTCTGGAACGAAGGTAACGTTCAGTTCAACTCTACTAACGTCCTGGGTACTGCAGTCATTCGTGACGCTACTGGATCTTTTGAAGCACATCGCATTACATTGGTTGCAGATGTTAACGGCATCGAAGGTGAACTGATTGGTAAGGCATCTAAGAACGTACTGAAAGAAGGCGATACCATGACTGGTACGCTGAACATCAGTGGTGCTCAATCTAACTTCTCTGTACAAGGAACCTCTGGTTTCACAGGTAACGTCGTAATGTCGAATGACCTGACAGTTGCAACTGACGTTCTATTCGTTGATGCTTCTGACGAAGAGGTTGGCATCGGCACCACAAATCCACTGGACAAACTGTCCGTGATCGGAGGTGCATTTGTTATTAACTCTGGCAATTCTGGTAACAGCATCTCGACACCAAATGCACTAGGCATCACATATGATTCCAGTGCTGCTCGCGGTCACATTATCGTTGATCATCAATCTGCTTCTACATCTCTTGACTTCGAGACCTCTAATAGTGGTACTCTAAGTTCCAAGATGAGATTGGATAATGTTGGTCATGTCTTCCCATTATCTTCTACACAGGATCTTGGTAAGGATAGCACCAACGAAAGATGGAGAAATCTATACGCGAAGAACGTATATGCCGACGAGAAACTAACTATTGAAGATGCAGCATCTAATGCTGGTGCTCCTGCATACTTCCTAGGTGCATCTGGTTTCCGTAACTTCCGTCTTGGTAACCAACTGCTTGCAGATGACACATTTGAAATTACAGCAAGCACTGCAAATGGTGGTCAGGTCTGGGGTTCTACTCCTGCTCTGTTTATCCAAGGTGCTACAAACAGAATTGCAATAAATACTACTAACTTCAGTGGTACTGATACATCTGGCGCATCTCCAGTTGTTAGAGATTATCAACTGAACATCGAAGGTGACCTTAACTTCAACGGTCAACTCTTCCAGAACAACGAAGAATTCGTTACTTCTAGATGGACACTGAACAAGACTACCAACAATATCTGGAGAATTTCTAGAGTTGGTATTAACCAGGCAAACCCAGATTATCAACTGGATGTCAACGGCAGTCTCAATGTTCGTGGTTCTACATTCGTTTCTGGATCTAACACTGACGTAATAAGTGTTAACGGTGATGTCCAATATGTTGATTCCTACGGCGTCTTCAAGACAAATCGCAACACAGTTAACGAAAACGTTACTATTCCTGCTGCTACAAACGCAGTAAGCGCAGGTCCTTTGACTATAAATAATGGTGTAACAATTACCATTGCAAACGGTAGCTCCTGGAGTGTCGTATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
791c8cf87c23151757ae7a3770cca1740d486daf6bae6d0a6cefdae9982e122f
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50