Protein

Genbank accession
WYC17680.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,75
Protein sequence
MTDKLIRELLIDVKQKGATRTAKSIENVSDALENAAAASELTNEQLGKMPKTLYSIERAADRAAKSLTKMQASRGMAGITKSIDGIGAKLDDLAIAMIEVADKLEVGFGGVSRSVKAMGNDVAAATEKVQDRLYDTNRALGGTARGFNDTAGAAGRASRAIGNTSGSARGATRDFAAMAKIGGSLPIMYAALASNIFVLQSAFEQLKLGDQLNRLEKFGVIVGTQTGTPVQSLARSLQEAAGYAISFEEAMRQASSASAYGFDAEQLNKFGLVARRAAAVLGVDMTDALNRVIKGVSKQEIELLDELGVTIRLNDAYADYVKQLNAANTGITYNINSLTTFQKQQAYANAVIAESTKRFGYLDEVLRATPWEQFAANADAALRTIQQSAAKYLGPVIDAINTVFYTSQASVSAEAARAQEKTNRQIDPTNVGAVALSLAASEEGYNKALDMYKESLDKRNKLKAEFDKRMSQADASTAAAIRLVGEGMPVGLAAGGFEVGGVRIGSSEANKKFVEETAAMGLQIARLGKEVDDSTENLNAWKSAYQAAGAAAAKASPEFQKQINLQRDTTDPDAVYDFNSTVLKGLTEQQKAYDQTKKTASDLANDFQNIASSTDTAAKTSATFEEVIKNISSLSAGTGKSADEYVKNLNLGFNTLSEMKTASQALSEYVKLTGNETKNQLAVQQKIADVYNQTKDKEKAQEAGRRLELQQLEEQEAALRRVLQTNQGNKAVEKEIEKIQLEKLKLTNQGMEAQKKVKDYTDKILGVDREIALLNDRTMTSTQYRLAQLKLELTIEEEKYEWYLKQADKQKEAEQSRRAQAQISRELWEAEKQATASHVSALMDALEVSQTQRNVTGQSQILTERLSILQQQLELSKGNTEEEIKYRNEIYKTSAALEQLRKQRENQTYKSVISSLGGTFTPTNGLSGDDKEFADFENRMSMYDQAIAKMSEVDSASTALANSIGNFSLAVVANAQDSLDSITTISAGMQMVGQMMAYSANQQISAIDQAIAAEQKRDGKSEESKAKIKKLEAEKTKIQQREAKKQIIISTAVAMMNAAATRPFLPLGLTMMATAAAAGALSLAAASSASSIPSVDSGTSTTSYLTLGERQKNIDVSMSANAGELSYIRGDKGIGGANSFVPRAEGGNMYPGVSYQMGEHGTEVVTPMVPMKATPNDELKTSSNSTSGRPIILNISAMDAASFREFASSNSGALRDAVELALNENGASLKTLGNS
Physico‐chemical
properties
protein length:1235 AA
molecular weight: 132883,80070 Da
isoelectric point:5,60526
aromaticity:0,05344
hydropathy:-0,38915

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage vB_SpuM_X5
[NCBI]
3135593 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WYC17680.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP502935 [NCBI]
CDS location
range 90645 -> 94352
strand -
CDS
ATGACTGATAAGCTAATACGAGAATTACTAATAGACGTTAAGCAGAAGGGGGCAACTCGTACTGCAAAGTCTATTGAAAACGTATCTGATGCGTTGGAAAACGCTGCTGCTGCTTCCGAACTGACAAATGAGCAGTTAGGTAAAATGCCCAAAACCCTTTACTCCATTGAGAGGGCAGCAGATAGAGCAGCGAAAAGTCTTACCAAAATGCAAGCTAGTAGGGGTATGGCTGGTATCACTAAATCCATTGATGGTATTGGTGCTAAGTTAGATGATCTAGCTATTGCAATGATCGAAGTAGCAGATAAGCTGGAAGTAGGATTTGGTGGAGTTTCTAGATCTGTTAAAGCAATGGGTAATGATGTTGCAGCTGCAACAGAAAAAGTCCAGGATAGATTATATGATACTAATAGGGCATTAGGTGGCACAGCTAGAGGTTTTAATGATACTGCTGGTGCCGCTGGTAGAGCTTCTAGAGCTATTGGTAATACTTCTGGTTCCGCTCGTGGCGCAACTCGTGATTTTGCGGCAATGGCTAAGATCGGTGGTAGTTTACCTATTATGTATGCAGCTCTTGCTTCCAACATCTTCGTTTTGCAATCTGCATTCGAACAACTTAAACTAGGTGATCAGCTAAATCGTCTAGAAAAATTTGGTGTTATAGTAGGTACTCAGACAGGTACTCCTGTTCAGTCCCTTGCTAGATCACTACAAGAGGCAGCTGGCTATGCAATCTCTTTTGAAGAAGCTATGAGGCAAGCATCCTCAGCGTCCGCTTATGGATTTGATGCTGAACAACTTAATAAATTTGGTTTAGTAGCTCGTCGTGCTGCTGCTGTTCTTGGCGTTGATATGACTGATGCACTTAATCGTGTAATTAAGGGTGTATCTAAACAAGAAATCGAACTTCTGGATGAACTTGGTGTTACTATTCGTCTTAACGATGCTTATGCTGATTACGTTAAACAGTTAAATGCTGCAAACACAGGTATAACATATAATATTAATAGCCTTACTACCTTCCAGAAACAGCAAGCGTATGCTAATGCTGTTATAGCAGAATCTACTAAACGTTTTGGTTACTTAGATGAAGTTTTACGTGCTACTCCATGGGAGCAATTTGCTGCTAATGCTGATGCTGCACTAAGAACAATACAGCAGTCAGCTGCTAAATACTTGGGACCAGTTATTGATGCTATCAACACAGTATTTTATACTTCTCAGGCCTCTGTATCTGCTGAAGCAGCTAGAGCCCAAGAAAAAACTAATAGACAGATAGATCCTACCAACGTTGGTGCTGTTGCTTTAAGTTTGGCCGCTTCTGAAGAGGGCTATAATAAAGCTCTGGATATGTATAAAGAGTCTCTGGATAAGCGTAATAAACTAAAGGCTGAGTTTGATAAACGTATGTCCCAAGCAGATGCTAGTACTGCCGCCGCTATTAGGTTGGTGGGTGAAGGAATGCCTGTTGGGTTAGCTGCTGGGGGATTTGAAGTAGGAGGAGTACGCATAGGTTCTTCCGAAGCTAATAAAAAGTTTGTAGAAGAAACCGCAGCTATGGGGCTACAGATAGCAAGGTTAGGTAAAGAAGTTGATGACTCTACTGAAAACCTTAATGCTTGGAAATCAGCATATCAAGCTGCTGGAGCTGCTGCTGCAAAGGCTAGTCCAGAGTTTCAGAAACAGATTAATCTACAGAGAGATACTACTGATCCTGATGCTGTATACGATTTTAACTCTACTGTATTAAAAGGACTAACTGAACAACAAAAAGCATATGATCAGACTAAGAAAACTGCTAGTGACTTAGCTAATGACTTTCAAAATATAGCTAGTAGCACAGATACTGCGGCTAAAACAAGTGCAACTTTTGAAGAGGTAATTAAAAACATATCGTCTCTATCCGCAGGAACTGGTAAGAGCGCTGATGAGTACGTTAAAAATCTTAACTTAGGGTTTAACACCTTATCTGAGATGAAAACTGCTTCCCAAGCCTTATCCGAGTACGTTAAACTAACGGGTAATGAAACTAAAAATCAGTTAGCAGTTCAACAGAAAATAGCTGATGTATATAATCAAACTAAGGATAAGGAAAAAGCTCAGGAAGCTGGTAGACGTTTAGAACTCCAACAGTTAGAAGAGCAAGAAGCTGCTTTACGCCGTGTTCTTCAAACTAATCAGGGAAATAAAGCTGTTGAGAAAGAAATTGAAAAAATTCAGCTGGAGAAACTTAAACTTACTAATCAGGGTATGGAGGCTCAGAAGAAAGTTAAGGATTATACAGATAAAATTCTGGGTGTAGACCGTGAGATAGCTCTTCTGAATGACCGTACTATGACTAGCACTCAGTATAGATTAGCACAGTTAAAGTTAGAACTAACCATAGAGGAAGAAAAGTACGAGTGGTACTTAAAACAAGCGGATAAACAAAAAGAGGCAGAACAGTCTAGACGTGCTCAAGCACAGATAAGTAGAGAGTTATGGGAAGCGGAGAAACAAGCTACTGCCTCGCATGTATCCGCCCTTATGGATGCCTTAGAGGTTAGCCAAACGCAGAGAAATGTCACTGGTCAGTCCCAGATTCTCACTGAAAGGTTATCTATTCTGCAGCAGCAGCTGGAGCTGTCTAAAGGTAATACTGAAGAAGAAATTAAATATCGTAATGAGATTTATAAAACTTCGGCGGCATTAGAGCAGCTTAGAAAACAGAGAGAGAATCAAACGTACAAATCAGTCATATCCTCACTAGGAGGTACATTCACTCCTACCAATGGATTATCTGGTGATGATAAAGAGTTTGCTGATTTTGAGAATAGAATGTCTATGTATGATCAGGCTATAGCTAAGATGTCAGAAGTGGATTCTGCTTCTACAGCATTGGCTAACAGCATAGGTAATTTCTCCTTAGCAGTGGTGGCTAATGCACAAGATAGCTTGGATAGTATAACAACCATATCTGCAGGTATGCAGATGGTGGGACAGATGATGGCATATTCCGCTAACCAGCAAATAAGTGCGATAGACCAGGCTATTGCAGCAGAACAGAAGCGTGATGGTAAATCTGAGGAATCTAAAGCTAAAATCAAGAAGTTGGAGGCAGAAAAGACTAAGATACAACAGCGAGAAGCTAAAAAGCAAATAATCATATCTACAGCAGTAGCTATGATGAACGCTGCAGCTACCCGTCCGTTCTTACCATTAGGGTTAACGATGATGGCCACTGCGGCTGCTGCAGGCGCACTATCCTTAGCCGCTGCTTCTAGTGCATCCTCTATACCTTCTGTGGATTCTGGAACAAGTACAACTAGTTACCTAACCTTAGGAGAGCGCCAGAAGAATATAGATGTGTCCATGTCTGCTAATGCTGGTGAATTATCTTATATTCGTGGCGATAAAGGCATAGGCGGTGCTAACTCTTTCGTTCCTCGTGCTGAGGGTGGTAATATGTACCCGGGGGTTAGCTATCAAATGGGTGAGCATGGTACAGAAGTAGTTACCCCTATGGTTCCTATGAAAGCTACACCTAATGATGAGCTAAAAACCTCGTCTAACTCAACTTCAGGAAGACCTATCATCCTGAATATTAGTGCTATGGATGCTGCAAGTTTCAGAGAGTTTGCTTCTAGTAATAGTGGTGCTCTAAGAGATGCAGTAGAATTAGCTCTGAATGAGAACGGTGCTAGTCTGAAAACATTAGGAAATTCTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
9b2a5cfc166649930ebde3e3d97c34b2441388b2c794a194cddba06a10b5d0fb
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3120
Evidence 0,3120

Literature

Title Authors Date PMID Source
The novel Salmonella phage vB_SpuM_X5 destroys the biofilm produced by Salmonella and its application in food Jin,X. and Sun,X. 2024-11-22 GenBank