Protein

View in Explore
Genbank accession
XNS48828.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 0,98
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADQNLKQIQFKRTSTENKAPGADIVARGEIVLNTHGRTLAIYTKDEADKVVQLAGKGVPFLDTSGTLNVDGTTTLKDNVTVAPNKSISFETTDLSGEITRHIVGKCATNDGWYIGAGGTSNSGILEIGTIDDGVETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDGSGNTTLPGDLRLGTNKTVKINSGSNLVLEMGVGSNDVYIKNQRGVGVLQLTNDSNLTFRNYQVYYAMGGKGPGKGGTLLTNVENNRQAWQYTISASTATTPRWVKIATIKHPGMGSAQLDLMIAGGIDSGHGRHCVDFITLSGRNLTSWSPNSLDNWVEWRRIGSPSSGNVPAYYVDKNDSATNAEASFDLYAKVPRYANDLFVTVLNTSGYIGQESGTVVIYESGQDTGDTGPSGSIPVSMKQIFDSLSKPDFNDTTGILPINRGGTGGTSAAAARNNLGLGTAAIRDVGEGTGNLLENGAYGLGGNGGKSIENITSNVDMMTRLKAYGGTFWRGAIKSGVSVQNGLYSHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASARVRVYAINNTGLAAGNVNFNELYGTANKPSKADVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTVPNLHASGPGTASVYVNAGTGNAHVWFRTGGNERGVIWANPNTADLGQINIRAKTTGGTSAGDYSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLTSIKNDITAGDNKQVSKAGDTMTGNLTINANLKVENPNGTMVDLGSENSDKYSRITLARKVGDGAAVAMLKVTPEGHVQFGYQDAVATPAPTKYILVKSNGLEVEGDLVFNQTYRGTEEAVDITDKTVDLNGLVIKGTDPGTRQMYKCFSSGGASKITNKPTSDGNFVLEVLSLRKISDTDWSCKQTFTTKNGGVEGTYVRYCQNGTWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGIGEGQTATFGGLNVNGIGTNDPYITFKNGARIREGQGNGIGALILSASSSTDSKYLALRPYGDTSGVDIKVKANGSSEALLEWSYGPGIRSNSSGAFVIYSKAGQALHLRPNGDSASQATVIDQNGKMTIGGEFEAQNSKITGNLNVSEDNRMIVLGKNSDIGLVKKNGMPGKIAISKSNSFTVMASTNTNNQINPADTFNDIFKVDADGNQTVYGNSTISRALTVSSVINANGGIIVPTTKYVQIADAPTQNDQATNKKYVDDKVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGRLTIAGDQLKTTSLWVTGDAAVNGVLTVDGRARFNQEFIVSTSVNVQNTGNTHLVFRKADGTEKGLVWADEPGSVSIRAGGISGKTWNFWNSGSCQFPGAISNYNGISSTTNYPAGQPNGTYSNTAGLVTRFSNGAYASLYFQEYVGNYHQAILNVNGFGRDDNFYFRAGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDNKEDGGMLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKGLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1508 AA
molecular weight: 159060,85260 Da
isoelectric point:6,22668
aromaticity:0,07029
hydropathy:-0,32454

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
4–620
DC_1942 cd19958 DC_0246
DC_1159
STR
450–1040
DC_1159 IPR030392
IPR030392
CHP
1408–1463
IPR030392 Coil
XNS48828.1
1 1508
Architecture
ATT
STR
RBD
ATT 4-620 | STR 621-1040 | RBD 1123-1508
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XNS48828.1
1 1508
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 778 778 0,1144
Central domain 779 977 200 0,2858
C-terminal 978 1508 530 0,7425
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-778
Central
779-977
C-terminal
978-1508

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage vB_KpnM_Biddle_MM4
[NCBI] 		3374978 Viruses >
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XNS48828.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP738796.1 [NCBI]
CDS location
range 78334 -> 82860
strand +
CDS
ATGGCCGATCAGAACTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAACTAGCACAGAGAATAAAGCACCAGGTGCAGATATCGTAGCCCGTGGCGAAATTGTGTTAAACACTCATGGACGCACTCTAGCTATCTACACTAAAGACGAAGCTGATAAAGTTGTTCAGCTTGCTGGTAAAGGTGTTCCATTTTTAGATACTTCCGGTACTCTCAATGTTGATGGAACTACTACATTAAAAGATAACGTTACTGTTGCTCCGAATAAATCGATCAGTTTTGAAACTACTGATTTGAGCGGTGAAATAACTCGACATATCGTAGGCAAATGCGCCACTAATGATGGCTGGTACATCGGTGCAGGTGGTACAAGCAACAGTGGTATTCTTGAAATCGGTACTATTGACGATGGCGTTGAAACCATCCAGTTTGTACAACGCGGTGCGGGCAACGTTGAAGCCCGAAAACTGGTCTTACTTGATGGTTCGGGTAATACTACTCTTCCGGGCGATTTAAGACTGGGAACTAATAAGACTGTTAAAATTAACAGTGGAAGCAACCTTGTTCTTGAAATGGGTGTAGGCTCTAACGACGTCTATATTAAAAACCAGCGAGGCGTAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGATAGCAATCTGACCTTCAGAAATTACCAGGTTTATTATGCTATGGGCGGAAAAGGTCCTGGTAAAGGCGGTACTCTTCTGACTAATGTAGAAAACAACCGCCAGGCCTGGCAGTATACTATTTCTGCTTCAACTGCCACAACCCCGCGCTGGGTTAAAATAGCCACTATAAAACACCCTGGAATGGGCTCGGCCCAGTTGGATTTAATGATAGCTGGTGGCATTGATTCTGGGCATGGAAGACATTGTGTAGATTTTATCACATTATCAGGTCGTAATTTAACATCTTGGAGCCCTAATAGCTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGTAGAATAGGATCACCTTCCTCTGGAAACGTTCCTGCGTATTATGTCGATAAAAATGATTCTGCTACTAATGCAGAGGCTTCATTTGATTTGTATGCTAAGGTCCCTCGTTATGCTAACGACCTTTTTGTAACAGTATTGAATACCTCCGGATACATCGGCCAAGAATCTGGAACTGTAGTTATCTACGAAAGCGGGCAAGATACTGGTGACACAGGGCCTTCCGGAAGCATTCCTGTTTCAATGAAGCAAATTTTTGACAGCTTATCAAAACCAGATTTCAACGATACCACTGGCATTCTTCCTATTAACCGTGGTGGTACTGGCGGTACTTCTGCTGCGGCCGCGCGTAATAACTTAGGCCTTGGAACTGCAGCTATTCGCGATGTCGGTGAAGGCACTGGTAACCTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGTGGTAATGGCGGTAAATCAATCGAAAACATTACCTCTAATGTGGATATGATGACCCGTTTAAAAGCATACGGCGGTACTTTCTGGCGTGGTGCTATTAAATCTGGGGTTAGTGTTCAAAATGGTCTTTATAGCCACGGCTCTGGTATTTTTATGAATGCCGGGGATACGATGTCGGCTATTAATATCGACTACGCCAGTGCTAGAGTTCGTGTATACGCAATTAACAACACAGGTCTTGCCGCAGGAAATGTTAACTTCAACGAACTTTATGGTACAGCAAACAAACCGTCTAAGGCCGACGTAGGGCTTGGTAATCTGACAAACGACACCCAGGTTAAAAAAGCCGGCGACACCATGACCGGTGATTTGACGGTTCCTAATTTACATGCTTCTGGGCCGGGAACCGCATCAGTATATGTTAATGCCGGGACTGGGAATGCACATGTATGGTTTAGAACCGGTGGTAATGAACGCGGTGTAATCTGGGCAAATCCAAATACTGCTGACTTAGGTCAGATTAATATTCGTGCAAAAACTACTGGTGGTACTTCTGCTGGTGATTATAGTTTCCGTTCTGATGGTCGCCTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAACATCACCTCCGGTTCAATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGACTTCTATTAAAAACGACATCACTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGTAAAGCTGGTGACACAATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAAGTCGAAAACCCTAATGGAACGATGGTTGATTTAGGTTCAGAGAACTCTGATAAGTACAGCAGAATAACTCTTGCACGCAAAGTTGGTGATGGCGCAGCTGTAGCAATGCTTAAAGTTACTCCTGAAGGACACGTGCAATTTGGCTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCAGCTCCTACCAAGTACATCCTGGTTAAATCTAACGGCCTTGAGGTAGAAGGTGATTTGGTTTTTAATCAGACCTATCGCGGCACCGAAGAGGCAGTTGATATTACTGATAAGACTGTTGACCTTAATGGTCTTGTCATTAAAGGAACCGACCCAGGTACTCGTCAGATGTATAAATGCTTCTCATCTGGTGGTGCTTCTAAGATAACGAATAAACCTACCTCTGACGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAAATTTCTGATACCGATTGGTCATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAACGGTGGTGTTGAAGGTACATATGTTCGATACTGCCAAAACGGCACATGGTCTGCATGGAAAGAGGTTGTTGCTGGTGTTCAACCGATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCCCGTAATAACCTCGGTATTGGTGAAGGACAAACGGCAACATTTGGTGGATTGAATGTCAACGGCATTGGAACCAACGACCCCTATATCACATTTAAAAATGGCGCAAGAATACGAGAAGGACAAGGCAATGGTATTGGAGCTTTGATTTTATCAGCTTCTTCATCAACTGACTCAAAATACCTTGCATTACGCCCTTATGGTGATACCTCTGGTGTTGATATTAAAGTAAAAGCCAACGGCTCTAGTGAAGCATTGCTTGAATGGTCTTATGGCCCAGGTATTCGTTCGAATTCATCGGGTGCTTTTGTTATCTACTCAAAAGCCGGCCAAGCACTTCATTTAAGGCCAAATGGTGACAGTGCGAGCCAAGCTACTGTTATTGATCAGAACGGTAAAATGACTATCGGTGGTGAGTTCGAGGCCCAGAACTCGAAAATCACAGGCAACTTGAACGTCTCTGAAGATAACAGAATGATCGTTCTTGGCAAAAACTCTGATATTGGTTTAGTCAAGAAAAACGGTATGCCGGGTAAAATAGCCATCAGTAAATCTAACTCGTTTACTGTTATGGCATCAACCAATACCAATAACCAAATTAATCCTGCTGATACGTTTAACGACATATTCAAGGTAGATGCAGACGGAAACCAAACAGTCTATGGAAATTCAACAATTTCTAGGGCTTTGACAGTATCAAGCGTTATTAATGCTAACGGCGGTATTATTGTTCCTACTACCAAGTATGTACAAATTGCCGATGCTCCTACACAGAATGACCAAGCCACCAACAAGAAATATGTTGATGATAAGGTTGCTTCTGCTATTAGTAATGCCGGCGATACCTATCTTCCGTTAGCGGGTGGTACTGTAACTGGGCGGTTAACAATTGCAGGCGATCAGTTAAAAACTACATCACTTTGGGTCACTGGCGATGCTGCTGTTAACGGTGTTTTAACTGTTGATGGAAGGGCTAGATTTAATCAAGAGTTCATTGTATCAACTTCGGTTAACGTCCAGAACACTGGTAACACTCATTTAGTCTTCCGTAAAGCAGATGGTACGGAAAAAGGGCTTGTTTGGGCCGATGAGCCTGGTAGCGTTAGTATAAGAGCTGGTGGTATCTCAGGGAAGACGTGGAATTTCTGGAACAGTGGTTCTTGCCAATTCCCAGGAGCTATTTCTAACTATAATGGAATTAGCAGCACTACTAATTATCCTGCAGGACAGCCTAACGGTACGTATAGTAATACCGCAGGATTGGTAACTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGCTTCGCTGTATTTCCAAGAGTATGTAGGAAATTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAATTTCTATTTCAGGGCTGGCGGCGACTTCTTCTGTACTCGTAACGGTTCTTTTGATAACGTTGAGATTCGCTCTGACCGTAGAGCCAAATCTGATATTAAAGTTATTGAAAACGCTTTGGAAAAAGTCGAGACCTTAAGCGGTAATACGTATGAGCTTCATAATACTTCTGGTGGTACTACTCGTTCTGCCGGGTTAATTGCTCAAGAGGTTCAAGAAGTTCTTCCTGAAGCAGTTACTCAGGATAATAAAGAAGATGGCGGTATGCTTCGTCTGAATTATAACTCAGTAATTGCTCTTCTTGTTGAATCAGTGAAAGAACTTTCGGCTGAGGTCAAAGGTCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
67657a8552a2a775641c0d6dd9c978cadfabd7109bbb2849a9c78760c1def471
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6725
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50