Protein

Genbank accession
AXH68348.1 [GenBank]
Protein name
tail tubular protein B
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect2
Probability 0,74
Protein sequence
MGAVVSQSIPNFLNGMSQQTPTQRGLNQGEDQVNLQNGLVDGLSKRPPLEYVATVDASNIYSNKTKFWNIQRDDANQYIVALYNGGIKVFDLAGNSKTVTIQSGSSYLTSTNPKEHFKLVNIADYTFIANTQTTVTADSTTSAAKVEEFLIVCKLTNYGREYKVALNHPNMAYEHEVVFQLPSGNDASTDSKFRDTNKITDILLNGTSSSHWDSNANGIGFKTIRTDTGATLSSSQGLANYSGISSHFTFEAFDSVIYGKPTGTVSSPNTLADYTISSSDGSGNTAMYAIRDEIQDFSKLPFYGKKDVIIKVTGEEGDTLSDYYVKFTGKSGVWNETIAPATSVGVTNSTMPHALINNNNGTFTFKELDWTDRVCGDSETNANPTFVGKKINNLTFYKNRLGIMSGENLVLTENASFFNFFATTSTQVLDTDPIDIAASGTQVNTLKNSVGFNESLLLFSDTAQYKLDSSGESISPTTAILNEVSSFEHDDKVTPVSAGKFAYFAQARTNNTAIREYFADDDTLTNDGLDISVSVQNLIPSNCHQIVSNTTEDTLVFLSADDADSQTAPYTGTASATNASTMIIYKYFFDGGEKVQNAWSKWTFTGVKIIGVMSRESYLYVLASEGTTTKLFKIDLRNLKDTTIGHGVYLDLKTSVTGSYSSTTDKTTFTSPYGAKTGLIAVDRTDGNNYTATNTSGSTYTIDGNHTSLYIGVPYESKYRLSTPYIRENTGRGLVAITTGRYQIRNVLFNFENSGFFQVEVTPTNRAKSTSIMNGYVIGTASSIVGQPAIASGTLRVPVQAQNTEFVLDIKSSSHLPMYIAGAEVEGYYHNRANRI
Physico‐chemical
properties
protein length:836 AA
molecular weight: 91021,64720 Da
isoelectric point:5,17982
aromaticity:0,10167
hydropathy:-0,31651

Domains

Domains [InterPro]
IPR058003
3–836
IPR058003
AXH68348.1
1 836
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pelagibacter phage HTVC021P
[NCBI] 		2282994 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AXH68348.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MH579717 [NCBI]
CDS location
range 22625 -> 25135
strand +
CDS
ATGGGTGCAGTTGTTTCCCAGTCTATTCCTAACTTTTTGAATGGAATGTCTCAACAGACACCTACTCAAAGAGGATTAAATCAAGGAGAAGACCAAGTTAATTTACAAAATGGATTAGTAGATGGTTTATCTAAAAGACCACCTTTAGAATATGTAGCAACAGTAGATGCTTCAAACATATATTCTAATAAAACAAAATTTTGGAATATACAAAGAGATGACGCTAACCAATACATTGTAGCATTATACAATGGTGGTATTAAAGTATTTGATTTAGCAGGTAATTCAAAAACTGTTACTATACAAAGTGGTTCAAGTTATTTAACTTCAACTAATCCTAAAGAACATTTTAAATTAGTAAATATTGCTGACTATACTTTTATAGCAAATACACAAACTACTGTAACTGCTGACAGTACAACGTCTGCGGCTAAAGTAGAAGAATTTTTAATTGTTTGTAAATTAACAAACTATGGTAGGGAATATAAAGTAGCATTAAATCACCCTAACATGGCTTATGAACATGAAGTAGTGTTTCAATTACCTTCAGGTAATGATGCGTCTACTGATAGTAAATTTAGAGATACAAACAAAATTACAGATATATTATTAAATGGTACATCTAGTTCACACTGGGATAGTAACGCTAATGGTATTGGATTTAAAACTATTAGAACAGATACAGGTGCAACTTTATCTAGTTCACAAGGATTAGCAAACTATTCAGGTATATCATCTCATTTTACATTTGAAGCGTTTGATAGTGTTATTTATGGAAAACCTACAGGTACAGTTTCATCACCAAACACACTAGCTGACTATACAATAAGTTCATCAGATGGTTCTGGTAACACAGCTATGTATGCTATCAGAGATGAAATACAAGATTTTAGTAAACTACCTTTCTATGGAAAGAAAGATGTAATTATAAAAGTAACTGGTGAAGAAGGAGACACATTATCAGATTACTATGTTAAATTTACAGGTAAGTCTGGTGTATGGAATGAAACTATAGCACCTGCTACTTCTGTAGGTGTAACTAATTCTACAATGCCACACGCATTGATTAACAATAATAATGGTACATTTACTTTTAAAGAATTAGATTGGACAGATAGAGTATGTGGAGATAGCGAAACAAATGCTAACCCTACTTTTGTAGGAAAGAAAATAAATAACCTTACATTTTACAAAAACAGATTAGGTATTATGTCTGGTGAAAATTTAGTATTAACAGAAAATGCTTCTTTCTTTAATTTCTTTGCAACAACATCTACACAAGTTTTAGATACTGACCCTATTGATATAGCGGCTTCAGGTACACAGGTTAATACACTTAAAAACTCTGTAGGATTTAACGAAAGTTTATTGTTATTTTCTGATACAGCACAATACAAATTAGATAGCTCTGGTGAAAGCATATCACCTACAACAGCTATACTTAATGAAGTATCTTCATTTGAACATGATGATAAAGTAACACCAGTTTCAGCAGGTAAGTTTGCTTACTTTGCACAAGCTAGAACAAACAATACAGCAATAAGAGAATACTTTGCTGATGATGATACATTAACAAATGATGGTTTAGATATTAGTGTATCAGTACAAAATTTAATACCATCTAATTGTCATCAAATTGTAAGTAATACAACAGAAGACACATTAGTATTTCTTTCTGCTGATGATGCAGATAGTCAAACTGCACCATACACAGGGACAGCTTCAGCTACAAATGCTAGTACAATGATTATCTATAAGTATTTCTTTGATGGTGGTGAAAAAGTACAAAACGCTTGGTCTAAATGGACATTCACAGGTGTTAAAATTATAGGAGTAATGAGTAGAGAAAGTTATCTTTATGTATTAGCTTCTGAAGGTACTACTACAAAATTATTTAAAATAGATTTAAGAAATTTAAAAGATACTACTATAGGTCATGGAGTTTATCTTGACCTTAAAACATCTGTTACAGGAAGTTATAGTAGTACAACAGACAAAACTACGTTTACATCACCTTATGGTGCAAAAACTGGATTAATAGCTGTAGATAGAACTGATGGAAATAATTATACAGCTACAAATACAAGTGGTTCTACTTATACAATAGATGGAAACCACACTTCGTTATACATTGGTGTTCCTTACGAAAGTAAGTACAGATTGTCTACTCCATATATTAGAGAAAATACTGGTAGAGGATTAGTAGCTATTACTACAGGTAGATACCAAATTAGAAATGTATTATTTAATTTTGAAAACAGTGGGTTCTTTCAGGTAGAAGTAACTCCCACTAACAGAGCTAAATCAACTTCAATAATGAATGGATATGTTATTGGTACAGCTTCATCTATTGTTGGACAACCTGCTATAGCTTCAGGAACATTAAGAGTTCCAGTACAAGCACAAAACACAGAATTTGTATTAGATATTAAATCATCTTCTCATTTACCTATGTATATCGCAGGTGCAGAAGTTGAAGGCTATTATCATAACAGAGCAAATAGGATTTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
16cdf4f14bf9ced5956037e05bd5b6469333315245e9978eeb6294c071d1ceac
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,8803
Evidence 0,8803
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Pelagiphages in the Podoviridae family integrate into host genomes Zhao,Y., Qin,F., Zhang,R., Giovannoni,S.J., Zhang,Z., Sun,J., Du,S. and Rensing,C. 2019 30474915 GenBank