Protein

Genbank accession
YP_010070348.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,62
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,89
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYNNRFWAATDNIPKPAGNFNRIRWKALRTDAVYTTVSSGPYQLKSGEAISVDTSVGNDIEFTLPPSPLDGETVIIQDIGGKPGINQVKINSSNQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQMIFIFNNRLWQMYVADYSREAAIVTPSTAYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNASTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDLIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNTGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRRATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWGHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTESQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLIRGFVKTSSGSLTFVGNDTVGSTQPLESYEKNGYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLGAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSGESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGAIPSDNGIIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140218,73520 Da
isoelectric point:5,55683
aromaticity:0,07292
hydropathy:-0,34445

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
979–1092
IPR048390 IPR048391
YP_010070348.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_G4498
[NCBI] 		2502301 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010070348.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_054918 [NCBI]
CDS location
range 148873 -> 152742
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGACCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAGCAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATAATAATCGTTTTTGGGCAGCAACGGATAATATTCCAAAACCTGCTGGAAATTTTAATAGAATTCGTTGGAAAGCATTACGTACTGATGCCGTATATACAACCGTATCATCTGGACCATATCAATTAAAATCCGGAGAAGCAATTTCAGTAGATACATCAGTTGGCAATGACATTGAGTTTACTTTACCACCTTCTCCGCTTGATGGAGAAACCGTAATAATTCAAGATATCGGTGGAAAACCTGGCATAAATCAGGTTAAAATAAATTCTTCAAATCAGAGTATTGTCAATTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTTTTAATGACTCATCCAAAGTCACAGATGATATTCATTTTTAATAATCGTTTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGCGATTGTTACTCCATCGACTGCGTATCAAGCACAATCTAATGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAACTGAATCCACTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGACGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCAAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTCATGGTATTTGGCGCGAATAATGGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTAACAGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGACTCTTTAAATGCTTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCAAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTGGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACTGAAACTCGCAGAGGTATTGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTAAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCAGATGACCTTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTCGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATACAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGCGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACACCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGCGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGCGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAGAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGGCCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACCGAATCGCAAGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCAACTTGGGCAGCAACTACTCTGATAAGAGGGTTTGTTAAAACTTCTTCTGGTTCATTAACGTTTGTTGGTAATGATACGGTAGGTTCAACACAGCCATTAGAATCATATGAGAAAAATGGTTATGCAGTATCACCATATGAATTAAATCGCGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTCTAGATTCGCTCCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAAACAGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGGGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACATTCGGTGGATCAGTTTCAGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACGGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACAAACCCGGCTCAAACGATGACAGTCAGAGTGTGGGGAAATCAATTTAGCGGGGAATCAGACACAACACGTTCTACCGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACGTCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGTAATAAAGCTGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACACCGATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGTGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAACGGAAATTATGGTTTCATTGTTCGCAATGATGGATCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGCGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAGGGCACTAAAACATCTGATTTATACACCCGCGCTCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACCCCAGAAGCACGTACCACTCGCTGGACGCGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAACCTTCGGATATAGGAGCAATCCCATCTGATAATGGAATAATAGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
b1f30ced8babd002bd51454f24e836c6eb77777bb35ff0819b30ccbedaed9adc
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2301
Evidence 0,2301
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Still something new to discover - new insights into E. coli phage diversity and taxonomy Korf,I.H.E., Adriaennsens,E., Dreiseikelmann,B., Kropinski,A., Nimtz,M., Meier-Kolthoff,J.P., Rohde,M., van Raaij,M. and Wittmann,J. 2019-05-17 — GenBank