Protein

Genbank accession
AIX14269.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSPWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTAARLASSRQITLGGDLDGSAIFDGSTNITISADLDLVPTLPHYDGTNTSSATYTKVVVDSKGRITNASSPTSLSEYGLDGTVEGQSAQAYDLDLAAIAGLTTTGIISRTSGGNMQTRTITGTATRISISQGAGISGNPTIDMITTAVTAGDYNTESLTSVSGAGSNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSSTNVPIATATEGSKYAAYAGGTTYVRYDIIEDSSRVYQSITGIAAGGGAPTHTDASDAGGWRYLGAAATEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRIGFADGNTVENFELDQELTATTGYRGFNYLNYFKVNDTSGNLLVGANNTGDSGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGDVNQTLDKTGDGNLFLQLTQNSATARTFSILSTNSGSGAANIVVAATDLVDIQASDAAGKVYVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAVAGTVRVWGNLQVDGTTTTVNSSTLQVDDPIITLGGDTAPVADDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLAGHGGGYSFLHAATNTAEVFTGTASGIIAGNVKLTSGTASSSNTTGDLVVAGGVGIAGAVNIGGLLDVDSTFRANSTSRFDDNMVIQGASKTLQINNGSGTTKIEFQSTTGNAIIGGVTDVTGNFNVNTNKFNVVAASGNTSIAGTLGVTNIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITTAKNSETGVWEIQSSDYGSLRVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATEAESRLNWLRVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTLRAHGGAGIERTLHVGGTGSGEGLFVGKRYNSDTVKFSVLGASGDTEIQGTLLVEDNVNFNGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNLTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQVNDTLGVSDVVTFTRNTEQTLTGSYAADGAFRLTGGAGIARNLAVGGDARVYGATELTGALDLNNNANISGTLLQGGGATFLSNVEILAGVGGATKFQVVSATGNTDIRGTLDIGGDVTAESNLTITGNLTVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDGSAKIGFFGYDRSANQFAFLTSASNSSEVLSGTDGPLRAGSLNLTGAGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVASGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALRTARTITVDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMTGTGLVTRTADNTYARRTLAVTASSGITLTNADGVSGNPTINVASTASNSANNLVLRDASGDFAAGTITAALVGNVTGQTSDISNHDTDALSEGSTNLYFTNERVDDRIDALVQASTGITKVYDDTAGTYTLSVTQADVNTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGVGVELSGAGALSVTQADIDTDNVTEGSTNVFYTEARFDASLAGKNTANLAEGTNLYYTDARADARIAAADTDDLSEGSTNLYHTSARADARVNLQTGANLDLSSKSTSDLSEGTNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLTNLATTTTLTLNLSGDPTPGAAVTTSVTNGGGGGFVAGTAVATTGGTGSSLTVNTTVVNGIITAAAVNAGGSGFLVNETVTVANANAGKVLSLNLASLAGGSNYVTGTALATTGGSGSASLTVDITASAGAITNVTINDGGTGYVVGETITIVQPTGLDGSNPGAGGTVNVATVATDATLQLTDVTTMEIGATVTGATSGTTGVITALAASAITVDTVDGFFKVGEVVSANDVTTLTVQSFA
Physico‐chemical
properties
protein length:2007 AA
molecular weight: 204345,44250 Da
isoelectric point:4,18894
aromaticity:0,05780
hydropathy:-0,09043

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
4–242
SSF69349
IPR041352
5–43
IPR041352
AIX14269.1
1 2007
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014a
[NCBI] 		1493507 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX14269.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019026 [NCBI]
CDS location
range 84617 -> 90640
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGGAGGGGTGGTGCTCAGGAATGGGCGAACGCGAACCCAACTCTCGCTCAAGGCGAATTGGGAATCGAACTTGATACTGGACGTTTCAAGATTGGTGATGGCGTTTCTCCCTGGAATACATTACGATATGAACGTCCTGTTGAATCTACTTCAAACACAGCAAACACTCTTGTGCAAAGAGATGCTGATGGTAATTTTTCAGCAGGTACAGTTACTGCAACATTAATTGGTAATGCTTCAACTGCTGCTCGTCTTGCATCATCTAGACAGATTACTCTTGGTGGTGACCTTGACGGATCTGCTATCTTTGATGGTTCAACAAACATCACGATTTCAGCAGATTTAGATTTAGTACCAACACTTCCACATTATGATGGTACTAACACGTCAAGTGCAACATATACAAAAGTTGTAGTTGATTCTAAAGGTAGAATTACTAATGCATCTTCACCAACCAGTCTTTCAGAATATGGTCTGGATGGAACAGTAGAAGGTCAATCAGCACAGGCATATGATCTTGACCTGGCAGCAATTGCAGGTCTTACCACCACGGGTATTATTTCCAGAACTTCTGGCGGTAATATGCAAACCAGAACTATTACTGGTACTGCAACTAGAATTTCTATCAGTCAAGGTGCTGGTATTAGTGGCAACCCAACCATTGATATGATCACTACAGCAGTAACTGCTGGAGATTATAATACAGAATCACTAACATCAGTTTCTGGTGCTGGATCTAACTCAGAACCATTTGGTACAGAAACTGTAAATGCTACAAAATTTACAGTAGATGCCTATGGCAGACTGACAAGTTCAACAAACGTACCTATTGCTACTGCTACCGAAGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGGAGGTACAACATATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAGAGTATATCAATCAATTACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCACACTGATGCTTCAGATGCTGGTGGGTGGAGATATCTCGGTGCAGCAGCAACAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGACATGTAACTATTGCTGCTGTTGGTGTAGATAATACACAATTACAAAATAATCGTATTGGTTTCGCTGACGGTAATACCGTAGAAAATTTTGAACTGGATCAGGAACTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATTTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACAGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTATTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGACGGCGATGTTAATCAGACACTGGATAAAACTGGGGATGGTAACCTTTTCCTTCAACTAACTCAGAATAGTGCAACTGCTAGAACCTTCAGCATTCTTTCTACAAATTCTGGTTCTGGTGCAGCAAACATTGTTGTTGCTGCAACTGATTTAGTTGATATTCAGGCAAGCGATGCAGCAGGTAAGGTATATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTTGATCCTGGTGATGACCGTGCTGTAGCTGGTACTGTTCGTGTCTGGGGTAACCTCCAGGTTGATGGAACTACTACAACAGTAAATTCATCGACTCTACAAGTTGATGACCCTATCATTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCAGTTGCTGACGATAATCTAGATCGTGGTATTGAATTTAGATATTACGATACCGAAGCACGTCTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTATACCGACTTAGCTGGTCATGGTGGTGGTTATAGTTTCCTCCATGCTGCTACAAATACTGCTGAAGTTTTTACTGGTACTGCTTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACATCTGGCACTGCATCTTCTTCCAATACAACTGGCGATCTGGTTGTTGCTGGTGGTGTTGGAATCGCGGGTGCAGTTAATATTGGTGGTCTATTAGATGTAGATAGTACATTCCGAGCAAACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAACATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAAATTAATAATGGTTCTGGAACTACGAAGATTGAGTTTCAATCAACAACTGGTAATGCAATTATCGGTGGTGTAACTGATGTAACTGGCAACTTCAACGTCAATACTAACAAGTTCAACGTTGTTGCTGCTTCTGGTAACACTTCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAACATCGCTACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCTGAAAGCACTAACGATATTACCACTGCTAAGAACTCAGAAACAGGTGTATGGGAGATTCAGTCTAGTGACTATGGATCTCTGAGAGTTGATGGTGGTGCATATGTTGCAGGATCTGCTCTAATTGATGGCACACTACACGTTAATGGTGCGATTGAAGTTAAGGATAGCGCGACAGAGGCAGAATCGAGACTGAACTGGTTGCGTGTCAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGATTCTTATCAGGCAACTCCCTCCTATGCATCTCACAACACTACAACTCTGAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGAACCCTTCATGTTGGTGGTACGGGATCTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACAATAGTGATACTGTTAAGTTCTCTGTTCTGGGTGCATCTGGTGATACAGAAATCCAAGGTACGTTGCTTGTCGAAGATAATGTAAATTTCAACGGCACTCTGGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACGACGGATAAATTCTTCGTTGATAATTTAACTGGCAATACCGATATCCAAGGCACACTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTCAGCAACGCTGTAACATTCGATCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGCACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAGCACGGACAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTTCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGCAACACAAATATTATCGGTACATTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGGTTAATGACACCTTGGGTGTATCTGATGTTGTAACCTTTACTAGAAATACCGAGCAAACTCTGACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGGTATTGCTAGAAATCTTGCTGTTGGCGGTGATGCTAGAGTCTATGGTGCTACCGAACTTACAGGTGCTCTCGACCTCAATAATAATGCCAATATTTCAGGAACACTCCTACAAGGTGGTGGTGCCACATTCCTTTCTAACGTTGAGATTTTAGCAGGCGTTGGTGGTGCTACTAAGTTCCAGGTAGTTTCTGCAACTGGCAATACTGATATTCGTGGCACTCTAGATATCGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAACCTTACTATTACAGGAAATCTAACAGTCAATGGAACAACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAACAACTAACGACGGTAAGGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAATTGGTTTCTTCGGATACGACAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCTTAACAAGTGCAAGTAACTCATCAGAAGTTCTTTCTGGAACTGATGGTCCTCTTCGTGCTGGTAGTCTTAATCTTACTGGTGCTGGTACATCACTTGATGTTGATGCAAACGCAAATATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATTTCTCAGGTTGCTTCTGGTGCTGCTCTGGTTATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTCAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTGAGGACTGCAAGAACAATCACTGTTGATGGTGTTGTTGATGGCAGTGTATCATTTAATGGTTCTGCCGATGTAACTATCAGCACTACCTACAATGATGCAGATATCACTGCACTTGCTGCAATGACAGGCACTGGTCTGGTAACAAGGACTGCCGATAACACTTATGCACGACGCACACTTGCTGTCACAGCATCCTCTGGTATTACACTGACGAATGCTGATGGTGTTTCTGGTAACCCAACAATTAACGTTGCTTCCACAGCAAGTAACTCAGCAAATAACCTTGTTCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCTGGAACTATTACTGCAGCATTAGTTGGTAATGTCACTGGTCAAACATCTGATATTAGTAATCATGATACCGATGCTCTTTCAGAAGGTTCTACCAATCTTTACTTCACTAATGAGCGTGTTGATGACAGAATCGACGCACTGGTACAAGCAAGCACTGGTATTACTAAGGTATATGATGACACAGCAGGCACCTATACACTCTCTGTAACGCAGGCAGACGTTAATACTGACAATGTAACAGAAGGTTCCACAAACCTCTTTACAACCGCTGCTAGGACCCGCACACACTTCACATACGGAGTAGGCGTAGAACTTAGTGGTGCAGGCGCTCTGAGTGTCACTCAGGCAGACATTGATACCGACAATGTAACTGAAGGTTCTACGAATGTCTTCTATACTGAGGCACGCTTTGATGCAAG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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
1322429ff859caf0c4d55dd94d90a7a7cfb9e8f75865911295ae8535c50080c3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5263
Evidence 0,5263
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank