Protein

Genbank accession
QHJ74674.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,63
Protein sequence
MNFINLSSQQAPNDVDWAGLVNSGVQGVLIRLGHGIIRDPCASGHIAKAKQYGLYWHGYHTYEGVVNEPQFTIKNATELGLSTSQYYFVDLTKSSDPFNDYYALHATWLSQGYSTGLLISNDDYLSKFTDSEVTASGTLRWLISDTEPANYDVWQYSSEGMVGTSSAKVGLNFAKTDKLKYNLNTTLTGADINKDPYNPQTPVGGAYIGWGYDTTGLGGGKTIGYSTNGENFYALIGPNGLVVRKSDGNRIYGTIADQIDSAISANVIPAKSAADSAVAYANDAIKKSRVNSQAIDDINSAVSDAVSDAAVARSDGLRAWNAAQSNVNLIDLNYASASAAISSARTEAIAAADEAKSSASVAQAGVVAVKSDVAAVQADVTATRSDVAVAKSDIADTKTTLEQTASGLNSKISGVETSLADTTSALSDAKTALTSDVADAKKLANTAQATADNAVKSASSVADDLTAVASQAKANTNGITKVTSDVGLLQTTVANNTGDISTIQETAKQIQQSVSDNAGNITVAKQTADSAVAVASDAKSNATVAIQTASQASITAQNASGQAASAVITANGAMTTASDAKSNATVAVQTASGASLTATNANSDATVAKQTASEAKVQASNAESDFAQLSIRANKIEANVADNSGAIASVQQTANGLTTTVGNVDNRVKKIEDNTNWTTKTGTLDMDTLTTTQNIYYRDTNLKNADGEAGWAYIQVVSTGERVTQTVWHDRSSIQHTRTGAIDGSTYDWDAWNQSATNSQVAEVKQTVDGITTTVSNIQGDVSQLKVSASSASVALSDAAGNISNLQATAKSFSAALSDTNSNVASVTATASELETKYADAANDISQIKTDAKGMTQTISNAQGDIAKLKTRADGFDAEFATANGNISKLQTDATGTTQTLANTKSDVAVLQSRADGLDTKYANAAGDINTLKANASGISQTLTNSQGDISTLKSTVSGVQTTLTDAQGNISTLQSDVSGLKKTTSDNAGNISTLQATAKTLTSQMSGAQGDISTLKQTASDFSSKVSGMETSLSDANSKINGITSNGGGRNLLQGTGTASGDVAGGNGTFAQGAFNGYDAVKTNGCWSEHYLDLKSALGRTNAKAGDWYTISVYVKADKQIDTGSLDVYRALGNVDANTNDGHLDPILMPNKPITTQWQQYSWSFQINNVSLQRQNTRVEYNFDTGDNWIYWAGWMLENGTVSHDWSPAPEDTDAKITANTTAIEQNKQAIALKADQTTVDKTNGTVQQLQSQLQVQAGQIASKVSSSDLDAKGYATQTYTQTQIKQTSDSWNANLASVKDGLTQSYTNLSATVNGLTTTVGNVDDRVKKIEDNTNWTTKTGVLDMNTLTTTQNIYYRDTNLKNADGETGWAYIQVVSTGERVTQTVWNDRSSIQHTRTGAIDGSTYDWDAWNQSATNAQVTAIKQTVDGIQTQVYNSDGSSKITQLSNLIATKVSSDDFNNLSKSVNLQTLDSADINNMKTNGHYFVHNLANNPIGGWVYVDVTGNGNDRIRQDVYQDSGIGHKYRRLFGTYWTNWEEGATYTEINQLQDAINLRVTKGDLISQINLQAGTALIQSNKLVLDAGTTVITGEAFIPSAAISSISADKVTIGSSSLYNSDGTLNLVNSKDGTTSKITVTQGNVDFDGIEKNASVIHFASDNNTNAFTITPVGATVTPTLFFERFDQTPGHWLGFTRNETEHEGVMFHTWDDDGERFFVDCHARFDKNLRTLGTLSQGSWDGTTAKPEAGVLTIKNGNTIWSGSNFLAIGDNLSNSYTNVMAKSFSQQSTLSSKTNIEEVDPKDALDLVNRTDIRSYQYTSDVEQGKTKRYTSLILDDVHDVSQYYAPDEFANEERTGRDDGSAVGYLFLAVKELTRRIKNLEEKLNG
Physico‐chemical
properties
protein length:1887 AA
molecular weight: 200274,33510 Da
isoelectric point:4,78689
aromaticity:0,06624
hydropathy:-0,41150

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:3.20.20.80
1–184
G3DSA:3.20.20.80 Coil PTHR34707 cd19958 IPR030392
IPR017853
4–177
IPR017853 SSF57997
G3DSA:1.20.5.340
814–898
G3DSA:1.20.5.340 G3DSA:1.20.5.340
Coil
831–851
Coil
QHJ74674.1
1 1887
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage JNU_P1
[NCBI] 		2686379 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QHJ74674.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN830252.1 [NCBI]
CDS location
range 17335 -> 22998
strand +
CDS
TTGAACTTCATCAATCTGAGCAGTCAACAAGCACCAAATGATGTTGACTGGGCCGGGCTGGTAAATTCTGGAGTGCAAGGCGTTTTAATCCGGTTGGGGCATGGGATCATCCGTGATCCGTGTGCCAGCGGACATATCGCCAAAGCCAAACAATACGGACTTTACTGGCACGGTTACCACACCTACGAAGGTGTAGTTAATGAACCACAATTTACGATAAAAAATGCAACCGAATTAGGGCTATCCACCAGCCAATACTACTTTGTCGATTTAACCAAGAGTTCCGACCCCTTCAATGACTACTATGCCTTGCACGCCACTTGGTTAAGCCAGGGTTACTCAACTGGACTACTGATCAGTAACGATGATTACCTATCCAAGTTTACGGATAGCGAGGTGACCGCTAGCGGGACCCTCCGTTGGTTAATCAGTGACACCGAACCGGCTAACTACGATGTATGGCAGTATTCAAGCGAGGGGATGGTCGGAACCAGTAGCGCGAAGGTCGGCTTAAACTTTGCGAAGACCGACAAGCTCAAATACAACCTGAATACCACTCTTACAGGGGCTGACATTAACAAAGACCCATACAACCCCCAAACACCCGTCGGTGGTGCCTACATTGGTTGGGGATATGACACAACGGGACTCGGCGGTGGCAAAACTATCGGTTATTCGACCAATGGGGAAAACTTTTACGCCTTAATTGGTCCCAATGGGCTGGTTGTGCGCAAGAGTGACGGTAATCGGATCTATGGAACAATTGCTGATCAAATTGATTCGGCAATTAGTGCTAACGTGATTCCCGCCAAATCCGCTGCTGATAGTGCCGTAGCATATGCCAACGATGCAATTAAAAAGTCGCGAGTCAATAGCCAGGCAATCGACGATATTAACTCGGCTGTAAGCGATGCCGTTTCGGACGCTGCGGTTGCCAGGAGTGATGGCTTACGGGCATGGAATGCCGCGCAGTCAAACGTCAATTTAATTGATCTAAACTATGCGTCGGCCAGTGCGGCGATCTCAAGCGCTCGTACCGAAGCAATTGCGGCGGCTGATGAGGCTAAATCATCGGCGAGTGTAGCACAAGCTGGTGTCGTTGCCGTGAAATCAGACGTAGCAGCGGTTCAGGCAGACGTGACCGCCACACGGTCAGATGTAGCGGTAGCCAAGAGTGATATTGCTGATACCAAGACCACACTTGAGCAGACTGCATCGGGCTTAAACTCTAAGATAAGTGGCGTGGAGACTAGCTTAGCCGACACGACCAGTGCCTTGAGTGACGCTAAGACGGCGCTAACCAGTGATGTGGCGGATGCTAAAAAACTAGCTAACACCGCCCAAGCAACAGCTGACAACGCTGTAAAAAGTGCCTCTAGCGTGGCAGATGATCTAACGGCGGTAGCAAGCCAAGCAAAGGCCAACACAAATGGGATCACGAAGGTAACGTCTGATGTGGGATTATTACAAACCACAGTGGCGAACAACACCGGCGACATTTCAACAATTCAAGAAACAGCGAAGCAAATTCAGCAATCTGTTTCTGATAACGCCGGTAACATCACGGTGGCCAAGCAAACCGCCGACAGTGCTGTTGCGGTAGCTAGTGATGCTAAGAGTAATGCGACGGTAGCTATCCAAACAGCGTCACAAGCTAGCATTACGGCACAAAATGCAAGTGGCCAGGCGGCAAGTGCTGTAATCACAGCTAACGGAGCAATGACCACCGCTAGTGATGCCAAAAGCAATGCCACAGTAGCGGTTCAAACAGCAAGTGGAGCAAGCCTAACGGCAACTAACGCCAATAGCGATGCCACAGTTGCTAAGCAAACCGCAAGCGAGGCCAAAGTCCAGGCGTCAAACGCCGAAAGCGACTTCGCTCAGCTCTCAATCAGAGCTAACAAGATCGAGGCAAATGTTGCCGATAACAGCGGGGCGATCGCAAGCGTGCAACAGACCGCGAACGGGCTGACAACTACGGTAGGTAATGTCGATAATCGAGTTAAAAAGATTGAAGACAATACCAACTGGACGACTAAGACCGGTACGCTTGATATGGACACGTTGACGACTACCCAGAATATCTACTACCGGGACACTAACCTAAAGAACGCCGATGGTGAAGCCGGGTGGGCGTATATTCAAGTGGTAAGTACGGGCGAACGGGTCACACAAACCGTATGGCACGACCGCTCGAGTATCCAACACACACGAACAGGTGCCATAGATGGGTCAACATACGACTGGGACGCCTGGAATCAATCTGCTACTAATTCACAAGTGGCGGAGGTTAAACAGACCGTTGACGGAATTACAACCACGGTCAGCAACATCCAAGGTGACGTTAGCCAACTCAAGGTATCGGCAAGCTCAGCCAGTGTAGCCTTGTCAGACGCGGCCGGTAACATCTCTAACCTTCAGGCAACGGCCAAGTCGTTCAGTGCGGCGTTGTCGGACACTAACAGCAACGTTGCTAGCGTGACTGCAACAGCGAGCGAACTTGAAACCAAGTATGCTGATGCTGCAAACGATATCAGTCAGATCAAGACTGACGCTAAGGGCATGACACAGACAATTAGCAACGCACAAGGCGACATCGCCAAACTCAAGACGCGCGCCGATGGTTTTGACGCTGAGTTTGCGACTGCAAATGGTAATATTAGCAAACTCCAGACGGACGCAACTGGTACTACGCAGACACTTGCTAACACCAAGAGTGATGTGGCTGTATTACAGTCACGGGCTGATGGCCTTGACACCAAGTACGCCAACGCGGCTGGTGATATTAATACACTTAAGGCGAATGCTAGTGGTATTAGCCAAACGCTTACCAACTCGCAAGGTGATATATCCACACTTAAGTCTACGGTGTCCGGCGTTCAAACTACGTTGACCGATGCGCAAGGCAATATCTCTACGCTCCAATCGGACGTGTCGGGGCTAAAAAAGACGACAAGTGATAACGCAGGCAACATCTCCACGTTACAGGCTACCGCCAAGACACTGACCAGTCAGATGAGCGGTGCGCAAGGTGACATCAGCACACTTAAACAGACCGCATCGGACTTTAGCTCTAAAGTTAGCGGTATGGAGACGAGCTTATCCGACGCCAACAGTAAGATTAATGGCATCACCAGTAATGGTGGCGGACGGAATCTGCTACAAGGGACAGGTACGGCAAGCGGTGATGTTGCCGGCGGTAACGGTACTTTTGCCCAAGGTGCTTTTAACGGTTATGATGCGGTTAAAACTAATGGTTGTTGGAGTGAGCATTATCTTGATCTTAAATCAGCCTTAGGCAGAACAAATGCTAAAGCGGGTGACTGGTACACAATTTCCGTTTATGTAAAAGCAGATAAACAAATTGATACTGGTAGCCTTGATGTATATAGGGCGCTTGGTAATGTTGATGCTAATACTAATGACGGTCACCTTGACCCTATCTTGATGCCAAATAAGCCTATAACAACACAGTGGCAACAATATTCTTGGAGTTTCCAGATTAACAACGTTAGTCTTCAACGACAGAATACTCGTGTTGAATACAACTTTGACACTGGAGATAACTGGATATATTGGGCTGGATGGATGCTCGAGAATGGAACTGTTTCCCACGACTGGTCACCAGCTCCGGAAGATACCGATGCTAAAATCACGGCCAACACAACGGCGATCGAACAAAACAAGCAAGCCATTGCACTCAAAGCCGACCAGACAACGGTTGACAAGACCAACGGAACTGTTCAACAGTTGCAGTCACAGCTTCAAGTACAGGCTGGCCAGATTGCGTCTAAGGTATCGAGTAGTGACCTTGATGCTAAGGGCTATGCAACACAAACGTACACACAGACGCAGATCAAGCAGACGTCTGACAGTTGGAACGCCAACCTGGCTTCGGTCAAGGATGGTCTGACGCAGTCGTATACCAACCTGTCGGCAACAGTAAACGGTTTAACAACGACGGTAGGCAATGTCGATGATCGAGTTAAGAAGATTGAAGACAATACTAACTGGACGACTAAGACCGGTGTTCTTGATATGAACACACTGACGACTACCCAGAATATCTACTACCGGGACACTAACCTAAAGAACGCCGATGGTGAAACCGGGTGGGCGTATATTCAAGTGGTAAGTACGGGCGAACGGGTCACACAAACCGTATGGAACGACCGATCGAGTATCCAACACACACGAACAGGTGCCATAGATGGGTCAACATACGACTGGGACGCCTGGAATCAATCTGCTACTAATGCACAAGTAACGGCGATAAAACAAACCGTTGACGGTATCCAGACACAGGTATACAACTCTGACGGCTCGAGCAAAATCACTCAGCTATCAAACTTGATTGCGACAAAGGTATCGAGTGACGATTTTAATAATCTAAGCAAGTCTGTGAACTTGCAGACGCTAGATTCGGCCGATATTAACAATATGAAAACCAACGGGCACTATTTCGTTCATAACCTAGCTAACAACCCAATTGGTGGCTGGGTTTACGTTGATGTAACTGGTAACGGTAATGACCGAATTCGCCAGGACGTTTACCAAGATAGTGGAATTGGACATAAATATCGACGTTTGTTTGGCACTTATTGGACCAACTGGGAAGAAGGTGCAACTTATACTGAGATTAATCAGCTTCAAGATGCCATCAACCTGCGAGTTACCAAAGGCGACCTGATTAGTCAAATCAACCTGCAAGCGGGGACAGCTTTAATTCAATCAAACAAGCTAGTTCTTGATGCCGGGACAACCGTCATCACAGGCGAGGCGTTTATCCCGAGTGCGGCGATCAGCAGCATTAGCGCGGATAAGGTCACGATAGGTTCGTCGTCACTGTACAACTCTGACGGAACATTAAATCTAGTCAATAGTAAAGATGGGACTACCTCCAAAATCACGGTAACACAAGGTAACGTTGATTTCGACGGAATAGAAAAGAACGCGTCCGTCATCCATTTCGCAAGCGATAATAATACAAACGCCTTTACCATTACGCCGGTTGGTGCAACGGTCACACCGACACTTTTCTTTGAGCGATTCGATCAAACCCCCGGGCATTGGCTTGGCTTTACTCGAAACGAAACAGAACACGAAGGTGTTATGTTCCATACGTGGGATGATGATGGTGAGCGATTTTTCGTTGATTGTCACGCGCGATTTGACAAAAACTTAAGAACGCTTGGGACCTTGTCTCAAGGGTCGTGGGATGGCACAACTGCAAAACCTGAAGCCGGAGTTTTAACGATCAAAAATGGTAACACGATCTGGTCGGGGTCAAACTTTCTGGCGATTGGTGATAATCTTAGCAATTCCTATACTAACGTGATGGCTAAGAGCTTTAGTCAACAGTCCACGTTGTCGTCCAAGACCAACATTGAGGAAGTAGATCCGAAGGACGCACTTGATTTGGTCAACCGTACTGACATCAGATCGTACCAGTACACATCTGACGTGGAACAAGGCAAAACTAAGCGCTACACGTCACTAATCCTCGATGACGTGCATGATGTAAGCCAATACTATGCACCGGATGAATTTGCTAATGAGGAACGGACAGGCCGTGACGATGGTTCAGCGGTTGGCTATCTCTTTTTAGCAGTTAAGGAACTCACTAGACGAATTAAAAATTTGGAGGAAAAATTAAATGGATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
8865c206d63a69099b65e8a478818b0e813ef45ff106ae840a8e172401da2d74
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5868
Evidence 0,5868
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Identification, characterization, and phylogenetic analysis of eight new inducible prophages in Lactobacillus Pei,Z., Sadiq,F.A., Han,X., Zhao,J., Zhang,H., Ross,R.P., Lu,W. and Chen,W. 2020 32450182 GenBank