Protein
View in Explore- Genbank accession
- UNY40319.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MPIINPNIQQLNSNIPDDLIFSGVDYPAAIAARDVFFVANPARKIDRLYVILEETNTHSIKYQQYILVSDTWVDMTSVVKGETGRTGDQGVQGPQGPVSLLWKENFDLLVNYVENDGVFYNGSSYRCIAPTTGNAPTETIYWALIAQKGNIGDEGPVGPIGPVGPMPINWKGLYSGLSAYAINDGVQYQNSSYRAIVANTDVLPIDPTTWELLAKKGNDGTDGEAGLNFLGEYSEFESYVPRDAVTFEGSCYICKLATTGHEPTQAVWWDLFTAKGQDGILFDFLGGYDPEYQYQLYNLCTYQGSTYGCNNEFGSLGHAPPDVDYWYVIASKGDTGVSGINVKGIYSNSTAYVPNDLVTYLGNSYVCTAGNTGSLPTDINYWALFVAQGAQGDIGPAGPVGMTWKNTWSNILPYNKDDVVYYNKSSYIALKDSINVQPATDETSWALVAAKGELSALEDRFALDATTEYTIGNVISYQGIRYCCRIDHTTDTVPTFIPSNWVPMSVGMVGATATESGTKGLVPIPESTFQDAKLVGSGEWDKTGRKTLVTLENFVANATMDPLTTVDVCEVIAIPQATSGITISIPNPTENTKVRKLIFINTGSTSFSLSTGHTVYAGKWIELYWALALQTWETYVGDTKIYDQANAYQAYDRCILGNITVYANAAIPANTVFAWGTSGATWAPVLPVGYIWKGPYTASTNYITGDIFTQSSVISASFFRVSSPFTSTTSFGTDVTTNGGVAVEKVSAYGWGLSSSSSLAVGATATANGRFGSPRRASIGEQDATLKGDNTWDRTGRGAYKALSNYTVDTTLPAVDTTSISEYLSIPQTTAGINITLPTPQIVNVTRRISIANTGTVDFTVNTVKVKVDQVATFIWVTNGSKWYQQAGGASLTTNDLAYGNAKAQPTNDTYTTSYALAATTATTVTCGATASGVTSIGWTTGQLKFTVLQAGKYKISAGSTITASAVNWGRTIITVSGVVKSQSPNEWVSTANAGVSSETETILDLAVNDVVECKAYSQNSGYMQGGYLTIEQLPVATLVDPELLSPETLSYLKMDSGLTGQTITNTTTNITFSNPLIDIGTNILYSNGIISFKGGARYKLTFAHSFIQPPSGGYFYYKFWDVTNSQFIGNAGGGDTVNSASTTIPASMISLDLDLTSLPVASTRQISVRSSATNGSTIVGNSSHGSPWFCAEQMPTSFVVSVDPESVLGSAIEYGYYRWSASQSITLSVQDINPDSTISGTIPNSNGVFSLTGGKTYEIEMGLYATWTGAGVTSISLVDAGTNTQISGSPTFSLNAVSGGNNSGDPAWKFIYTPATNQTVKFRTNDSTLSCTIFATRSWVSIRQLPTATIIDKTVTATNDQANAGYFDIGNMRYQWGESLVNSANPVVVTLPAPFKNASYAVNSTMLTGNDTAVALTAATRDRTTTTFLVKKTYNTSGTFGFASEGFTWIAIGLKP
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1457 AA molecular weight: 156007,04880 Da isoelectric point: 4,70527 aromaticity: 0,10776 hydropathy: -0,08950
Domains
Domains [InterPro]
DC_0876
STR
54–165
STR
54–165
DC_0876
STR
148–227
STR
148–227
DC_1983
ATT
216–281
ATT
216–281
1
1457
Architecture
STR 54-215 | ATT 216-459 | STR 460-587 | ATT 588-768 | RBD 889-1041 | RBD 1360-1455 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudaeromonas phage vB_PpeM_ KLEP7 [NCBI] |
2928862 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Pseudaeromonas pectinilytica [NCBI] |
1756761 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Aeromonadales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UNY40319.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM654377.1
[NCBI]
CDS location
range 109336 -> 113709
strand +
strand +
CDS
ATGCCTATTATTAATCCAAACATTCAACAACTTAATTCCAATATTCCAGATGATCTTATATTTTCTGGTGTAGATTATCCAGCAGCAATAGCAGCTCGTGATGTTTTCTTTGTAGCTAACCCTGCTCGAAAGATTGATAGACTCTATGTAATACTTGAAGAAACTAATACACATTCAATTAAATATCAACAATATATCCTTGTTTCTGACACATGGGTAGATATGACATCTGTCGTCAAAGGAGAAACAGGGCGAACTGGAGATCAGGGTGTTCAAGGTCCTCAAGGGCCTGTTAGTCTTCTTTGGAAAGAAAACTTTGACCTATTAGTTAATTATGTAGAAAATGATGGTGTTTTCTATAATGGCTCTAGTTATAGATGTATTGCTCCAACTACAGGAAATGCTCCTACAGAAACAATCTATTGGGCACTTATTGCTCAAAAAGGTAATATCGGTGATGAAGGTCCTGTAGGCCCAATAGGGCCAGTTGGGCCTATGCCTATTAACTGGAAAGGACTATATTCAGGTCTTTCAGCATATGCAATTAATGATGGTGTTCAATACCAGAATTCTAGTTATCGAGCTATAGTTGCTAATACTGATGTTCTTCCTATAGATCCTACAACTTGGGAACTACTTGCCAAGAAAGGAAATGATGGTACAGATGGTGAAGCTGGTCTTAATTTCCTTGGTGAATATTCAGAGTTTGAATCTTATGTTCCAAGAGATGCTGTTACATTTGAAGGTAGTTGTTATATCTGTAAATTAGCAACAACTGGTCACGAACCTACACAAGCTGTCTGGTGGGATTTGTTTACAGCCAAAGGACAAGATGGTATTTTGTTTGATTTCTTGGGCGGTTATGATCCAGAATATCAATATCAATTATATAATCTGTGTACTTATCAAGGATCTACTTATGGCTGCAATAATGAGTTTGGTTCTTTAGGCCATGCACCACCAGATGTTGATTACTGGTATGTTATTGCCTCAAAAGGTGATACAGGTGTTTCTGGGATTAATGTTAAAGGTATTTATAGCAACAGCACTGCTTATGTTCCTAATGACTTAGTTACTTATCTTGGTAATAGTTATGTATGTACAGCAGGCAATACAGGTAGCTTACCTACTGATATTAATTATTGGGCATTGTTTGTAGCTCAAGGTGCTCAAGGTGATATTGGCCCTGCTGGCCCTGTAGGTATGACATGGAAAAATACATGGTCTAATATTCTTCCCTACAATAAAGATGATGTAGTTTATTATAATAAGTCTAGCTATATTGCACTTAAAGACTCTATTAATGTTCAACCAGCAACAGATGAAACATCATGGGCATTAGTAGCTGCTAAAGGGGAATTGTCTGCTTTAGAAGATCGTTTTGCACTAGATGCAACAACTGAATATACAATTGGTAATGTTATTAGTTATCAAGGAATCCGTTATTGCTGCCGGATTGACCATACTACTGATACTGTTCCTACATTTATTCCTTCTAATTGGGTCCCTATGTCAGTTGGAATGGTAGGTGCAACAGCAACAGAATCAGGAACAAAAGGCTTAGTTCCTATCCCTGAATCTACTTTTCAAGATGCTAAGTTAGTTGGCTCTGGAGAGTGGGATAAAACAGGGCGTAAAACTCTAGTCACTCTAGAAAACTTTGTTGCTAATGCAACTATGGACCCATTGACTACAGTGGATGTTTGTGAAGTTATTGCTATTCCTCAAGCAACTTCTGGAATTACTATTAGTATTCCTAATCCAACTGAAAACACAAAAGTCCGTAAGTTAATTTTTATTAATACAGGCTCTACTTCATTCTCCTTGTCTACTGGTCATACTGTTTATGCAGGTAAGTGGATTGAACTCTATTGGGCTTTAGCATTGCAGACTTGGGAAACCTATGTTGGTGATACTAAGATTTATGATCAAGCTAATGCTTATCAGGCTTATGATCGTTGTATTCTAGGTAATATTACAGTTTATGCAAATGCTGCTATTCCAGCTAATACTGTATTTGCTTGGGGAACCAGTGGTGCAACTTGGGCTCCTGTGCTTCCGGTAGGTTATATATGGAAAGGTCCATATACTGCCAGCACTAATTATATTACTGGTGATATTTTTACCCAGAGCTCTGTAATATCTGCCAGCTTTTTTCGTGTATCTTCACCATTTACATCTACTACAAGTTTTGGTACGGATGTAACTACTAATGGTGGCGTGGCAGTGGAGAAAGTTTCTGCTTATGGCTGGGGACTTAGTTCTAGTTCTAGCTTGGCAGTAGGTGCAACCGCTACAGCTAATGGTAGATTTGGATCACCTAGGAGGGCGTCAATTGGTGAACAAGATGCCACACTGAAAGGTGATAACACTTGGGATAGGACAGGTCGTGGAGCCTATAAAGCTCTTTCTAACTACACAGTGGACACTACCTTACCTGCTGTAGATACTACCAGTATTTCCGAATACCTAAGTATTCCACAAACAACTGCTGGAATTAATATTACGCTACCAACACCACAGATTGTTAATGTAACAAGACGGATCAGTATAGCCAACACTGGGACTGTAGATTTTACAGTTAATACAGTTAAGGTTAAAGTAGATCAAGTTGCAACATTTATTTGGGTAACTAATGGATCTAAGTGGTATCAACAAGCAGGTGGTGCAAGTCTAACAACTAATGACTTAGCTTATGGTAATGCTAAAGCACAACCCACTAATGATACCTATACAACATCTTATGCTCTAGCAGCTACTACAGCAACTACTGTTACATGTGGGGCTACTGCATCAGGCGTTACAAGTATTGGATGGACTACTGGTCAACTCAAGTTCACTGTCCTTCAAGCAGGTAAATATAAGATTAGTGCAGGAAGCACCATAACAGCCTCTGCTGTTAACTGGGGTAGAACTATTATCACAGTAAGTGGTGTTGTTAAATCACAAAGTCCTAATGAATGGGTTTCTACTGCTAATGCTGGTGTTAGTTCTGAAACGGAAACAATCCTAGATCTTGCTGTTAATGACGTTGTAGAATGTAAAGCATACAGCCAGAATTCAGGTTATATGCAAGGTGGTTATTTAACTATTGAACAATTACCTGTTGCTACTTTAGTTGATCCTGAATTATTAAGTCCTGAAACTCTTAGTTATTTGAAAATGGATTCAGGTTTGACTGGTCAGACAATAACTAATACTACAACTAATATCACCTTCTCTAATCCTTTAATTGATATTGGGACTAACATTTTATACAGTAATGGAATTATTAGTTTCAAGGGAGGTGCTCGTTACAAACTGACATTCGCACATAGTTTTATTCAGCCCCCTTCTGGTGGATACTTTTATTACAAGTTCTGGGATGTAACTAACTCTCAGTTTATTGGGAATGCAGGTGGTGGAGATACTGTCAACTCGGCATCTACCACGATTCCAGCATCTATGATTTCATTAGACTTAGATTTAACTTCTTTACCTGTAGCTTCTACTAGACAAATATCGGTAAGAAGTAGTGCAACAAACGGATCTACTATAGTAGGTAATTCTTCTCATGGATCCCCTTGGTTCTGCGCTGAACAGATGCCTACTTCATTTGTTGTCTCCGTAGATCCTGAATCTGTTCTAGGTTCTGCTATTGAATATGGCTATTATAGATGGTCTGCTAGTCAATCAATTACTCTTTCAGTGCAAGATATAAATCCCGATTCTACAATATCTGGGACTATACCTAACTCAAACGGGGTTTTCTCTTTGACTGGTGGAAAGACCTATGAAATTGAAATGGGATTGTATGCTACATGGACCGGAGCTGGCGTTACATCTATTTCACTTGTAGATGCAGGAACTAATACTCAGATATCAGGTTCCCCAACTTTCAGTCTGAATGCTGTTTCTGGAGGTAACAATTCAGGAGATCCAGCATGGAAGTTTATTTATACTCCTGCTACTAATCAAACAGTTAAATTTAGGACTAATGATAGTACATTAAGCTGTACTATATTTGCAACTAGAAGCTGGGTGTCTATTAGACAACTACCAACAGCAACTATTATTGATAAGACAGTAACTGCTACAAATGACCAAGCAAATGCAGGTTACTTTGATATTGGAAACATGCGTTATCAATGGGGTGAATCACTTGTTAACTCAGCTAATCCTGTAGTAGTCACATTACCAGCACCTTTCAAGAATGCTTCCTATGCTGTCAACTCAACTATGCTAACTGGGAATGATACGGCGGTAGCCTTAACAGCAGCAACAAGAGATAGGACAACTACAACCTTTTTGGTCAAGAAGACGTACAATACTTCTGGGACTTTCGGGTTTGCTAGTGAAGGGTTTACTTGGATAGCTATTGGACTAAAACCATAA
Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
56df598b718ad4e184db3139aff535b62181c97c18a8163fb6e39629b1de6236
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Complete genome sequence of Pseudaeromonas bacteriophage vB_PpeM_ KLEP7 | Simoliunas,E., Simoliuniene,M., Kvederaviciute,K. and Sulcius,S. | — | — | GenBank |