Protein

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Genbank accession
XVF94269.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADYKLSQLNSIDTIRSEDLLHIRVKKRPEMLGDEDRRMTYQDFLASFKLERFVQIAGSTMTGDLGIVKLLYGGKAVFDPTGSSEITIGDILKTFKINANGLKLTIADASRSATVYHTLNKPSPNELGMRTNEENDARYARIAITNTFSGTQNIQGDANLLRLRNQNANNAQYIEGVNLDGSARWWVGIGSNGSDEVKLYNNKYNSALTIASNISVNKSLAITGQVQPSDFSNLDARYFTQTVANQRFAQLAGNNTFTGANTFTNLVAKKNANAITLQNTDASTALYILGKKSDGTNKWYVGTDSDETRLNIYNYLAGSQVSLGTTIGINKTVQITGQVQPSDWANIDSRYIPAATLSTIARTNAVNTFSAQQIINSDGEALALQAKTVTSLFIRGKSADGTSKWYVGNGDASDILNLYNYKTGKGLNIGSSFEMNATLAITGQVQPSDFSNLDARYYTQSTANSRYMLAYSSGTGTEVGDSDGIAWNAKTGLYNVTGKSGGSTQLVYHMYQGSSSTPAAQLKFNYNNGGFWYRSARDGYGFESAWSKIYTDKDKPTPSDIGAYTKAETDQRIAQAVSDSTDLNKIYPVGIVTWFNSNVNPNTALPGLTWTYLNNGVGRTIRIAAANGSDVATTGGSDSVTLSVGNLPSHTHSFSATTSSFDYGTKTSSTTGNHNHNRGTMEITGSFGYFRSDASSFYTASGAFYLGSQAGSKGYTGNNFTNGIPVNFNASRNWSGVTNTTGNHSHTVGIGAHSHTVSGNTGGTGSGSAFSVTNQFYKLMAWVRTA
Physico‐chemical
properties
protein length:786 AA
molecular weight: 84579,12420 Da
isoelectric point:8,95828
aromaticity:0,09924
hydropathy:-0,41832

Domains

Domains [InterPro]
DC_0032
ATT
1–268
DC_0032 G3DSA:6.20.80.10 DC_1993
IPR048388
ATT
159–247
IPR048388 IPR048388 G3DSA:6.20.80.10 IPR022246
G3DSA:6.20.80.10
STR
159–218
G3DSA:6.20.80.10 DC_1993 IPR048388
XVF94269.1
1 786
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 1-354 | STR 355-380 | ATT 381-470 | STR 471-782 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage MET-P1-301
[NCBI] 		3434334 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XVF94269.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV700625.1 [NCBI]
CDS location
range 48965 -> 51325
strand -
CDS
ATGGCAGATTACAAATTGAGTCAGTTAAACTCAATCGACACAATTCGTTCAGAAGACCTATTGCACATCAGAGTTAAGAAAAGACCTGAAATGTTGGGTGATGAAGACCGTAGAATGACCTATCAAGACTTCTTAGCTTCCTTCAAACTAGAAAGGTTTGTTCAGATTGCTGGAAGCACTATGACTGGGGATTTAGGTATTGTCAAGTTACTTTATGGTGGTAAGGCTGTATTTGACCCTACAGGCTCTTCTGAGATTACTATTGGGGATATTTTAAAGACTTTTAAAATTAACGCAAATGGTCTTAAACTAACTATTGCAGATGCTTCAAGGTCAGCAACTGTTTATCATACTCTGAATAAGCCAAGTCCTAATGAGCTTGGTATGAGAACTAATGAAGAGAATGATGCAAGATACGCAAGAATTGCTATCACAAACACATTCTCTGGAACTCAAAATATTCAAGGTGATGCTAACTTACTTCGCCTTAGAAACCAAAATGCAAATAATGCACAATATATCGAAGGTGTAAACCTAGATGGTTCGGCTAGATGGTGGGTTGGTATTGGTAGTAATGGCTCTGATGAAGTGAAGTTGTATAATAACAAATACAATTCAGCCTTGACTATTGCAAGCAACATCTCTGTTAATAAATCTTTAGCAATCACTGGACAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACTTAGATGCTAGATACTTTACTCAGACAGTTGCTAATCAGAGATTTGCACAGTTAGCTGGTAATAACACTTTTACAGGTGCTAACACTTTCACTAACCTTGTTGCTAAGAAGAATGCTAATGCTATTACTTTGCAGAATACTGATGCAAGTACAGCACTTTACATTCTCGGTAAGAAGTCTGATGGAACAAATAAATGGTATGTTGGTACAGATTCTGACGAGACACGTCTAAATATTTATAACTACCTTGCAGGTTCACAGGTTTCGCTAGGTACTACTATTGGTATCAATAAAACTGTGCAAATCACTGGACAAGTCCAACCTTCAGATTGGGCTAACATTGACTCTAGATATATTCCGGCAGCAACATTAAGTACGATTGCAAGAACTAATGCTGTTAACACATTCTCTGCGCAGCAGATTATTAACTCTGATGGCGAAGCCCTTGCGTTACAAGCAAAAACTGTAACGTCATTGTTTATTAGAGGTAAATCTGCTGATGGAACTAGCAAGTGGTATGTTGGGAATGGTGATGCCAGCGACATCTTAAACCTGTATAACTACAAGACAGGTAAAGGGCTTAACATTGGTTCATCATTCGAAATGAATGCAACTTTAGCAATCACTGGTCAAGTTCAACCTTCAGATTTCTCTAACCTAGATGCTAGATATTACACGCAATCTACCGCAAACTCTAGGTATATGCTTGCTTATTCTTCTGGCACTGGTACAGAGGTAGGTGATAGTGATGGCATTGCTTGGAATGCTAAAACTGGTCTGTATAATGTTACAGGGAAATCTGGTGGTTCAACACAACTGGTCTACCATATGTATCAGGGTAGCAGTTCTACACCAGCGGCTCAGCTAAAATTTAACTACAACAATGGTGGTTTTTGGTATAGGTCAGCAAGAGACGGTTATGGTTTTGAGAGTGCTTGGTCTAAAATCTATACAGACAAAGATAAACCAACACCTTCAGATATCGGTGCATACACTAAAGCTGAAACTGACCAGAGGATTGCACAGGCAGTAAGTGACTCTACAGACCTGAATAAAATCTATCCAGTAGGTATTGTAACGTGGTTTAACAGTAATGTTAACCCTAATACAGCACTTCCTGGTCTAACTTGGACGTACCTGAACAATGGTGTTGGTAGAACTATTAGAATTGCAGCAGCAAACGGTTCAGATGTTGCTACAACTGGTGGTTCAGACTCTGTAACGTTATCTGTTGGTAACTTACCTTCACATACACACAGTTTCTCTGCTACCACTTCATCATTTGACTATGGTACTAAGACCTCTAGCACAACTGGTAACCACAACCACAACAGAGGTACTATGGAGATTACTGGTTCATTTGGTTACTTCAGAAGTGACGCTAGTAGCTTCTACACAGCAAGTGGTGCATTCTACCTCGGTAGTCAGGCAGGTTCTAAAGGGTATACTGGTAACAACTTTACTAATGGTATCCCTGTCAACTTCAACGCATCAAGAAACTGGTCTGGTGTAACGAATACAACAGGTAACCACAGCCACACTGTTGGTATTGGTGCTCACAGCCACACAGTTAGTGGTAACACAGGTGGTACTGGTTCTGGTTCAGCATTTAGTGTTACTAACCAGTTCTATAAGTTAATGGCTTGGGTAAGAACTGCTTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
59424e37a17dc36a4d286892822b4a349f8fa9828c3fe289dc36d91898f6e000
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7397
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50