Protein

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Genbank accession
XGU05709.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,85
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTIFTKDDSGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHKNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIQYINESGDSKYWTFNRNGSFIVDNGSIEVRAGNISASGNINSATGFVSAPRVNTKNINLSSKTFIPNNDAGYDLVSLPTWVYNPPADGSDNTTNGLNYLRKLRASSASSIFHEIVDCRKGKPQEISWWTGVGPSSFQWAFDTSGRITAGKSISVGLPDNGANGRYPLDSAISIGIAIGDNDTGIKWVRDGVYDLMANGISSATILNNGINSTKKLMVGYSRDSGSTWVFPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYNSNSKMYHYFRGTGRMSVSMAEGLIVEPGILDIKTGSNRVAIRADGTFDSTQRISMQNGIFLSSNGNNNGISFKASTSIDGTKTLNWDGGTRPGQNKNTVIVKAWGNSFNASGGTDRQTVFEVSDTQGYYFYAQRTTPASGQTVGPINFKFNGTVETGHIIGLGNISASGTGSFGGNVTMSNGLFVQGGSSITGQVKIGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEDKLYIIPTPQNAGESGGISNLRPFYIALSNGKVSMDHDVDIGGGRFKVEVAGTTAGQRITVNAGSDALRINAPTQESSNFIQGRKADVPKWYLGIGDGGNVVRMHSYTHSHGIALNSDSVDITKPLKVGNAQLGTDGNITSGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGATDGWYKFATVTMPQSTSTAFFKIVGGSGFNSGLFTQCNIAEIVLRTSNERPVDLNAVLYTRTIAAAFKNIAVNKVSGDTYDIYVYAGTFCNQLACEWTCTENATVSVIGINSSTQSPVDALPDTAVNGQVANVLNNLVDRGKGKRYEADSEIAINSQTGIRIRSNSDKTGSVATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVMMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGDNPRNMRIFHRGDATRGNRIEIADETNYIAYFEKAPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSITFGDSDTGIKQNGDGLLDIYANNVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGEAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSSRVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1260 AA
molecular weight: 135174,55700 Da
isoelectric point:8,46304
aromaticity:0,08730
hydropathy:-0,34246

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–937
DC_0538 DC_0932 IPR030392
G3DSA:6.20.80.10
STR
691–750
G3DSA:6.20.80.10 DC_1942
IPR048388
ATT
692–766
IPR048388 IPR030392 Coil
XGU05709.1
1 1260
Architecture
STR
ATT
STR
STR
ATT
STR 1-691 | ATT 692-766 | STR 767-937 | STR 960-1083 | ATT 1084-1259 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XGU05709.1
1 1260
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 308 308 0,1155
Central domain 309 507 200 0,4898
C-terminal 508 1260 752 0,6917
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-308
Central
309-507
C-terminal
508-1260

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage Pu-Krd-SF3
[NCBI] 		3328528 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XGU05709.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ249397 [NCBI]
CDS location
range 9768 -> 13550
strand -
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACAATTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATTGACTTAAGCATTTCTGCTGGTGGTAATATCAGTGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAATGGAACATATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTCCTGCCTAAAACCGCGGGTAATGGTGCGTGGGCAAATCAACATAAAAATAAAGCTCCTATCTTTACCGATTTGAGTTCAACTACTTCTACTTCAGAATACCATCCGCTAATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGTTGGTACGTTAGTAAATGAAGGAAGTTTTAAAATTCAATATATCAATGAATCTGGTGATTCAAAATATTGGACTTTTAATCGAAACGGTAGTTTTATTGTAGATAATGGCAGTATTGAAGTCCGTGCAGGTAATATTTCGGCTTCAGGTAATATTAACTCGGCAACTGGATTTGTTTCTGCACCGCGCGTCAATACAAAAAATATTAACCTGAGTTCTAAAACCTTTATACCGAATAATGACGCTGGGTATGATTTAGTTTCTTTGCCTACTTGGGTTTATAACCCACCGGCTGATGGTTCTGATAATACTACTAACGGTTTAAACTATTTGCGTAAATTACGTGCATCAAGTGCATCAAGTATTTTCCATGAAATTGTCGATTGTCGAAAAGGCAAGCCGCAAGAAATTTCTTGGTGGACTGGTGTAGGGCCTTCGTCTTTCCAATGGGCGTTTGATACCTCTGGACGTATTACCGCAGGTAAATCTATTTCAGTAGGTCTTCCTGATAACGGGGCAAATGGACGTTATCCTTTAGATTCTGCCATTTCTATCGGTATTGCAATTGGTGATAATGACACCGGTATTAAATGGGTCCGTGATGGCGTTTATGACCTGATGGCTAACGGTATTTCATCTGCTACTATTTTGAATAACGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTTGGTTATAGTCGAGATTCCGGTTCTACTTGGGTTTTCCCAAATAATAACCAAGCAATGTTTACTGCGCGTACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGTGATGGGCAAACTCATATCGGTTATAACAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGTCCGTTAGTATGGCCGAAGGACTTATTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAAAACCGGTTCCAATAGGGTTGCTATTAGAGCAGATGGTACATTTGACTCAACCCAACGTATTTCAATGCAGAATGGTATATTTTTATCTTCTAATGGAAATAACAATGGTATATCTTTTAAAGCTTCTACTAGTATAGATGGAACTAAAACGCTTAACTGGGACGGCGGTACTCGCCCTGGTCAAAACAAAAATACAGTAATTGTGAAAGCATGGGGTAATTCATTTAATGCCAGTGGTGGAACAGATAGACAAACTGTATTTGAAGTTTCTGACACTCAAGGATATTATTTTTATGCTCAACGCACTACTCCAGCGTCAGGTCAAACAGTAGGTCCTATTAATTTTAAATTTAACGGAACTGTCGAAACAGGCCATATCATAGGCCTTGGTAATATAAGTGCCTCCGGTACAGGTTCTTTTGGTGGCAATGTTACCATGTCTAATGGTTTGTTTGTCCAAGGTGGTTCTTCTATTACTGGACAAGTTAAAATTGGCGGAACTGCTGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGTCGTTCTGAAGATAAGCTTTATATTATTCCAACCCCGCAGAATGCTGGTGAATCAGGTGGTATTTCTAATTTACGTCCGTTCTATATTGCATTAAGTAATGGTAAAGTTTCCATGGATCATGATGTAGATATCGGCGGCGGTAGATTTAAAGTAGAAGTGGCTGGAACTACGGCTGGTCAACGTATTACAGTTAATGCAGGGAGCGATGCTCTTAGAATAAATGCTCCAACACAAGAGTCTTCTAACTTCATCCAAGGACGTAAAGCAGATGTTCCAAAATGGTATTTAGGTATTGGCGATGGCGGCAACGTCGTTCGTATGCATAGTTACACCCATTCACATGGTATTGCATTAAACTCTGATTCTGTTGATATTACTAAGCCTCTTAAAGTAGGAAATGCACAACTAGGAACTGACGGTAATATTACCAGTGGTTCAGGAAACTTTGCCAACTTAAATACCACGTTAAATCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTATGGAGCAACCGATGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAATCCACTTCGACAGCCTTCTTTAAAATAGTTGGAGGTTCTGGATTTAATAGCGGATTATTCACCCAATGTAATATTGCTGAAATTGTTTTACGTACTAGTAATGAAAGACCTGTTGACTTAAATGCTGTATTATACACAAGAACAATTGCAGCTGCATTTAAAAATATTGCAGTTAATAAGGTCTCTGGAGATACATATGACATTTATGTTTATGCTGGAACATTTTGTAATCAATTAGCTTGTGAATGGACATGTACTGAAAACGCTACTGTTAGTGTTATTGGTATTAACTCATCTACGCAATCACCTGTAGATGCTCTTCCAGATACAGCAGTTAACGGTCAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGCGGCAAAGGTAAGCGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAGCCAAACTGGTATTCGTATTAGAAGCAACAGCGATAAAACTGGTTCTGTTGCTACAATGTTACGAAATGACGGCGGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGCAGCAACTGTTAATGGTGATTGGAATAGTAAACGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACCGGCGAAGTGATGATGAATAATGGCATAGCTGTTCGCAGTGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCCGGTGATAACCCGAGAAACATGCGTATATTCCATCGCGGTGATGCCACTCGTGGTAATCGCATTGAAATTGCTGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAGCTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTAGCTGGTGTTAATCAAATGAATTCATTTGGTATTAATATCAATAACGCACTTGGTGGAAACAGTATAACATTTGGTGATAGCGATACTGGTATTAAGCAAAATGGTGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAACGTACAAGTATTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATATAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTTAAACCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTTAACGGTGTCATTTACGATAAAGCTGAATACATCGGTGGAGAGGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGCTACAAGACGTTTTACCAGAAGCCGTCCGTGAAACAGAAGACAGCAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTGGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTTCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
45e7874d1caaa56970c34414bc14e748df9378145a99f5a277355335f56555b1
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2709
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50