Protein
View in Explore- Genbank accession
- BDR26168.1 [GenBank]
- Protein name
- hypothetical protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MSIQSGPSVLNQFVPDFLIDSTPTNGQFLVYDDTVQAFVNSTNPRIVLDSSNILDGSITIDKLAISGNKVPGYVLTITSAGGMAFLPVPGSGGQLPSLDELLDTNIVSPTITQYLKWDGSAWVNSNITLNDVSDVSVISPTADDVLAWESGSWTNKKIDYTSLTNKPDLSDVVRSSELSSVAFSGDYNDLVNIPSATSNTIVGLTDVNDTALPNGFLRWNASGDEVEFITSISATVITGLAPVATSGNYNDLLGKPNLSVYPLRTEFSTVATTGNYSDLNNVPLTFAPSAHTHPAAQITGLASVATSNDYNDLVNKPTAMAPTAHTHAISDIIGLQNSLDSKLTVNLTTRLPKDVIYFNGTSWVNKQLSYTDISGTPNLDNYVTDSELSTVATTGRYSDLINKPELVENLNDLLDVDVSSKQTGNVLTWNGTAWVASAITQASIDWANISNKPSVFSPAAHTHDVVDVLGLQSLLDSKLDANIAFDGDYNSLTNKPGLIDLQDTFSPAVPNGFLRWNNLGTLVAYQDYIYPQDISGLSDVAISGQYSDLLGTPSLSTVAITGSYSDLIDAPPAFDGDYDSLTNKPFIPTNFDFKFIGLNDVSPTVQPGGYLKWNLDGSFVVSSANIPATDVAGLSVVSTTGQYSDLLGKPLLATVSSSGSYTDLINIPTEFNPAVHTHNIADISGLQAALDNKLNTSDAFSGDYNDLTNAPTNSSYSLVGLSDTNSVPVANGFLRWNASGSSVEYIQTIPVNAITGLAPVASSGQYADLQGTPDLSDYVLSVSLADIATTGEYSDLINAPDLSVYANKTDLSDVATTGQYSDLLGIPTQFTPTVHVHNVSQISGLATVATSGSYNDLSNKPSFANVATTGSYDDLNNKPSIPTNGSFSLLGLNDTNNTPVADGILRWNSSANQVIYANTIDAQSVSGLATVATIGKLSSLSDVDLIGLNQNEILQWNGSAWVPVPYNPNQIQAYIESGNTKVSTNDILDSIVLTAGPTTGNIIFELGNTNSSIILNPVANNVDALISSTSRIKLDSSTGISLGNISYPMTDGTVGQAVVTNGAGQLSFETVVKPSQLATVATSGNYNDLTNKPTLVTELNGLADVRMRDTNGNYLAQPEDVLTYSNGIWQARPNTSSSFIGLSDTQNITLPEDRANAYLRWDTTGNLIIYEDSISASVIAGLAEVATTGDLHDLINVNVNLPDMNNPATQAVWGLIWDRQNQRWINYNLRNIAGSGGSTVVALNDLTDVTLTFPVVDGNVLRATVQPDNSIVWQNKQLSYSDLTGTISMSLLQLTDTSSSAVPNGFLRWDSSGNTVQYITTISTNDITGLAPVATSGNYNDLSNTPAIPASINDLADVNTVSPVPTNGYVLTWDSSSNNWIAKEPATNPSGSTALADLTDVSLSDLAASDVLKYNGTTWVNEPVTYSELTDLPTFALVAFSGDYNDLTNKPSGSTTSILDLTDTADTALPNGFLRWNASGDEVLYQSSIDVSDIIGLSGVAISGDYNDLSNKPENNSYYFRKLADAGNPQPNTFIKYPAFTIPPGSDIDDVNPILEYVSSINALTDIDNLAPVATNGILGSLVDVNLNSVEDGQVLTYDAVTNSWINKNSSGSPVVTSWTKISGNYTVTGSEYLLVDTTSASVTITLPVAPTENMVIRIADWKGTFRTNSCVVNTNGMPLMGASMDNTLTIQNQNASIELTFVDTTYGWKITDGIGEISKQNIPVTNWRTVDSSSTPAMLIAQPGEAIYVNTNNGAVTVKLPTGASVNAVVRIADLLGTYDKASCFVDGNGNPIMGKNEILEIANENASIEFTYVDSVVGWKVTDGIGELGRKTDIASDSDIIVYVATDGNDTTGSGTEESPFATLNAAFLSLDGKFVNSSAEIIVRVAEGVYEPTNPVAFSHIQGMNVKLIGEMPQASSSFTVTNITNNAGLATVTMQLSSVSDYEVGDIIKITSAATMLECVEIITAINTGSNTLEIVIPNSVLADVSDYTGYTGTISKFTTVFKNTNMYVAGGYSLGFIDNIALVDDTGLGTALTVGRTYTTGIYDGPAYVGLGANFAVYGYETAIQSIPGSSVVLAGNLCRQAVAAIRADGSILSFNAGQSVYIANQAQDGIVLKHGSKLIHNDDASQSFVFVIFNNIKSGTIMSLDTSISTANFEVKNSEGIMIAATRHSTVDARSAIVSGTITGDLEVNATGMSVININEPAGSTNIPLAVVCNPAHGSNTELQKGYIGL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2236 AA molecular weight: 236321,91070 Da isoelectric point: 4,09601 aromaticity: 0,07379 hydropathy: -0,02263
Domains
Domains [InterPro]
DC_0165
STR
1–265
STR
1–265
PF12789
STR
324–347
STR
324–347
DC_0165
STR
693–783
STR
693–783
1
2236
Architecture
STR 1-265 | ATT 321-592 | STR 593-862 | STR 880-1118 | ATT 1119-1393 | STR 1394-1841 | RBD 1842-2236
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudomonas phage sp. 30-3 [NCBI] |
2972143 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Pseudomonas aeruginosa [NCBI] |
287 | cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BDR26168.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC727698
[NCBI]
CDS location
range 168088 -> 174798
strand +
strand +
CDS
ATGAGTATACAATCAGGTCCTTCTGTATTAAATCAATTTGTTCCAGATTTTCTAATAGATAGTACACCAACTAATGGTCAATTTTTAGTTTATGACGATACTGTCCAGGCATTTGTAAATAGCACAAATCCCAGAATCGTATTAGATTCGTCTAATATATTAGACGGTTCTATAACAATTGATAAACTTGCAATATCTGGTAATAAAGTGCCTGGATACGTACTAACTATAACTTCCGCGGGCGGAATGGCATTTTTACCAGTACCTGGCAGCGGTGGCCAATTACCTAGTCTAGATGAATTACTAGACACAAATATAGTATCTCCTACTATAACCCAATATCTTAAATGGGACGGTTCTGCATGGGTTAATAGTAATATAACGTTAAATGATGTATCAGATGTCTCTGTTATCTCCCCTACAGCTGATGATGTATTAGCATGGGAATCAGGTTCTTGGACAAATAAGAAAATAGATTATACATCACTAACAAACAAACCAGATTTGAGTGATGTAGTTAGATCTAGCGAATTGTCATCAGTTGCATTCAGTGGTGATTATAATGATTTAGTAAATATTCCCAGTGCAACTTCTAATACTATAGTTGGATTAACAGATGTTAACGATACTGCACTACCCAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGTGGCGATGAGGTAGAATTTATTACTTCAATTTCTGCTACTGTAATAACCGGGTTAGCTCCAGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATTAGGAAAACCTAATTTGTCAGTGTATCCGCTTAGAACTGAATTTTCCACTGTTGCAACCACCGGTAATTATTCTGATTTGAACAATGTGCCTTTGACATTTGCACCAAGTGCGCATACTCACCCGGCTGCACAAATCACAGGATTAGCATCTGTAGCTACTAGCAACGATTATAACGATTTAGTTAATAAACCGACTGCGATGGCGCCAACAGCACATACGCATGCTATATCTGATATTATAGGATTGCAAAATTCGCTAGATAGTAAGCTGACTGTTAATTTAACTACTAGACTTCCAAAAGATGTTATTTATTTTAACGGCACTTCGTGGGTAAACAAGCAATTATCTTATACTGATATTTCCGGTACTCCTAACTTAGATAACTATGTTACTGATTCAGAATTATCTACTGTTGCTACAACTGGCAGATATTCTGATTTAATAAATAAACCCGAGTTAGTAGAAAATTTAAACGACTTATTAGATGTAGATGTTTCTTCTAAACAAACAGGGAACGTATTAACCTGGAACGGAACAGCATGGGTTGCTAGTGCAATAACACAAGCAAGCATAGATTGGGCTAATATAAGCAATAAACCAAGCGTTTTTAGCCCCGCTGCGCATACACACGACGTAGTAGACGTACTAGGCCTGCAAAGTTTACTAGACAGCAAACTTGACGCAAATATTGCATTCGACGGCGATTATAATAGTTTAACAAATAAACCGGGGTTAATAGATCTTCAAGATACATTTAGTCCTGCTGTACCTAATGGATTCTTACGGTGGAATAATTTAGGTACCTTAGTTGCATATCAAGATTATATATATCCGCAAGATATTTCAGGATTGTCGGACGTTGCTATATCAGGTCAGTATTCGGATTTATTGGGTACTCCTTCCTTATCAACTGTTGCTATAACCGGGAGTTATAGCGACTTAATTGATGCGCCGCCTGCATTTGACGGTGATTATGATAGTTTAACAAATAAACCGTTTATTCCTACTAATTTTGATTTTAAATTTATAGGTTTAAATGATGTAAGTCCTACTGTTCAGCCTGGCGGCTATTTAAAATGGAACTTAGACGGTTCATTTGTTGTATCGTCAGCAAACATTCCTGCAACAGATGTAGCAGGTTTATCTGTTGTGTCTACAACCGGACAATATTCGGATTTATTAGGCAAACCGTTATTAGCTACAGTTTCTTCGTCGGGTAGTTATACTGATTTAATAAATATTCCTACTGAATTTAATCCAGCCGTACATACCCACAATATAGCAGACATATCCGGATTACAGGCAGCCCTGGACAATAAATTAAATACATCTGATGCATTTAGTGGTGATTATAATGATCTAACTAATGCACCTACTAATAGTTCATATTCATTAGTGGGTTTATCAGATACTAATTCTGTACCTGTTGCAAACGGATTCTTACGCTGGAATGCATCTGGAAGTAGTGTTGAATATATTCAAACAATTCCTGTAAATGCAATAACTGGATTGGCTCCTGTTGCATCATCTGGCCAGTATGCAGATTTGCAAGGAACACCGGATTTATCTGACTATGTTTTATCTGTATCATTGGCTGACATAGCTACAACTGGAGAATATTCAGATTTAATAAATGCACCTGATTTAAGTGTGTATGCTAATAAAACTGATCTGTCAGATGTAGCTACAACAGGACAATATTCGGATTTATTGGGTATTCCTACACAATTTACACCGACAGTTCATGTCCATAACGTTTCTCAAATAAGTGGATTAGCTACTGTTGCTACTAGCGGAAGTTATAATGATTTATCTAATAAACCGTCGTTTGCTAATGTTGCAACTACAGGCAGCTATGATGATCTAAACAATAAACCATCCATACCTACTAATGGCAGTTTTAGTTTACTTGGGTTAAATGATACAAATAATACGCCAGTTGCAGATGGTATATTGCGTTGGAATTCCAGTGCAAATCAGGTAATATATGCAAATACAATCGATGCACAATCTGTTTCTGGATTAGCTACTGTTGCAACTATAGGTAAACTATCTTCACTAAGTGATGTAGATTTAATAGGTTTGAACCAGAATGAAATATTGCAATGGAACGGTTCTGCATGGGTACCTGTACCTTATAATCCTAATCAAATACAAGCCTACATAGAGAGCGGAAATACAAAAGTTTCTACTAACGATATTTTAGATAGCATTGTTCTAACAGCAGGACCTACTACTGGAAATATAATATTCGAGTTAGGAAATACAAATAGCTCAATTATTCTAAATCCAGTTGCTAATAACGTAGATGCTCTTATTTCTTCTACTTCTAGAATAAAATTAGATTCATCCACTGGCATATCATTAGGTAATATAAGTTATCCAATGACCGACGGTACAGTTGGGCAAGCAGTAGTTACAAATGGAGCTGGCCAACTATCGTTTGAAACAGTAGTTAAACCCTCTCAATTGGCTACAGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTAACTAATAAACCTACATTAGTAACCGAACTAAACGGACTTGCTGACGTTCGTATGCGTGATACTAATGGAAATTATTTAGCACAACCAGAGGATGTGTTAACATATTCTAACGGAATATGGCAAGCACGACCGAACACTAGTTCTTCTTTTATAGGTTTAAGCGATACCCAAAATATAACATTGCCAGAAGATAGGGCTAATGCATACTTACGTTGGGATACTACTGGAAATCTAATTATATACGAAGATAGTATTTCTGCAAGCGTAATTGCCGGATTAGCAGAAGTAGCAACCACAGGAGATTTGCACGATTTAATAAATGTAAATGTAAATTTACCTGATATGAACAATCCAGCTACACAAGCTGTTTGGGGTTTAATATGGGATCGTCAGAATCAACGTTGGATAAATTACAATTTACGTAATATAGCAGGTTCGGGTGGATCTACAGTAGTAGCATTGAATGACTTAACTGATGTTACTCTTACTTTCCCTGTAGTTGACGGTAATGTTCTTAGAGCAACTGTGCAACCAGACAATAGTATTGTTTGGCAGAACAAACAACTATCTTATAGTGACTTAACTGGAACTATAAGTATGAGTCTGTTGCAATTAACTGATACTAGTTCATCTGCTGTACCTAATGGATTCTTACGGTGGGACTCATCGGGTAACACAGTTCAGTATATTACTACAATAAGTACAAATGATATAACCGGGTTAGCTCCGGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATCTAATACACCTGCTATACCGGCATCAATTAATGATTTAGCAGATGTTAATACCGTTAGTCCTGTTCCTACAAACGGATATGTATTAACATGGGATAGTAGTTCGAATAATTGGATTGCAAAAGAACCTGCAACTAACCCATCTGGTAGTACAGCCCTAGCTGATCTAACAGATGTATCTCTATCTGATCTAGCTGCTAGTGATGTTTTAAAATACAACGGTACTACATGGGTAAACGAACCAGTTACGTATTCTGAATTAACAGATTTACCTACATTTGCGTTAGTTGCATTCAGTGGTGATTATAATGATTTAACTAATAAGCCATCAGGATCTACTACATCTATACTAGATCTAACTGACACTGCAGATACTGCACTACCCAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGTGGCGATGAGGTTTTATATCAATCATCTATTGATGTTTCTGATATAATAGGATTATCCGGTGTAGCTATAAGTGGTGATTATAACGATTTATCCAACAAACCGGAAAATAATTCGTATTATTTTAGAAAGTTAGCTGATGCAGGAAATCCGCAGCCTAATACATTTATAAAATATCCTGCGTTTACTATTCCGCCCGGTAGTGATATAGACGATGTTAATCCTATACTCGAATATGTAAGTAGCATAAATGCACTAACTGACATAGATAACCTAGCTCCGGTTGCTACTAACGGAATACTAGGCAGTTTAGTAGACGTAAATCTAAATTCAGTAGAAGATGGACAAGTTCTTACTTATGATGCTGTAACAAATAGCTGGATAAACAAAAATAGTTCAGGATCGCCGGTAGTAACTTCGTGGACAAAGATAAGTGGCAACTATACTGTAACTGGCTCAGAATATTTATTGGTAGATACGACTTCTGCTAGTGTAACAATTACTCTGCCTGTTGCCCCTACCGAAAATATGGTAATTCGTATTGCTGATTGGAAAGGTACATTTAG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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
29f68c10ee689b0c9d89e66278b40109a1335c6f46df2fd78b99c20a3b519784
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50
Literature
| Title | Authors | Date | PMID | Source |
|---|---|---|---|---|
| Whole-Genome Sequence of Pseudomonas phage 30-3 | Fujiki,J., Nakamura,T., Nakamura,K., Tamamura,K., Ichikawa,N., Ishiguro,Y. and Iwano,H. | 2021-07 | — | GenBank |