Genbank accession
BDR26168.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MSIQSGPSVLNQFVPDFLIDSTPTNGQFLVYDDTVQAFVNSTNPRIVLDSSNILDGSITIDKLAISGNKVPGYVLTITSAGGMAFLPVPGSGGQLPSLDELLDTNIVSPTITQYLKWDGSAWVNSNITLNDVSDVSVISPTADDVLAWESGSWTNKKIDYTSLTNKPDLSDVVRSSELSSVAFSGDYNDLVNIPSATSNTIVGLTDVNDTALPNGFLRWNASGDEVEFITSISATVITGLAPVATSGNYNDLLGKPNLSVYPLRTEFSTVATTGNYSDLNNVPLTFAPSAHTHPAAQITGLASVATSNDYNDLVNKPTAMAPTAHTHAISDIIGLQNSLDSKLTVNLTTRLPKDVIYFNGTSWVNKQLSYTDISGTPNLDNYVTDSELSTVATTGRYSDLINKPELVENLNDLLDVDVSSKQTGNVLTWNGTAWVASAITQASIDWANISNKPSVFSPAAHTHDVVDVLGLQSLLDSKLDANIAFDGDYNSLTNKPGLIDLQDTFSPAVPNGFLRWNNLGTLVAYQDYIYPQDISGLSDVAISGQYSDLLGTPSLSTVAITGSYSDLIDAPPAFDGDYDSLTNKPFIPTNFDFKFIGLNDVSPTVQPGGYLKWNLDGSFVVSSANIPATDVAGLSVVSTTGQYSDLLGKPLLATVSSSGSYTDLINIPTEFNPAVHTHNIADISGLQAALDNKLNTSDAFSGDYNDLTNAPTNSSYSLVGLSDTNSVPVANGFLRWNASGSSVEYIQTIPVNAITGLAPVASSGQYADLQGTPDLSDYVLSVSLADIATTGEYSDLINAPDLSVYANKTDLSDVATTGQYSDLLGIPTQFTPTVHVHNVSQISGLATVATSGSYNDLSNKPSFANVATTGSYDDLNNKPSIPTNGSFSLLGLNDTNNTPVADGILRWNSSANQVIYANTIDAQSVSGLATVATIGKLSSLSDVDLIGLNQNEILQWNGSAWVPVPYNPNQIQAYIESGNTKVSTNDILDSIVLTAGPTTGNIIFELGNTNSSIILNPVANNVDALISSTSRIKLDSSTGISLGNISYPMTDGTVGQAVVTNGAGQLSFETVVKPSQLATVATSGNYNDLTNKPTLVTELNGLADVRMRDTNGNYLAQPEDVLTYSNGIWQARPNTSSSFIGLSDTQNITLPEDRANAYLRWDTTGNLIIYEDSISASVIAGLAEVATTGDLHDLINVNVNLPDMNNPATQAVWGLIWDRQNQRWINYNLRNIAGSGGSTVVALNDLTDVTLTFPVVDGNVLRATVQPDNSIVWQNKQLSYSDLTGTISMSLLQLTDTSSSAVPNGFLRWDSSGNTVQYITTISTNDITGLAPVATSGNYNDLSNTPAIPASINDLADVNTVSPVPTNGYVLTWDSSSNNWIAKEPATNPSGSTALADLTDVSLSDLAASDVLKYNGTTWVNEPVTYSELTDLPTFALVAFSGDYNDLTNKPSGSTTSILDLTDTADTALPNGFLRWNASGDEVLYQSSIDVSDIIGLSGVAISGDYNDLSNKPENNSYYFRKLADAGNPQPNTFIKYPAFTIPPGSDIDDVNPILEYVSSINALTDIDNLAPVATNGILGSLVDVNLNSVEDGQVLTYDAVTNSWINKNSSGSPVVTSWTKISGNYTVTGSEYLLVDTTSASVTITLPVAPTENMVIRIADWKGTFRTNSCVVNTNGMPLMGASMDNTLTIQNQNASIELTFVDTTYGWKITDGIGEISKQNIPVTNWRTVDSSSTPAMLIAQPGEAIYVNTNNGAVTVKLPTGASVNAVVRIADLLGTYDKASCFVDGNGNPIMGKNEILEIANENASIEFTYVDSVVGWKVTDGIGELGRKTDIASDSDIIVYVATDGNDTTGSGTEESPFATLNAAFLSLDGKFVNSSAEIIVRVAEGVYEPTNPVAFSHIQGMNVKLIGEMPQASSSFTVTNITNNAGLATVTMQLSSVSDYEVGDIIKITSAATMLECVEIITAINTGSNTLEIVIPNSVLADVSDYTGYTGTISKFTTVFKNTNMYVAGGYSLGFIDNIALVDDTGLGTALTVGRTYTTGIYDGPAYVGLGANFAVYGYETAIQSIPGSSVVLAGNLCRQAVAAIRADGSILSFNAGQSVYIANQAQDGIVLKHGSKLIHNDDASQSFVFVIFNNIKSGTIMSLDTSISTANFEVKNSEGIMIAATRHSTVDARSAIVSGTITGDLEVNATGMSVININEPAGSTNIPLAVVCNPAHGSNTELQKGYIGL
Physico‐chemical
properties
protein length:2236 AA
molecular weight: 236321,91070 Da
isoelectric point:4,09601
aromaticity:0,07379
hydropathy:-0,02263

Domains

Domains [InterPro]
DC_0165
STR
693–783
BDR26168.1
1 2236
Architecture
STR
ATT
STR
STR
ATT
STR
RBD
STR 1-265 | ATT 321-592 | STR 593-862 | STR 880-1118 | ATT 1119-1393 | STR 1394-1841 | RBD 1842-2236
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pseudomonas phage sp. 30-3
[NCBI]
2972143 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Pseudomonas aeruginosa
[NCBI]
287 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
BDR26168.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LC727698 [NCBI]
CDS location
range 168088 -> 174798
strand +
CDS
ATGAGTATACAATCAGGTCCTTCTGTATTAAATCAATTTGTTCCAGATTTTCTAATAGATAGTACACCAACTAATGGTCAATTTTTAGTTTATGACGATACTGTCCAGGCATTTGTAAATAGCACAAATCCCAGAATCGTATTAGATTCGTCTAATATATTAGACGGTTCTATAACAATTGATAAACTTGCAATATCTGGTAATAAAGTGCCTGGATACGTACTAACTATAACTTCCGCGGGCGGAATGGCATTTTTACCAGTACCTGGCAGCGGTGGCCAATTACCTAGTCTAGATGAATTACTAGACACAAATATAGTATCTCCTACTATAACCCAATATCTTAAATGGGACGGTTCTGCATGGGTTAATAGTAATATAACGTTAAATGATGTATCAGATGTCTCTGTTATCTCCCCTACAGCTGATGATGTATTAGCATGGGAATCAGGTTCTTGGACAAATAAGAAAATAGATTATACATCACTAACAAACAAACCAGATTTGAGTGATGTAGTTAGATCTAGCGAATTGTCATCAGTTGCATTCAGTGGTGATTATAATGATTTAGTAAATATTCCCAGTGCAACTTCTAATACTATAGTTGGATTAACAGATGTTAACGATACTGCACTACCCAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGTGGCGATGAGGTAGAATTTATTACTTCAATTTCTGCTACTGTAATAACCGGGTTAGCTCCAGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATTAGGAAAACCTAATTTGTCAGTGTATCCGCTTAGAACTGAATTTTCCACTGTTGCAACCACCGGTAATTATTCTGATTTGAACAATGTGCCTTTGACATTTGCACCAAGTGCGCATACTCACCCGGCTGCACAAATCACAGGATTAGCATCTGTAGCTACTAGCAACGATTATAACGATTTAGTTAATAAACCGACTGCGATGGCGCCAACAGCACATACGCATGCTATATCTGATATTATAGGATTGCAAAATTCGCTAGATAGTAAGCTGACTGTTAATTTAACTACTAGACTTCCAAAAGATGTTATTTATTTTAACGGCACTTCGTGGGTAAACAAGCAATTATCTTATACTGATATTTCCGGTACTCCTAACTTAGATAACTATGTTACTGATTCAGAATTATCTACTGTTGCTACAACTGGCAGATATTCTGATTTAATAAATAAACCCGAGTTAGTAGAAAATTTAAACGACTTATTAGATGTAGATGTTTCTTCTAAACAAACAGGGAACGTATTAACCTGGAACGGAACAGCATGGGTTGCTAGTGCAATAACACAAGCAAGCATAGATTGGGCTAATATAAGCAATAAACCAAGCGTTTTTAGCCCCGCTGCGCATACACACGACGTAGTAGACGTACTAGGCCTGCAAAGTTTACTAGACAGCAAACTTGACGCAAATATTGCATTCGACGGCGATTATAATAGTTTAACAAATAAACCGGGGTTAATAGATCTTCAAGATACATTTAGTCCTGCTGTACCTAATGGATTCTTACGGTGGAATAATTTAGGTACCTTAGTTGCATATCAAGATTATATATATCCGCAAGATATTTCAGGATTGTCGGACGTTGCTATATCAGGTCAGTATTCGGATTTATTGGGTACTCCTTCCTTATCAACTGTTGCTATAACCGGGAGTTATAGCGACTTAATTGATGCGCCGCCTGCATTTGACGGTGATTATGATAGTTTAACAAATAAACCGTTTATTCCTACTAATTTTGATTTTAAATTTATAGGTTTAAATGATGTAAGTCCTACTGTTCAGCCTGGCGGCTATTTAAAATGGAACTTAGACGGTTCATTTGTTGTATCGTCAGCAAACATTCCTGCAACAGATGTAGCAGGTTTATCTGTTGTGTCTACAACCGGACAATATTCGGATTTATTAGGCAAACCGTTATTAGCTACAGTTTCTTCGTCGGGTAGTTATACTGATTTAATAAATATTCCTACTGAATTTAATCCAGCCGTACATACCCACAATATAGCAGACATATCCGGATTACAGGCAGCCCTGGACAATAAATTAAATACATCTGATGCATTTAGTGGTGATTATAATGATCTAACTAATGCACCTACTAATAGTTCATATTCATTAGTGGGTTTATCAGATACTAATTCTGTACCTGTTGCAAACGGATTCTTACGCTGGAATGCATCTGGAAGTAGTGTTGAATATATTCAAACAATTCCTGTAAATGCAATAACTGGATTGGCTCCTGTTGCATCATCTGGCCAGTATGCAGATTTGCAAGGAACACCGGATTTATCTGACTATGTTTTATCTGTATCATTGGCTGACATAGCTACAACTGGAGAATATTCAGATTTAATAAATGCACCTGATTTAAGTGTGTATGCTAATAAAACTGATCTGTCAGATGTAGCTACAACAGGACAATATTCGGATTTATTGGGTATTCCTACACAATTTACACCGACAGTTCATGTCCATAACGTTTCTCAAATAAGTGGATTAGCTACTGTTGCTACTAGCGGAAGTTATAATGATTTATCTAATAAACCGTCGTTTGCTAATGTTGCAACTACAGGCAGCTATGATGATCTAAACAATAAACCATCCATACCTACTAATGGCAGTTTTAGTTTACTTGGGTTAAATGATACAAATAATACGCCAGTTGCAGATGGTATATTGCGTTGGAATTCCAGTGCAAATCAGGTAATATATGCAAATACAATCGATGCACAATCTGTTTCTGGATTAGCTACTGTTGCAACTATAGGTAAACTATCTTCACTAAGTGATGTAGATTTAATAGGTTTGAACCAGAATGAAATATTGCAATGGAACGGTTCTGCATGGGTACCTGTACCTTATAATCCTAATCAAATACAAGCCTACATAGAGAGCGGAAATACAAAAGTTTCTACTAACGATATTTTAGATAGCATTGTTCTAACAGCAGGACCTACTACTGGAAATATAATATTCGAGTTAGGAAATACAAATAGCTCAATTATTCTAAATCCAGTTGCTAATAACGTAGATGCTCTTATTTCTTCTACTTCTAGAATAAAATTAGATTCATCCACTGGCATATCATTAGGTAATATAAGTTATCCAATGACCGACGGTACAGTTGGGCAAGCAGTAGTTACAAATGGAGCTGGCCAACTATCGTTTGAAACAGTAGTTAAACCCTCTCAATTGGCTACAGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTAACTAATAAACCTACATTAGTAACCGAACTAAACGGACTTGCTGACGTTCGTATGCGTGATACTAATGGAAATTATTTAGCACAACCAGAGGATGTGTTAACATATTCTAACGGAATATGGCAAGCACGACCGAACACTAGTTCTTCTTTTATAGGTTTAAGCGATACCCAAAATATAACATTGCCAGAAGATAGGGCTAATGCATACTTACGTTGGGATACTACTGGAAATCTAATTATATACGAAGATAGTATTTCTGCAAGCGTAATTGCCGGATTAGCAGAAGTAGCAACCACAGGAGATTTGCACGATTTAATAAATGTAAATGTAAATTTACCTGATATGAACAATCCAGCTACACAAGCTGTTTGGGGTTTAATATGGGATCGTCAGAATCAACGTTGGATAAATTACAATTTACGTAATATAGCAGGTTCGGGTGGATCTACAGTAGTAGCATTGAATGACTTAACTGATGTTACTCTTACTTTCCCTGTAGTTGACGGTAATGTTCTTAGAGCAACTGTGCAACCAGACAATAGTATTGTTTGGCAGAACAAACAACTATCTTATAGTGACTTAACTGGAACTATAAGTATGAGTCTGTTGCAATTAACTGATACTAGTTCATCTGCTGTACCTAATGGATTCTTACGGTGGGACTCATCGGGTAACACAGTTCAGTATATTACTACAATAAGTACAAATGATATAACCGGGTTAGCTCCGGTTGCTACTAGTGGAAATTATAATGACTTATCTAATACACCTGCTATACCGGCATCAATTAATGATTTAGCAGATGTTAATACCGTTAGTCCTGTTCCTACAAACGGATATGTATTAACATGGGATAGTAGTTCGAATAATTGGATTGCAAAAGAACCTGCAACTAACCCATCTGGTAGTACAGCCCTAGCTGATCTAACAGATGTATCTCTATCTGATCTAGCTGCTAGTGATGTTTTAAAATACAACGGTACTACATGGGTAAACGAACCAGTTACGTATTCTGAATTAACAGATTTACCTACATTTGCGTTAGTTGCATTCAGTGGTGATTATAATGATTTAACTAATAAGCCATCAGGATCTACTACATCTATACTAGATCTAACTGACACTGCAGATACTGCACTACCCAACGGATTCTTGCGCTGGAACGCAAGTGGCGATGAGGTTTTATATCAATCATCTATTGATGTTTCTGATATAATAGGATTATCCGGTGTAGCTATAAGTGGTGATTATAACGATTTATCCAACAAACCGGAAAATAATTCGTATTATTTTAGAAAGTTAGCTGATGCAGGAAATCCGCAGCCTAATACATTTATAAAATATCCTGCGTTTACTATTCCGCCCGGTAGTGATATAGACGATGTTAATCCTATACTCGAATATGTAAGTAGCATAAATGCACTAACTGACATAGATAACCTAGCTCCGGTTGCTACTAACGGAATACTAGGCAGTTTAGTAGACGTAAATCTAAATTCAGTAGAAGATGGACAAGTTCTTACTTATGATGCTGTAACAAATAGCTGGATAAACAAAAATAGTTCAGGATCGCCGGTAGTAACTTCGTGGACAAAGATAAGTGGCAACTATACTGTAACTGGCTCAGAATATTTATTGGTAGATACGACTTCTGCTAGTGTAACAATTACTCTGCCTGTTGCCCCTACCGAAAATATGGTAATTCGTATTGCTGATTGGAAAGGTACATTTAG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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
29f68c10ee689b0c9d89e66278b40109a1335c6f46df2fd78b99c20a3b519784
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,3618
Oligomeric State monomer
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Whole-Genome Sequence of Pseudomonas phage 30-3 Fujiki,J., Nakamura,T., Nakamura,K., Tamamura,K., Ichikawa,N., Ishiguro,Y. and Iwano,H. 2021-07 — GenBank