Protein

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Genbank accession
YP_008130147.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MANRLQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFAAGTITATIIGNASTAARLASTRQIQLSQDVTATGNFDGSTNLNLQASLELIPTLPHYDGTASASGTYTKVTVDSKGRITNASFPSTLADYNLNGTVEGSSAQPYDLDLVAIAGLTTTGIISRTSGGNMATRTITGTATRISVANGNGVSGNPTLDLITTAVQAGDYNTESLTSVNSAGSNSEPFGTETVNATKFTVDAHGRLTSATNVPIATAVEGTTALDYNAATSYSRYAIIKNASKVYQAYQAISAGAGAPTHTSGDNGGWRYLAAESTEQKGLASFAQEDFDVAAGHVSIAAAGVDNTQLQNNRISFADGNSIEHFELDQELTTTTGYRGFTGINYVNVKNTSGGLLFAANNTGDSGNGEVDINVKSLISDPDFIFDGATTQQIDKTGDGDFNIELTQNTSSNRNLTIASTNAGSGTSRVTITAEDVIDIDTSESTGKVHVENMRFQEDYIGSSNATLHLDPGDDRAITGLVRVHGDLQVDGTTTTVNSTVTTVDDPIITLGGDTAPASDDNKDRGVEFRYYDSQARVGFFGYDDSYTDLGGHVGGFTFLHNATNTSEVFSGTASGITAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGIGDDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVFQGASKTLELKNGSGTTKTTLHTTTGNVDVGGILTVTGNVDANSDVAVAGDIHLESTNDITTAKNGTSGAWEIQSNDYGALRLDGGFYVAGSGLIDGTLHVNGPIEVKDSATETESRLNWLRVRYRGRFGDTYQASPSYASHNFSTIKAHGGAGIMKSLYVGATGSGERFSVGKLNSGDTEKFSVIGATGNTDIQGTLTVAGETNINDTLIINASNESFHIQNGSGVNKFTVDTDNGNTIIEGTVNINGVTDIDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTNIEGTLTADGHAELNSTLNVDSNTTLGGTLTVANNTEINGTLDVDANFAVRSGTTDKMTVASSTGNIATDGTLVVAGQTTINDSLIIQSDNEVVNINTGSGVTKFSIDTDNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFQTSGVNTFTANSQQTLTGTYGADGALRLTGGAGIGKNLAVGEGLRVYGGTELTGALDLNSSANISGSTIVENQLIVKADNKVFKVQTAGAVDKFVVDTDNGNTETQGTLTVQGDITGNSNLIITGNLTVNGTTSTVNSTTVTIDDPVFTLGGDTAPASNDGKDRGIEFRYFDGSAKLGFFGFDRSSQEFAFLTTATNSSEVFSGTDGALRIGSLRVTGAGTSVDIDNNLNVDGTATVDGQIISQLAQGVAPFVVASSTKVNNLNADFLDGLTTSATDTTGNSVVTRSSGNFSAGQITAATGTGAAAGFLGNASTADAWKTARTLTIDGVVDGSVSINGASDPTLTVTFNDADITALAAQSGTGYMVRTAANTYAHRTFSVTSNSGLTLTNADGISGNTTINVASASTNAANNLVLRDGSGNFASNVITATSFSGNLIKSSTSAKDIKPETNSTYDLGSSTLQWANIHADAANIDTVTGNLIGNVTGNLVAATTQAKDIDPALNSTYDL
Physico‐chemical
properties
protein length:1619 AA
molecular weight: 166925,05230 Da
isoelectric point:4,38117
aromaticity:0,05991
hydropathy:-0,22217

Domains

Domains [InterPro]
SSF69349
STR
4–242
SSF69349 DC_1607 DC_1607
IPR041352
ATT
6–43
IPR041352
YP_008130147.1
1 1619
Architecture
ATT
STR
STR
STR
ATT 4-43 | STR 44-242 | STR 339-912 | STR 1108-1585 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Prochlorococcus phage P-SSM3
[NCBI] 		536453 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Ronodorvirus > Ronodorvirus pssm3
Host Prochlorococcus marinus str. NATL2A
[NCBI] 		59920 Bacteria > Cyanobacteria > Prochlorales > Prochlorococcaceae > Prochlorococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_008130147.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_021559 [NCBI]
CDS location
range 174206 -> 179063
strand +
CDS
ATGGCGAATAGATTACAATTAAGAAGAGGGGGTGCTCAGGAATGGGCAAACGCAAACCCAACACTTGCTCAAGGTGAACTTGGTATTGAGCTAGATACAGGTCGATTTAAAATCGGTGATGGTGTATCTGCATGGAACACGTTGCGATATGAACGTCCAGTAGAATCAACATCAAACACTGCTAATACTCTCGTACAGAGAGATGCTGATGGTAATTTCGCTGCAGGTACTATAACTGCAACTATAATTGGTAATGCATCAACTGCTGCTAGACTTGCTTCAACTCGTCAGATACAGTTATCTCAGGACGTAACTGCTACAGGAAACTTTGACGGATCTACAAACTTAAACTTACAAGCTTCATTAGAATTAATACCTACACTACCTCATTATGATGGTACAGCAAGTGCTAGTGGTACATACACGAAAGTCACAGTTGATTCTAAAGGTAGGATAACTAACGCTTCATTCCCTTCAACTCTTGCAGATTACAACTTAAACGGAACTGTTGAAGGATCTTCTGCTCAACCATACGACCTTGACTTGGTTGCAATAGCAGGACTTACTACTACTGGTATAATATCAAGAACCAGTGGTGGAAACATGGCAACCAGAACTATTACTGGTACTGCTACAAGAATTTCTGTAGCTAATGGTAATGGTGTTTCTGGAAACCCAACATTAGATCTTATTACAACTGCTGTACAAGCAGGTGATTATAATACGGAATCCCTGACATCCGTAAATTCTGCAGGTTCTAACTCAGAACCCTTTGGTACAGAGACAGTTAACGCTACTAAGTTCACTGTAGATGCACATGGTAGATTGACAAGTGCGACAAATGTGCCTATCGCTACAGCAGTAGAAGGTACAACTGCACTAGATTATAATGCAGCGACTTCATACTCTAGGTATGCAATCATCAAGAATGCATCAAAAGTTTATCAAGCATATCAAGCTATTTCTGCAGGTGCAGGTGCTCCTACTCATACTAGCGGTGATAATGGCGGGTGGAGATACCTCGCTGCCGAGAGCACTGAACAGAAAGGTCTTGCATCCTTTGCCCAAGAAGACTTTGACGTAGCAGCTGGACATGTTTCTATTGCTGCTGCAGGTGTAGATAATACACAATTACAGAACAATCGCATTTCTTTTGCTGACGGTAATTCTATTGAGCATTTTGAATTAGATCAAGAACTCACCACAACAACTGGATATAGAGGATTTACTGGAATAAATTATGTCAATGTAAAGAATACATCAGGTGGTTTATTATTTGCTGCTAATAACACAGGTGATAGTGGCAACGGTGAAGTTGATATTAATGTAAAATCATTAATAAGTGATCCAGATTTTATCTTTGATGGTGCTACAACACAACAGATTGATAAGACTGGTGATGGTGATTTTAACATTGAACTAACACAGAACACTTCATCTAATAGAAACCTTACTATTGCTTCTACTAACGCAGGATCTGGAACTAGCAGAGTTACAATTACTGCAGAAGACGTTATTGATATTGATACTTCTGAATCAACTGGTAAAGTTCATGTAGAAAACATGAGATTCCAAGAAGATTATATTGGATCTTCTAATGCAACCTTACATCTTGATCCAGGTGATGATAGAGCAATTACAGGGTTAGTACGAGTTCATGGAGATTTACAAGTAGATGGTACGACGACGACAGTTAATTCAACAGTTACAACAGTGGATGATCCCATCATTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCTGCTAGTGATGACAATAAAGATCGTGGTGTTGAGTTCAGATATTACGATAGTCAAGCAAGAGTTGGTTTCTTTGGATATGATGACTCATACACCGACCTCGGAGGACACGTCGGAGGATTCACATTTTTACACAACGCCACAAATACTTCAGAGGTCTTTAGTGGAACAGCGTCAGGTATAACTGCAGGTAACTTAAAACTTACAACAAATACAAACTCAACATCTAATACTACAGGAGATTTGGTAGTTGCGGGTGGTGTTGGTATTGGAGATGATGTTAATATTGGTGGATTATTAGATGTAGATGGTACATTCCGTGCTAATTCTACAAGTAGATTTGATGATAATATCGTATTCCAAGGTGCTTCTAAGACCTTAGAACTTAAGAACGGATCAGGAACTACTAAAACTACACTTCACACCACTACAGGTAATGTTGATGTAGGTGGTATCCTCACAGTCACTGGTAATGTAGATGCTAATAGTGATGTTGCTGTGGCAGGAGATATACATCTAGAAAGCACAAATGATATTACCACTGCTAAGAATGGAACCTCTGGTGCTTGGGAGATTCAATCAAATGATTATGGTGCACTTAGACTTGATGGTGGTTTCTATGTAGCAGGATCTGGTCTGATTGATGGTACATTACATGTTAATGGTCCTATCGAAGTTAAGGATAGTGCAACAGAGACTGAATCTAGATTGAACTGGTTGAGAGTTAGATACAGAGGTCGTTTTGGTGATACTTATCAAGCATCTCCATCTTATGCATCTCATAACTTCTCCACTATAAAAGCACATGGTGGTGCAGGTATTATGAAATCCTTGTACGTTGGTGCTACAGGGTCAGGAGAGAGGTTCTCAGTTGGTAAATTAAACAGTGGTGATACAGAGAAGTTTAGTGTTATTGGTGCAACTGGTAATACAGATATTCAAGGTACACTGACAGTTGCAGGTGAGACAAATATAAATGATACTCTTATAATTAATGCCTCTAACGAATCATTCCATATTCAAAATGGATCAGGAGTCAATAAATTTACAGTTGATACAGATAATGGTAATACTATAATTGAAGGTACAGTTAATATTAATGGTGTTACTGATATTGATGCTGATTTCGCAGTTAGAAACGGAACGACTGATAAGTTCTTTGTCGATAATGTAACTGGTAATACTAATATTGAAGGCACGCTGACTGCTGATGGTCATGCTGAATTAAATTCAACACTTAATGTTGATAGTAATACAACTCTTGGTGGTACGCTAACTGTTGCTAACAACACAGAAATCAATGGCACCTTAGATGTTGATGCAAACTTTGCAGTTAGATCAGGTACGACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCTACAGGTAATATTGCAACTGATGGTACTCTAGTTGTTGCAGGTCAAACAACAATTAACGACTCTTTAATAATTCAAAGTGATAATGAAGTAGTTAATATAAACACTGGTTCTGGTGTAACTAAGTTCAGTATTGATACTGATAACGGTAATACCAATATAATCGGTACGTTAACAGTTGGTGATGCAACTCAAATTAACGATACATTCCAAACATCTGGTGTTAATACATTTACTGCAAACTCACAACAAACATTAACAGGAACTTATGGTGCTGATGGTGCTCTAAGACTTACTGGTGGTGCAGGTATTGGTAAAAACTTAGCAGTTGGTGAGGGATTAAGAGTTTATGGTGGAACTGAATTAACAGGTGCTCTTGATCTTAACAGTAGTGCAAATATATCAGGTTCAACAATTGTTGAGAACCAATTAATTGTTAAAGCAGATAATAAAGTATTCAAAGTACAAACAGCTGGTGCTGTTGATAAGTTTGTGGTTGACACAGACAATGGTAATACTGAAACACAAGGAACATTAACAGTTCAAGGAGATATAACTGGTAATTCTAATCTAATCATCACAGGTAATCTTACAGTTAATGGTACAACTTCTACAGTTAACTCAACAACGGTCACTATAGATGATCCTGTATTTACTCTAGGTGGTGATACTGCTCCTGCATCAAATGATGGTAAAGATAGAGGTATTGAATTTAGATATTTTGATGGATCTGCTAAACTTGGTTTCTTTGGATTTGATAGATCATCTCAAGAATTTGCTTTCCTAACTACTGCTACTAATAGTAGTGAAGTTTTCTCAGGAACTGATGGTGCATTAAGAATTGGTTCTCTAAGAGTCACTGGTGCAGGTACATCAGTTGACATTGATAATAACTTAAACGTTGATGGTACAGCAACAGTTGATGGTCAGATAATTTCTCAACTTGCTCAGGGTGTTGCACCATTTGTAGTTGCATCTTCAACTAAAGTCAATAATCTTAACGCAGATTTCCTTGATGGATTGACTACAAGTGCTACAGACACAACTGGTAATAGTGTTGTAACTAGATCATCTGGTAATTTCTCTGCAGGACAAATCACTGCTGCAACTGGAACTGGTGCTGCTGCAGGATTCTTAGGAAACGCATCAACTGCTGACGCATGGAAGACTGCTAGAACACTTACTATTGATGGTGTAGTAGATGGTTCAGTATCAATCAATGGTGCTTCTGATCCAACACTTACAGTTACATTTAATGATGCAGACATTACTGCACTTGCTGCACAATCTGGCACAGGATACATGGTCAGAACTGCTGCAAACACATATGCTCATCGTACATTCTCAGTCACATCAAATTCTGGTCTTACACTAACAAATGCTGATGGTATATCTGGTAATACTACAATCAACGTAGCATCTGCAAGCACAAACGCTGCAAACAACTTAGTCTTACGTGATGGATCTGGTAATTTTGCTTCTAACGTAATTACTGCTACTTCTTTCTCAGGTAATCTTATAAAATCTAGCACTTCAGCTAAGGATATTAAACCTGAGACAAATTCAACATACGATTTAGGTTCTAGTACATTACAATGGGCAAACATTCATGCTGACGCAGCGAATATTGATACTGTCACAGGTAATTTAATTGGTAATGTAACAGGTAATCTTGTAGCAGCAACAACTCAAGCCAAAGATATAGATCCTGCTTTAAATTCAACATACGATTTAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
4005a4c93b70fd030e4bbd6311433c79300cd1c2d0c1823804c7ac7d2c32aaa3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,6149
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
The Genome Sequence of Prochlorococcus phage P-SSM3 Henn,M.R., Sullivan,M.S., Osburne,M.S., Levin,J., Malboeuf,C., Casali,M., Russ,C., Lennon,N., Chapman,S.B., Erlich,R., Young,S.K., Yandava,C., Zeng,Q., Alvarado,L., Anderson,S., Berlin,A., Chen,Z., Freedman,E., Gellesch,M., Goldberg,J., Green,L., Griggs,A., Gujja,S., Heilman,E.R., Heiman,D., Hollinger,A., Howarth,C., Larson,L., Mehta,T., Pearson,M., Roberts,A., Ryan,E., Saif,S., Shea,T., Shenoy,N., Sisk,P., Stolte,C., Sykes,S., White,J., Yu,Q., Coleman,M.L., Huang,K.H., Weigele,P.R., DeFrancesco,A.S., Kern,S.E., Thompson,L.R., Fu,R., Hombeck,B., Chisholm,S.W., Haas,B., Nusbaum,C. and Birren,B. 2011-09-23 — GenBank