Protein
View in Explore- UniProt accession
- A0A1D7S387 [UniProt]
- Protein name
- Baseplate wedge tail fiber connector
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAKQALNLGASANDNTGDTLRIGGDKINDNFNELYSALGNGVNLTVSLLNPSSGQVLRYNGTNFVAADYSNLTSALDVNGNSIISSSNGNIPIAANGVGVISLASNSITSTFGATIDMPTQVKYKNEYTSLGAAPAAADYPGYFFTIDGADDPYVNINIATGGVGDVRAKLITEYSSLDDLSDVDLTSNAPTNNQVLKWNAATNKFIPGDDVAGAGEQNIFATVAGDTGSTNADSATDTLTIAGGTNITTSVSGDTLTVDFSGTLTTTFAALTDTDTNGLTQGDNIYWNGTNWVRSQGGSPMIWWELTVPVENSSNDYFFAGPGFDGTVRDPTLYVYRGFTYAFDNTIEGGGHPFRIQSTQGLTGTPYTTGQSGSGSSILYWTIPMDAPNTLYYQCTLHANMQGTINVVS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 410 AA molecular weight: 42979,37070 Da isoelectric point: 4,05003 aromaticity: 0,09512 hydropathy: -0,18220
Domains
Domains [InterPro]
IPR036240
STR
1–57
STR
1–57
DC_0210
STR
1–410
STR
1–410
IPR008987
ATT
3–135
ATT
3–135
G3DSA:1.20.5.960
Unmapped
13–43
Unmapped
13–43
1
410
Architecture
ATT 1-135 | STR 136-410
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Synechococcus phage S-RIM2 [NCBI] |
687800 | Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Nerrivikvirus > Nerrivikvirus srim2 |
| Host |
Synechococcus [NCBI] |
1129 | cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AON99318.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349234
[NCBI]
CDS location
range 74184 -> 75416
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAAACAAGCACTAAACCTTGGAGCTTCTGCTAATGACAATACGGGGGACACCCTCCGTATTGGTGGTGATAAAATTAATGACAACTTTAATGAGTTATATTCTGCTCTAGGAAATGGAGTGAACTTAACGGTTAGTTTGCTGAACCCTTCTTCGGGTCAGGTTCTCCGTTATAATGGCACCAACTTTGTTGCTGCTGATTATAGTAACTTGACATCTGCTTTGGATGTCAATGGTAACTCTATCATCTCTTCTAGTAATGGAAATATCCCCATTGCTGCAAACGGCGTGGGCGTTATTAGCCTAGCATCTAACAGTATCACTTCAACGTTTGGTGCTACTATTGATATGCCAACGCAAGTGAAGTATAAGAATGAATATACATCGCTTGGTGCTGCTCCTGCTGCAGCAGATTACCCTGGATATTTCTTCACGATCGATGGCGCTGACGATCCATATGTAAACATCAACATTGCAACTGGTGGTGTTGGTGATGTGAGAGCAAAACTTATCACTGAATATTCCAGTCTTGACGACTTAAGTGATGTTGACCTTACATCTAATGCTCCTACCAACAATCAGGTCTTAAAGTGGAATGCTGCTACCAATAAGTTCATCCCTGGTGATGATGTTGCTGGTGCAGGTGAGCAGAATATCTTTGCAACTGTTGCTGGTGATACTGGAAGCACCAATGCAGATAGTGCAACAGATACATTGACTATTGCTGGCGGCACTAACATCACAACATCAGTTTCTGGTGACACATTGACTGTTGACTTTAGTGGCACTCTTACTACTACGTTTGCTGCTCTGACTGATACTGATACAAATGGTCTCACTCAAGGCGACAATATATACTGGAACGGAACCAACTGGGTTAGATCTCAGGGTGGAAGTCCTATGATTTGGTGGGAACTGACTGTTCCCGTAGAAAATTCTAGCAATGATTACTTCTTTGCTGGTCCTGGATTTGATGGTACAGTTCGTGACCCAACGCTGTATGTTTACAGAGGGTTCACTTATGCGTTTGATAATACGATCGAAGGTGGTGGTCACCCCTTCAGGATCCAGTCAACTCAAGGTTTGACTGGTACTCCATACACTACTGGTCAGAGTGGTAGCGGTTCTTCGATTCTCTACTGGACTATCCCTATGGATGCTCCTAATACACTGTATTATCAGTGTACACTCCATGCGAATATGCAAGGTACAATTAACGTCGTAAGTTGA
Genbank protein accession
AOO07661.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349273
[NCBI]
CDS location
range 74410 -> 75642
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAAACAAGCACTAAACCTTGGAGCTTCTGCTAATGACAATACGGGGGACACCCTCCGTATTGGTGGTGATAAAATTAATGACAACTTTAATGAGTTATATTCTGCTCTAGGAAATGGAGTGAACTTAACGGTTAGTTTGCTGAACCCTTCTTCGGGTCAGGTTCTCCGTTATAATGGCACCAACTTTGTTGCTGCTGATTATAGTAACTTGACATCTGCTTTGGATGTCAATGGTAACTCTATCATCTCTTCTAGTAATGGAAATATCCCCATTGCTGCAAACGGCGTGGGCGTTATTAGCCTAGCATCTAACAGTATCACTTCAACGTTTGGTGCTACTATTGATATGCCAACGCAAGTGAAGTATAAGAATGAATATACATCGCTTGGTGCTGCTCCTGCTGCAGCAGATTACCCTGGATATTTCTTCACGATCGATGGCGCTGACGATCCATATGTAAACATCAACATTGCAACTGGTGGTGTTGGTGATGTGAGAGCAAAACTTATCACTGAATATTCCAGTCTTGACGACTTAAGTGATGTTGACCTTACATCTAATGCTCCTACCAACAATCAGGTCTTAAAGTGGAATGCTGCTACCAATAAGTTCATCCCTGGTGATGATGTTGCTGGTGCAGGTGAGCAGAATATCTTTGCAACTGTTGCTGGTGATACTGGAAGCACCAATGCAGATAGTGCAACAGATACATTGACTATTGCTGGCGGCACTAACATCACAACATCAGTTTCTGGTGACACATTGACTGTTGACTTTAGTGGCACTCTTACTACTACGTTTGCTGCTCTGACTGATACTGATACAAATGGTCTCACTCAAGGCGACAATATATACTGGAACGGAACCAACTGGGTTAGATCTCAGGGTGGAAGTCCTATGATTTGGTGGGAACTGACTGTTCCCGTAGAAAATTCTAGCAATGATTACTTCTTTGCTGGTCCTGGATTTGATGGTACAGTTCGTGACCCAACGCTGTATGTTTACAGAGGGTTCACTTATGCGTTTGATAATACGATCGAAGGTGGTGGTCACCCCTTCAGGATCCAGTCAACTCAAGGTTTGACTGGTACTCCATACACTACTGGTCAGAGTGGTAGCGGTTCTTCGATTCTCTACTGGACTATCCCTATGGATGCTCCCAATACACTGTATTATCAGTGTACACTCCATGCGAATATGCAAGGTACAATTAACGTCGTAAGTTGA
Genbank protein accession
AOO08092.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349275
[NCBI]
CDS location
range 74407 -> 75639
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAAACAAGCACTAAACCTTGGAGCTTCTGCTAATGACAATACGGGGGACACCCTCCGTATTGGTGGTGATAAAATTAATGACAACTTTAATGAGTTATATTCTGCTCTAGGAAATGGAGTGAACTTAACGGTTAGTTTGCTGAACCCTTCTTCGGGTCAGGTTCTCCGTTATAATGGCACCAACTTTGTTGCTGCTGATTATAGTAACTTGACATCTGCTTTGGATGTCAATGGTAACTCTATCATCTCTTCTAGTAATGGAAATATCCCCATTGCTGCAAACGGCGTGGGCGTTATTAGCCTAGCATCTAACAGTATCACTTCAACGTTTGGTGCTACTATTGATATGCCAACGCAAGTGAAGTATAAGAATGAATATACATCGCTTGGTGCTGCTCCTGCTGCAGCAGATTACCCTGGATATTTCTTCACGATCGATGGCGCTGACGATCCATATGTAAACATCAACATTGCAACTGGTGGTGTTGGTGATGTGAGAGCAAAACTTATCACTGAATATTCCAGTCTTGACGACTTAAGTGATGTTGACCTTACATCTAATGCTCCTACCAACAATCAGGTCTTAAAGTGGAATGCTGCTACCAATAAGTTCATCCCTGGTGATGATGTTGCTGGTGCAGGTGAGCAGAATATCTTTGCAACTGTTGCTGGTGATACTGGAAGCACCAATGCAGATAGTGCAACAGATACATTGACTATTGCTGGCGGCACTAACATCACAACATCAGTTTCTGGTGACACATTGACTGTTGACTTTAGTGGCACTCTTACTACTACGTTTGCTGCTCTGACTGATACTGATACAAATGGTCTCACTCAAGGCGACAATATATACTGGAACGGAACCAACTGGGTTAGATCTCAGGGTGGAAGTCCTATGATTTGGTGGGAACTGACTGTTCCCGTAGAAAATTCTAGCAATGATTACTTCTTTGCTGGTCCTGGATTTGATGGTACAGTTCGTGACCCAACGCTGTATGTTTACAGAGGGTTCACTTATGCGTTTGATAATACGATCGAAGGTGGTGGTCACCCCTTCAGGATCCAGTCAACTCAAGGTTTGACTGGTACTCCATACACTACTGGTCAGAGTGGTAGCGGTTCTTCGATTCTCTACTGGACTATCCCTATGGATGCTCCCAATACACTGTATTATCAGTGTACACTCCATGCGAATATGCAAGGTACAATTAACGTCGTAAGTTGA
Genbank protein accession
AOO09165.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349280
[NCBI]
CDS location
range 74408 -> 75640
strand +
strand +
CDS
ATGGCTAAACAAGCACTAAACCTTGGAGCTTCTGCTAATGACAATACGGGGGACACCCTCCGTATTGGTGGTGATAAAATTAATGACAACTTTAATGAGTTATATTCTGCTCTAGGAAATGGAGTGAACTTAACGGTTAGTTTGCTGAACCCTTCTTCGGGTCAGGTTCTCCGTTATAATGGCACCAACTTTGTTGCTGCTGATTATAGTAACTTGACATCTGCTTTGGATGTCAATGGTAACTCTATCATCTCTTCTAGTAATGGAAATATCCCCATTGCTGCAAACGGCGTGGGCGTTATTAGCCTAGCATCTAACAGTATCACTTCAACGTTTGGTGCTACTATTGATATGCCAACGCAAGTGAAGTATAAGAATGAATATACATCGCTTGGTGCTGCTCCTGCTGCAGCAGATTACCCTGGATATTTCTTCACGATCGATGGCGCTGACGATCCATATGTAAACATCAACATTGCAACTGGTGGTGTTGGTGATGTGAGAGCAAAACTTATCACTGAATATTCCAGTCTTGACGACTTAAGTGATGTTGACCTTACATCTAATGCTCCTACCAACAATCAGGTCTTAAAGTGGAATGCTGCTACCAATAAGTTCATCCCTGGTGATGATGTTGCTGGTGCAGGTGAGCAGAATATCTTTGCAACTGTTGCTGGTGATACTGGAAGCACCAATGCAGATAGTGCAACAGATACATTGACTATTGCTGGCGGCACTAACATCACAACATCAGTTTCTGGTGACACATTGACTGTTGACTTTAGTGGCACTCTTACTACTACGTTTGCTGCTCTGACTGATACTGATACAAATGGTCTCACTCAAGGCGACAATATATACTGGAACGGAACCAACTGGGTTAGATCTCAGGGTGGAAGTCCTATGATTTGGTGGGAACTGACTGTTCCCGTAGAAAATTCTAGCAATGATTACTTCTTTGCTGGTCCTGGATTTGATGGTACAGTTCGTGACCCAACGCTGTATGTTTACAGAGGGTTCACTTATGCGTTTGATAATACGATCGAAGGTGGTGGTCACCCCTTCAGGATCCAGTCAACTCAAGGTTTGACTGGTACTCCATACACTACTGGTCAGAGTGGTAGCGGTTCTTCGATTCTCTACTGGACTATCCCTATGGATGCTCCCAATACACTGTATTATCAGTGTACACTCCATGCGAATATGCAAGGTACAATTAACGTCGTAAGTTGA
Genome Context
Genome Context
Gene Ontology
| Description | Category | Evidence (source) | |
|---|---|---|---|
| GO:0019076 | viral release from host cell | Biological Process | IEA:InterPro (UniProt) |
Tertiary structure
PDB ID
77ed24e77df0ca9ae6ee6401d693784ef58c2088da34e067b4c7d349ae3abb46
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50