Protein

Genbank accession
XDJ03730.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,58
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,91
Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRSLRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVDTAAGNDITFTLPSTPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLITAPVQSIVNFRGQQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSIQEVGTHSIEGRTTIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTAQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQDTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTDNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQQGWANAVVTPETLHKKTSTDARIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATEGLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNNTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVTADSVLTISNTGTETHLIFEKGPQTGTNQAQTVTIRVWGNQFSGESDATRSTVFEVADETSYHFYSQREKAGNITFSINGTVMPINVNALGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSANAFRAINGDYGFFIRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140290,86710 Da
isoelectric point:5,19425
aromaticity:0,07448
hydropathy:-0,30675

Domains

Domains [InterPro]
IPR048390
978–1092
IPR048390 IPR048391
XDJ03730.1
1 1289
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Salmonella phage Manna
[NCBI] 		3234042 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XDJ03730.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP987310.1 [NCBI]
CDS location
range 152045 -> 155914
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGACGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGTACGTTGGAGATCATTACGTACTGATGCTAATTGGACAACTGTTTCATCAGGACCTTATCAATTAAAGTCAGGCGAATCAATTTCAGTTGATACTGCAGCCGGTAATGACATTACATTTACTTTACCATCTACCCCAATTGACGGTGATACTATCGTTCTCCAAGACATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTACAGCTCCGGTACAAAGCATTGTAAATTTTAGAGGTCAGCAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCACAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTCGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACGCCTGCGAGTCTCTATCAGGCGCAATCAAACGATTTTATCGTACGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGAGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAATACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACAACGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTGTGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCGCGTTTACGCATTATAACGACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAGCTCAGACAATTGAACTTCAGCTTCCGACTGATATTTCTGTTGGTGATACTGTCAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGCTCAGAATATCCGCCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAATGGTGAAACTAATTATGTTCCGGTTTTACAGCTTGCTTACATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTAGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACGTTAGCTAATCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTTAACCAGGATACTACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACAGCTACTGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAAGAAACTAATGCAGGAACCGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGCCAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGCCGTGAATTAAATGGTACGAATGTTTATAATAAAAACACTGATAATTTAGTTGTTTCACCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGTCAGCAAGGATGGGCAAATGCTGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGCAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACACGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAAAGCAACTGAAGGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAATACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAACGTGGTACACTTCGTGTGGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTGGACAATGTTCTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCAACTACTGCGATAAGGGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTAGGTTCTACCCAAGATTTAGAACTGTATGAGAAAAATAGTTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAAAAGCAAAAGCGGTAGATAGTAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTACAGCAGATAGTGTACTAACTATTTCTAATACTGGAACAGAAACTCATCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCAAGCACAGACGGTGACTATTAGAGTGTGGGGTAATCAATTTAGTGGGGAATCAGATGCAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGCCGATGAAACATCTTATCACTTTTATTCTCAGCGCGAAAAAGCTGGAAATATAACGTTTAGCATTAATGGTACTGTAATGCCAATAAATGTGAATGCTTTAGGTTCTTTGAACGCGAACGGCGTTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACAGCCAATGGTGAATTCATTAGCAAGTCTGCAAATGCCTTTAGAGCAATAAATGGTGATTATGGATTCTTTATTCGCAATGATGGATCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGTGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGCCCATTAGCTATTAATAATGCATCTGGCCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAAACATCTGACTTATATACACGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGATATTAACGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGTCTTCCATATTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACCCCAGAAGCTCGTACCACTCGTTGGACGCGTACATGGCAGAAAACCAAAAATTCTTGGTCAAGCTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAGCCATCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

Title Authors Date PMID Source
Biological characterization and genomic analysis of Salmonella infecting phages Prasanth,M., Oppong,K. and Young,R. 2024-01-17 — GenBank