Protein

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Genbank accession
XNS47909.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,81
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MADLAKIQFLRSTVAGKTPTTSQLADGELAINMADYAIYTKNGSSIVQLAGKGIPETNTKKLTVDGPSALNDTVTVAEGKTITFTNENLSGEITRHIVGKCASNDGWYIGSGGTSNNGILEIGTIDDGTETIQFVQRGAGNVEARKLVLLDSSGNTTLPGDLRLSTNKTVKISNGSTLTLEMGVGANDVYIKNLRGAGVLQLTNDSNLAFRNSQVYYAMNGRGPGKSGTLLTNVENNRQAWQYPISAATALTPRWLKIATMKHPASASSQLDLMITGGIDSGHGKHHVDFITLSGHNLTSWSTSNLDNWVEWRRIGSPNKGNVPEYYVVKNDAATDSEASFDFYAKVPRYGNGLYVTVLNTSGYNGQDSGTVIIYETNQDIGDTGPSGSILVSMKQIFDSIAKPDFGDTTGTLPVNRGGTGATNVGDARNNLGLGTAAVRDVGEGAGNVLENGAYGLGGNGGKSINNIISNADMLTRLKSYGGTFWRGVTKSGVSVQNGLYNHGSGIFMNAGDTMSAINIDYASAKVRVYAANDSGLATGNVKYNELYGTANKPTKDDVGLGNLTNDTQVKKAGDTMTGDLTAPNLYASGPGTASVYVDAGSGNAHVWFRTNGGERGVIWATPNTTDLGQINIRAKTTGGTSAGDFSFRSDGRLDVPVAVKVGGAAMLTKDGNITSGSMFGGNLNNYLNSIKNDIVAGDNKQVSKTGDTMTGNLTINANLKVENPNGSMVDFGSENSDKYSRITLARKVGSGAAVAMLKITPEGYVQFGYQDAVATPAPSKYLLVKSNGLEVEGDLVFNQTYRGTEDAVDITDKTNDLNNMVIKGSDLGTRQLYKCVSSGGGSNIANKPTSDGNFVLEVLSLRKISDTDWTCKQTFTTKNGDVEGTYVRYCQNGTWSAWKEVVAGVQPINLGGTGATSVAAARNNLGVGEGQSVKFGGLVVDGNINVVSGNFVIAGQAPTDNSHLTNKKYVDDRVASAISNAGDTYLPLAGGTVTGRLTITGDQLKTTSLLVTGDTAVNGVLTVDGRARFNQEFIVSTSVNVQNTGNSHLVFRKADGTEKGLIWADEPGSVSIRAGGVSGPTWNFWNSGSCQFPGAISNFNGVNSTTNYPGGGSGAYLNTAGLTSRFSNGAYVSLYFQEYVGNYHQAILNVNGFGRDDNFYFRAGGDFFCTRNGSFDNVEIRSDRRAKSDIKVIENALEKVETLSGNTYELHNTSGGTTRSAGLIAQEVQEVLPEAVTQDIEADGGLLRLNYNSVIALLVESVKELSAEVKNLKAEIEELKSK
Physico‐chemical
properties
protein length:1283 AA
molecular weight: 135399,58450 Da
isoelectric point:5,63697
aromaticity:0,07327
hydropathy:-0,30530

Domains

Domains [InterPro]
DC_1942
ATT
2–613
DC_1942 DC_0246
DC_1942
ATT
593–696
DC_1942 cd19958 IPR030392
IPR030392
CHP
1183–1238
IPR030392 Coil
XNS47909.1
1 1283
Architecture
ATT
RBD
STR
RBD
ATT 2-696 | RBD 738-814 | STR 815-902 | RBD 903-1283
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
XNS47909.1
1 1283
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 216 216 0,1001
Central domain 217 427 212 0,1628
C-terminal 428 1283 855 0,6598
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-216
Central
217-427
C-terminal
428-1283

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage vB_KpnM_ALF_ER54
[NCBI] 		3374977 Viruses >
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XNS47909.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP738790.1 [NCBI]
CDS location
range 168593 -> 172444
strand +
CDS
ATGGCTGATTTAGCAAAAATTCAATTCCTACGTAGCACAGTTGCGGGGAAAACACCTACTACAAGTCAGCTTGCAGATGGTGAACTGGCGATCAACATGGCTGATTATGCCATTTACACGAAAAATGGTTCTTCGATCGTTCAGTTAGCGGGTAAAGGTATCCCAGAAACAAATACCAAAAAATTAACAGTTGATGGGCCTAGTGCTCTTAATGATACCGTTACCGTAGCGGAAGGTAAAACTATTACTTTCACCAACGAGAATTTAAGTGGTGAAATAACTCGTCATATCGTCGGTAAATGTGCCAGCAATGATGGATGGTACATCGGCTCCGGTGGTACAAGCAATAACGGCATTCTTGAAATCGGTACTATTGACGATGGTACTGAAACAATCCAGTTTGTACAACGCGGTGCAGGTAACGTAGAAGCCAGAAAATTAGTCTTACTTGATAGCTCTGGTAATACTACTCTTCCTGGGGATTTAAGATTATCCACTAATAAAACCGTTAAAATTAGTAATGGAAGCACTCTTACGTTAGAAATGGGCGTAGGTGCTAATGATGTATACATTAAAAACCTGAGAGGTGCAGGTGTTCTTCAATTAACTAATGACAGCAATCTGGCATTCAGAAATTCTCAGGTTTATTACGCCATGAACGGAAGAGGTCCTGGTAAATCTGGTACTCTTCTGACGAACGTGGAAAACAATCGTCAGGCGTGGCAATACCCAATTTCGGCTGCAACTGCTTTAACTCCACGATGGCTTAAAATCGCCACAATGAAACACCCAGCATCGGCATCTTCACAGTTAGATTTAATGATTACTGGTGGTATTGATTCTGGACACGGTAAGCATCATGTAGATTTTATTACATTATCCGGGCACAATTTAACATCTTGGAGCACTAGCAATTTAGATAACTGGGTTGAATGGCGCAGGATTGGTTCTCCTAATAAAGGAAACGTTCCAGAATATTACGTTGTTAAAAATGATGCTGCTACAGATTCAGAGGCTTCGTTTGATTTTTATGCTAAAGTTCCTCGATACGGCAATGGCCTTTACGTTACAGTGCTAAACACCTCTGGATACAACGGCCAAGATTCAGGTACAGTAATTATCTATGAAACCAATCAGGACATTGGTGATACTGGACCGTCTGGAAGTATTCTTGTTTCGATGAAACAAATTTTTGACAGTATCGCAAAACCAGATTTCGGTGATACTACCGGTACTCTTCCGGTTAATCGAGGTGGTACAGGTGCTACTAATGTTGGTGATGCTAGAAATAACTTAGGTCTTGGTACTGCGGCCGTTCGTGATGTCGGTGAAGGTGCTGGTAATGTTTTAGAAAATGGCGCTTATGGCTTAGGCGGTAATGGTGGTAAATCCATCAACAACATTATCTCTAATGCGGATATGTTGACCCGCTTAAAATCATACGGTGGTACTTTCTGGCGTGGTGTTACTAAATCTGGCGTTAGTGTTCAAAACGGCCTTTATAACCACGGCTCCGGTATTTTTATGAATGCTGGTGATACCATGTCAGCCATTAATATCGACTACGCTAGTGCTAAAGTTCGTGTATACGCAGCTAACGACAGTGGTCTTGCTACAGGAAATGTTAAGTACAATGAACTTTACGGCACAGCAAACAAGCCGACAAAGGACGACGTAGGGCTTGGTAATCTGACAAACGACACTCAGGTTAAAAAAGCTGGCGACACCATGACTGGTGATTTAACTGCACCTAACCTCTATGCTTCTGGGCCGGGAACCGCATCGGTGTATGTTGATGCAGGAAGCGGAAATGCTCATGTATGGTTTAGAACAAACGGCGGTGAGCGTGGTGTAATTTGGGCAACTCCAAATACTACGGACTTAGGACAAATTAACATTCGTGCAAAAACTACTGGTGGTACTTCTGCTGGTGATTTTAGCTTCCGTTCTGATGGTCGCCTTGATGTTCCTGTAGCAGTTAAAGTTGGTGGAGCAGCAATGCTAACCAAAGACGGGAATATTACCTCAGGTTCGATGTTTGGTGGTAACCTTAACAACTATTTGAATTCTATTAAAAACGACATCGTTGCTGGCGATAATAAGCAAGTAAGTAAGACTGGTGATACCATGACCGGTAACTTGACTATTAACGCTAACTTAAAGGTTGAAAATCCTAATGGATCGATGGTTGATTTTGGTTCAGAGAACTCAGATAAGTATAGCAGAATAACTCTTGCACGTAAAGTTGGCTCTGGCGCTGCCGTAGCAATGCTTAAAATTACTCCTGAAGGGTACGTGCAATTTGGTTATCAAGATGCAGTTGCTACTCCAGCTCCCAGCAAGTATCTCCTGGTTAAATCTAACGGCCTTGAGGTAGAAGGGGATTTAGTTTTTAATCAGACCTATCGCGGCACTGAAGACGCAGTTGATATTACTGATAAGACTAATGACCTTAACAACATGGTTATTAAAGGCAGTGATTTAGGTACTCGTCAGCTGTATAAATGTGTATCTTCTGGTGGTGGTTCTAATATAGCTAATAAACCTACCTCTGACGGCAACTTTGTTCTTGAAGTTCTGTCTTTGCGTAAAATTTCTGATACCGATTGGACATGTAAGCAGACCTTTACTACAAAGAACGGTGATGTTGAAGGCACATATGTTCGATACTGCCAAAACGGTACATGGTCTGCATGGAAAGAGGTTGTTGCTGGTGTTCAACCAATTAATTTAGGTGGTACTGGAGCAACTTCTGTAGCTGCTGCTCGTAATAACCTCGGTGTTGGTGAAGGACAGAGCGTTAAGTTCGGCGGATTAGTTGTTGATGGAAACATCAACGTTGTTTCTGGTAATTTTGTTATTGCAGGCCAAGCTCCTACTGATAACTCGCATCTGACCAACAAAAAATACGTTGATGATCGGGTTGCTTCTGCCATTAGTAATGCGGGTGATACTTATCTTCCATTAGCAGGTGGTACTGTAACTGGGCGGTTAACAATTACAGGCGATCAGTTAAAAACTACATCACTTTTGGTTACGGGAGACACTGCTGTTAATGGTGTTTTAACTGTTGATGGAAGGGCTAGATTTAATCAAGAGTTCATTGTATCAACTTCGGTTAACGTCCAGAACACTGGTAACAGTCATTTGGTCTTCCGTAAAGCTGATGGTACAGAAAAAGGACTTATTTGGGCTGATGAGCCTGGTAGCGTTAGTATAAGAGCAGGTGGTGTCTCTGGGCCAACGTGGAATTTCTGGAACAGTGGTTCTTGCCAATTCCCAGGTGCTATTAGTAACTTTAATGGTGTTAATAGTACTACTAATTACCCTGGCGGCGGAAGTGGCGCGTATTTAAATACCGCTGGCTTAACAAGTAGATTTAGTAATGGTGCTTATGTTTCCTTATACTTCCAAGAATATGTAGGAAATTATCACCAGGCTATTCTTAATGTTAATGGATTCGGTCGAGATGACAATTTCTATTTCAGGGCCGGCGGTGACTTCTTCTGTACTCGTAACGGTTCTTTTGATAACGTTGAGATTCGTTCTGACCGTAGAGCCAAATCGGATATCAAAGTTATTGAAAATGCTTTAGAAAAGGTTGAAACATTATCTGGTAATACTTATGAACTTCATAACACTTCTGGCGGTACTACTCGTTCTGCGGGTTTAATCGCGCAGGAAGTTCAAGAAGTTCTTCCGGAAGCAGTTACTCAGGATATTGAAGCAGACGGGGGTTTATTGCGTCTGAATTACAACTCAGTAATTGCACTTCTCGTTGAATCTGTTAAAGAGCTTTCTGCCGAAGTTAAAAATCTTAAAGCAGAAATTGAAGAACTTAAATCTAAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
7d0a02f68e02bd7d3cef0578e5d328105bfffc3f830c2ad9b0a1c76897fdb993
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5349
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50