Protein
View in Explore- Genbank accession
- USL86799.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TF
- Protein sequence
-
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDIDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSNSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAARAGNMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMVRPGVERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFIPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGEAIKELTEYIKRQYNIGADGRMASTNENFARRQEISTLFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYEGWGNDNPFDRYSDTPPSDNGGPEQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYNYAQQKVSLATDYVRDNVPNQFSELRRNINIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRTVNYSNQLNGYSDIVNQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDINTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYIPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNQIITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNVADASNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTIGLGKDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTTAGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQIPELINSDGSKHTAAKNKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNNSDEETTESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILGRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKFKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYGADDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSDVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQMKEKELLNKYSATEKTSVAPKATSSSFKESTTDVINDTITTIKSKSTDITNWFRDSTIGKAIKAVSPVESIRKMVTTTVDTIIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDIEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPVFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRVQIANAIMGATDDEGISIWKAPSIFNIVGDMDSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRSFASRIIDNVKSTFNSATTKVTNWMENTSARVSQVIGRAQEGITDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAATAKQKDMATDKELIGGAADTSITDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSATDVSSGQQPVVDTGAATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADMLNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2237 AA molecular weight: 245805,09160 Da isoelectric point: 8,72452 aromaticity: 0,07555 hydropathy: -0,46464
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–899
STR
1–899
Coil
Unmapped
149–173
Unmapped
149–173
IPR023346
STR
1883–2015
STR
1883–2015
IPR008258
ENZ
1885–1978
ENZ
1885–1978
1
2237
Architecture
STR 1-2048 | RBD 2049-2237
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudomonas phage OMKO1 [NCBI] |
2734642 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
| Host |
Pseudomonas aeruginosa PAO1 [NCBI] |
208964 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales > Pseudomonadaceae > Pseudomonas |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
USL86799.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
ON631220.1
[NCBI]
CDS location
range 256539 -> 263252
strand +
strand +
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAAGCCGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATATCGATGATATTTTTGGTGATACACCGAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCTGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATTCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTTCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGTCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCTGCTATAGATCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAGGGTGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGCGATAAGGTATCAGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCTATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAGTTTCGTTCTATGCTGCATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATTCCCGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCAGCTCAACGGGTATCGAATAGTTTTGTTGACAACGCTATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCGAATGAAAATATCCGTAACTTTGCAGATGCAGCTCGCGCTGGAAACATGTTTGGCGCGGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCTGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCAGTTATACCTGTATTAGGTAGAATGGTTCGTCCTGGTGTGGAACGTTTTTCAAATAACTATCTAGGTGGTCGACACAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAATTACCAAAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCTCCATTTATTCCACAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTTGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGTGATGATATTACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGTTCATTCATGTCTGTAGAGGATTCAGCTGCAAATACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGAGGTGTGAGTGGTGCTCTTACCGATGTTCTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCGCTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGACCCCGAAGCATATGCTCGTGCTGGTGGGTATGATCGTTCTAAAGTGTCCGGTGAGGCGATTAAAGAATTAACGGAATATATTAAACGGCAATACAATATTGGCGCTGATGGTAGGATGGCAAGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTACATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGATCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGTATTATCATAACCGAGCAGGGTATTGATCGTATTAATTACCCACGTATTTGGGAACTAATGAGTTCAGAAGTAAAATACGAAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTGATACACCACCTTCTGATAATGGTGGTCCAGAGCAACTCTCCCCACTAGGTGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGCCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGTCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCCTCTAAACTGGCCCAAGAGCAAGCTAATAAAGGCTATAATTACGCACAACAAAAAGTATCACTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGCGAATTACGTAGGAATATAAACATTCCAGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGAGATCAACTATACGGCCAAGCTGGCGATATGTATAGCCGTACTGTTAACTATAGTAATCAGCTCAATGGATATTCTGATATAGTCAATCAATCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACTCCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGATATTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAAATATCTGATATTACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGTATAACTGTAGTAACTGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTCTATAATCAACGTGGTGATTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCAGCACAGATCGCTGGTGATGCTAGAGAACGGTTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATATACCTGGCCGTGAAGAAGCTGTTATTCTTGGACGTGATCTACTAGCCGGTGAGTATATCGATACAGCAACTAATCAAATTATAACTAATTTGAAAGATGCCAAAGGTACTATTATTAACAGGGCTGGTGATGTAGTCGTAACTGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGGTCAGATGGTTTTAATCTGCGAAGGAATGTAGCAGATGCATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTTGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTATTGGATTAGGTAAGGATATTCTAAGTAATCGGGATGCATATTTACCTGGTATGTTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGTGAGTATTATACAACTGCTGGTAACCTATTAAAATCATTCGATGAGATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATTGTTGTTGATGAAGAACAAATACCTGAACTTATTAACTCTGATGGGTCTAAGCATACTGCTGCTAAGAATAAGGGTTTATTCCGAACTGGTTTAGGTAATCTAGCCCGTGGTTATGCTAATATGTCAATGCGTTATTGGAAGTGGTTAGGTAAGAAATCTGTAGATACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTACTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTTAGTGCATTTACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACCACCACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTGCGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGCCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGCGATACTTTAAATGGTAAAAATAACAGTGATGAAGAAACCACTGAATCAAAAGGTCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCTTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCCCGCCAAATACTTGGTAGAGGTGCTTTAGCTATTGGTGGTGGAGCATTATCAACAGCTGCTGCATATGCTAGTTTTGGTGGTACTGGTGCATCAACAAATGATAAATTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACCAGTAATCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATTCAAAGATGACTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTACGGTGCTACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGTGTAGCTACACGTGGTGGAGATGCCTCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATGGTGCTGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATCGACTTCAGATTTAAACCGATCTTTGAGGCATGGCTTAAAGGACTATCCAAAATTAATCGTAGTGATGTAGATATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAGCTCATTAGATCAGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTTCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTTGCTTCTATACAGATGAAAGAAAAGGAATTATTAAACAAGTATAGCGCTACAGAGAAAACATCTGTCGCACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTACTACTGATGTGATAAATGATACTATTACTACGATTAAGTCTAAGTCAACTGATATTACTAATTGGTTTAGGGATTCAACTATTGGAAAAGCAATTAAAGCGGTTAGTCCAGTTGAATCTATACGTAAAATGGTAACTACAACAGTAGACACAATTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACTTCACTGCAAGCATTACGTGTACATGCTTATGGAATGCAAGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGATTATTATCAATTGAAAGTCTTGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGTAAAGCTACTTATACAGGTGATATAGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACAACTAGCGA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
9ce6bbd8c3c04dfc5ed87342aaadaace22d32c59ade45b1f2e7901de38e3a91a
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50