Protein

Genbank accession
AIX24082.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,77
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,97
Protein sequence
MADRFPLIVNAISKKIEEIVAGDNLELTGNGLIISGDTGAGKYLTSDGTTVFWGDPGNVYLTQSQTLTNKTLESSIISGSNNTITNIPNSALINSGITINGSTIALGGTVTTPDNNTTYTIAAVDGASAARKIIRLTSGGNAGSGIDDDITLIAGTNVTLDRSNDDITINSSYVDTDTITTLQSEVGGSAQSGAITIAASGSSTVSQNAGTKTITISSSYIDTITRLRATAGQVFSASDFTFLDGGATTVTQSVDGNGDPTITYSSVDTITRIKGGGAGSFVTGDTTFTGGTNVTVSQAGNIITVDSVDTNTVTRLSSGSNAVVSGDFNFTSSGATSLTQTTVGGVTTINISSANDDTGASLQASGGLILQGTNFRLKNYNTFSGNTLMKWDSGNDQLTDSIITDNGSTVTITGDLVVEGTQTILNVSTLQVEDNDIELRKGNNLTGTNGGITLNRTTDSSGNITSYVALQWNESVGYWRSWDGSVEKRFVTEGETQILTNKTLTSPTLTAPVLGSATATSINGLVISSTASATLDIASSKTLDVDRDLSLTSDNNSASINVNFRQGGNVAYTSDTLASFSSTTSTQIRGLITDTTGTGRLVFQDSPTFLTSLNTTSTGFTLFNSSVTNITAFGAAGIITMGQSGGTMTVNQSLVVNEDLTVGTGISDTITFNGTVNSENADILIRGTATDPMSVGRGGGAVNTNTRVGVSALQSNTSGSQNTALGYQALFTNNSGAANTAVGNRALRANGVGSNNIGIGRDVLLVNLEGSKNVAMGNNALESNTSGDSNVCIGHYAGFDVLGSGNVLIGPAYNENSGDVTFRPPSVSGDNQLVIGSGGQAWVRGDSNFDVTFNNDVTVDQDVIVKGNLTVNGIQTIVKSNIVQITDKNIELASIVSTQFVASATDGTADITSINPTAGLIPGMEVTTSTAGFTVPSNTIIVSISGNTATLSNNISGNGQITLTAIGPSDSAAEDGGIIVKGSTDKSILWKGSDAGVTYNSWVSSEHFDLASGKYLSLDAIRIADPNTSTIGPNNGTTTGLIDVTGGSNGYNLGSAVVGAAATSFNFTGTGEITLPNGDTAQRNSSPLNGMLRYNGQTNVFEGYSNGAWGSIGGNVAISSPAPSNSVEGDLWYDSDDGRLFVYYNDGVTTQWVDASPNGVPTDLIIEGTTELRGTATTRAILPDADDTYDLGSATKRWANIYSADLQLSNEGGANDVDGTWGQYTIQEGEHDLFLINRRSGKKYKFNLTEVN
Physico‐chemical
properties
protein length:1252 AA
molecular weight: 128860,08180 Da
isoelectric point:4,22458
aromaticity:0,05751
hydropathy:-0,13211

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014j
[NCBI] 		1493514 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX24082.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019069 [NCBI]
CDS location
range 166965 -> 170723
strand +
CDS
ATGGCTGACCGCTTTCCGTTAATTGTTAATGCAATTTCAAAGAAGATTGAAGAAATTGTAGCAGGAGACAATTTAGAACTAACTGGTAATGGTCTTATTATCAGTGGTGATACTGGTGCTGGCAAGTATTTAACGAGTGATGGAACTACCGTTTTCTGGGGAGATCCTGGCAATGTTTACCTTACACAATCACAAACATTAACTAATAAAACTCTTGAATCTAGTATTATTTCTGGATCGAATAATACTATTACAAACATTCCTAATAGTGCTCTTATTAATTCTGGAATTACGATTAACGGATCTACTATTGCTCTTGGTGGAACTGTAACAACTCCTGATAATAACACTACTTATACTATTGCTGCTGTAGATGGAGCTTCTGCTGCGAGAAAAATTATTCGTTTGACATCAGGTGGCAATGCTGGTTCTGGAATTGACGATGATATTACTTTAATTGCTGGAACTAATGTAACTTTAGATAGATCTAATGATGATATTACAATCAACTCCTCATATGTAGATACTGATACTATCACTACATTACAATCTGAAGTTGGTGGTTCTGCTCAAAGTGGAGCAATCACAATTGCTGCCAGTGGATCTTCCACAGTATCTCAAAATGCTGGAACAAAAACTATAACGATTAGTTCTTCGTACATTGATACTATTACAAGACTCAGAGCAACTGCAGGTCAAGTATTTTCTGCATCTGACTTTACCTTTCTTGATGGTGGCGCAACCACAGTAACTCAGAGTGTAGATGGTAATGGTGATCCTACTATTACGTATAGTTCTGTTGATACGATTACTCGAATTAAAGGTGGTGGTGCCGGATCATTTGTAACTGGCGACACTACATTTACTGGTGGAACAAATGTAACAGTATCTCAAGCAGGTAATATAATTACCGTTGATTCTGTAGACACAAACACTGTAACTAGATTGTCTAGTGGTAGCAATGCAGTTGTTTCTGGAGATTTTAACTTCACATCTTCTGGAGCAACATCACTAACTCAAACAACAGTAGGTGGTGTCACTACTATCAATATTAGTTCTGCTAACGATGACACGGGTGCATCTCTACAAGCATCGGGTGGTTTGATACTTCAAGGCACTAACTTTAGACTAAAGAACTACAATACTTTCAGTGGTAACACTTTAATGAAGTGGGACTCTGGTAATGACCAGTTAACAGATAGTATTATTACTGATAATGGATCTACTGTTACGATTACCGGCGATTTAGTTGTTGAAGGAACACAAACTATTTTAAACGTTTCTACCTTACAGGTTGAAGATAATGATATTGAACTTAGAAAGGGTAATAACTTAACTGGAACGAATGGTGGTATTACTCTTAATAGGACCACTGATTCGTCTGGAAATATAACTTCATACGTTGCTTTACAATGGAACGAGTCTGTTGGATACTGGAGATCATGGGATGGTTCAGTAGAGAAAAGATTTGTTACTGAAGGTGAGACGCAAATTCTAACTAACAAAACTCTTACATCTCCTACTTTAACTGCTCCTGTTCTTGGATCCGCAACAGCAACGTCAATTAATGGTCTTGTAATTTCTTCTACTGCATCAGCAACTTTAGATATTGCATCATCAAAAACTTTAGATGTTGATAGGGACCTGTCATTAACTTCTGATAATAATAGTGCATCTATCAACGTAAACTTTAGACAAGGTGGAAACGTTGCTTATACATCAGATACTCTAGCATCATTTTCTTCTACAACATCAACTCAAATACGTGGTCTGATTACTGACACTACAGGTACAGGACGTTTAGTATTTCAAGATTCTCCAACATTCTTAACATCATTAAACACTACATCTACTGGTTTCACACTGTTTAATTCTAGTGTTACTAATATAACAGCATTTGGTGCTGCTGGCATTATTACTATGGGTCAATCTGGCGGCACGATGACCGTCAATCAAAGTTTAGTGGTTAATGAAGATCTAACAGTCGGCACTGGTATTTCAGATACTATTACGTTTAACGGCACTGTTAATTCTGAAAATGCTGACATTTTAATTAGAGGAACTGCCACTGATCCTATGAGTGTTGGTCGTGGTGGTGGAGCAGTTAACACAAACACGAGAGTTGGTGTTAGTGCTTTACAAAGTAATACTTCTGGATCTCAAAATACTGCACTGGGATATCAAGCATTATTCACAAACAATTCTGGCGCAGCGAACACGGCTGTCGGTAATAGAGCACTTCGTGCGAATGGTGTTGGTAGTAATAATATTGGTATCGGTAGGGATGTATTACTGGTAAACTTAGAGGGAAGTAAGAATGTTGCCATGGGCAACAACGCACTTGAAAGTAATACTAGTGGAGATTCTAACGTTTGTATTGGACACTATGCTGGTTTTGATGTACTTGGAAGTGGAAACGTTTTAATTGGACCAGCTTATAACGAGAACTCTGGTGATGTAACCTTCCGTCCTCCTAGTGTCTCTGGAGATAATCAATTAGTAATTGGATCTGGTGGACAAGCATGGGTTCGTGGCGATTCTAATTTTGATGTCACGTTTAATAATGATGTGACTGTTGATCAAGATGTTATAGTTAAAGGAAACTTAACTGTTAATGGAATACAAACTATAGTTAAATCAAACATAGTACAAATAACTGATAAAAATATTGAACTTGCTTCCATTGTAAGTACTCAGTTTGTCGCATCTGCCACTGATGGAACTGCTGATATCACGTCAATCAATCCCACTGCTGGTTTGATTCCTGGAATGGAAGTCACAACTAGTACTGCTGGATTTACAGTTCCATCTAACACAATTATCGTTAGTATTTCTGGGAATACTGCTACTCTCTCAAATAATATTTCTGGTAATGGACAGATTACATTAACTGCTATTGGTCCTTCTGATTCTGCTGCAGAAGATGGTGGTATTATTGTTAAAGGATCTACTGATAAATCTATTCTTTGGAAAGGATCTGATGCTGGAGTAACATATAATAGTTGGGTATCTTCGGAGCACTTTGATCTTGCTAGTGGAAAGTATTTGTCATTGGACGCAATCAGAATTGCTGATCCAAATACATCAACAATTGGACCTAACAATGGAACTACTACAGGTCTTATTGATGTTACTGGTGGTAGCAACGGATATAATTTAGGTAGTGCAGTTGTTGGTGCTGCTGCTACATCATTTAACTTTACAGGAACGGGGGAAATTACGCTCCCTAATGGTGATACTGCTCAACGTAATAGCAGTCCTTTGAATGGTATGCTTAGATACAATGGTCAAACTAATGTATTTGAAGGATATTCAAACGGTGCATGGGGATCAATTGGTGGTAATGTAGCAATTTCAAGTCCTGCTCCTTCTAATTCTGTGGAAGGAGATCTCTGGTATGATTCTGATGATGGTCGTTTGTTTGTATACTATAACGACGGAGTTACAACTCAGTGGGTAGATGCTTCACCAAACGGAGTTCCTACTGATCTAATTATTGAGGGAACTACAGAACTTAGAGGAACTGCTACTACAAGAGCAATACTTCCCGATGCTGATGATACTTACGATCTAGGTTCAGCAACTAAGCGTTGGGCAAACATCTACTCTGCTGACCTTCAACTATCTAACGAGGGTGGTGCTAATGATGTTGATGGAACTTGGGGTCAGTACACAATTCAAGAAGGTGAGCATGACCTCTTCCTAATCAACAGAAGATCTGGTAAGAAGTATAAGTTCAACCTTACGGAGGTCAACTGA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID
504f8dc82b978d7d82fb8e87659ad0be57759ef41cba2c3fb60da4008ff9e7e6
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2428
Evidence 0,2428
Download PDB

Literature

Title Authors Date PMID Source
Ecological redundancy of diverse viral populations within a natural community Gregory,A.C., LaButti,K., Copeland,A., Woyke,T. and Sullivan,M.B. 2015-03-20 — GenBank